MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011205	CTG	2	6	258092	258097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242060
5002	NC_011205	AGA	2	6	258163	258168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242060
5003	NC_011205	GCC	2	6	258292	258297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242060
5004	NC_011205	GAA	2	6	258305	258310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242060
5005	NC_011205	CGT	2	6	258311	258316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242060
5006	NC_011205	CGTC	2	8	258376	258383	0 %	25 %	25 %	50 %	198242060
5007	NC_011205	TCG	2	6	258445	258450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242060
5008	NC_011205	GAA	2	6	258458	258463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242060
5009	NC_011205	GCG	2	6	258503	258508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242060
5010	NC_011205	AAG	2	6	258519	258524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242060
5011	NC_011205	TGAT	2	8	258542	258549	25 %	50 %	25 %	0 %	198242060
5012	NC_011205	GTG	2	6	258595	258600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243983
5013	NC_011205	AGA	2	6	258616	258621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243983
5014	NC_011205	GCG	2	6	258640	258645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243983
5015	NC_011205	GCA	2	6	258728	258733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5016	NC_011205	GTG	2	6	258742	258747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243983
5017	NC_011205	TGG	2	6	258782	258787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243983
5018	NC_011205	CGC	2	6	258833	258838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243983
5019	NC_011205	AAT	2	6	258882	258887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243983
5020	NC_011205	CAG	2	6	258892	258897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5021	NC_011205	CAG	2	6	258928	258933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5022	NC_011205	GGC	2	6	258948	258953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243983
5023	NC_011205	TGA	2	6	258957	258962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243983
5024	NC_011205	GGC	2	6	258978	258983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243983
5025	NC_011205	GGC	2	6	259017	259022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243983
5026	NC_011205	CTG	2	6	259045	259050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5027	NC_011205	GCGG	2	8	259076	259083	0 %	0 %	75 %	25 %	198243983
5028	NC_011205	GCA	2	6	259106	259111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5029	NC_011205	TGG	2	6	259242	259247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243983
5030	NC_011205	GTC	2	6	259304	259309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5031	NC_011205	CCA	2	6	259352	259357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243983
5032	NC_011205	TGA	2	6	259358	259363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243983
5033	NC_011205	ATCC	2	8	259432	259439	25 %	25 %	0 %	50 %	198243983
5034	NC_011205	TCAT	2	8	259448	259455	25 %	50 %	0 %	25 %	198243983
5035	NC_011205	ATGGC	2	10	259534	259543	20 %	20 %	40 %	20 %	198243983
5036	NC_011205	GC	3	6	259562	259567	0 %	0 %	50 %	50 %	198243983
5037	NC_011205	GC	3	6	259592	259597	0 %	0 %	50 %	50 %	198243983
5038	NC_011205	GC	3	6	259607	259612	0 %	0 %	50 %	50 %	198243983
5039	NC_011205	GGC	2	6	259671	259676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243983
5040	NC_011205	ACG	2	6	259678	259683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243983
5041	NC_011205	GGAT	2	8	259781	259788	25 %	25 %	50 %	0 %	198243983
5042	NC_011205	CG	3	6	259836	259841	0 %	0 %	50 %	50 %	198243983
5043	NC_011205	TGT	2	6	260195	260200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244628
5044	NC_011205	ATGG	2	8	260263	260270	25 %	25 %	50 %	0 %	198244628
5045	NC_011205	GTCC	2	8	260334	260341	0 %	25 %	25 %	50 %	198244628
5046	NC_011205	TGC	2	6	260358	260363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244628
5047	NC_011205	TAG	2	6	260400	260405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244628
5048	NC_011205	ACCG	2	8	260417	260424	25 %	0 %	25 %	50 %	198244628
5049	NC_011205	TG	3	6	260457	260462	0 %	50 %	50 %	0 %	198244628
5050	NC_011205	TAT	2	6	260514	260519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244628
5051	NC_011205	ATA	2	6	260588	260593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244628
5052	NC_011205	CGG	2	6	260625	260630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244628
5053	NC_011205	TGC	2	6	260687	260692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244628
5054	NC_011205	TGA	2	6	260706	260711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244628
5055	NC_011205	AG	3	6	260712	260717	50 %	0 %	50 %	0 %	198244628
5056	NC_011205	ACTTT	2	10	260829	260838	20 %	60 %	0 %	20 %	198244628
5057	NC_011205	CGT	2	6	260911	260916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244628
5058	NC_011205	CGG	2	6	260919	260924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244628
5059	NC_011205	TGA	2	6	260937	260942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244628
5060	NC_011205	T	7	7	261023	261029	0 %	100 %	0 %	0 %	198242689
5061	NC_011205	GCC	2	6	261033	261038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242689
5062	NC_011205	ATT	2	6	261052	261057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242689
5063	NC_011205	CGC	2	6	261111	261116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242689
5064	NC_011205	TGGC	2	8	261133	261140	0 %	25 %	50 %	25 %	198242689
5065	NC_011205	TG	3	6	261146	261151	0 %	50 %	50 %	0 %	198242689
5066	NC_011205	TTG	2	6	261178	261183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242689
5067	NC_011205	ATC	2	6	261191	261196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242689
5068	NC_011205	ACA	2	6	261197	261202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242689
5069	NC_011205	TGG	2	6	261247	261252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242689
5070	NC_011205	CTG	2	6	261265	261270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242689
5071	NC_011205	CGG	2	6	261290	261295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242689
5072	NC_011205	GC	3	6	261378	261383	0 %	0 %	50 %	50 %	198242689
5073	NC_011205	CGG	2	6	261546	261551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242689
5074	NC_011205	TGG	2	6	261638	261643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242689
5075	NC_011205	GGC	2	6	261736	261741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242689
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5081	NC_011205	CGT	2	6	262086	262091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243349
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5085	NC_011205	ATC	2	6	262194	262199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243349
5086	NC_011205	TGC	2	6	262250	262255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243349
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5088	NC_011205	ACG	2	6	262365	262370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243349
5089	NC_011205	TCT	2	6	262464	262469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243349
5090	NC_011205	CGTTAG	2	12	262645	262656	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	198243349
5091	NC_011205	GTG	2	6	262743	262748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243349
5092	NC_011205	ATT	2	6	262755	262760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243349
5093	NC_011205	TGA	2	6	262843	262848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243349
5094	NC_011205	AAC	2	6	262899	262904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243349
5095	NC_011205	TTA	2	6	262964	262969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243349
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5097	NC_011205	GGGC	2	8	263078	263085	0 %	0 %	75 %	25 %	198243349
5098	NC_011205	GTT	2	6	263141	263146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243349
5099	NC_011205	TC	3	6	263173	263178	0 %	50 %	0 %	50 %	198243349
5100	NC_011205	AG	3	6	263186	263191	50 %	0 %	50 %	0 %	198243349
5101	NC_011205	GCT	2	6	263247	263252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5102	NC_011205	CAG	2	6	263256	263261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5103	NC_011205	CATT	2	8	263301	263308	25 %	50 %	0 %	25 %	198241995
5104	NC_011205	CTC	2	6	263344	263349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241995
5105	NC_011205	ATG	2	6	263381	263386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241995
5106	NC_011205	CAC	2	6	263598	263603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241995
5107	NC_011205	GTC	2	6	263677	263682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5108	NC_011205	CGC	2	6	263684	263689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241995
5109	NC_011205	AGG	2	6	263726	263731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241995
5110	NC_011205	TCG	2	6	263762	263767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241995
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5112	NC_011205	GTG	2	6	263829	263834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241995
5113	NC_011205	CGT	2	6	263838	263843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5114	NC_011205	GGCG	2	8	263874	263881	0 %	0 %	75 %	25 %	198241995
5115	NC_011205	CTA	2	6	263901	263906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241995
5116	NC_011205	CG	3	6	263922	263927	0 %	0 %	50 %	50 %	198241995
5117	NC_011205	CG	3	6	264176	264181	0 %	0 %	50 %	50 %	198241995
5118	NC_011205	CTT	2	6	264396	264401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241995
5119	NC_011205	CGACAC	2	12	264411	264422	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198241995
5120	NC_011205	GCG	2	6	264524	264529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241995
5121	NC_011205	CAG	2	6	264550	264555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5122	NC_011205	GGT	2	6	264673	264678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241995
5123	NC_011205	TCT	2	6	264683	264688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241995
5124	NC_011205	GAC	2	6	264706	264711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241995
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5132	NC_011205	TAC	2	6	265027	265032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241995
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5134	NC_011205	GGC	2	6	265129	265134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241995
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5140	NC_011205	TTA	2	6	265349	265354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241995
5141	NC_011205	TCA	2	6	265367	265372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241995
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5144	NC_011205	TCT	2	6	265550	265555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241995
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5153	NC_011205	TGG	2	6	266158	266163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242621
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5162	NC_011205	A	6	6	266672	266677	100 %	0 %	0 %	0 %	198245250
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5243	NC_011205	TGG	2	6	270835	270840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243100
5244	NC_011205	TGC	2	6	270935	270940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243100
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5362	NC_011205	TAA	2	6	276782	276787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242676
5363	NC_011205	CAT	2	6	276865	276870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245178
5364	NC_011205	TTG	2	6	276983	276988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245178
5365	NC_011205	GCG	2	6	277017	277022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245178
5366	NC_011205	CT	3	6	277092	277097	0 %	50 %	0 %	50 %	198245178
5367	NC_011205	T	6	6	277163	277168	0 %	100 %	0 %	0 %	198245178
5368	NC_011205	GCTG	2	8	277183	277190	0 %	25 %	50 %	25 %	198245178
5369	NC_011205	TCA	2	6	277210	277215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245178
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5374	NC_011205	GGC	2	6	277373	277378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245178
5375	NC_011205	GCT	2	6	277426	277431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245178
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5385	NC_011205	TGC	2	6	278103	278108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245178
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5387	NC_011205	AAG	2	6	278169	278174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245178
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5394	NC_011205	CTG	2	6	278456	278461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245178
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5398	NC_011205	CTG	2	6	278885	278890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245178
5399	NC_011205	TGCTC	2	10	278892	278901	0 %	40 %	20 %	40 %	198245178
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5402	NC_011205	T	6	6	279398	279403	0 %	100 %	0 %	0 %	198246253
5403	NC_011205	CT	3	6	279539	279544	0 %	50 %	0 %	50 %	198244025
5404	NC_011205	TCA	2	6	279658	279663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244025
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5471	NC_011205	GTAT	3	12	282977	282988	25 %	50 %	25 %	0 %	198244299
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5475	NC_011205	CACT	2	8	283218	283225	25 %	25 %	0 %	50 %	198244299
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5479	NC_011205	GC	4	8	283513	283520	0 %	0 %	50 %	50 %	198242516
5480	NC_011205	AGC	2	6	283690	283695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242516
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5482	NC_011205	AGT	2	6	283909	283914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242516
5483	NC_011205	GGC	2	6	283955	283960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242516
5484	NC_011205	CGAT	2	8	283968	283975	25 %	25 %	25 %	25 %	198242516
5485	NC_011205	ATTA	2	8	284024	284031	50 %	50 %	0 %	0 %	198242516
5486	NC_011205	TCT	2	6	284043	284048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242516
5487	NC_011205	TTCA	2	8	284102	284109	25 %	50 %	0 %	25 %	198242516
5488	NC_011205	CGC	2	6	284119	284124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242516
5489	NC_011205	CAG	2	6	284129	284134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242516
5490	NC_011205	CCA	2	6	284137	284142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242516
5491	NC_011205	CAG	2	6	284174	284179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242516
5492	NC_011205	T	6	6	284191	284196	0 %	100 %	0 %	0 %	198242516
5493	NC_011205	CCA	2	6	284218	284223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242516
5494	NC_011205	CGC	2	6	284276	284281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242516
5495	NC_011205	GC	3	6	284283	284288	0 %	0 %	50 %	50 %	198242516
5496	NC_011205	GCG	2	6	284296	284301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242516
5497	NC_011205	CGC	2	6	284368	284373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242516
5498	NC_011205	GCC	2	6	284408	284413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242516
5499	NC_011205	CG	3	6	284438	284443	0 %	0 %	50 %	50 %	198242516
5500	NC_011205	TCA	2	6	284548	284553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242516

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