MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011274	TCA	2	6	355256	355261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351636
6002	NC_011274	AGC	2	6	355284	355289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351636
6003	NC_011274	ATC	2	6	355313	355318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351636
6004	NC_011274	CAT	2	6	355329	355334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351636
6005	NC_011274	GC	3	6	355341	355346	0 %	0 %	50 %	50 %	205351636
6006	NC_011274	CCG	2	6	355478	355483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351636
6007	NC_011274	CTT	2	6	355560	355565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351636
6008	NC_011274	CTG	2	6	355600	355605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351636
6009	NC_011274	GCT	4	12	355636	355647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351636
6010	NC_011274	A	6	6	355693	355698	100 %	0 %	0 %	0 %	205351636
6011	NC_011274	GCGA	2	8	355956	355963	25 %	0 %	50 %	25 %	205351637
6012	NC_011274	T	7	7	355995	356001	0 %	100 %	0 %	0 %	205351637
6013	NC_011274	CCATTG	2	12	356045	356056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	205351637
6014	NC_011274	GC	3	6	356104	356109	0 %	0 %	50 %	50 %	205351637
6015	NC_011274	CGTA	2	8	356118	356125	25 %	25 %	25 %	25 %	205351637
6016	NC_011274	CTGG	2	8	356277	356284	0 %	25 %	50 %	25 %	205351637
6017	NC_011274	TGAC	2	8	356288	356295	25 %	25 %	25 %	25 %	205351637
6018	NC_011274	TTA	2	6	356450	356455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351637
6019	NC_011274	CCG	2	6	356525	356530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351637
6020	NC_011274	TAT	2	6	356624	356629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351637
6021	NC_011274	GGA	2	6	356712	356717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351637
6022	NC_011274	ATT	2	6	356746	356751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351637
6023	NC_011274	CGT	2	6	356776	356781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351637
6024	NC_011274	TTAAA	2	10	356825	356834	60 %	40 %	0 %	0 %	205351637
6025	NC_011274	TAAA	2	8	356882	356889	75 %	25 %	0 %	0 %	205351637
6026	NC_011274	ACC	2	6	356902	356907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351637
6027	NC_011274	GCG	2	6	356942	356947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351637
6028	NC_011274	TGG	2	6	356954	356959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351637
6029	NC_011274	GCT	2	6	356973	356978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351637
6030	NC_011274	AT	3	6	357221	357226	50 %	50 %	0 %	0 %	205351638
6031	NC_011274	CAA	2	6	357318	357323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351638
6032	NC_011274	TA	3	6	357325	357330	50 %	50 %	0 %	0 %	205351638
6033	NC_011274	T	6	6	357413	357418	0 %	100 %	0 %	0 %	205351638
6034	NC_011274	CTGA	2	8	357543	357550	25 %	25 %	25 %	25 %	205351638
6035	NC_011274	GGA	2	6	357572	357577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351638
6036	NC_011274	CGC	2	6	357587	357592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351638
6037	NC_011274	GCA	2	6	357596	357601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351638
6038	NC_011274	GGC	3	9	357633	357641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351638
6039	NC_011274	GCA	2	6	357659	357664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351638
6040	NC_011274	TCG	2	6	357676	357681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351638
6041	NC_011274	TTCG	2	8	357689	357696	0 %	50 %	25 %	25 %	205351638
6042	NC_011274	TTA	2	6	357723	357728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351638
6043	NC_011274	CGT	2	6	357774	357779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351638
6044	NC_011274	CGA	2	6	357821	357826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351638
6045	NC_011274	GC	3	6	357828	357833	0 %	0 %	50 %	50 %	205351638
6046	NC_011274	CG	3	6	357882	357887	0 %	0 %	50 %	50 %	205351638
6047	NC_011274	CCG	2	6	357896	357901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351638
6048	NC_011274	CG	3	6	358051	358056	0 %	0 %	50 %	50 %	205351638
6049	NC_011274	GCTG	2	8	358066	358073	0 %	25 %	50 %	25 %	205351638
6050	NC_011274	CGT	2	6	358082	358087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351638
6051	NC_011274	GAG	2	6	358092	358097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351638
6052	NC_011274	GAA	2	6	358245	358250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351638
6053	NC_011274	TGCC	2	8	358322	358329	0 %	25 %	25 %	50 %	205351638
6054	NC_011274	TTC	2	6	358390	358395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351639
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6056	NC_011274	GCC	2	6	358460	358465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351639
6057	NC_011274	A	6	6	358636	358641	100 %	0 %	0 %	0 %	205351639
6058	NC_011274	CCG	2	6	358668	358673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351639
6059	NC_011274	TGA	2	6	358690	358695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351639
6060	NC_011274	GCA	2	6	358735	358740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351639
6061	NC_011274	TAA	2	6	358744	358749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351639
6062	NC_011274	GCT	2	6	358846	358851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351639
6063	NC_011274	GGC	2	6	358860	358865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351639
6064	NC_011274	GCG	2	6	358892	358897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351639
6065	NC_011274	CAT	2	6	358922	358927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351639
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6069	NC_011274	TTG	2	6	359338	359343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351640
6070	NC_011274	GCCA	2	8	359402	359409	25 %	0 %	25 %	50 %	205351640
6071	NC_011274	GCCA	2	8	359439	359446	25 %	0 %	25 %	50 %	205351640
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6074	NC_011274	GCGTT	2	10	359618	359627	0 %	40 %	40 %	20 %	205351640
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6084	NC_011274	CCAT	2	8	360148	360155	25 %	25 %	0 %	50 %	205351640
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6089	NC_011274	GTA	2	6	360268	360273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351640
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6091	NC_011274	T	7	7	360349	360355	0 %	100 %	0 %	0 %	205351640
6092	NC_011274	CGT	2	6	360862	360867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351641
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6105	NC_011274	GCG	2	6	361570	361575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351642
6106	NC_011274	GC	3	6	361605	361610	0 %	0 %	50 %	50 %	205351642
6107	NC_011274	TGA	2	6	361615	361620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351642
6108	NC_011274	GAT	3	9	361638	361646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351642
6109	NC_011274	CGG	2	6	361673	361678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351642
6110	NC_011274	GCA	2	6	361718	361723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351642
6111	NC_011274	GCC	2	6	361797	361802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351642
6112	NC_011274	GCAGGC	2	12	361835	361846	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	205351642
6113	NC_011274	GCG	2	6	361993	361998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351642
6114	NC_011274	CGCGC	2	10	362048	362057	0 %	0 %	40 %	60 %	205351642
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6117	NC_011274	GGT	2	6	362288	362293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351642
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6119	NC_011274	GAA	2	6	362505	362510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351642
6120	NC_011274	ACA	2	6	362526	362531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351642
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6122	NC_011274	TGG	2	6	362862	362867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351643
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6234	NC_011274	GCCA	2	8	371872	371879	25 %	0 %	25 %	50 %	205351649
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6239	NC_011274	ATGA	2	8	372007	372014	50 %	25 %	25 %	0 %	205351649
6240	NC_011274	GAC	2	6	372071	372076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351649
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6242	NC_011274	GCG	4	12	372121	372132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351649
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6489	NC_011274	GGC	2	6	391376	391381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351667
6490	NC_011274	CGT	2	6	391436	391441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351667
6491	NC_011274	CGG	2	6	391498	391503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351667
6492	NC_011274	GCA	2	6	391546	391551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351667
6493	NC_011274	CG	3	6	391556	391561	0 %	0 %	50 %	50 %	205351667
6494	NC_011274	GGC	2	6	391583	391588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351667
6495	NC_011274	ATT	2	6	391622	391627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351667
6496	NC_011274	CGCGAT	2	12	391634	391645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205351667
6497	NC_011274	GAA	2	6	391670	391675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351667
6498	NC_011274	GCCA	2	8	391681	391688	25 %	0 %	25 %	50 %	205351667
6499	NC_011274	GC	3	6	391705	391710	0 %	0 %	50 %	50 %	205351667
6500	NC_011274	CAGC	2	8	391788	391795	25 %	0 %	25 %	50 %	205351667

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