MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011205	GCGGAA	2	12	54438	54449	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	198245825
1002	NC_011205	GTTTG	2	10	54527	54536	0 %	60 %	40 %	0 %	198245825
1003	NC_011205	ACC	2	6	54573	54578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245825
1004	NC_011205	CTG	2	6	54759	54764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1005	NC_011205	CTG	2	6	55008	55013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1006	NC_011205	GC	3	6	55024	55029	0 %	0 %	50 %	50 %	198245825
1007	NC_011205	A	6	6	55042	55047	100 %	0 %	0 %	0 %	198245825
1008	NC_011205	GCA	2	6	55049	55054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1009	NC_011205	CG	3	6	55098	55103	0 %	0 %	50 %	50 %	198245825
1010	NC_011205	AAG	2	6	55132	55137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245825
1011	NC_011205	GCT	2	6	55304	55309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1012	NC_011205	GGC	2	6	55328	55333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245825
1013	NC_011205	GTG	2	6	55379	55384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245825
1014	NC_011205	GTTTG	2	10	55455	55464	0 %	60 %	40 %	0 %	198245825
1015	NC_011205	CCA	2	6	55474	55479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245825
1016	NC_011205	TCC	2	6	55572	55577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198245825
1017	NC_011205	TGA	2	6	55579	55584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245825
1018	NC_011205	CGC	2	6	55693	55698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245825
1019	NC_011205	TGA	2	6	55705	55710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245825
1020	NC_011205	TGC	2	6	55799	55804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1021	NC_011205	TCG	2	6	55814	55819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1022	NC_011205	CG	3	6	55832	55837	0 %	0 %	50 %	50 %	198245825
1023	NC_011205	CTG	2	6	55842	55847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1024	NC_011205	TGG	2	6	55900	55905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245825
1025	NC_011205	GCA	2	6	55943	55948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1026	NC_011205	GTTC	2	8	56029	56036	0 %	50 %	25 %	25 %	198245825
1027	NC_011205	CAT	2	6	56045	56050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245825
1028	NC_011205	CG	3	6	56087	56092	0 %	0 %	50 %	50 %	198245825
1029	NC_011205	TGA	2	6	56171	56176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245825
1030	NC_011205	ACG	2	6	56233	56238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1031	NC_011205	GTT	2	6	56240	56245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245825
1032	NC_011205	GAA	2	6	56262	56267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245825
1033	NC_011205	CAA	2	6	56315	56320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245825
1034	NC_011205	AAG	2	6	56412	56417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245825
1035	NC_011205	G	6	6	56486	56491	0 %	0 %	100 %	0 %	198245825
1036	NC_011205	TGA	3	9	56495	56503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245825
1037	NC_011205	GCT	2	6	56578	56583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245825
1038	NC_011205	CACTA	2	10	56586	56595	40 %	20 %	0 %	40 %	198245825
1039	NC_011205	AAC	2	6	56668	56673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245825
1040	NC_011205	TGA	2	6	56685	56690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245825
1041	NC_011205	GTA	2	6	56732	56737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198246069
1042	NC_011205	GCA	2	6	56760	56765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198246069
1043	NC_011205	TCC	2	6	56775	56780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198246069
1044	NC_011205	GCG	2	6	56877	56882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198246069
1045	NC_011205	TGA	2	6	56940	56945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198246069
1046	NC_011205	ATC	2	6	56996	57001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198246069
1047	NC_011205	GGC	2	6	57002	57007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198246069
1048	NC_011205	GC	3	6	57006	57011	0 %	0 %	50 %	50 %	198246069
1049	NC_011205	TGT	2	6	57046	57051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198246069
1050	NC_011205	CGGCG	2	10	57124	57133	0 %	0 %	60 %	40 %	198246069
1051	NC_011205	TTCAC	2	10	57379	57388	20 %	40 %	0 %	40 %	198245423
1052	NC_011205	GAT	2	6	57399	57404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245423
1053	NC_011205	CGG	2	6	57412	57417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245423
1054	NC_011205	AGCC	2	8	57439	57446	25 %	0 %	25 %	50 %	198245423
1055	NC_011205	AGC	3	9	57487	57495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245423
1056	NC_011205	AAG	2	6	57508	57513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245423
1057	NC_011205	AAAG	2	8	57518	57525	75 %	0 %	25 %	0 %	198245423
1058	NC_011205	CGC	2	6	57545	57550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245423
1059	NC_011205	GGC	2	6	57605	57610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245423
1060	NC_011205	ATGG	2	8	57651	57658	25 %	25 %	50 %	0 %	198245423
1061	NC_011205	TTG	2	6	57855	57860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242816
1062	NC_011205	GC	3	6	57882	57887	0 %	0 %	50 %	50 %	198242816
1063	NC_011205	TCT	2	6	58002	58007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242816
1064	NC_011205	GC	4	8	58112	58119	0 %	0 %	50 %	50 %	198242816
1065	NC_011205	GAA	2	6	58133	58138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242816
1066	NC_011205	G	6	6	58208	58213	0 %	0 %	100 %	0 %	198242816
1067	NC_011205	TGAT	2	8	58323	58330	25 %	50 %	25 %	0 %	198242816
1068	NC_011205	TCG	2	6	58356	58361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242816
1069	NC_011205	ACT	2	6	58391	58396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242816
1070	NC_011205	TGG	2	6	58446	58451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242816
1071	NC_011205	TCTAAC	2	12	58469	58480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242816
1072	NC_011205	GAA	2	6	58509	58514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242816
1073	NC_011205	CGA	2	6	58528	58533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242816
1074	NC_011205	GCG	2	6	58535	58540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242816
1075	NC_011205	AGG	2	6	58548	58553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242816
1076	NC_011205	GCC	2	6	58568	58573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242816
1077	NC_011205	CTG	2	6	58587	58592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242816
1078	NC_011205	GGC	3	9	58649	58657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242816
1079	NC_011205	GAA	2	6	58682	58687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242816
1080	NC_011205	T	6	6	58910	58915	0 %	100 %	0 %	0 %	198242213
1081	NC_011205	AAAAT	2	10	58950	58959	80 %	20 %	0 %	0 %	198242213
1082	NC_011205	TGGA	2	8	58992	58999	25 %	25 %	50 %	0 %	198242213
1083	NC_011205	CAA	2	6	59002	59007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242213
1084	NC_011205	ATT	2	6	60180	60185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242945
1085	NC_011205	TGA	2	6	60206	60211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242945
1086	NC_011205	CGCTG	2	10	60227	60236	0 %	20 %	40 %	40 %	198242945
1087	NC_011205	C	6	6	60241	60246	0 %	0 %	0 %	100 %	198242945
1088	NC_011205	TAA	2	6	60262	60267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242945
1089	NC_011205	A	6	6	60295	60300	100 %	0 %	0 %	0 %	198242945
1090	NC_011205	GCT	2	6	60374	60379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242945
1091	NC_011205	TGA	2	6	60499	60504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242945
1092	NC_011205	TG	3	6	60721	60726	0 %	50 %	50 %	0 %	198242945
1093	NC_011205	CTGC	2	8	60777	60784	0 %	25 %	25 %	50 %	198242945
1094	NC_011205	GTA	2	6	60838	60843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242945
1095	NC_011205	CTGG	2	8	60884	60891	0 %	25 %	50 %	25 %	198242945
1096	NC_011205	CCG	2	6	60955	60960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242945
1097	NC_011205	GGT	2	6	60968	60973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242945
1098	NC_011205	TGGCGC	2	12	61015	61026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	198242945
1099	NC_011205	GTGG	2	8	61049	61056	0 %	25 %	75 %	0 %	198242945
1100	NC_011205	TC	3	6	61125	61130	0 %	50 %	0 %	50 %	198245736
1101	NC_011205	CTG	2	6	61219	61224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245736
1102	NC_011205	CTG	2	6	61247	61252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245736
1103	NC_011205	CTGC	2	8	61259	61266	0 %	25 %	25 %	50 %	198245736
1104	NC_011205	TCA	2	6	61306	61311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245736
1105	NC_011205	TGC	2	6	61447	61452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245736
1106	NC_011205	CGG	2	6	61535	61540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245736
1107	NC_011205	AAT	2	6	61548	61553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245736
1108	NC_011205	A	6	6	61615	61620	100 %	0 %	0 %	0 %	198245736
1109	NC_011205	CTT	2	6	61662	61667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245736
1110	NC_011205	CGA	2	6	61694	61699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245736
1111	NC_011205	CCA	2	6	61730	61735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245736
1112	NC_011205	TTC	2	6	61795	61800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243185
1113	NC_011205	ATT	2	6	61843	61848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243185
1114	NC_011205	CGA	2	6	61854	61859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243185
1115	NC_011205	ACCA	2	8	61895	61902	50 %	0 %	0 %	50 %	198243185
1116	NC_011205	GTT	2	6	61924	61929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243185
1117	NC_011205	GTGG	2	8	61930	61937	0 %	25 %	75 %	0 %	198243185
1118	NC_011205	AAT	2	6	62005	62010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243185
1119	NC_011205	CAA	2	6	62106	62111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243185
1120	NC_011205	CATT	2	8	62120	62127	25 %	50 %	0 %	25 %	198243185
1121	NC_011205	CAA	2	6	62154	62159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243185
1122	NC_011205	ATA	2	6	62206	62211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243185
1123	NC_011205	GGT	3	9	62235	62243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243185
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1125	NC_011205	CTG	3	9	62293	62301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243185
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1499	NC_011205	GTC	2	6	79852	79857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241932
1500	NC_011205	ATC	2	6	79899	79904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241932

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