MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011205	CGG	2	6	320321	320326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245302
6002	NC_011205	CCG	2	6	320341	320346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245302
6003	NC_011205	GACA	2	8	320395	320402	50 %	0 %	25 %	25 %	198245302
6004	NC_011205	CGC	2	6	320412	320417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245916
6005	NC_011205	GCG	2	6	320420	320425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6006	NC_011205	ATG	2	6	320429	320434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245916
6007	NC_011205	CCA	2	6	320445	320450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245916
6008	NC_011205	AC	3	6	320488	320493	50 %	0 %	0 %	50 %	198245916
6009	NC_011205	CAGC	2	8	320494	320501	25 %	0 %	25 %	50 %	198245916
6010	NC_011205	GGCT	2	8	320550	320557	0 %	25 %	50 %	25 %	198245916
6011	NC_011205	GCG	2	6	320567	320572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6012	NC_011205	CGC	2	6	320587	320592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245916
6013	NC_011205	CTG	2	6	320669	320674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6014	NC_011205	GCG	2	6	320722	320727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6015	NC_011205	TGA	2	6	320770	320775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245916
6016	NC_011205	GCC	2	6	320777	320782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245916
6017	NC_011205	CGGCG	2	10	320801	320810	0 %	0 %	60 %	40 %	198245916
6018	NC_011205	CTG	2	6	320828	320833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6019	NC_011205	ATC	2	6	320879	320884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245916
6020	NC_011205	GGC	2	6	320893	320898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6021	NC_011205	ACC	2	6	320937	320942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245916
6022	NC_011205	GCTGGG	2	12	320944	320955	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198245916
6023	NC_011205	CTG	2	6	321020	321025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6024	NC_011205	GAC	2	6	321096	321101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6025	NC_011205	GCG	2	6	321103	321108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6026	NC_011205	GGAT	2	8	321189	321196	25 %	25 %	50 %	0 %	198245916
6027	NC_011205	ACA	2	6	321214	321219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245916
6028	NC_011205	GCC	4	12	321247	321258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245916
6029	NC_011205	CTG	2	6	321290	321295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6030	NC_011205	CTG	2	6	321317	321322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6031	NC_011205	GGT	2	6	321352	321357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245916
6032	NC_011205	GTGA	2	8	321398	321405	25 %	25 %	50 %	0 %	198245916
6033	NC_011205	GCG	2	6	321431	321436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6034	NC_011205	GCG	2	6	321456	321461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6035	NC_011205	CAGC	2	8	321487	321494	25 %	0 %	25 %	50 %	198245916
6036	NC_011205	CATT	2	8	321496	321503	25 %	50 %	0 %	25 %	198245916
6037	NC_011205	GCG	2	6	321545	321550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6038	NC_011205	GCG	2	6	321557	321562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6039	NC_011205	CGG	2	6	321574	321579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245916
6040	NC_011205	TCG	2	6	321603	321608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245916
6041	NC_011205	CGGG	2	8	321652	321659	0 %	0 %	75 %	25 %	198245916
6042	NC_011205	TGAA	2	8	321695	321702	50 %	25 %	25 %	0 %	198245916
6043	NC_011205	TGA	2	6	321703	321708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242259
6044	NC_011205	A	6	6	321708	321713	100 %	0 %	0 %	0 %	198242259
6045	NC_011205	ATG	2	6	321721	321726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242259
6046	NC_011205	TCA	2	6	321731	321736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242259
6047	NC_011205	ATT	2	6	321763	321768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242259
6048	NC_011205	T	7	7	321811	321817	0 %	100 %	0 %	0 %	198242259
6049	NC_011205	ATC	2	6	321819	321824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242259
6050	NC_011205	A	6	6	321951	321956	100 %	0 %	0 %	0 %	198242259
6051	NC_011205	GGA	2	6	321986	321991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242259
6052	NC_011205	T	6	6	322239	322244	0 %	100 %	0 %	0 %	198242259
6053	NC_011205	TATC	2	8	322289	322296	25 %	50 %	0 %	25 %	198242259
6054	NC_011205	GGA	2	6	322307	322312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242259
6055	NC_011205	TGTGG	2	10	322330	322339	0 %	40 %	60 %	0 %	198242259
6056	NC_011205	TTTA	2	8	322346	322353	25 %	75 %	0 %	0 %	198242259
6057	NC_011205	CG	3	6	322422	322427	0 %	0 %	50 %	50 %	198242259
6058	NC_011205	ATAA	2	8	322440	322447	75 %	25 %	0 %	0 %	198242259
6059	NC_011205	TCA	2	6	322759	322764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242773
6060	NC_011205	A	6	6	322779	322784	100 %	0 %	0 %	0 %	198242773
6061	NC_011205	CTA	2	6	322805	322810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242773
6062	NC_011205	GGAT	2	8	322886	322893	25 %	25 %	50 %	0 %	198242773
6063	NC_011205	A	6	6	322936	322941	100 %	0 %	0 %	0 %	198242773
6064	NC_011205	TTA	2	6	322956	322961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242773
6065	NC_011205	GAA	2	6	323014	323019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242773
6066	NC_011205	TGA	2	6	323055	323060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242773
6067	NC_011205	T	6	6	323165	323170	0 %	100 %	0 %	0 %	198242462
6068	NC_011205	GC	4	8	323175	323182	0 %	0 %	50 %	50 %	198242462
6069	NC_011205	GTTCTG	2	12	323197	323208	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	198242462
6070	NC_011205	GCT	2	6	323211	323216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6071	NC_011205	TGC	2	6	323309	323314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6072	NC_011205	ATC	2	6	323347	323352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242462
6073	NC_011205	GCT	2	6	323394	323399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6074	NC_011205	CTG	2	6	323464	323469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6075	NC_011205	AAC	2	6	323522	323527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242462
6076	NC_011205	TGC	2	6	323528	323533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6077	NC_011205	CG	3	6	323549	323554	0 %	0 %	50 %	50 %	198242462
6078	NC_011205	CTGG	2	8	323660	323667	0 %	25 %	50 %	25 %	198242462
6079	NC_011205	TGG	2	6	323717	323722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242462
6080	NC_011205	CTG	2	6	323755	323760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6081	NC_011205	GGC	2	6	323830	323835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242462
6082	NC_011205	TGG	2	6	323851	323856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242462
6083	NC_011205	TTGA	2	8	323875	323882	25 %	50 %	25 %	0 %	198242462
6084	NC_011205	CCG	2	6	323885	323890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242462
6085	NC_011205	CGCC	2	8	323898	323905	0 %	0 %	25 %	75 %	198242462
6086	NC_011205	CGG	2	6	323913	323918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242462
6087	NC_011205	CTG	2	6	323971	323976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6088	NC_011205	GC	3	6	323993	323998	0 %	0 %	50 %	50 %	198242462
6089	NC_011205	CGG	2	6	324053	324058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242462
6090	NC_011205	GGC	2	6	324066	324071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242462
6091	NC_011205	TGG	2	6	324140	324145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242462
6092	NC_011205	TTG	2	6	324160	324165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242462
6093	NC_011205	CGC	2	6	324279	324284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242462
6094	NC_011205	GC	3	6	324287	324292	0 %	0 %	50 %	50 %	198242462
6095	NC_011205	GC	3	6	324301	324306	0 %	0 %	50 %	50 %	198242462
6096	NC_011205	GCC	2	6	324368	324373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242462
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6101	NC_011205	CTG	2	6	324658	324663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
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6103	NC_011205	CTG	2	6	324730	324735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6104	NC_011205	CGG	2	6	324741	324746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242462
6105	NC_011205	CTG	2	6	324751	324756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
6106	NC_011205	TGT	2	6	324776	324781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242462
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6108	NC_011205	TGAA	2	8	324824	324831	50 %	25 %	25 %	0 %	198242462
6109	NC_011205	CG	3	6	324841	324846	0 %	0 %	50 %	50 %	198242462
6110	NC_011205	GTGAA	2	10	324860	324869	40 %	20 %	40 %	0 %	198242462
6111	NC_011205	TCCCG	2	10	324897	324906	0 %	20 %	20 %	60 %	198242462
6112	NC_011205	CTG	2	6	324910	324915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242462
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6117	NC_011205	CCG	2	6	325060	325065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242462
6118	NC_011205	ATG	2	6	325130	325135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242462
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6120	NC_011205	CGG	2	6	325193	325198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242462
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6122	NC_011205	ACAGCG	2	12	325232	325243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242462
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6482	NC_011205	GCTG	2	8	351326	351333	0 %	25 %	50 %	25 %	198243221
6483	NC_011205	CGT	2	6	351337	351342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243221
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6486	NC_011205	CTGA	2	8	351410	351417	25 %	25 %	25 %	25 %	198243221
6487	NC_011205	TAT	2	6	351984	351989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242538
6488	NC_011205	ATG	2	6	352232	352237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241903
6489	NC_011205	AAT	2	6	352247	352252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241903
6490	NC_011205	GAT	2	6	352270	352275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241903
6491	NC_011205	TTA	2	6	352278	352283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241903
6492	NC_011205	CTG	2	6	352341	352346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241903
6493	NC_011205	GCC	2	6	352362	352367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241903
6494	NC_011205	TTACT	2	10	352386	352395	20 %	60 %	0 %	20 %	198241903
6495	NC_011205	ACTG	2	8	352420	352427	25 %	25 %	25 %	25 %	198241903
6496	NC_011205	AGCT	2	8	352594	352601	25 %	25 %	25 %	25 %	198241903
6497	NC_011205	T	7	7	352645	352651	0 %	100 %	0 %	0 %	198241903
6498	NC_011205	TGA	2	6	352669	352674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241903
6499	NC_011205	AT	3	6	352765	352770	50 %	50 %	0 %	0 %	198241903
6500	NC_011205	ATT	2	6	352817	352822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241903

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