MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011274	TC	3	6	61011	61016	0 %	50 %	0 %	50 %	205351395
1002	NC_011274	CTG	2	6	61102	61107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351395
1003	NC_011274	CTG	2	6	61130	61135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351395
1004	NC_011274	CTGC	2	8	61142	61149	0 %	25 %	25 %	50 %	205351395
1005	NC_011274	TCA	2	6	61189	61194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351395
1006	NC_011274	TGC	2	6	61330	61335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351395
1007	NC_011274	CGG	2	6	61418	61423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351395
1008	NC_011274	AAT	2	6	61431	61436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351395
1009	NC_011274	A	6	6	61498	61503	100 %	0 %	0 %	0 %	205351395
1010	NC_011274	CTT	2	6	61545	61550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351395
1011	NC_011274	CGA	2	6	61577	61582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351395
1012	NC_011274	CCA	2	6	61613	61618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351395
1013	NC_011274	TTC	2	6	61678	61683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351396
1014	NC_011274	ATT	2	6	61726	61731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351396
1015	NC_011274	CGA	2	6	61737	61742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1016	NC_011274	ACCA	2	8	61778	61785	50 %	0 %	0 %	50 %	205351396
1017	NC_011274	GGT	2	6	61816	61821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351396
1018	NC_011274	AAT	2	6	61888	61893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351396
1019	NC_011274	CAA	2	6	61989	61994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351396
1020	NC_011274	CATT	2	8	62003	62010	25 %	50 %	0 %	25 %	205351396
1021	NC_011274	CAA	2	6	62037	62042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351396
1022	NC_011274	ATA	2	6	62089	62094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351396
1023	NC_011274	GGT	3	9	62118	62126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351396
1024	NC_011274	TGG	2	6	62162	62167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351396
1025	NC_011274	CTG	3	9	62176	62184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1026	NC_011274	CAGCGC	2	12	62188	62199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351396
1027	NC_011274	CAG	2	6	62221	62226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1028	NC_011274	TGG	2	6	62235	62240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351396
1029	NC_011274	TGC	2	6	62261	62266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1030	NC_011274	GC	3	6	62270	62275	0 %	0 %	50 %	50 %	205351396
1031	NC_011274	TTG	2	6	62336	62341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351396
1032	NC_011274	TAA	2	6	62349	62354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351396
1033	NC_011274	AAT	2	6	62377	62382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351396
1034	NC_011274	T	6	6	62437	62442	0 %	100 %	0 %	0 %	205351396
1035	NC_011274	T	7	7	62444	62450	0 %	100 %	0 %	0 %	205351396
1036	NC_011274	GCG	2	6	62451	62456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351396
1037	NC_011274	AAG	2	6	62465	62470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351396
1038	NC_011274	TGG	2	6	62489	62494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351396
1039	NC_011274	GCG	2	6	62542	62547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351396
1040	NC_011274	ACA	2	6	62619	62624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351396
1041	NC_011274	GCT	2	6	62652	62657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1042	NC_011274	GCG	2	6	62701	62706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351396
1043	NC_011274	ACA	2	6	62715	62720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351396
1044	NC_011274	CAG	3	9	62725	62733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1045	NC_011274	CGT	2	6	62922	62927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351396
1046	NC_011274	CGC	2	6	62934	62939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351396
1047	NC_011274	AT	3	6	62945	62950	50 %	50 %	0 %	0 %	205351396
1048	NC_011274	TCAA	2	8	63044	63051	50 %	25 %	0 %	25 %	205351396
1049	NC_011274	TGG	2	6	63210	63215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351396
1050	NC_011274	CAG	2	6	63516	63521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1051	NC_011274	GCC	2	6	63568	63573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1052	NC_011274	CCG	2	6	63581	63586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1053	NC_011274	CCG	2	6	63593	63598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1054	NC_011274	TCA	2	6	63638	63643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351397
1055	NC_011274	GCC	2	6	63664	63669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1056	NC_011274	CAG	3	9	63696	63704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1057	NC_011274	CCA	2	6	63740	63745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351397
1058	NC_011274	CCA	2	6	63824	63829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351397
1059	NC_011274	CGC	2	6	63830	63835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1060	NC_011274	CAG	2	6	63870	63875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1061	NC_011274	CGGCG	2	10	63876	63885	0 %	0 %	60 %	40 %	205351397
1062	NC_011274	GCA	3	9	63890	63898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1063	NC_011274	CCA	2	6	63902	63907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351397
1064	NC_011274	GTA	2	6	63908	63913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351397
1065	NC_011274	CAC	2	6	63918	63923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351397
1066	NC_011274	T	6	6	63935	63940	0 %	100 %	0 %	0 %	205351397
1067	NC_011274	GC	4	8	64001	64008	0 %	0 %	50 %	50 %	205351397
1068	NC_011274	CGG	2	6	64014	64019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351397
1069	NC_011274	CGC	2	6	64053	64058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1070	NC_011274	CAG	2	6	64074	64079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1071	NC_011274	CGC	2	6	64127	64132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1072	NC_011274	GCC	3	9	64147	64155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1073	NC_011274	AGT	2	6	64184	64189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351397
1074	NC_011274	TCAGCG	2	12	64190	64201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1075	NC_011274	GCC	3	9	64234	64242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1076	NC_011274	CAG	3	9	64245	64253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1077	NC_011274	CAG	2	6	64269	64274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1078	NC_011274	CGCCCA	2	12	64295	64306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	205351397
1079	NC_011274	GCG	2	6	64319	64324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351397
1080	NC_011274	CAGCGC	2	12	64425	64436	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351397
1081	NC_011274	GC	3	6	64466	64471	0 %	0 %	50 %	50 %	205351397
1082	NC_011274	CGT	2	6	64508	64513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1083	NC_011274	CAG	2	6	64521	64526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1084	NC_011274	GCC	2	6	64578	64583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351397
1085	NC_011274	GCA	3	9	64595	64603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1086	NC_011274	CTT	2	6	64617	64622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351397
1087	NC_011274	GCCA	2	8	64630	64637	25 %	0 %	25 %	50 %	205351397
1088	NC_011274	CAG	4	12	64638	64649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1089	NC_011274	CAG	2	6	64656	64661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351397
1090	NC_011274	ATG	2	6	64663	64668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351397
1091	NC_011274	GCCTG	2	10	64669	64678	0 %	20 %	40 %	40 %	205351397
1092	NC_011274	TCA	2	6	64754	64759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351398
1093	NC_011274	GCGCG	2	10	64823	64832	0 %	0 %	60 %	40 %	205351398
1094	NC_011274	CAG	2	6	64866	64871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1095	NC_011274	GCG	2	6	64934	64939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351398
1096	NC_011274	GCC	2	6	64981	64986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351398
1097	NC_011274	GCC	2	6	65005	65010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351398
1098	NC_011274	GCTG	2	8	65015	65022	0 %	25 %	50 %	25 %	205351398
1099	NC_011274	CGC	2	6	65027	65032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351398
1100	NC_011274	CAC	2	6	65046	65051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351398
1101	NC_011274	CTTCCA	2	12	65063	65074	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	205351398
1102	NC_011274	GGC	2	6	65091	65096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351398
1103	NC_011274	CGC	2	6	65154	65159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351398
1104	NC_011274	CGT	2	6	65222	65227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1105	NC_011274	CAG	2	6	65310	65315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1106	NC_011274	GGC	2	6	65324	65329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351398
1107	NC_011274	CCT	2	6	65344	65349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351398
1108	NC_011274	CACCGG	2	12	65379	65390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351398
1109	NC_011274	CCG	2	6	65420	65425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351398
1110	NC_011274	CCG	2	6	65576	65581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351398
1111	NC_011274	CTG	2	6	65586	65591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1112	NC_011274	CCA	2	6	65639	65644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351398
1113	NC_011274	CCA	2	6	65780	65785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351398
1114	NC_011274	GGA	2	6	65823	65828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351398
1115	NC_011274	CAG	2	6	65871	65876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1116	NC_011274	GGT	2	6	65895	65900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351398
1117	NC_011274	GTGCAG	2	12	65910	65921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	205351398
1118	NC_011274	ACGT	2	8	65922	65929	25 %	25 %	25 %	25 %	205351398
1119	NC_011274	T	6	6	65937	65942	0 %	100 %	0 %	0 %	205351398
1120	NC_011274	CAG	2	6	66027	66032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1121	NC_011274	CCAG	2	8	66047	66054	25 %	0 %	25 %	50 %	205351398
1122	NC_011274	TGG	2	6	66077	66082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351398
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1124	NC_011274	CGA	2	6	66212	66217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351398
1125	NC_011274	CCA	2	6	66224	66229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351398
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1231	NC_011274	CGTGC	2	10	71241	71250	0 %	20 %	40 %	40 %	205351404
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1233	NC_011274	CTGA	2	8	71353	71360	25 %	25 %	25 %	25 %	205351404
1234	NC_011274	TTGAT	2	10	71411	71420	20 %	60 %	20 %	0 %	205351404
1235	NC_011274	GGC	2	6	71514	71519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351404
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1240	NC_011274	GC	3	6	71852	71857	0 %	0 %	50 %	50 %	205351404
1241	NC_011274	TGA	2	6	71888	71893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351404
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1243	NC_011274	GCA	2	6	71944	71949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351404
1244	NC_011274	ATT	2	6	71965	71970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351404
1245	NC_011274	ACCGC	2	10	71971	71980	20 %	0 %	20 %	60 %	205351404
1246	NC_011274	TG	3	6	72001	72006	0 %	50 %	50 %	0 %	205351404
1247	NC_011274	TGC	2	6	72117	72122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351404
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1374	NC_011274	GGCG	2	8	79095	79102	0 %	0 %	75 %	25 %	205351409
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1498	NC_011274	ATG	3	9	87196	87204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351415
1499	NC_011274	CCA	2	6	87308	87313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351415
1500	NC_011274	CGA	2	6	87326	87331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351415

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