MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 1132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011204	GCT	2	6	35484	35489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241702
502	NC_011204	GCG	2	6	35512	35517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241702
503	NC_011204	GGC	2	6	35518	35523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241702
504	NC_011204	TCGG	2	8	35582	35589	0 %	25 %	50 %	25 %	198241702
505	NC_011204	GGTA	2	8	35625	35632	25 %	25 %	50 %	0 %	198241702
506	NC_011204	AGC	2	6	35795	35800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241702
507	NC_011204	ACG	2	6	35812	35817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241702
508	NC_011204	GCA	2	6	35820	35825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241702
509	NC_011204	GGC	2	6	35828	35833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241702
510	NC_011204	CGAA	3	12	35854	35865	50 %	0 %	25 %	25 %	198241702
511	NC_011204	GCG	2	6	35958	35963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241702
512	NC_011204	GGATTT	2	12	35972	35983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	198241702
513	NC_011204	GTCA	2	8	36019	36026	25 %	25 %	25 %	25 %	198241702
514	NC_011204	AGT	2	6	36399	36404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241698
515	NC_011204	GCT	2	6	36422	36427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241698
516	NC_011204	CTTT	2	8	36433	36440	0 %	75 %	0 %	25 %	198241698
517	NC_011204	CGT	2	6	36477	36482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241698
518	NC_011204	T	6	6	36484	36489	0 %	100 %	0 %	0 %	198241698
519	NC_011204	TCT	3	9	36506	36514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241698
520	NC_011204	TTA	2	6	37314	37319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241683
521	NC_011204	ACG	2	6	37378	37383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241683
522	NC_011204	GCG	2	6	37387	37392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241683
523	NC_011204	TGG	3	9	37425	37433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241683
524	NC_011204	CGC	2	6	37500	37505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241694
525	NC_011204	TTC	2	6	37523	37528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241694
526	NC_011204	CCT	2	6	37536	37541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241694
527	NC_011204	CAT	2	6	37549	37554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241694
528	NC_011204	ATC	2	6	37556	37561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241694
529	NC_011204	C	7	7	37637	37643	0 %	0 %	0 %	100 %	198241694
530	NC_011204	GCG	2	6	37664	37669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241694
531	NC_011204	GCC	2	6	37670	37675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241694
532	NC_011204	ACT	2	6	37678	37683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241694
533	NC_011204	GC	3	6	37701	37706	0 %	0 %	50 %	50 %	198241694
534	NC_011204	TGG	2	6	37719	37724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241694
535	NC_011204	CTG	2	6	37819	37824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241694
536	NC_011204	CG	3	6	37989	37994	0 %	0 %	50 %	50 %	198241727
537	NC_011204	TTC	2	6	38055	38060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241727
538	NC_011204	ATT	2	6	38170	38175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241727
539	NC_011204	T	7	7	38174	38180	0 %	100 %	0 %	0 %	198241727
540	NC_011204	GGC	2	6	38205	38210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241727
541	NC_011204	CACG	2	8	38228	38235	25 %	0 %	25 %	50 %	198241727
542	NC_011204	CCA	2	6	38280	38285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241727
543	NC_011204	GCG	2	6	38315	38320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241727
544	NC_011204	CGC	2	6	38367	38372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241727
545	NC_011204	GCC	2	6	38389	38394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241727
546	NC_011204	CGG	2	6	38430	38435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241727
547	NC_011204	GTG	2	6	38437	38442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241727
548	NC_011204	A	6	6	38638	38643	100 %	0 %	0 %	0 %	198241638
549	NC_011204	CCG	2	6	38726	38731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241638
550	NC_011204	CCA	3	9	38768	38776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241638
551	NC_011204	TTC	2	6	38799	38804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241638
552	NC_011204	ACCAGC	2	12	38839	38850	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198241638
553	NC_011204	CAG	2	6	38898	38903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241638
554	NC_011204	GCAGC	2	10	38931	38940	20 %	0 %	40 %	40 %	198241638
555	NC_011204	CAC	2	6	38944	38949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241638
556	NC_011204	CCA	2	6	39197	39202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241638
557	NC_011204	CAG	3	9	39204	39212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241638
558	NC_011204	CAC	2	6	39213	39218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241638
559	NC_011204	TGA	2	6	39224	39229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241638
560	NC_011204	CAG	2	6	39255	39260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241638
561	NC_011204	CATCGT	2	12	39318	39329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198241638
562	NC_011204	TC	3	6	39364	39369	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
563	NC_011204	CTG	2	6	39403	39408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
564	NC_011204	GCA	2	6	39477	39482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
565	NC_011204	TC	3	6	39546	39551	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
566	NC_011204	TCC	2	6	39572	39577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
567	NC_011204	CAGGT	2	10	39580	39589	20 %	20 %	40 %	20 %	198241643
568	NC_011204	GCT	2	6	39627	39632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
569	NC_011204	CGG	2	6	39641	39646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
570	NC_011204	CTGC	2	8	39657	39664	0 %	25 %	25 %	50 %	198241643
571	NC_011204	CTG	2	6	39722	39727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
572	NC_011204	GCC	2	6	39751	39756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241643
573	NC_011204	CAC	3	9	39802	39810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
574	NC_011204	CCT	2	6	39846	39851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
575	NC_011204	CAGC	2	8	39861	39868	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
576	NC_011204	CGG	2	6	39999	40004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
577	NC_011204	GCA	2	6	40113	40118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
578	NC_011204	CGGC	2	8	40124	40131	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
579	NC_011204	TCG	2	6	40271	40276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
580	NC_011204	TGC	2	6	40439	40444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
581	NC_011204	CAC	2	6	40468	40473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
582	NC_011204	GCT	2	6	40643	40648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
583	NC_011204	TCC	2	6	40706	40711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
584	NC_011204	CCA	2	6	40746	40751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
585	NC_011204	GC	3	6	40758	40763	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
586	NC_011204	TGA	2	6	40766	40771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241643
587	NC_011204	GGT	2	6	40819	40824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241643
588	NC_011204	CTG	2	6	40843	40848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
589	NC_011204	CGA	2	6	40895	40900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
590	NC_011204	CCT	2	6	41028	41033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
591	NC_011204	ATG	2	6	41231	41236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241643
592	NC_011204	CGG	2	6	41244	41249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
593	NC_011204	CTG	2	6	41260	41265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
594	NC_011204	CAC	2	6	41313	41318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
595	NC_011204	ACC	3	9	41332	41340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
596	NC_011204	CCA	2	6	41382	41387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
597	NC_011204	TCA	2	6	41396	41401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241643
598	NC_011204	AGG	2	6	41402	41407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241643
599	NC_011204	CGCTG	2	10	41439	41448	0 %	20 %	40 %	40 %	198241643
600	NC_011204	GCCCCA	2	12	41535	41546	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198241643
601	NC_011204	GGT	2	6	41608	41613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241643
602	NC_011204	TTTCG	2	10	41656	41665	0 %	60 %	20 %	20 %	198241643
603	NC_011204	GGC	2	6	41680	41685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
604	NC_011204	CCT	2	6	41751	41756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
605	NC_011204	ATG	2	6	41770	41775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241643
606	NC_011204	CAG	2	6	41815	41820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
607	NC_011204	CCACAT	2	12	41841	41852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198241643
608	NC_011204	GCA	2	6	41921	41926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
609	NC_011204	CAG	2	6	41944	41949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
610	NC_011204	CTGA	2	8	41956	41963	25 %	25 %	25 %	25 %	198241643
611	NC_011204	CCA	2	6	41982	41987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
612	NC_011204	CTG	2	6	42010	42015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
613	NC_011204	GGC	2	6	42042	42047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
614	NC_011204	CAG	2	6	42135	42140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
615	NC_011204	TG	3	6	42227	42232	0 %	50 %	50 %	0 %	198241643
616	NC_011204	CAGG	2	8	42330	42337	25 %	0 %	50 %	25 %	198241643
617	NC_011204	TCA	2	6	42372	42377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241643
618	NC_011204	CGC	2	6	42411	42416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241643
619	NC_011204	TCT	2	6	42480	42485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241643
620	NC_011204	CCGG	2	8	42486	42493	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
621	NC_011204	GCT	2	6	42505	42510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
622	NC_011204	TC	3	6	42540	42545	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
623	NC_011204	CCAG	2	8	42690	42697	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
624	NC_011204	TCA	2	6	42714	42719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241643
625	NC_011204	CTG	2	6	42727	42732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
626	NC_011204	ATC	2	6	42767	42772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241643
627	NC_011204	CACG	2	8	42792	42799	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
628	NC_011204	CT	3	6	42818	42823	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
629	NC_011204	TCCGG	2	10	42879	42888	0 %	20 %	40 %	40 %	198241643
630	NC_011204	CTG	2	6	42913	42918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
631	NC_011204	CCT	2	6	42951	42956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
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634	NC_011204	CAG	2	6	43042	43047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
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642	NC_011204	GCA	2	6	43280	43285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
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647	NC_011204	CGG	2	6	43561	43566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
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652	NC_011204	TCT	2	6	43858	43863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241673
653	NC_011204	GA	3	6	43864	43869	50 %	0 %	50 %	0 %	198241673
654	NC_011204	CAA	2	6	43874	43879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241673
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723	NC_011204	ATC	2	6	49811	49816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241731
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730	NC_011204	TCA	2	6	50295	50300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241731
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732	NC_011204	TGC	2	6	50396	50401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241731
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743	NC_011204	ATA	2	6	50949	50954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241665
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750	NC_011204	CCATC	2	10	51191	51200	20 %	20 %	0 %	60 %	198241665
751	NC_011204	AAT	2	6	51202	51207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241665
752	NC_011204	TCC	2	6	51226	51231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241697
753	NC_011204	TTC	2	6	51262	51267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241697
754	NC_011204	TTC	2	6	51276	51281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241697
755	NC_011204	TCT	2	6	51286	51291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241697
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