MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011205	TCG	2	6	158278	158283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243518
3002	NC_011205	CGA	2	6	158301	158306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243518
3003	NC_011205	CATA	2	8	158350	158357	50 %	25 %	0 %	25 %	198243518
3004	NC_011205	GTC	2	6	158423	158428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243518
3005	NC_011205	TAC	2	6	158518	158523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243518
3006	NC_011205	TAA	2	6	158617	158622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242490
3007	NC_011205	ATG	2	6	158629	158634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242490
3008	NC_011205	GCG	2	6	158694	158699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242490
3009	NC_011205	GGA	2	6	158747	158752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242490
3010	NC_011205	TTG	2	6	158769	158774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242490
3011	NC_011205	ACC	2	6	158781	158786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242490
3012	NC_011205	TGA	2	6	158855	158860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242490
3013	NC_011205	CGG	2	6	158929	158934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242490
3014	NC_011205	AACG	2	8	159033	159040	50 %	0 %	25 %	25 %	198242490
3015	NC_011205	CGC	2	6	159160	159165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242490
3016	NC_011205	TCA	2	6	159181	159186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242490
3017	NC_011205	TC	3	6	159314	159319	0 %	50 %	0 %	50 %	198242490
3018	NC_011205	CGC	2	6	159320	159325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242490
3019	NC_011205	GAG	2	6	159408	159413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242490
3020	NC_011205	CTGC	2	8	159417	159424	0 %	25 %	25 %	50 %	198242490
3021	NC_011205	TAT	2	6	159444	159449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242490
3022	NC_011205	CG	3	6	159456	159461	0 %	0 %	50 %	50 %	198242490
3023	NC_011205	TATT	2	8	159484	159491	25 %	75 %	0 %	0 %	198242490
3024	NC_011205	ATT	2	6	159493	159498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242490
3025	NC_011205	GTC	2	6	159560	159565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242997
3026	NC_011205	CGC	2	6	159580	159585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242997
3027	NC_011205	CGG	2	6	159607	159612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242997
3028	NC_011205	C	6	6	159676	159681	0 %	0 %	0 %	100 %	198242997
3029	NC_011205	GAC	2	6	159683	159688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242997
3030	NC_011205	ACG	2	6	159714	159719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242997
3031	NC_011205	GCA	2	6	159883	159888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242529
3032	NC_011205	CGT	2	6	159895	159900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242529
3033	NC_011205	GATCA	2	10	159962	159971	40 %	20 %	20 %	20 %	198242529
3034	NC_011205	TGT	2	6	160047	160052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242529
3035	NC_011205	GCC	2	6	160097	160102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242529
3036	NC_011205	GCT	2	6	160153	160158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242529
3037	NC_011205	CTG	2	6	160205	160210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242529
3038	NC_011205	GCT	2	6	160273	160278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242529
3039	NC_011205	CAG	2	6	160295	160300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242529
3040	NC_011205	A	6	6	160356	160361	100 %	0 %	0 %	0 %	198242529
3041	NC_011205	TCT	2	6	160444	160449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242529
3042	NC_011205	TTA	2	6	160580	160585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245968
3043	NC_011205	GC	3	6	160612	160617	0 %	0 %	50 %	50 %	198245968
3044	NC_011205	CG	3	6	160659	160664	0 %	0 %	50 %	50 %	198245968
3045	NC_011205	CAT	2	6	160668	160673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245968
3046	NC_011205	CGTCA	2	10	160708	160717	20 %	20 %	20 %	40 %	198245968
3047	NC_011205	ACC	2	6	160718	160723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245968
3048	NC_011205	CAG	2	6	160762	160767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245968
3049	NC_011205	CTG	2	6	160825	160830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245968
3050	NC_011205	TTC	2	6	160867	160872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245968
3051	NC_011205	A	6	6	160881	160886	100 %	0 %	0 %	0 %	198245968
3052	NC_011205	CGG	2	6	160923	160928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245968
3053	NC_011205	GGGC	2	8	160968	160975	0 %	0 %	75 %	25 %	198245968
3054	NC_011205	AAT	2	6	161002	161007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245968
3055	NC_011205	CCG	2	6	161078	161083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245968
3056	NC_011205	GAA	2	6	161341	161346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245038
3057	NC_011205	ATT	2	6	161476	161481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245038
3058	NC_011205	CTG	2	6	161549	161554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245038
3059	NC_011205	A	6	6	161663	161668	100 %	0 %	0 %	0 %	198245038
3060	NC_011205	TCG	2	6	161753	161758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245038
3061	NC_011205	ACG	2	6	161890	161895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245038
3062	NC_011205	CGG	2	6	161930	161935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3063	NC_011205	GGC	2	6	161968	161973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3064	NC_011205	GGC	2	6	161989	161994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3065	NC_011205	CGG	3	9	162027	162035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3066	NC_011205	GGC	2	6	162055	162060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3067	NC_011205	AG	3	6	162078	162083	50 %	0 %	50 %	0 %	198245038
3068	NC_011205	CGG	2	6	162084	162089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3069	NC_011205	AGA	2	6	162099	162104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245038
3070	NC_011205	CGG	2	6	162168	162173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245038
3071	NC_011205	CG	3	6	162187	162192	0 %	0 %	50 %	50 %	198245038
3072	NC_011205	CCGC	2	8	162242	162249	0 %	0 %	25 %	75 %	198245038
3073	NC_011205	CAC	2	6	162321	162326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245038
3074	NC_011205	ATCCC	2	10	162408	162417	20 %	20 %	0 %	60 %	198245628
3075	NC_011205	CCA	3	9	162459	162467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245628
3076	NC_011205	TGA	2	6	162489	162494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245628
3077	NC_011205	GCCAGC	2	12	162533	162544	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	198245628
3078	NC_011205	GCA	2	6	162576	162581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245628
3079	NC_011205	T	6	6	162653	162658	0 %	100 %	0 %	0 %	198245628
3080	NC_011205	GAA	2	6	162765	162770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245628
3081	NC_011205	AGA	2	6	162866	162871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245628
3082	NC_011205	CGCTGC	2	12	162872	162883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	198245628
3083	NC_011205	AAT	2	6	162988	162993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245628
3084	NC_011205	CG	3	6	162996	163001	0 %	0 %	50 %	50 %	198245628
3085	NC_011205	AGA	2	6	163004	163009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245628
3086	NC_011205	GGC	2	6	163039	163044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3087	NC_011205	GCA	2	6	163065	163070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245628
3088	NC_011205	GGC	2	6	163087	163092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3089	NC_011205	AAT	2	6	163102	163107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245628
3090	NC_011205	AGCGC	2	10	163116	163125	20 %	0 %	40 %	40 %	198245628
3091	NC_011205	AGC	2	6	163182	163187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245628
3092	NC_011205	ATC	2	6	163223	163228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245628
3093	NC_011205	GCG	2	6	163239	163244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3094	NC_011205	ATGA	2	8	163393	163400	50 %	25 %	25 %	0 %	198245628
3095	NC_011205	TGA	2	6	163412	163417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245628
3096	NC_011205	CTT	2	6	163437	163442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245628
3097	NC_011205	GCG	2	6	163451	163456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3098	NC_011205	TGA	2	6	163509	163514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245628
3099	NC_011205	TGCC	2	8	163838	163845	0 %	25 %	25 %	50 %	198244503
3100	NC_011205	GC	3	6	163855	163860	0 %	0 %	50 %	50 %	198244503
3101	NC_011205	ACC	2	6	163947	163952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244503
3102	NC_011205	ATC	2	6	163971	163976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244503
3103	NC_011205	TGC	2	6	163995	164000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244503
3104	NC_011205	TGG	2	6	164020	164025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244503
3105	NC_011205	GCC	2	6	164067	164072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244503
3106	NC_011205	ATG	3	9	164118	164126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244503
3107	NC_011205	GCA	2	6	164152	164157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244503
3108	NC_011205	GGAT	2	8	164184	164191	25 %	25 %	50 %	0 %	198244503
3109	NC_011205	GC	3	6	164278	164283	0 %	0 %	50 %	50 %	198244503
3110	NC_011205	CAA	2	6	164429	164434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244503
3111	NC_011205	GAC	2	6	164441	164446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244503
3112	NC_011205	CTT	2	6	164455	164460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244503
3113	NC_011205	CGCC	2	8	164497	164504	0 %	0 %	25 %	75 %	198244503
3114	NC_011205	GAA	2	6	164626	164631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244503
3115	NC_011205	GAT	2	6	164797	164802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244503
3116	NC_011205	CA	3	6	164826	164831	50 %	0 %	0 %	50 %	198244503
3117	NC_011205	ACC	2	6	164895	164900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244503
3118	NC_011205	TGA	2	6	164943	164948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244503
3119	NC_011205	TGAGC	2	10	164965	164974	20 %	20 %	40 %	20 %	198244503
3120	NC_011205	TGT	2	6	165030	165035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245059
3121	NC_011205	CCAG	2	8	165071	165078	25 %	0 %	25 %	50 %	198245059
3122	NC_011205	GGCG	2	8	165101	165108	0 %	0 %	75 %	25 %	198245059
3123	NC_011205	ATG	2	6	165111	165116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
3124	NC_011205	TGA	2	6	165154	165159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
3125	NC_011205	TGA	2	6	165196	165201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
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3128	NC_011205	GAT	2	6	165374	165379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
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3131	NC_011205	GC	4	8	165678	165685	0 %	0 %	50 %	50 %	198242484
3132	NC_011205	GC	3	6	165699	165704	0 %	0 %	50 %	50 %	198242484
3133	NC_011205	ATG	2	6	165845	165850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242484
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3135	NC_011205	GAT	2	6	165973	165978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242484
3136	NC_011205	GAT	2	6	166020	166025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242484
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3143	NC_011205	CAT	2	6	166290	166295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242484
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3145	NC_011205	CGG	2	6	166467	166472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242484
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3147	NC_011205	GGC	2	6	166538	166543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242484
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3152	NC_011205	ATT	2	6	166782	166787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242926
3153	NC_011205	T	7	7	166818	166824	0 %	100 %	0 %	0 %	198242926
3154	NC_011205	TCG	2	6	166866	166871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242926
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3243	NC_011205	GCC	2	6	171451	171456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243004
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3360	NC_011205	GCT	2	6	177322	177327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243655
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3482	NC_011205	TGG	3	9	182151	182159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242405
3483	NC_011205	TTG	2	6	182160	182165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242405
3484	NC_011205	CGG	2	6	182172	182177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242405
3485	NC_011205	TGC	2	6	182213	182218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242405
3486	NC_011205	GAGC	2	8	182247	182254	25 %	0 %	50 %	25 %	198242405
3487	NC_011205	CATC	2	8	182274	182281	25 %	25 %	0 %	50 %	198242405
3488	NC_011205	TGGC	2	8	182402	182409	0 %	25 %	50 %	25 %	198242405
3489	NC_011205	CGC	2	6	182635	182640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242405
3490	NC_011205	CA	3	6	182711	182716	50 %	0 %	0 %	50 %	198242405
3491	NC_011205	TCG	2	6	183135	183140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3492	NC_011205	AGA	2	6	183145	183150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241769
3493	NC_011205	TGC	2	6	183175	183180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3494	NC_011205	GCT	2	6	183235	183240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3495	NC_011205	GAA	3	9	183260	183268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241769
3496	NC_011205	TCC	2	6	183298	183303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241769
3497	NC_011205	GCT	2	6	183344	183349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3498	NC_011205	ACC	2	6	183365	183370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769
3499	NC_011205	CTG	2	6	183404	183409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3500	NC_011205	ACA	2	6	183429	183434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241769

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