MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 2630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	198244353
2	NC_011205	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	198244850
3	NC_011205	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	198242395
4	NC_011205	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	198245613
5	NC_011205	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	198243023
6	NC_011205	GTGAT	2	10	14914	14923	20 %	40 %	40 %	0 %	198245221
7	NC_011205	GGCTG	2	10	18853	18862	0 %	20 %	60 %	20 %	198242422
8	NC_011205	AGAGC	2	10	19374	19383	40 %	0 %	40 %	20 %	198242422
9	NC_011205	CCTGA	2	10	19915	19924	20 %	20 %	20 %	40 %	198242422
10	NC_011205	TACCG	2	10	21052	21061	20 %	20 %	20 %	40 %	198242908
11	NC_011205	GGCCG	2	10	21676	21685	0 %	0 %	60 %	40 %	198242908
12	NC_011205	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	198243657
13	NC_011205	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	198242187
14	NC_011205	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	198242187
15	NC_011205	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	198242340
16	NC_011205	ATCTG	2	10	30967	30976	20 %	40 %	20 %	20 %	198243542
17	NC_011205	TTACG	2	10	31022	31031	20 %	40 %	20 %	20 %	198243542
18	NC_011205	AAAAG	2	10	32563	32572	80 %	0 %	20 %	0 %	198245062
19	NC_011205	TATAA	2	10	34166	34175	60 %	40 %	0 %	0 %	198244833
20	NC_011205	ATCGT	2	10	34919	34928	20 %	40 %	20 %	20 %	198245122
21	NC_011205	ATTTT	2	10	34963	34972	20 %	80 %	0 %	0 %	198245122
22	NC_011205	AGCGA	2	10	35592	35601	40 %	0 %	40 %	20 %	198242535
23	NC_011205	TCCTG	2	10	35802	35811	0 %	40 %	20 %	40 %	198242535
24	NC_011205	GGTCA	2	10	38037	38046	20 %	20 %	40 %	20 %	198242289
25	NC_011205	TTCAT	2	10	39309	39318	20 %	60 %	0 %	20 %	198242182
26	NC_011205	TGAAA	2	10	40125	40134	60 %	20 %	20 %	0 %	198243820
27	NC_011205	ACGGC	2	10	44485	44494	20 %	0 %	40 %	40 %	198244177
28	NC_011205	TTTTA	2	10	44811	44820	20 %	80 %	0 %	0 %	198244177
29	NC_011205	GGGCT	2	10	46559	46568	0 %	20 %	60 %	20 %	198245761
30	NC_011205	GCGTA	2	10	48435	48444	20 %	20 %	40 %	20 %	198242197
31	NC_011205	GACCA	2	10	49040	49049	40 %	0 %	20 %	40 %	198242197
32	NC_011205	CCGGC	2	10	49182	49191	0 %	0 %	40 %	60 %	198242197
33	NC_011205	CAGAC	2	10	50372	50381	40 %	0 %	20 %	40 %	198242197
34	NC_011205	TGTGC	2	10	53133	53142	0 %	40 %	40 %	20 %	198244244
35	NC_011205	GTTTG	2	10	54527	54536	0 %	60 %	40 %	0 %	198245825
36	NC_011205	GTTTG	2	10	55455	55464	0 %	60 %	40 %	0 %	198245825
37	NC_011205	CACTA	2	10	56586	56595	40 %	20 %	0 %	40 %	198245825
38	NC_011205	CGGCG	2	10	57124	57133	0 %	0 %	60 %	40 %	198246069
39	NC_011205	TTCAC	2	10	57379	57388	20 %	40 %	0 %	40 %	198245423
40	NC_011205	AAAAT	2	10	58950	58959	80 %	20 %	0 %	0 %	198242213
41	NC_011205	CGCTG	2	10	60227	60236	0 %	20 %	40 %	40 %	198242945
42	NC_011205	GCCTG	2	10	64786	64795	0 %	20 %	40 %	40 %	198242548
43	NC_011205	GCGCG	2	10	64940	64949	0 %	0 %	60 %	40 %	198242442
44	NC_011205	CGTGC	2	10	71359	71368	0 %	20 %	40 %	40 %	198246254
45	NC_011205	TTGAT	2	10	71529	71538	20 %	60 %	20 %	0 %	198246254
46	NC_011205	ACCGC	2	10	72089	72098	20 %	0 %	20 %	60 %	198246254
47	NC_011205	CGATG	2	10	77573	77582	20 %	20 %	40 %	20 %	198241932
48	NC_011205	GCGAA	2	10	78514	78523	40 %	0 %	40 %	20 %	198241932
49	NC_011205	CGTAC	2	10	79404	79413	20 %	20 %	20 %	40 %	198241932
50	NC_011205	TTGCC	2	10	81040	81049	0 %	40 %	20 %	40 %	198243994
51	NC_011205	CGTCC	2	10	81150	81159	0 %	20 %	20 %	60 %	198243994
52	NC_011205	TCAGC	2	10	84269	84278	20 %	20 %	20 %	40 %	198246082
53	NC_011205	GGCCA	2	10	84417	84426	20 %	0 %	40 %	40 %	198246082
54	NC_011205	GTACG	2	10	86988	86997	20 %	20 %	40 %	20 %	198245005
55	NC_011205	CAGAA	2	10	87701	87710	60 %	0 %	20 %	20 %	198245005
56	NC_011205	CCGCA	2	10	89820	89829	20 %	0 %	20 %	60 %	198242315
57	NC_011205	CGGTT	2	10	90325	90334	0 %	40 %	40 %	20 %	198241975
58	NC_011205	GCTCC	2	10	91461	91470	0 %	20 %	20 %	60 %	198241975
59	NC_011205	TGGCG	2	10	92105	92114	0 %	20 %	60 %	20 %	198245456
60	NC_011205	TGCAC	2	10	94187	94196	20 %	20 %	20 %	40 %	198244841
61	NC_011205	TGGCA	2	10	94256	94265	20 %	20 %	40 %	20 %	198244841
62	NC_011205	TCTGT	2	10	94582	94591	0 %	60 %	20 %	20 %	198246065
63	NC_011205	GCGCT	2	10	94892	94901	0 %	20 %	40 %	40 %	198246065
64	NC_011205	GGCGC	2	10	95306	95315	0 %	0 %	60 %	40 %	198246065
65	NC_011205	AACGT	2	10	98076	98085	40 %	20 %	20 %	20 %	198243323
66	NC_011205	CCCAA	2	10	100226	100235	40 %	0 %	0 %	60 %	198244102
67	NC_011205	TTGTT	2	10	100933	100942	0 %	80 %	20 %	0 %	198244102
68	NC_011205	GCTTC	2	10	102313	102322	0 %	40 %	20 %	40 %	198242523
69	NC_011205	TGCGT	2	10	102600	102609	0 %	40 %	40 %	20 %	198242523
70	NC_011205	TGATC	2	10	104300	104309	20 %	40 %	20 %	20 %	198243576
71	NC_011205	TGGCG	2	10	107460	107469	0 %	20 %	60 %	20 %	198245326
72	NC_011205	AGCGC	2	10	108020	108029	20 %	0 %	40 %	40 %	198245326
73	NC_011205	ACGTT	2	10	108837	108846	20 %	40 %	20 %	20 %	198245956
74	NC_011205	CCGCG	2	10	109105	109114	0 %	0 %	40 %	60 %	198245956
75	NC_011205	GGGGT	2	10	110501	110510	0 %	20 %	80 %	0 %	198245956
76	NC_011205	CAGCG	2	10	113406	113415	20 %	0 %	40 %	40 %	198243370
77	NC_011205	GCCGG	2	10	113706	113715	0 %	0 %	60 %	40 %	198243370
78	NC_011205	CGAGC	2	10	113831	113840	20 %	0 %	40 %	40 %	198243370
79	NC_011205	ATTTG	2	10	114274	114283	20 %	60 %	20 %	0 %	198243370
80	NC_011205	TTGCC	2	10	118777	118786	0 %	40 %	20 %	40 %	198245925
81	NC_011205	AGCAG	2	10	119454	119463	40 %	0 %	40 %	20 %	198245222
82	NC_011205	AGTTT	2	10	121684	121693	20 %	60 %	20 %	0 %	198245931
83	NC_011205	TAGTG	2	10	122102	122111	20 %	40 %	40 %	0 %	198245285
84	NC_011205	TCGAT	2	10	123532	123541	20 %	40 %	20 %	20 %	198242698
85	NC_011205	CGGCG	2	10	126162	126171	0 %	0 %	60 %	40 %	198245083
86	NC_011205	CGTTT	2	10	126624	126633	0 %	60 %	20 %	20 %	198245083
87	NC_011205	ATTGG	2	10	126888	126897	20 %	40 %	40 %	0 %	198244310
88	NC_011205	ATTCC	2	10	131725	131734	20 %	40 %	0 %	40 %	198245889
89	NC_011205	AAAGC	2	10	134022	134031	60 %	0 %	20 %	20 %	198242108
90	NC_011205	CCGCA	2	10	134555	134564	20 %	0 %	20 %	60 %	198242108
91	NC_011205	AGTTC	2	10	136926	136935	20 %	40 %	20 %	20 %	198243393
92	NC_011205	TGCCT	2	10	137026	137035	0 %	40 %	20 %	40 %	198242976
93	NC_011205	AAGCG	2	10	141679	141688	40 %	0 %	40 %	20 %	198246066
94	NC_011205	GTTTG	2	10	143582	143591	0 %	60 %	40 %	0 %	198243206
95	NC_011205	CGTAT	2	10	145053	145062	20 %	40 %	20 %	20 %	198243819
96	NC_011205	ATCAG	2	10	146889	146898	40 %	20 %	20 %	20 %	198242404
97	NC_011205	CTGCC	2	10	148835	148844	0 %	20 %	20 %	60 %	198242528
98	NC_011205	CGGCG	2	10	151565	151574	0 %	0 %	60 %	40 %	198242669
99	NC_011205	CCGGC	2	10	154919	154928	0 %	0 %	40 %	60 %	198243171
100	NC_011205	CGCTG	2	10	155811	155820	0 %	20 %	40 %	40 %	198243171
101	NC_011205	GATCA	2	10	159962	159971	40 %	20 %	20 %	20 %	198242529
102	NC_011205	CGTCA	2	10	160708	160717	20 %	20 %	20 %	40 %	198245968
103	NC_011205	ATCCC	2	10	162408	162417	20 %	20 %	0 %	60 %	198245628
104	NC_011205	AGCGC	2	10	163116	163125	20 %	0 %	40 %	40 %	198245628
105	NC_011205	TGAGC	2	10	164965	164974	20 %	20 %	40 %	20 %	198244503
106	NC_011205	CGCAT	2	10	165227	165236	20 %	20 %	20 %	40 %	198245059
107	NC_011205	CGAAC	2	10	165956	165965	40 %	0 %	20 %	40 %	198242484
108	NC_011205	GTTCA	2	10	166222	166231	20 %	40 %	20 %	20 %	198242484
109	NC_011205	ATGAC	2	10	167188	167197	40 %	20 %	20 %	20 %	198242926
110	NC_011205	CTGGA	2	10	167778	167787	20 %	20 %	40 %	20 %	198241957
111	NC_011205	CAGAA	2	10	169897	169906	60 %	0 %	20 %	20 %	198242461
112	NC_011205	CGAAG	2	10	172768	172777	40 %	0 %	40 %	20 %	198242476
113	NC_011205	GGCAT	2	10	180048	180057	20 %	20 %	40 %	20 %	198246153
114	NC_011205	GGCCA	2	10	180470	180479	20 %	0 %	40 %	40 %	198243041
115	NC_011205	GCGCC	2	10	180483	180492	0 %	0 %	40 %	60 %	198243041
116	NC_011205	CGTTT	2	10	180985	180994	0 %	60 %	20 %	20 %	198243041
117	NC_011205	GGGGA	2	10	181037	181046	20 %	0 %	80 %	0 %	198243041
118	NC_011205	CTGGT	2	10	184674	184683	0 %	40 %	40 %	20 %	198241769
119	NC_011205	CCGCT	2	10	188691	188700	0 %	20 %	20 %	60 %	198244320
120	NC_011205	GCCCA	2	10	191243	191252	20 %	0 %	20 %	60 %	198241927
121	NC_011205	GCGCA	2	10	191648	191657	20 %	0 %	40 %	40 %	198241927
122	NC_011205	ATCGG	2	10	193039	193048	20 %	20 %	40 %	20 %	198242627
123	NC_011205	GCCGC	2	10	194249	194258	0 %	0 %	40 %	60 %	198243647
124	NC_011205	ATCCA	2	10	199599	199608	40 %	20 %	0 %	40 %	198245647
125	NC_011205	CGGCG	2	10	201719	201728	0 %	0 %	60 %	40 %	198243284
126	NC_011205	TGGTC	2	10	202585	202594	0 %	40 %	40 %	20 %	198243284
127	NC_011205	CGTCA	2	10	204283	204292	20 %	20 %	20 %	40 %	198243400
128	NC_011205	AGCGC	2	10	205234	205243	20 %	0 %	40 %	40 %	198243400
129	NC_011205	CGGCG	2	10	207148	207157	0 %	0 %	60 %	40 %	198244834
130	NC_011205	TTCGG	2	10	208028	208037	0 %	40 %	40 %	20 %	198245891
131	NC_011205	CTTGC	2	10	209037	209046	0 %	40 %	20 %	40 %	198242710
132	NC_011205	TGAGC	2	10	209449	209458	20 %	20 %	40 %	20 %	198243382
133	NC_011205	CGGCA	2	10	210534	210543	20 %	0 %	40 %	40 %	198243907
134	NC_011205	GCACG	2	10	210713	210722	20 %	0 %	40 %	40 %	198243907
135	NC_011205	AGATC	2	10	211118	211127	40 %	20 %	20 %	20 %	198243902
136	NC_011205	CGCGG	2	10	211540	211549	0 %	0 %	60 %	40 %	198245984
137	NC_011205	CGCGG	2	10	211724	211733	0 %	0 %	60 %	40 %	198245984
138	NC_011205	GCCAG	2	10	213708	213717	20 %	0 %	40 %	40 %	198245792
139	NC_011205	GCGCG	2	10	214274	214283	0 %	0 %	60 %	40 %	198244547
140	NC_011205	TAGCG	2	10	215351	215360	20 %	20 %	40 %	20 %	198242553
141	NC_011205	CGGGG	2	10	216092	216101	0 %	0 %	80 %	20 %	198243727
142	NC_011205	GCGAA	2	10	218212	218221	40 %	0 %	40 %	20 %	198243727
143	NC_011205	CAGCG	2	10	218275	218284	20 %	0 %	40 %	40 %	198243727
144	NC_011205	GGCGG	2	10	220025	220034	0 %	0 %	80 %	20 %	198242626
145	NC_011205	GTTGA	2	10	221874	221883	20 %	40 %	40 %	0 %	198243961
146	NC_011205	TTCAA	2	10	221980	221989	40 %	40 %	0 %	20 %	198243961
147	NC_011205	GGAAT	2	10	222734	222743	40 %	20 %	40 %	0 %	198243961
148	NC_011205	GCAGC	2	10	223393	223402	20 %	0 %	40 %	40 %	198243961
149	NC_011205	TGGCG	2	10	224596	224605	0 %	20 %	60 %	20 %	198245094
150	NC_011205	TGGTC	2	10	224724	224733	0 %	40 %	40 %	20 %	198245094
151	NC_011205	GGCGT	2	10	225787	225796	0 %	20 %	60 %	20 %	198244879
152	NC_011205	GCACC	2	10	230986	230995	20 %	0 %	20 %	60 %	198242771
153	NC_011205	GCCGC	2	10	232522	232531	0 %	0 %	40 %	60 %	198241827
154	NC_011205	ATTTT	2	10	233932	233941	20 %	80 %	0 %	0 %	198242660
155	NC_011205	CAGGT	2	10	235360	235369	20 %	20 %	40 %	20 %	198244305
156	NC_011205	CGGCG	2	10	236853	236862	0 %	0 %	60 %	40 %	198243476
157	NC_011205	TGCTT	2	10	237347	237356	0 %	60 %	20 %	20 %	198243476
158	NC_011205	CCGGG	2	10	244488	244497	0 %	0 %	60 %	40 %	198243155
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160	NC_011205	CTGAA	2	10	255299	255308	40 %	20 %	20 %	20 %	198243582
161	NC_011205	AAGCG	2	10	255363	255372	40 %	0 %	40 %	20 %	198243582
162	NC_011205	TGGTG	2	10	257267	257276	0 %	40 %	60 %	0 %	198242567
163	NC_011205	ATGGC	2	10	259534	259543	20 %	20 %	40 %	20 %	198243983
164	NC_011205	ACTTT	2	10	260829	260838	20 %	60 %	0 %	20 %	198244628
165	NC_011205	TACGG	2	10	264742	264751	20 %	20 %	40 %	20 %	198241995
166	NC_011205	TCCAG	2	10	266758	266767	20 %	20 %	20 %	40 %	198245250
167	NC_011205	GTGAA	2	10	268039	268048	40 %	20 %	40 %	0 %	198244535
168	NC_011205	ATGCC	2	10	269130	269139	20 %	20 %	20 %	40 %	198242586
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173	NC_011205	TCCCT	2	10	279239	279248	0 %	40 %	0 %	60 %	198246253
174	NC_011205	GACCA	2	10	285751	285760	40 %	0 %	20 %	40 %	198243314
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177	NC_011205	GATTT	2	10	286805	286814	20 %	60 %	20 %	0 %	198246027
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183	NC_011205	CGATT	2	10	300588	300597	20 %	40 %	20 %	20 %	198245521
184	NC_011205	ACTGG	2	10	303464	303473	20 %	20 %	40 %	20 %	198243385
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191	NC_011205	GCGGT	2	10	316220	316229	0 %	20 %	60 %	20 %	198243093
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198	NC_011205	GGCCT	2	10	325795	325804	0 %	20 %	40 %	40 %	198242462
199	NC_011205	TCGCT	2	10	326105	326114	0 %	40 %	20 %	40 %	198242462
200	NC_011205	CGCAG	2	10	327589	327598	20 %	0 %	40 %	40 %	198243222
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240	NC_011205	ACGGT	2	10	407673	407682	20 %	20 %	40 %	20 %	198243123
241	NC_011205	TAAAG	2	10	409069	409078	60 %	20 %	20 %	0 %	198244599
242	NC_011205	AAGCC	2	10	410861	410870	40 %	0 %	20 %	40 %	198244599
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244	NC_011205	CGGGC	2	10	412524	412533	0 %	0 %	60 %	40 %	198244899
245	NC_011205	GCTAC	2	10	413190	413199	20 %	20 %	20 %	40 %	198244899
246	NC_011205	CGCAA	2	10	415538	415547	40 %	0 %	20 %	40 %	198245639
247	NC_011205	ATTAC	2	10	417269	417278	40 %	40 %	0 %	20 %	198242367
248	NC_011205	CGCGC	2	10	421307	421316	0 %	0 %	40 %	60 %	198242940
249	NC_011205	GCGCA	2	10	421951	421960	20 %	0 %	40 %	40 %	198242940
250	NC_011205	GCCGT	2	10	424550	424559	0 %	20 %	40 %	40 %	198241918
251	NC_011205	GTGGC	2	10	425661	425670	0 %	20 %	60 %	20 %	198245504
252	NC_011205	GGCAT	2	10	427799	427808	20 %	20 %	40 %	20 %	198246038
253	NC_011205	ATATT	2	10	432283	432292	40 %	60 %	0 %	0 %	198245095
254	NC_011205	CCCAG	2	10	432383	432392	20 %	0 %	20 %	60 %	198245095
255	NC_011205	GCGCC	2	10	432866	432875	0 %	0 %	40 %	60 %	198245095
256	NC_011205	AGCGA	2	10	433057	433066	40 %	0 %	40 %	20 %	198245095
257	NC_011205	CAGCG	2	10	433806	433815	20 %	0 %	40 %	40 %	198246116
258	NC_011205	TGATT	2	10	434013	434022	20 %	60 %	20 %	0 %	198246116
259	NC_011205	GTACG	2	10	435490	435499	20 %	20 %	40 %	20 %	198242503
260	NC_011205	GGCAG	2	10	435746	435755	20 %	0 %	60 %	20 %	198242503
261	NC_011205	GCCCA	2	10	436129	436138	20 %	0 %	20 %	60 %	198243134
262	NC_011205	GCGCT	2	10	438370	438379	0 %	20 %	40 %	40 %	198245099
263	NC_011205	ACTTT	2	10	441046	441055	20 %	60 %	0 %	20 %	198242742
264	NC_011205	CAAAG	2	10	442504	442513	60 %	0 %	20 %	20 %	198242044
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266	NC_011205	GCGCT	2	10	446257	446266	0 %	20 %	40 %	40 %	198242983
267	NC_011205	GTAAT	2	10	447111	447120	40 %	40 %	20 %	0 %	198242983
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271	NC_011205	GCGCC	2	10	451062	451071	0 %	0 %	40 %	60 %	198245472
272	NC_011205	CGCGG	2	10	453840	453849	0 %	0 %	60 %	40 %	198245074
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278	NC_011205	GCCAT	2	10	462342	462351	20 %	20 %	20 %	40 %	198242692
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284	NC_011205	GCGCT	2	10	471688	471697	0 %	20 %	40 %	40 %	198241974
285	NC_011205	CGGCG	2	10	477052	477061	0 %	0 %	60 %	40 %	198244486
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376	NC_011205	GAGCA	2	10	638479	638488	40 %	0 %	40 %	20 %	198242982
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380	NC_011205	TGACG	2	10	648106	648115	20 %	20 %	40 %	20 %	198244462
381	NC_011205	GCAGG	2	10	648457	648466	20 %	0 %	60 %	20 %	198243561
382	NC_011205	GTCAG	2	10	648573	648582	20 %	20 %	40 %	20 %	198243561
383	NC_011205	AACGC	2	10	648962	648971	40 %	0 %	20 %	40 %	198245078
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385	NC_011205	TGGCG	2	10	650646	650655	0 %	20 %	60 %	20 %	198244469
386	NC_011205	AAGCA	2	10	650825	650834	60 %	0 %	20 %	20 %	198244469
387	NC_011205	CAAGA	2	10	651185	651194	60 %	0 %	20 %	20 %	198244469
388	NC_011205	GATGC	2	10	651637	651646	20 %	20 %	40 %	20 %	198244469
389	NC_011205	CCAAC	2	10	656894	656903	40 %	0 %	0 %	60 %	198242887
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391	NC_011205	CCAAC	2	10	657400	657409	40 %	0 %	0 %	60 %	198243524
392	NC_011205	ATGAG	2	10	657637	657646	40 %	20 %	40 %	0 %	198243524
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500	NC_011205	TGGCA	2	10	857870	857879	20 %	20 %	40 %	20 %	198241958

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