MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011274	CAGCGC	2	12	477364	477375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351737
8002	NC_011274	CGACG	2	10	477448	477457	20 %	0 %	40 %	40 %	205351737
8003	NC_011274	CGG	2	6	477468	477473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351737
8004	NC_011274	CAGCGC	2	12	477688	477699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351737
8005	NC_011274	CGC	2	6	477708	477713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351737
8006	NC_011274	AGC	2	6	477716	477721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351737
8007	NC_011274	CTG	2	6	477841	477846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351737
8008	NC_011274	CGCC	2	8	477918	477925	0 %	0 %	25 %	75 %	205351737
8009	NC_011274	TGGC	2	8	477957	477964	0 %	25 %	50 %	25 %	205351737
8010	NC_011274	GCC	2	6	477985	477990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351738
8011	NC_011274	GACAA	2	10	478018	478027	60 %	0 %	20 %	20 %	205351738
8012	NC_011274	CAT	2	6	478092	478097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351738
8013	NC_011274	CAG	2	6	478161	478166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351738
8014	NC_011274	CCA	2	6	478177	478182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351738
8015	NC_011274	GCC	2	6	478201	478206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351738
8016	NC_011274	GCTG	2	8	478254	478261	0 %	25 %	50 %	25 %	205351738
8017	NC_011274	CGG	2	6	478380	478385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351738
8018	NC_011274	TCA	2	6	478406	478411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351738
8019	NC_011274	ATAA	2	8	478440	478447	75 %	25 %	0 %	0 %	205351738
8020	NC_011274	CGA	2	6	478496	478501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351738
8021	NC_011274	CAG	3	9	478566	478574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351738
8022	NC_011274	CGG	2	6	478580	478585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351738
8023	NC_011274	ACC	2	6	478645	478650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351738
8024	NC_011274	CCAGCA	2	12	478739	478750	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	205351738
8025	NC_011274	AGC	3	9	478756	478764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351738
8026	NC_011274	CAG	2	6	478767	478772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351738
8027	NC_011274	CAT	2	6	478843	478848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351739
8028	NC_011274	CG	3	6	478882	478887	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
8029	NC_011274	CA	3	6	478939	478944	50 %	0 %	0 %	50 %	205351739
8030	NC_011274	CAG	2	6	479051	479056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351739
8031	NC_011274	TGT	2	6	479059	479064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351739
8032	NC_011274	GTG	2	6	479069	479074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351739
8033	NC_011274	CG	3	6	479090	479095	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
8034	NC_011274	CACCG	2	10	479099	479108	20 %	0 %	20 %	60 %	205351739
8035	NC_011274	CCA	2	6	479122	479127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351739
8036	NC_011274	GA	3	6	479163	479168	50 %	0 %	50 %	0 %	205351739
8037	NC_011274	CGG	2	6	479191	479196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351739
8038	NC_011274	GC	3	6	479224	479229	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
8039	NC_011274	CCA	2	6	479368	479373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351739
8040	NC_011274	TAT	2	6	479374	479379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351739
8041	NC_011274	CG	3	6	479428	479433	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
8042	NC_011274	CG	3	6	479447	479452	0 %	0 %	50 %	50 %	205351739
8043	NC_011274	TGC	2	6	479469	479474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351739
8044	NC_011274	GCC	2	6	479477	479482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351739
8045	NC_011274	GCG	2	6	479505	479510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351739
8046	NC_011274	ATTA	2	8	479555	479562	50 %	50 %	0 %	0 %	205351739
8047	NC_011274	GCT	2	6	479572	479577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351739
8048	NC_011274	CAC	2	6	479645	479650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351739
8049	NC_011274	CGCA	2	8	479744	479751	25 %	0 %	25 %	50 %	205351739
8050	NC_011274	CGT	2	6	479756	479761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351739
8051	NC_011274	AG	3	6	479819	479824	50 %	0 %	50 %	0 %	205351739
8052	NC_011274	CAC	2	6	479834	479839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351739
8053	NC_011274	TCA	2	6	479923	479928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351739
8054	NC_011274	GGC	2	6	480046	480051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351740
8055	NC_011274	TCG	2	6	480062	480067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351740
8056	NC_011274	CTT	2	6	480129	480134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351740
8057	NC_011274	CAG	2	6	480139	480144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351740
8058	NC_011274	GCG	2	6	480177	480182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351740
8059	NC_011274	GC	3	6	480219	480224	0 %	0 %	50 %	50 %	205351740
8060	NC_011274	GGCC	2	8	480244	480251	0 %	0 %	50 %	50 %	205351740
8061	NC_011274	AGA	2	6	480252	480257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351740
8062	NC_011274	TTA	2	6	480332	480337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351740
8063	NC_011274	GCA	2	6	480447	480452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351740
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8065	NC_011274	CAG	2	6	480553	480558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351740
8066	NC_011274	TGT	2	6	480564	480569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351740
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8068	NC_011274	GTT	2	6	480610	480615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351740
8069	NC_011274	GCG	2	6	480635	480640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351740
8070	NC_011274	CAG	2	6	480658	480663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351740
8071	NC_011274	CGG	3	9	480669	480677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351740
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8073	NC_011274	GGC	2	6	480692	480697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351740
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8081	NC_011274	CAG	2	6	481479	481484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351741
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8086	NC_011274	CGA	2	6	481663	481668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351741
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8091	NC_011274	TGT	2	6	482078	482083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351742
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8094	NC_011274	CAG	2	6	482140	482145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351742
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8098	NC_011274	GCG	2	6	482342	482347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351742
8099	NC_011274	GC	3	6	482353	482358	0 %	0 %	50 %	50 %	205351742
8100	NC_011274	CCGAC	2	10	482393	482402	20 %	0 %	20 %	60 %	205351742
8101	NC_011274	ACC	2	6	482437	482442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351742
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8105	NC_011274	CGCT	2	8	482665	482672	0 %	25 %	25 %	50 %	205351742
8106	NC_011274	GGA	2	6	482706	482711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351742
8107	NC_011274	CA	3	6	482742	482747	50 %	0 %	0 %	50 %	205351742
8108	NC_011274	GTGGC	2	10	482795	482804	0 %	20 %	60 %	20 %	205351742
8109	NC_011274	TCA	2	6	482811	482816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351742
8110	NC_011274	TGG	2	6	482843	482848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351742
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8117	NC_011274	GGGC	2	8	483152	483159	0 %	0 %	75 %	25 %	205351743
8118	NC_011274	ACC	2	6	483160	483165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351743
8119	NC_011274	TCG	2	6	483200	483205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351743
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8484	NC_011274	CGC	2	6	502576	502581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351760
8485	NC_011274	GCA	2	6	502612	502617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351760
8486	NC_011274	GCG	3	9	502659	502667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351760
8487	NC_011274	TGT	2	6	502776	502781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351760
8488	NC_011274	GTC	2	6	502836	502841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351760
8489	NC_011274	TGAA	2	8	502860	502867	50 %	25 %	25 %	0 %	205351760
8490	NC_011274	GAA	2	6	502874	502879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351760
8491	NC_011274	TCG	2	6	503043	503048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351760
8492	NC_011274	GCG	2	6	503051	503056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351760
8493	NC_011274	CTG	2	6	503057	503062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351760
8494	NC_011274	GTG	2	6	503105	503110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351760
8495	NC_011274	CGA	2	6	503113	503118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351760
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8497	NC_011274	TGG	2	6	503432	503437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351761
8498	NC_011274	A	7	7	503518	503524	100 %	0 %	0 %	0 %	205351761
8499	NC_011274	GAAG	2	8	503541	503548	50 %	0 %	50 %	0 %	205351761
8500	NC_011274	GC	4	8	503664	503671	0 %	0 %	50 %	50 %	205351761

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