MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011205	CGA	2	6	500414	500419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244876
9002	NC_011205	ATCTT	2	10	500491	500500	20 %	60 %	0 %	20 %	198244876
9003	NC_011205	TAA	2	6	500625	500630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243660
9004	NC_011205	TTG	2	6	500675	500680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243660
9005	NC_011205	CGC	2	6	500710	500715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243660
9006	NC_011205	TCAT	2	8	500720	500727	25 %	50 %	0 %	25 %	198243660
9007	NC_011205	TGG	2	6	500784	500789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243660
9008	NC_011205	AAG	2	6	500936	500941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243660
9009	NC_011205	TCA	2	6	500946	500951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243660
9010	NC_011205	GAA	2	6	501040	501045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243660
9011	NC_011205	GCTT	2	8	501105	501112	0 %	50 %	25 %	25 %	198243660
9012	NC_011205	GCGT	2	8	501122	501129	0 %	25 %	50 %	25 %	198243660
9013	NC_011205	ATG	2	6	501158	501163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243660
9014	NC_011205	TTA	2	6	501239	501244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243660
9015	NC_011205	ACG	2	6	501296	501301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243660
9016	NC_011205	CAG	2	6	501370	501375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243660
9017	NC_011205	TAT	2	6	501715	501720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198246145
9018	NC_011205	AAATTT	2	12	501745	501756	50 %	50 %	0 %	0 %	198246145
9019	NC_011205	AAT	2	6	501802	501807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198246145
9020	NC_011205	CAG	2	6	502050	502055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9021	NC_011205	TGCG	2	8	502129	502136	0 %	25 %	50 %	25 %	198245630
9022	NC_011205	CGG	2	6	502211	502216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245630
9023	NC_011205	CAA	2	6	502217	502222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245630
9024	NC_011205	TTA	2	6	502348	502353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245630
9025	NC_011205	TAA	2	6	502365	502370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245630
9026	NC_011205	GGC	2	6	502380	502385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245630
9027	NC_011205	CGC	2	6	502397	502402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
9028	NC_011205	CCG	2	6	502421	502426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
9029	NC_011205	CAG	2	6	502509	502514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9030	NC_011205	CG	3	6	502515	502520	0 %	0 %	50 %	50 %	198245630
9031	NC_011205	GCC	2	6	502548	502553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
9032	NC_011205	CGA	2	6	502565	502570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9033	NC_011205	TCG	2	6	502571	502576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9034	NC_011205	CAG	2	6	502578	502583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9035	NC_011205	CGC	2	6	502631	502636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
9036	NC_011205	GGT	3	9	502647	502655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245630
9037	NC_011205	TTA	2	6	502720	502725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245630
9038	NC_011205	GCG	2	6	502745	502750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245630
9039	NC_011205	CGA	2	6	502751	502756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9040	NC_011205	TCGG	2	8	502792	502799	0 %	25 %	50 %	25 %	198245630
9041	NC_011205	GCC	2	6	502843	502848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
9042	NC_011205	GCCA	2	8	502888	502895	25 %	0 %	25 %	50 %	198245630
9043	NC_011205	CCG	2	6	502906	502911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
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9045	NC_011205	CAC	2	6	503040	503045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245630
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9047	NC_011205	CGC	2	6	503097	503102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245630
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9050	NC_011205	AACC	2	8	503137	503144	50 %	0 %	0 %	50 %	198245630
9051	NC_011205	CGA	3	9	503146	503154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9052	NC_011205	A	6	6	503158	503163	100 %	0 %	0 %	0 %	198245630
9053	NC_011205	GGC	2	6	503164	503169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245630
9054	NC_011205	ACCA	2	8	503220	503227	50 %	0 %	0 %	50 %	198245630
9055	NC_011205	GAA	2	6	503232	503237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245630
9056	NC_011205	CAG	2	6	503334	503339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245630
9057	NC_011205	TTGAC	2	10	503376	503385	20 %	40 %	20 %	20 %	198245630
9058	NC_011205	ATG	2	6	504313	504318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242918
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9061	NC_011205	CGG	2	6	504506	504511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242918
9062	NC_011205	CCT	2	6	504598	504603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198242918
9063	NC_011205	CGCGG	2	10	504607	504616	0 %	0 %	60 %	40 %	198242918
9064	NC_011205	GCC	2	6	505011	505016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245040
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9093	NC_011205	TGA	2	6	506256	506261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245040
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9104	NC_011205	CAT	2	6	507027	507032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242637
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9107	NC_011205	ATT	2	6	507536	507541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242558
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9112	NC_011205	TGGCGG	2	12	507660	507671	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198242558
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9121	NC_011205	GCA	2	6	508090	508095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242558
9122	NC_011205	GCG	3	9	508137	508145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242558
9123	NC_011205	TGT	2	6	508254	508259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242558
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9126	NC_011205	GAA	2	6	508352	508357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242558
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9237	NC_011205	CTT	2	6	514126	514131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244144
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9242	NC_011205	A	6	6	514248	514253	100 %	0 %	0 %	0 %	198244144
9243	NC_011205	GAG	2	6	514278	514283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244144
9244	NC_011205	GAT	2	6	514305	514310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244144
9245	NC_011205	GC	3	6	514336	514341	0 %	0 %	50 %	50 %	198244144
9246	NC_011205	TGG	2	6	514342	514347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244144
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9250	NC_011205	CGG	2	6	514667	514672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243913
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9363	NC_011205	GGC	2	6	522075	522080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
9364	NC_011205	TAT	2	6	522104	522109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242112
9365	NC_011205	GGC	2	6	522117	522122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
9366	NC_011205	GCC	2	6	522163	522168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242112
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9368	NC_011205	GTC	2	6	522268	522273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242112
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9482	NC_011205	CAC	2	6	527401	527406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242302
9483	NC_011205	TGC	2	6	527424	527429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242302
9484	NC_011205	CCG	2	6	527453	527458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242302
9485	NC_011205	CGA	2	6	527538	527543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242302
9486	NC_011205	ATA	2	6	527582	527587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242302
9487	NC_011205	G	6	6	527625	527630	0 %	0 %	100 %	0 %	198242302
9488	NC_011205	AAT	2	6	528057	528062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242666
9489	NC_011205	GCG	2	6	528065	528070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242666
9490	NC_011205	ACATCC	2	12	528121	528132	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198242666
9491	NC_011205	TCA	2	6	528175	528180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242666
9492	NC_011205	GC	3	6	528224	528229	0 %	0 %	50 %	50 %	198242666
9493	NC_011205	CAG	2	6	528303	528308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242666
9494	NC_011205	GATT	2	8	528359	528366	25 %	50 %	25 %	0 %	198242666
9495	NC_011205	TGT	2	6	528373	528378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242666
9496	NC_011205	GAT	2	6	528426	528431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242666
9497	NC_011205	CAGC	2	8	528467	528474	25 %	0 %	25 %	50 %	198242666
9498	NC_011205	GAAAG	2	10	528493	528502	60 %	0 %	40 %	0 %	198242666
9499	NC_011205	GCT	2	6	528555	528560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242666
9500	NC_011205	CAG	2	6	528675	528680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242666

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