MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 8060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
2	NC_011149	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
3	NC_011149	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	197250740
4	NC_011149	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
5	NC_011149	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
6	NC_011149	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
7	NC_011149	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
8	NC_011149	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
9	NC_011149	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	197249934
10	NC_011149	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	197249934
11	NC_011149	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
12	NC_011149	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
13	NC_011149	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
14	NC_011149	TG	3	6	5147	5152	0 %	50 %	50 %	0 %	197249510
15	NC_011149	CG	3	6	5250	5255	0 %	0 %	50 %	50 %	197249510
16	NC_011149	CG	3	6	5469	5474	0 %	0 %	50 %	50 %	197249510
17	NC_011149	AG	3	6	5551	5556	50 %	0 %	50 %	0 %	197249510
18	NC_011149	CG	3	6	5970	5975	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
19	NC_011149	GC	3	6	6888	6893	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
20	NC_011149	CG	3	6	6990	6995	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
21	NC_011149	TC	3	6	7772	7777	0 %	50 %	0 %	50 %	197248384
22	NC_011149	CG	3	6	7859	7864	0 %	0 %	50 %	50 %	197248384
23	NC_011149	CG	3	6	7957	7962	0 %	0 %	50 %	50 %	197248384
24	NC_011149	CT	3	6	8450	8455	0 %	50 %	0 %	50 %	197248384
25	NC_011149	GC	3	6	8474	8479	0 %	0 %	50 %	50 %	197248384
26	NC_011149	TG	3	6	8900	8905	0 %	50 %	50 %	0 %	197251166
27	NC_011149	GC	3	6	9572	9577	0 %	0 %	50 %	50 %	197251907
28	NC_011149	CG	3	6	10532	10537	0 %	0 %	50 %	50 %	197250147
29	NC_011149	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	197247979
30	NC_011149	GC	3	6	13301	13306	0 %	0 %	50 %	50 %	197247979
31	NC_011149	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	197250919
32	NC_011149	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	197250919
33	NC_011149	AT	3	6	15373	15378	50 %	50 %	0 %	0 %	197251857
34	NC_011149	AT	3	6	15648	15653	50 %	50 %	0 %	0 %	197251857
35	NC_011149	AT	3	6	15901	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	197251857
36	NC_011149	GA	3	6	17065	17070	50 %	0 %	50 %	0 %	197251520
37	NC_011149	GC	3	6	18367	18372	0 %	0 %	50 %	50 %	197248226
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39	NC_011149	GC	3	6	20658	20663	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
40	NC_011149	GC	3	6	20778	20783	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
41	NC_011149	GC	3	6	21183	21188	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
42	NC_011149	GC	3	6	22041	22046	0 %	0 %	50 %	50 %	197248849
43	NC_011149	CT	3	6	22796	22801	0 %	50 %	0 %	50 %	197248849
44	NC_011149	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	197250746
45	NC_011149	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	197250746
46	NC_011149	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	449785010
47	NC_011149	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	449785010
48	NC_011149	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
49	NC_011149	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
50	NC_011149	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
51	NC_011149	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	197251618
52	NC_011149	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	197251618
53	NC_011149	GT	3	6	28493	28498	0 %	50 %	50 %	0 %	197250867
54	NC_011149	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	197250867
55	NC_011149	CT	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	197249913
56	NC_011149	CG	3	6	30433	30438	0 %	0 %	50 %	50 %	197249913
57	NC_011149	AT	3	6	30534	30539	50 %	50 %	0 %	0 %	449785011
58	NC_011149	GC	3	6	30765	30770	0 %	0 %	50 %	50 %	449785011
59	NC_011149	GC	3	6	31055	31060	0 %	0 %	50 %	50 %	449785011
60	NC_011149	TC	3	6	33487	33492	0 %	50 %	0 %	50 %	197249381
61	NC_011149	AT	3	6	33737	33742	50 %	50 %	0 %	0 %	197249381
62	NC_011149	TA	3	6	33940	33945	50 %	50 %	0 %	0 %	197249381
63	NC_011149	TA	3	6	34435	34440	50 %	50 %	0 %	0 %	197250600
64	NC_011149	AT	3	6	34694	34699	50 %	50 %	0 %	0 %	197250600
65	NC_011149	AT	3	6	35440	35445	50 %	50 %	0 %	0 %	197251278
66	NC_011149	TG	4	8	35655	35662	0 %	50 %	50 %	0 %	197251278
67	NC_011149	GC	3	6	36248	36253	0 %	0 %	50 %	50 %	197251278
68	NC_011149	TA	3	6	37198	37203	50 %	50 %	0 %	0 %	197250571
69	NC_011149	AT	3	6	39514	39519	50 %	50 %	0 %	0 %	197248673
70	NC_011149	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	197249148
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72	NC_011149	TG	3	6	42798	42803	0 %	50 %	50 %	0 %	197247602
73	NC_011149	CG	3	6	43313	43318	0 %	0 %	50 %	50 %	197247498
74	NC_011149	AG	3	6	43498	43503	50 %	0 %	50 %	0 %	197247498
75	NC_011149	TA	3	6	43686	43691	50 %	50 %	0 %	0 %	197247498
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79	NC_011149	TG	3	6	47187	47192	0 %	50 %	50 %	0 %	197251902
80	NC_011149	GC	4	8	47326	47333	0 %	0 %	50 %	50 %	197251902
81	NC_011149	GA	3	6	48240	48245	50 %	0 %	50 %	0 %	197250162
82	NC_011149	CG	4	8	49307	49314	0 %	0 %	50 %	50 %	197248810
83	NC_011149	CG	3	6	49520	49525	0 %	0 %	50 %	50 %	197248810
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87	NC_011149	GC	3	6	52509	52514	0 %	0 %	50 %	50 %	197247824
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92	NC_011149	CG	3	6	55831	55836	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
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102	NC_011149	GC	3	6	64582	64587	0 %	0 %	50 %	50 %	197250360
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104	NC_011149	CG	3	6	66317	66322	0 %	0 %	50 %	50 %	197250006
105	NC_011149	GC	3	6	66723	66728	0 %	0 %	50 %	50 %	197249120
106	NC_011149	AT	3	6	68147	68152	50 %	50 %	0 %	0 %	197248761
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108	NC_011149	GC	3	6	69600	69605	0 %	0 %	50 %	50 %	197247805
109	NC_011149	AC	3	6	69652	69657	50 %	0 %	0 %	50 %	197247805
110	NC_011149	AG	3	6	69798	69803	50 %	0 %	50 %	0 %	197247457
111	NC_011149	CG	3	6	69877	69882	0 %	0 %	50 %	50 %	197247457
112	NC_011149	GC	3	6	69905	69910	0 %	0 %	50 %	50 %	197247457
113	NC_011149	CG	3	6	70534	70539	0 %	0 %	50 %	50 %	197251141
114	NC_011149	CG	3	6	70814	70819	0 %	0 %	50 %	50 %	197251141
115	NC_011149	TG	3	6	71455	71460	0 %	50 %	50 %	0 %	197249273
116	NC_011149	GC	3	6	71966	71971	0 %	0 %	50 %	50 %	197249273
117	NC_011149	CG	3	6	72201	72206	0 %	0 %	50 %	50 %	197249273
118	NC_011149	GC	3	6	72273	72278	0 %	0 %	50 %	50 %	197249273
119	NC_011149	GC	3	6	72450	72455	0 %	0 %	50 %	50 %	197247435
120	NC_011149	CG	3	6	73311	73316	0 %	0 %	50 %	50 %	197247849
121	NC_011149	GC	3	6	73457	73462	0 %	0 %	50 %	50 %	197247849
122	NC_011149	CG	3	6	74640	74645	0 %	0 %	50 %	50 %	197251291
123	NC_011149	CT	3	6	75983	75988	0 %	50 %	0 %	50 %	197249998
124	NC_011149	GC	3	6	77151	77156	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
125	NC_011149	CG	3	6	77287	77292	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
126	NC_011149	CG	3	6	77763	77768	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
127	NC_011149	TC	3	6	78196	78201	0 %	50 %	0 %	50 %	197250511
128	NC_011149	GC	5	10	78809	78818	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
129	NC_011149	CG	3	6	78869	78874	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
130	NC_011149	GC	3	6	79454	79459	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
131	NC_011149	GC	3	6	79953	79958	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
132	NC_011149	CG	3	6	81011	81016	0 %	0 %	50 %	50 %	197248515
133	NC_011149	CT	3	6	81091	81096	0 %	50 %	0 %	50 %	197248515
134	NC_011149	CG	3	6	81685	81690	0 %	0 %	50 %	50 %	197251288
135	NC_011149	CG	4	8	81753	81760	0 %	0 %	50 %	50 %	197251288
136	NC_011149	GC	3	6	84278	84283	0 %	0 %	50 %	50 %	197250411
137	NC_011149	GT	4	8	84300	84307	0 %	50 %	50 %	0 %	197250411
138	NC_011149	TC	3	6	85953	85958	0 %	50 %	0 %	50 %	197251657
139	NC_011149	GC	3	6	86218	86223	0 %	0 %	50 %	50 %	197251657
140	NC_011149	GC	4	8	86839	86846	0 %	0 %	50 %	50 %	197249408
141	NC_011149	TG	3	6	88382	88387	0 %	50 %	50 %	0 %	197248396
142	NC_011149	CT	3	6	88725	88730	0 %	50 %	0 %	50 %	197248654
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