MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011205	TGAT	2	8	183444	183451	25 %	50 %	25 %	0 %	198241769
3502	NC_011205	TGC	2	6	183481	183486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3503	NC_011205	CTG	2	6	183506	183511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3504	NC_011205	ACG	2	6	183528	183533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3505	NC_011205	AGA	2	6	183535	183540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241769
3506	NC_011205	CCG	2	6	183617	183622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241769
3507	NC_011205	A	6	6	183630	183635	100 %	0 %	0 %	0 %	198241769
3508	NC_011205	TCACCG	2	12	183636	183647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198241769
3509	NC_011205	CGA	2	6	183676	183681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3510	NC_011205	TC	4	8	183682	183689	0 %	50 %	0 %	50 %	198241769
3511	NC_011205	A	6	6	183745	183750	100 %	0 %	0 %	0 %	198241769
3512	NC_011205	CAAA	2	8	183799	183806	75 %	0 %	0 %	25 %	198241769
3513	NC_011205	A	6	6	183821	183826	100 %	0 %	0 %	0 %	198241769
3514	NC_011205	GTG	2	6	183854	183859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241769
3515	NC_011205	TTC	2	6	183868	183873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241769
3516	NC_011205	GCG	3	9	183942	183950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3517	NC_011205	GGC	2	6	183962	183967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3518	NC_011205	TCT	2	6	183981	183986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241769
3519	NC_011205	GC	3	6	184008	184013	0 %	0 %	50 %	50 %	198241769
3520	NC_011205	CGA	2	6	184147	184152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3521	NC_011205	GTGC	2	8	184154	184161	0 %	25 %	50 %	25 %	198241769
3522	NC_011205	TGG	2	6	184162	184167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241769
3523	NC_011205	ACC	2	6	184199	184204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769
3524	NC_011205	AGC	2	6	184271	184276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3525	NC_011205	GGTC	2	8	184303	184310	0 %	25 %	50 %	25 %	198241769
3526	NC_011205	GCG	2	6	184317	184322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3527	NC_011205	TAC	2	6	184384	184389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241769
3528	NC_011205	CCG	2	6	184440	184445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241769
3529	NC_011205	CAC	2	6	184501	184506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769
3530	NC_011205	CAC	2	6	184508	184513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769
3531	NC_011205	TC	3	6	184548	184553	0 %	50 %	0 %	50 %	198241769
3532	NC_011205	TGC	3	9	184596	184604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3533	NC_011205	CGG	2	6	184621	184626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3534	NC_011205	CGG	2	6	184665	184670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3535	NC_011205	CTGGT	2	10	184674	184683	0 %	40 %	40 %	20 %	198241769
3536	NC_011205	GCC	2	6	184691	184696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241769
3537	NC_011205	CTG	2	6	184823	184828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3538	NC_011205	GAA	2	6	184837	184842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241769
3539	NC_011205	TCT	2	6	184857	184862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241769
3540	NC_011205	CTG	2	6	185015	185020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3541	NC_011205	GAT	2	6	185026	185031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241769
3542	NC_011205	CGT	2	6	185051	185056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3543	NC_011205	TGGC	2	8	185090	185097	0 %	25 %	50 %	25 %	198241769
3544	NC_011205	CTG	2	6	185108	185113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3545	NC_011205	CGG	2	6	185139	185144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3546	NC_011205	TG	3	6	185184	185189	0 %	50 %	50 %	0 %	198241769
3547	NC_011205	GAC	2	6	185204	185209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3548	NC_011205	CTG	2	6	185216	185221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3549	NC_011205	CGA	2	6	185245	185250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3550	NC_011205	CG	3	6	185291	185296	0 %	0 %	50 %	50 %	198241769
3551	NC_011205	GCT	2	6	185305	185310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3552	NC_011205	GCC	2	6	185353	185358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241769
3553	NC_011205	CGC	2	6	185371	185376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241769
3554	NC_011205	GAA	2	6	185387	185392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241769
3555	NC_011205	GCG	2	6	185418	185423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3556	NC_011205	CG	3	6	185422	185427	0 %	0 %	50 %	50 %	198241769
3557	NC_011205	GTT	2	6	185442	185447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241769
3558	NC_011205	GGT	2	6	185491	185496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241769
3559	NC_011205	TCTACC	2	12	185498	185509	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	198241769
3560	NC_011205	GGC	2	6	185569	185574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3561	NC_011205	GGC	2	6	185578	185583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3562	NC_011205	CGG	2	6	185646	185651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3563	NC_011205	CT	3	6	185684	185689	0 %	50 %	0 %	50 %	198241769
3564	NC_011205	CTT	2	6	185773	185778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243795
3565	NC_011205	TAT	2	6	185782	185787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243795
3566	NC_011205	ATT	2	6	185835	185840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243795
3567	NC_011205	AT	3	6	185885	185890	50 %	50 %	0 %	0 %	198243795
3568	NC_011205	GTA	2	6	185896	185901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243795
3569	NC_011205	CGT	2	6	185939	185944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243795
3570	NC_011205	ATC	2	6	185973	185978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243795
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3572	NC_011205	T	6	6	185989	185994	0 %	100 %	0 %	0 %	198243795
3573	NC_011205	GC	3	6	186016	186021	0 %	0 %	50 %	50 %	198243795
3574	NC_011205	GAG	2	6	186047	186052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198243795
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3578	NC_011205	AACC	2	8	186201	186208	50 %	0 %	0 %	50 %	198243795
3579	NC_011205	ATT	2	6	186219	186224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243795
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3581	NC_011205	ACG	2	6	186773	186778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243029
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3585	NC_011205	CATT	2	8	186976	186983	25 %	50 %	0 %	25 %	198243029
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3588	NC_011205	TGGA	2	8	187448	187455	25 %	25 %	50 %	0 %	198245043
3589	NC_011205	GAA	2	6	187460	187465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245043
3590	NC_011205	TGA	2	6	187467	187472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245043
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3592	NC_011205	AG	3	6	187537	187542	50 %	0 %	50 %	0 %	198245043
3593	NC_011205	GGA	2	6	187561	187566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245043
3594	NC_011205	GTC	2	6	187577	187582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245043
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3596	NC_011205	CAA	2	6	187826	187831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244320
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3601	NC_011205	CTG	2	6	188012	188017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244320
3602	NC_011205	GCG	2	6	188163	188168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244320
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3604	NC_011205	ATG	2	6	188277	188282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244320
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3606	NC_011205	GAT	2	6	188296	188301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244320
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3608	NC_011205	T	6	6	188413	188418	0 %	100 %	0 %	0 %	198244320
3609	NC_011205	GGC	2	6	188426	188431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244320
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3612	NC_011205	GGGC	2	8	188466	188473	0 %	0 %	75 %	25 %	198244320
3613	NC_011205	CGTT	2	8	188535	188542	0 %	50 %	25 %	25 %	198244320
3614	NC_011205	GCG	2	6	188600	188605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244320
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3618	NC_011205	CCGCT	2	10	188691	188700	0 %	20 %	20 %	60 %	198244320
3619	NC_011205	GCC	2	6	188705	188710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244320
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3622	NC_011205	A	7	7	188761	188767	100 %	0 %	0 %	0 %	198244320
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3744	NC_011205	ATG	2	6	195262	195267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243647
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3863	NC_011205	GAATCT	2	12	201649	201660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	198243284
3864	NC_011205	GGT	2	6	201707	201712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243284
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3984	NC_011205	TTCGG	2	10	208028	208037	0 %	40 %	40 %	20 %	198245891
3985	NC_011205	GGA	2	6	208103	208108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245891
3986	NC_011205	GC	4	8	208137	208144	0 %	0 %	50 %	50 %	198245891
3987	NC_011205	TGA	2	6	208160	208165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245891
3988	NC_011205	TAT	2	6	208235	208240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245891
3989	NC_011205	T	6	6	208355	208360	0 %	100 %	0 %	0 %	198245891
3990	NC_011205	CGC	2	6	208380	208385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245891
3991	NC_011205	TA	3	6	208393	208398	50 %	50 %	0 %	0 %	198245891
3992	NC_011205	ATA	2	6	208411	208416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245891
3993	NC_011205	CA	3	6	208451	208456	50 %	0 %	0 %	50 %	198245891
3994	NC_011205	TCTT	2	8	208478	208485	0 %	75 %	0 %	25 %	198245891
3995	NC_011205	GGC	2	6	208494	208499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245891
3996	NC_011205	AGC	2	6	208520	208525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245891
3997	NC_011205	CAC	2	6	208553	208558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245891
3998	NC_011205	TGC	2	6	208594	208599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245891
3999	NC_011205	CTT	2	6	208772	208777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242710
4000	NC_011205	GCC	2	6	208837	208842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242710

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