MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011274	GC	3	6	249971	249976	0 %	0 %	50 %	50 %	205351549
4502	NC_011274	T	8	8	249992	249999	0 %	100 %	0 %	0 %	205351549
4503	NC_011274	TCT	2	6	250030	250035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351549
4504	NC_011274	GC	3	6	250076	250081	0 %	0 %	50 %	50 %	205351549
4505	NC_011274	T	6	6	250084	250089	0 %	100 %	0 %	0 %	205351549
4506	NC_011274	TTA	2	6	250126	250131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351549
4507	NC_011274	G	6	6	250141	250146	0 %	0 %	100 %	0 %	205351549
4508	NC_011274	TGCC	2	8	250174	250181	0 %	25 %	25 %	50 %	205351549
4509	NC_011274	GC	3	6	250199	250204	0 %	0 %	50 %	50 %	205351549
4510	NC_011274	TGC	2	6	250296	250301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4511	NC_011274	GC	3	6	250325	250330	0 %	0 %	50 %	50 %	205351549
4512	NC_011274	AGG	2	6	250341	250346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351549
4513	NC_011274	ATT	2	6	250359	250364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351549
4514	NC_011274	AGG	2	6	250403	250408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351549
4515	NC_011274	GTT	2	6	250410	250415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351549
4516	NC_011274	TA	3	6	250472	250477	50 %	50 %	0 %	0 %	205351549
4517	NC_011274	AGC	2	6	250523	250528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4518	NC_011274	GCA	2	6	250545	250550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4519	NC_011274	AGA	2	6	250554	250559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351549
4520	NC_011274	GGT	2	6	250566	250571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351549
4521	NC_011274	AGT	2	6	250575	250580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351549
4522	NC_011274	GCA	2	6	250595	250600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4523	NC_011274	T	6	6	250642	250647	0 %	100 %	0 %	0 %	205351549
4524	NC_011274	CGA	2	6	250676	250681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4525	NC_011274	CTG	2	6	250735	250740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4526	NC_011274	CAT	2	6	250767	250772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351549
4527	NC_011274	GC	3	6	250811	250816	0 %	0 %	50 %	50 %	205351549
4528	NC_011274	GCT	2	6	250851	250856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351549
4529	NC_011274	TGA	2	6	250877	250882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351549
4530	NC_011274	TTA	2	6	250901	250906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351549
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4532	NC_011274	T	6	6	250944	250949	0 %	100 %	0 %	0 %	205351549
4533	NC_011274	TCA	2	6	250987	250992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351549
4534	NC_011274	AAT	2	6	251225	251230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351550
4535	NC_011274	T	6	6	251269	251274	0 %	100 %	0 %	0 %	205351550
4536	NC_011274	CCG	2	6	251346	251351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351550
4537	NC_011274	CTT	2	6	251439	251444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351550
4538	NC_011274	CG	3	6	251474	251479	0 %	0 %	50 %	50 %	205351550
4539	NC_011274	ATG	2	6	251501	251506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351550
4540	NC_011274	CGC	2	6	251535	251540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351550
4541	NC_011274	CGC	2	6	251550	251555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351550
4542	NC_011274	ACG	2	6	251717	251722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351550
4543	NC_011274	CTT	2	6	251730	251735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351550
4544	NC_011274	TCG	2	6	251750	251755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351550
4545	NC_011274	AG	3	6	251836	251841	50 %	0 %	50 %	0 %	205351550
4546	NC_011274	TTC	2	6	251852	251857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351550
4547	NC_011274	GTGA	2	8	251866	251873	25 %	25 %	50 %	0 %	205351550
4548	NC_011274	T	6	6	251889	251894	0 %	100 %	0 %	0 %	205351550
4549	NC_011274	GC	3	6	251907	251912	0 %	0 %	50 %	50 %	205351550
4550	NC_011274	CGGCG	2	10	251985	251994	0 %	0 %	60 %	40 %	205351550
4551	NC_011274	CTG	2	6	252025	252030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351550
4552	NC_011274	AC	3	6	252058	252063	50 %	0 %	0 %	50 %	205351551
4553	NC_011274	GTT	2	6	252101	252106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351551
4554	NC_011274	GCA	2	6	252119	252124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4555	NC_011274	ATT	2	6	252126	252131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351551
4556	NC_011274	GC	3	6	252136	252141	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
4557	NC_011274	TCT	2	6	252169	252174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351551
4558	NC_011274	CAG	2	6	252252	252257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4559	NC_011274	ATGA	2	8	252286	252293	50 %	25 %	25 %	0 %	205351551
4560	NC_011274	TGGG	2	8	252307	252314	0 %	25 %	75 %	0 %	205351551
4561	NC_011274	A	6	6	252316	252321	100 %	0 %	0 %	0 %	205351551
4562	NC_011274	GCG	2	6	252377	252382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351551
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4564	NC_011274	CGG	2	6	252566	252571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351551
4565	NC_011274	CCG	2	6	252616	252621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351551
4566	NC_011274	CG	3	6	252620	252625	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
4567	NC_011274	TGC	2	6	252667	252672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351551
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4569	NC_011274	TCA	2	6	252766	252771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351551
4570	NC_011274	GCA	2	6	252785	252790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
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4572	NC_011274	GTT	2	6	252863	252868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351551
4573	NC_011274	TGAC	2	8	253052	253059	25 %	25 %	25 %	25 %	205351551
4574	NC_011274	CCAG	2	8	253079	253086	25 %	0 %	25 %	50 %	205351551
4575	NC_011274	GC	3	6	253148	253153	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
4576	NC_011274	CGC	3	9	253169	253177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351551
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4582	NC_011274	GCA	2	6	253427	253432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4583	NC_011274	GCA	2	6	253460	253465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4584	NC_011274	GC	3	6	253482	253487	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
4585	NC_011274	GGC	2	6	253520	253525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351551
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4587	NC_011274	CAT	2	6	253587	253592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351551
4588	NC_011274	GTC	2	6	253638	253643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4589	NC_011274	GCAG	2	8	253708	253715	25 %	0 %	50 %	25 %	205351551
4590	NC_011274	AGC	2	6	253744	253749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
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4593	NC_011274	CGC	2	6	253826	253831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351551
4594	NC_011274	CAG	2	6	253872	253877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4595	NC_011274	ACC	2	6	253897	253902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351551
4596	NC_011274	CG	3	6	253956	253961	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
4597	NC_011274	CCA	2	6	253988	253993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351551
4598	NC_011274	CGAG	2	8	254000	254007	25 %	0 %	50 %	25 %	205351551
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4601	NC_011274	TGG	2	6	254119	254124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351551
4602	NC_011274	GGC	2	6	254148	254153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351551
4603	NC_011274	CAG	2	6	254232	254237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4604	NC_011274	CAGA	2	8	254273	254280	50 %	0 %	25 %	25 %	205351551
4605	NC_011274	CAG	2	6	254286	254291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4606	NC_011274	CGTA	2	8	254304	254311	25 %	25 %	25 %	25 %	205351551
4607	NC_011274	ATA	2	6	254342	254347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351551
4608	NC_011274	CAG	2	6	254352	254357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
4609	NC_011274	CGC	2	6	254441	254446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351551
4610	NC_011274	GCC	2	6	254454	254459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351551
4611	NC_011274	TTCGG	2	10	254538	254547	0 %	40 %	40 %	20 %	205351551
4612	NC_011274	CCAG	2	8	254594	254601	25 %	0 %	25 %	50 %	205351551
4613	NC_011274	GC	3	6	254650	254655	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
4614	NC_011274	AGGG	2	8	254685	254692	25 %	0 %	75 %	0 %	205351551
4615	NC_011274	ATT	2	6	254972	254977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351552
4616	NC_011274	CGT	2	6	254978	254983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351552
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4621	NC_011274	GCA	2	6	255215	255220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351552
4622	NC_011274	TTC	2	6	255228	255233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351552
4623	NC_011274	CCTTCG	2	12	255286	255297	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	205351552
4624	NC_011274	GGC	2	6	255312	255317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351552
4625	NC_011274	CT	3	6	255373	255378	0 %	50 %	0 %	50 %	205351552
4626	NC_011274	CGA	2	6	255422	255427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351552
4627	NC_011274	CAC	2	6	255537	255542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351552
4628	NC_011274	AGGC	2	8	255589	255596	25 %	0 %	50 %	25 %	205351552
4629	NC_011274	GTT	2	6	255608	255613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351552
4630	NC_011274	GGT	2	6	255654	255659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351552
4631	NC_011274	T	6	6	255728	255733	0 %	100 %	0 %	0 %	205351552
4632	NC_011274	GC	3	6	256315	256320	0 %	0 %	50 %	50 %	205351553
4633	NC_011274	CAT	2	6	256334	256339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351553
4634	NC_011274	CTGAA	2	10	256381	256390	40 %	20 %	20 %	20 %	205351553
4635	NC_011274	AAGCG	2	10	256445	256454	40 %	0 %	40 %	20 %	205351553
4636	NC_011274	GCT	2	6	256464	256469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351553
4637	NC_011274	TTC	2	6	256485	256490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351553
4638	NC_011274	GCTG	2	8	256501	256508	0 %	25 %	50 %	25 %	205351553
4639	NC_011274	AAGA	2	8	256608	256615	75 %	0 %	25 %	0 %	205351553
4640	NC_011274	AAC	2	6	256746	256751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351553
4641	NC_011274	GAA	2	6	256917	256922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351553
4642	NC_011274	TAA	2	6	256941	256946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351553
4643	NC_011274	ATG	2	6	257258	257263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351554
4644	NC_011274	A	6	6	257270	257275	100 %	0 %	0 %	0 %	205351554
4645	NC_011274	CTGA	2	8	257279	257286	25 %	25 %	25 %	25 %	205351554
4646	NC_011274	GCG	2	6	257345	257350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351554
4647	NC_011274	A	6	6	257351	257356	100 %	0 %	0 %	0 %	205351554
4648	NC_011274	GCT	2	6	257369	257374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351554
4649	NC_011274	GACT	2	8	257437	257444	25 %	25 %	25 %	25 %	205351554
4650	NC_011274	CGC	2	6	257494	257499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351554
4651	NC_011274	GAA	2	6	257546	257551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351554
4652	NC_011274	TCG	2	6	257596	257601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351554
4653	NC_011274	GC	3	6	257648	257653	0 %	0 %	50 %	50 %	205351554
4654	NC_011274	CTG	2	6	257760	257765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351554
4655	NC_011274	GAAA	2	8	257824	257831	75 %	0 %	25 %	0 %	205351554
4656	NC_011274	GAA	2	6	257860	257865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351554
4657	NC_011274	CTG	2	6	257933	257938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351554
4658	NC_011274	GACT	2	8	258007	258014	25 %	25 %	25 %	25 %	205351554
4659	NC_011274	GCA	2	6	258017	258022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351554
4660	NC_011274	TGC	2	6	258028	258033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351554
4661	NC_011274	GCG	2	6	258246	258251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351555
4662	NC_011274	TGGTG	2	10	258349	258358	0 %	40 %	60 %	0 %	205351555
4663	NC_011274	GGT	2	6	258365	258370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351555
4664	NC_011274	CGCC	2	8	258499	258506	0 %	0 %	25 %	75 %	205351555
4665	NC_011274	CTG	2	6	258569	258574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351555
4666	NC_011274	TAA	2	6	258577	258582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351555
4667	NC_011274	TCTG	2	8	258595	258602	0 %	50 %	25 %	25 %	205351555
4668	NC_011274	TTC	2	6	258620	258625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351555
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4671	NC_011274	CGT	2	6	258875	258880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351555
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4679	NC_011274	CGT	2	6	259393	259398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351556
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4681	NC_011274	CTG	2	6	259492	259497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351556
4682	NC_011274	TCG	2	6	259527	259532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351556
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4687	NC_011274	GCA	2	6	259811	259816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351557
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4695	NC_011274	TGA	2	6	260040	260045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351557
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4700	NC_011274	GCA	2	6	260189	260194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351557
4701	NC_011274	TGG	2	6	260325	260330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351557
4702	NC_011274	GTC	2	6	260387	260392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351557
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4706	NC_011274	TCAT	2	8	260531	260538	25 %	50 %	0 %	25 %	205351557
4707	NC_011274	ATGGC	2	10	260617	260626	20 %	20 %	40 %	20 %	205351557
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4714	NC_011274	TGA	2	6	260892	260897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351557
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4718	NC_011274	GTCC	2	8	261417	261424	0 %	25 %	25 %	50 %	205351558
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4722	NC_011274	TG	3	6	261540	261545	0 %	50 %	50 %	0 %	205351558
4723	NC_011274	TAT	2	6	261597	261602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351558
4724	NC_011274	ATA	2	6	261671	261676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351558
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4727	NC_011274	TGA	2	6	261789	261794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351558
4728	NC_011274	AG	3	6	261795	261800	50 %	0 %	50 %	0 %	205351558
4729	NC_011274	ACTTT	2	10	261912	261921	20 %	60 %	0 %	20 %	205351558
4730	NC_011274	CGT	2	6	261994	261999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351558
4731	NC_011274	CGG	2	6	262002	262007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351558
4732	NC_011274	TGA	2	6	262020	262025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351558
4733	NC_011274	T	7	7	262106	262112	0 %	100 %	0 %	0 %	205351559
4734	NC_011274	GCC	2	6	262116	262121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351559
4735	NC_011274	ATT	2	6	262135	262140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351559
4736	NC_011274	CGC	2	6	262194	262199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351559
4737	NC_011274	TGGC	2	8	262216	262223	0 %	25 %	50 %	25 %	205351559
4738	NC_011274	TG	3	6	262229	262234	0 %	50 %	50 %	0 %	205351559
4739	NC_011274	TTG	2	6	262261	262266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351559
4740	NC_011274	ATC	2	6	262274	262279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351559
4741	NC_011274	ACA	2	6	262280	262285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351559
4742	NC_011274	TGG	2	6	262330	262335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351559
4743	NC_011274	CTG	2	6	262348	262353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351559
4744	NC_011274	CGG	2	6	262373	262378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351559
4745	NC_011274	GC	3	6	262461	262466	0 %	0 %	50 %	50 %	205351559
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4985	NC_011274	CG	3	6	275297	275302	0 %	0 %	50 %	50 %	205351569
4986	NC_011274	GGC	2	6	275311	275316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351569
4987	NC_011274	TGA	2	6	275320	275325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351569
4988	NC_011274	TCA	2	6	275333	275338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351569
4989	NC_011274	A	6	6	275359	275364	100 %	0 %	0 %	0 %	205351569
4990	NC_011274	TCG	2	6	275366	275371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351569
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4992	NC_011274	CGG	2	6	275597	275602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351569
4993	NC_011274	TGC	2	6	275638	275643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351569
4994	NC_011274	GCT	2	6	275721	275726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351569
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