MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011274	T	6	6	31610	31615	0 %	100 %	0 %	0 %	205351371
502	NC_011274	GGC	2	6	31641	31646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351371
503	NC_011274	GGGCG	2	10	31677	31686	0 %	0 %	80 %	20 %	205351371
504	NC_011274	GCC	2	6	31798	31803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351371
505	NC_011274	AAG	2	6	31808	31813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351371
506	NC_011274	AGC	2	6	31819	31824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351371
507	NC_011274	ATG	2	6	31835	31840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351371
508	NC_011274	CTC	2	6	31843	31848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351371
509	NC_011274	GCA	2	6	31866	31871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351371
510	NC_011274	GTC	2	6	31900	31905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351371
511	NC_011274	TGCGT	2	10	32056	32065	0 %	40 %	40 %	20 %	205351372
512	NC_011274	ACCG	2	8	32114	32121	25 %	0 %	25 %	50 %	205351372
513	NC_011274	GTT	2	6	32145	32150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351372
514	NC_011274	AGGC	2	8	32152	32159	25 %	0 %	50 %	25 %	205351372
515	NC_011274	ATA	2	6	32197	32202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351372
516	NC_011274	TAT	2	6	32222	32227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351372
517	NC_011274	ATT	2	6	32281	32286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351372
518	NC_011274	AAAAG	2	10	32450	32459	80 %	0 %	20 %	0 %	205351373
519	NC_011274	A	7	7	32470	32476	100 %	0 %	0 %	0 %	205351373
520	NC_011274	TTA	2	6	32503	32508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351373
521	NC_011274	CAG	2	6	32549	32554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351373
522	NC_011274	CCTG	2	8	32588	32595	0 %	25 %	25 %	50 %	205351373
523	NC_011274	AACA	2	8	32604	32611	75 %	0 %	0 %	25 %	205351373
524	NC_011274	TGT	2	6	32629	32634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351373
525	NC_011274	TCG	2	6	32640	32645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351373
526	NC_011274	CAG	2	6	32646	32651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351373
527	NC_011274	AAG	2	6	32655	32660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351373
528	NC_011274	ATC	2	6	32719	32724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351373
529	NC_011274	CGCA	2	8	32778	32785	25 %	0 %	25 %	50 %	205351373
530	NC_011274	T	6	6	32805	32810	0 %	100 %	0 %	0 %	205351373
531	NC_011274	ATT	2	6	32824	32829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351373
532	NC_011274	TAAA	2	8	32848	32855	75 %	25 %	0 %	0 %	205351373
533	NC_011274	TTA	2	6	32860	32865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351373
534	NC_011274	A	6	6	33263	33268	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
535	NC_011274	A	7	7	33273	33279	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
536	NC_011274	TTA	2	6	33313	33318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351374
537	NC_011274	GCG	2	6	33339	33344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351374
538	NC_011274	GCG	2	6	33366	33371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351374
539	NC_011274	TC	3	6	33373	33378	0 %	50 %	0 %	50 %	205351374
540	NC_011274	CTT	2	6	33384	33389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351374
541	NC_011274	TTAT	2	8	33417	33424	25 %	75 %	0 %	0 %	205351374
542	NC_011274	TGA	2	6	33613	33618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351374
543	NC_011274	AT	3	6	33623	33628	50 %	50 %	0 %	0 %	205351374
544	NC_011274	A	7	7	33648	33654	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
545	NC_011274	TCA	2	6	33703	33708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351374
546	NC_011274	GAT	2	6	33734	33739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351374
547	NC_011274	TGTTTG	2	12	33773	33784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351374
548	NC_011274	A	6	6	33790	33795	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
549	NC_011274	TTGG	2	8	33801	33808	0 %	50 %	50 %	0 %	205351374
550	NC_011274	A	6	6	33814	33819	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
551	NC_011274	TA	3	6	33826	33831	50 %	50 %	0 %	0 %	205351374
552	NC_011274	TGC	2	6	33839	33844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351374
553	NC_011274	TCT	2	6	33876	33881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351374
554	NC_011274	AGT	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351374
555	NC_011274	TTA	2	6	33947	33952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351374
556	NC_011274	GTT	2	6	33981	33986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351374
557	NC_011274	A	6	6	33988	33993	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
558	NC_011274	GCG	2	6	34046	34051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351374
559	NC_011274	TATAA	2	10	34053	34062	60 %	40 %	0 %	0 %	205351374
560	NC_011274	TAC	2	6	34066	34071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351374
561	NC_011274	TGA	2	6	34079	34084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351374
562	NC_011274	AAT	2	6	34085	34090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351374
563	NC_011274	A	6	6	34152	34157	100 %	0 %	0 %	0 %	205351374
564	NC_011274	CTTT	2	8	34181	34188	0 %	75 %	0 %	25 %	205351374
565	NC_011274	AGC	2	6	34201	34206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351374
566	NC_011274	GAAG	2	8	34221	34228	50 %	0 %	50 %	0 %	205351374
567	NC_011274	AAT	2	6	34313	34318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351375
568	NC_011274	AT	3	6	34322	34327	50 %	50 %	0 %	0 %	205351375
569	NC_011274	CTT	2	6	34335	34340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351375
570	NC_011274	T	7	7	34339	34345	0 %	100 %	0 %	0 %	205351375
571	NC_011274	AGA	2	6	34348	34353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351375
572	NC_011274	ATA	2	6	34382	34387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351375
573	NC_011274	A	7	7	34428	34434	100 %	0 %	0 %	0 %	205351375
574	NC_011274	CGC	2	6	34463	34468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351375
575	NC_011274	CTT	2	6	34514	34519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351375
576	NC_011274	C	6	6	34521	34526	0 %	0 %	0 %	100 %	205351375
577	NC_011274	GTT	2	6	34542	34547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351375
578	NC_011274	T	6	6	34546	34551	0 %	100 %	0 %	0 %	205351375
579	NC_011274	ATAA	2	8	34552	34559	75 %	25 %	0 %	0 %	205351375
580	NC_011274	TTG	2	6	34564	34569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351375
581	NC_011274	AT	3	6	34583	34588	50 %	50 %	0 %	0 %	205351375
582	NC_011274	ATC	2	6	34622	34627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351375
583	NC_011274	T	6	6	34643	34648	0 %	100 %	0 %	0 %	205351375
584	NC_011274	GTGC	2	8	34675	34682	0 %	25 %	50 %	25 %	205351375
585	NC_011274	TTAA	2	8	34685	34692	50 %	50 %	0 %	0 %	205351375
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587	NC_011274	AT	3	6	35329	35334	50 %	50 %	0 %	0 %	205351376
588	NC_011274	AAC	2	6	35336	35341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351376
589	NC_011274	TGGA	2	8	35437	35444	25 %	25 %	50 %	0 %	205351376
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592	NC_011274	ATG	2	6	35513	35518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351376
593	NC_011274	TG	4	8	35544	35551	0 %	50 %	50 %	0 %	205351376
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595	NC_011274	TAT	2	6	35676	35681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351376
596	NC_011274	TCCTG	2	10	35689	35698	0 %	40 %	20 %	40 %	205351376
597	NC_011274	GCA	2	6	35700	35705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351376
598	NC_011274	GGA	2	6	35718	35723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351376
599	NC_011274	GGT	2	6	35789	35794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351376
600	NC_011274	CTT	2	6	35813	35818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351376
601	NC_011274	TCT	2	6	35928	35933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351376
602	NC_011274	TTC	2	6	35957	35962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351376
603	NC_011274	TAT	2	6	36048	36053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351376
604	NC_011274	ATT	2	6	36107	36112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351376
605	NC_011274	CGC	2	6	36119	36124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351376
606	NC_011274	GC	3	6	36137	36142	0 %	0 %	50 %	50 %	205351376
607	NC_011274	CAA	2	6	36204	36209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351376
608	NC_011274	TAT	2	6	36282	36287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351376
609	NC_011274	TTA	2	6	36328	36333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351376
610	NC_011274	GAT	3	9	36343	36351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351376
611	NC_011274	GGGA	2	8	36381	36388	25 %	0 %	75 %	0 %	205351376
612	NC_011274	GCA	2	6	36423	36428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351376
613	NC_011274	TTG	2	6	36434	36439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351376
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615	NC_011274	CGA	2	6	36698	36703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351376
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