MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011274	AAC	2	6	87340	87345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351415
1502	NC_011274	CGA	2	6	87365	87370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351415
1503	NC_011274	CATC	2	8	87401	87408	25 %	25 %	0 %	50 %	205351415
1504	NC_011274	AGA	2	6	87419	87424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351415
1505	NC_011274	CGG	2	6	87543	87548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351415
1506	NC_011274	TAG	3	9	87559	87567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351415
1507	NC_011274	CAGAA	2	10	87583	87592	60 %	0 %	20 %	20 %	205351415
1508	NC_011274	AGG	2	6	87608	87613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351415
1509	NC_011274	CAT	2	6	87618	87623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351415
1510	NC_011274	CCAG	2	8	87695	87702	25 %	0 %	25 %	50 %	205351415
1511	NC_011274	TAA	2	6	87782	87787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351415
1512	NC_011274	ATT	2	6	87841	87846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351415
1513	NC_011274	A	8	8	87855	87862	100 %	0 %	0 %	0 %	205351415
1514	NC_011274	T	6	6	87882	87887	0 %	100 %	0 %	0 %	205351415
1515	NC_011274	TGA	2	6	88415	88420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351416
1516	NC_011274	TAA	2	6	88436	88441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351416
1517	NC_011274	GCT	2	6	88512	88517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351416
1518	NC_011274	CAG	2	6	88530	88535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351416
1519	NC_011274	GGC	2	6	88569	88574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351416
1520	NC_011274	CT	3	6	88611	88616	0 %	50 %	0 %	50 %	205351416
1521	NC_011274	TGA	2	6	88625	88630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351416
1522	NC_011274	AC	3	6	88676	88681	50 %	0 %	0 %	50 %	205351416
1523	NC_011274	GCC	2	6	88695	88700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351416
1524	NC_011274	GCG	2	6	88701	88706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351416
1525	NC_011274	GCG	2	6	88735	88740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351416
1526	NC_011274	TTC	2	6	88745	88750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351416
1527	NC_011274	CAG	2	6	88764	88769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351416
1528	NC_011274	TGG	2	6	88780	88785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351416
1529	NC_011274	CT	4	8	88830	88837	0 %	50 %	0 %	50 %	205351416
1530	NC_011274	CGG	2	6	88906	88911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351416
1531	NC_011274	GCG	2	6	88974	88979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351416
1532	NC_011274	A	6	6	88980	88985	100 %	0 %	0 %	0 %	205351416
1533	NC_011274	CA	3	6	89042	89047	50 %	0 %	0 %	50 %	205351416
1534	NC_011274	AGC	2	6	89065	89070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351416
1535	NC_011274	GTG	2	6	89085	89090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351416
1536	NC_011274	GAA	2	6	89106	89111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351416
1537	NC_011274	CGC	2	6	89117	89122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351416
1538	NC_011274	TGA	2	6	89227	89232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351417
1539	NC_011274	GC	3	6	89236	89241	0 %	0 %	50 %	50 %	205351417
1540	NC_011274	GCT	2	6	89327	89332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351417
1541	NC_011274	AGA	2	6	89345	89350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351417
1542	NC_011274	GCT	2	6	89370	89375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351417
1543	NC_011274	GCG	2	6	89410	89415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351417
1544	NC_011274	TGC	3	9	89419	89427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351417
1545	NC_011274	GGC	2	6	89453	89458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351417
1546	NC_011274	ACG	2	6	89494	89499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351417
1547	NC_011274	GCG	2	6	89529	89534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351417
1548	NC_011274	CGG	2	6	89552	89557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351417
1549	NC_011274	CAG	2	6	89609	89614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351417
1550	NC_011274	GCG	2	6	89653	89658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351417
1551	NC_011274	CCGCA	2	10	89702	89711	20 %	0 %	20 %	60 %	205351417
1552	NC_011274	TGG	2	6	89758	89763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351417
1553	NC_011274	GCA	2	6	89785	89790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351417
1554	NC_011274	CCCG	2	8	89851	89858	0 %	0 %	25 %	75 %	205351417
1555	NC_011274	TGGA	2	8	89877	89884	25 %	25 %	50 %	0 %	205351417
1556	NC_011274	GC	3	6	89986	89991	0 %	0 %	50 %	50 %	205351417
1557	NC_011274	CAA	2	6	90008	90013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351417
1558	NC_011274	CCTG	2	8	90077	90084	0 %	25 %	25 %	50 %	205351417
1559	NC_011274	CAT	2	6	90183	90188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351418
1560	NC_011274	CGGTT	2	10	90207	90216	0 %	40 %	40 %	20 %	205351418
1561	NC_011274	GCG	2	6	90217	90222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351418
1562	NC_011274	TGCT	2	8	90227	90234	0 %	50 %	25 %	25 %	205351418
1563	NC_011274	CTG	2	6	90275	90280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351418
1564	NC_011274	GAA	2	6	90285	90290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351418
1565	NC_011274	CAT	2	6	90330	90335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351418
1566	NC_011274	ATT	2	6	90425	90430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351418
1567	NC_011274	CGC	2	6	90444	90449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351418
1568	NC_011274	TCG	2	6	90451	90456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351418
1569	NC_011274	GTT	2	6	90559	90564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351418
1570	NC_011274	CTG	2	6	90652	90657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351418
1571	NC_011274	GCC	2	6	90781	90786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351418
1572	NC_011274	AAC	2	6	90849	90854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351418
1573	NC_011274	TCA	2	6	90882	90887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351418
1574	NC_011274	A	6	6	90901	90906	100 %	0 %	0 %	0 %	205351418
1575	NC_011274	TGG	2	6	90977	90982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351418
1576	NC_011274	GAAT	2	8	91013	91020	50 %	25 %	25 %	0 %	205351418
1577	NC_011274	TGG	2	6	91034	91039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351418
1578	NC_011274	GCG	3	9	91135	91143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351418
1579	NC_011274	CGA	2	6	91170	91175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351418
1580	NC_011274	AGCA	2	8	91180	91187	50 %	0 %	25 %	25 %	205351418
1581	NC_011274	GTAT	2	8	91241	91248	25 %	50 %	25 %	0 %	205351418
1582	NC_011274	GCTCC	2	10	91343	91352	0 %	20 %	20 %	60 %	205351418
1583	NC_011274	A	7	7	91366	91372	100 %	0 %	0 %	0 %	205351418
1584	NC_011274	GAA	2	6	91386	91391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351418
1585	NC_011274	TCA	2	6	91400	91405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351418
1586	NC_011274	TGA	2	6	91409	91414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351418
1587	NC_011274	TAT	2	6	91439	91444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351418
1588	NC_011274	CAT	2	6	91514	91519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351419
1589	NC_011274	CGG	2	6	91573	91578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351419
1590	NC_011274	GAC	2	6	91596	91601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351419
1591	NC_011274	CGTT	2	8	91607	91614	0 %	50 %	25 %	25 %	205351419
1592	NC_011274	CG	3	6	91693	91698	0 %	0 %	50 %	50 %	205351419
1593	NC_011274	TAA	2	6	91728	91733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351419
1594	NC_011274	GCA	2	6	91879	91884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351420
1595	NC_011274	TGA	2	6	91897	91902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351420
1596	NC_011274	TCC	2	6	91913	91918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351420
1597	NC_011274	GCG	2	6	91947	91952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351420
1598	NC_011274	TGGCG	2	10	91987	91996	0 %	20 %	60 %	20 %	205351420
1599	NC_011274	AAC	2	6	92001	92006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351420
1600	NC_011274	CGC	2	6	92010	92015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351420
1601	NC_011274	GC	3	6	92043	92048	0 %	0 %	50 %	50 %	205351420
1602	NC_011274	GTT	2	6	92089	92094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351420
1603	NC_011274	GCG	2	6	92119	92124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351420
1604	NC_011274	TGTT	2	8	92178	92185	0 %	75 %	25 %	0 %	205351420
1605	NC_011274	CGC	2	6	92190	92195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351420
1606	NC_011274	GCGT	2	8	92293	92300	0 %	25 %	50 %	25 %	205351420
1607	NC_011274	CGC	2	6	92317	92322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351420
1608	NC_011274	TGG	2	6	92355	92360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351420
1609	NC_011274	GGC	2	6	92384	92389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351420
1610	NC_011274	ATG	2	6	92510	92515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351420
1611	NC_011274	GCC	2	6	92554	92559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351420
1612	NC_011274	GTT	2	6	92581	92586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351420
1613	NC_011274	CCG	2	6	92590	92595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351420
1614	NC_011274	CTAT	2	8	92658	92665	25 %	50 %	0 %	25 %	205351420
1615	NC_011274	TCG	2	6	92682	92687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351420
1616	NC_011274	T	6	6	92747	92752	0 %	100 %	0 %	0 %	205351420
1617	NC_011274	ATG	2	6	92828	92833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351420
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1620	NC_011274	GTG	2	6	92888	92893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351420
1621	NC_011274	CTT	2	6	92911	92916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351420
1622	NC_011274	CGG	2	6	92920	92925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351420
1623	NC_011274	TTA	2	6	93054	93059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351420
1624	NC_011274	TAA	2	6	93073	93078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351420
1625	NC_011274	GCA	2	6	93339	93344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351421
1626	NC_011274	CGC	2	6	93467	93472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351421
1627	NC_011274	GAGC	2	8	93518	93525	25 %	0 %	50 %	25 %	205351421
1628	NC_011274	TAAT	2	8	93530	93537	50 %	50 %	0 %	0 %	205351421
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1738	NC_011274	TAAA	2	8	100654	100661	75 %	25 %	0 %	0 %	205351427
1739	NC_011274	GTC	2	6	100665	100670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351427
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1742	NC_011274	CGA	2	6	100751	100756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351427
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1747	NC_011274	CAG	3	9	101236	101244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351428
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1749	NC_011274	GCG	2	6	101363	101368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351428
1750	NC_011274	TAA	2	6	101453	101458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351428
1751	NC_011274	AAG	2	6	101712	101717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351428
1752	NC_011274	TTG	2	6	101740	101745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351428
1753	NC_011274	ACGC	2	8	101802	101809	25 %	0 %	25 %	50 %	205351428
1754	NC_011274	TAA	2	6	101922	101927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351428
1755	NC_011274	TCG	2	6	101938	101943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351428
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1759	NC_011274	AC	3	6	102346	102351	50 %	0 %	0 %	50 %	205351429
1760	NC_011274	CG	3	6	102447	102452	0 %	0 %	50 %	50 %	205351430
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1763	NC_011274	GCG	3	9	102641	102649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351430
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1768	NC_011274	TCATGG	2	12	102908	102919	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	205351430
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1782	NC_011274	TAA	2	6	103801	103806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351431
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1784	NC_011274	GCG	2	6	103978	103983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351431
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1789	NC_011274	GAC	2	6	104111	104116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351431
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1864	NC_011274	CCA	2	6	108299	108304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351434
1865	NC_011274	CAGT	2	8	108372	108379	25 %	25 %	25 %	25 %	205351434
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1870	NC_011274	GGC	2	6	108676	108681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351434
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1972	NC_011274	CCGCG	2	10	113315	113324	0 %	0 %	40 %	60 %	205351437
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1987	NC_011274	CG	3	6	114075	114080	0 %	0 %	50 %	50 %	205351437
1988	NC_011274	GCG	2	6	114183	114188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351437
1989	NC_011274	A	7	7	114346	114352	100 %	0 %	0 %	0 %	205351437
1990	NC_011274	GCA	2	6	114443	114448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351437
1991	NC_011274	CAC	2	6	114465	114470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351437
1992	NC_011274	GAT	2	6	114480	114485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351437
1993	NC_011274	CAG	2	6	114528	114533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351437
1994	NC_011274	GCGG	2	8	114536	114543	0 %	0 %	75 %	25 %	205351437
1995	NC_011274	GCG	2	6	114695	114700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351437
1996	NC_011274	GGGGT	2	10	114711	114720	0 %	20 %	80 %	0 %	205351437
1997	NC_011274	TAA	2	6	114782	114787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351437
1998	NC_011274	CGG	2	6	114810	114815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351437
1999	NC_011274	GCA	2	6	114854	114859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351437
2000	NC_011274	GCG	2	6	114941	114946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351437

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