MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011149	CGA	2	6	211163	211168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251732
4002	NC_011149	CGG	2	6	211174	211179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251732
4003	NC_011149	CAC	2	6	211241	211246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251732
4004	NC_011149	ATT	2	6	211248	211253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251732
4005	NC_011149	CAC	2	6	211256	211261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251732
4006	NC_011149	TAT	2	6	211304	211309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251732
4007	NC_011149	TGG	2	6	211324	211329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251732
4008	NC_011149	TGG	2	6	211438	211443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251732
4009	NC_011149	GAGC	2	8	211508	211515	25 %	0 %	50 %	25 %	197251732
4010	NC_011149	TAA	2	6	211541	211546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251732
4011	NC_011149	GAA	2	6	211560	211565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197251732
4012	NC_011149	ATG	2	6	211607	211612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251732
4013	NC_011149	GCC	2	6	211693	211698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250507
4014	NC_011149	TCA	2	6	211701	211706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250507
4015	NC_011149	TAT	2	6	211723	211728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250507
4016	NC_011149	ATG	2	6	211808	211813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250507
4017	NC_011149	CGT	2	6	211845	211850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250507
4018	NC_011149	T	6	6	211853	211858	0 %	100 %	0 %	0 %	197250507
4019	NC_011149	CTG	2	6	211889	211894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250507
4020	NC_011149	ATC	2	6	211919	211924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250507
4021	NC_011149	CGG	3	9	211936	211944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250507
4022	NC_011149	GC	3	6	211949	211954	0 %	0 %	50 %	50 %	197250507
4023	NC_011149	TTG	2	6	212028	212033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250507
4024	NC_011149	CTG	2	6	212078	212083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250507
4025	NC_011149	CGC	2	6	212142	212147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250507
4026	NC_011149	ACCT	2	8	212150	212157	25 %	25 %	0 %	50 %	197250507
4027	NC_011149	CGG	2	6	212158	212163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250507
4028	NC_011149	GCT	2	6	212182	212187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250507
4029	NC_011149	GCC	2	6	212188	212193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250507
4030	NC_011149	ATG	2	6	212271	212276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250507
4031	NC_011149	GAC	2	6	212287	212292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250507
4032	NC_011149	CGC	2	6	212317	212322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250507
4033	NC_011149	CTG	2	6	212330	212335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250507
4034	NC_011149	TC	3	6	212482	212487	0 %	50 %	0 %	50 %	197248848
4035	NC_011149	GAATCT	2	12	212491	212502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197248848
4036	NC_011149	GGT	2	6	212549	212554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248848
4037	NC_011149	CGGCG	2	10	212561	212570	0 %	0 %	60 %	40 %	197248848
4038	NC_011149	TGC	2	6	212581	212586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248848
4039	NC_011149	CCG	2	6	212628	212633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248848
4040	NC_011149	GTG	2	6	212790	212795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248848
4041	NC_011149	CGG	2	6	212947	212952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248848
4042	NC_011149	G	6	6	212951	212956	0 %	0 %	100 %	0 %	197248848
4043	NC_011149	GCT	2	6	212969	212974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248848
4044	NC_011149	GTT	2	6	213009	213014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248848
4045	NC_011149	CCG	2	6	213079	213084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248848
4046	NC_011149	ATTTC	2	10	213091	213100	20 %	60 %	0 %	20 %	197248848
4047	NC_011149	GCC	2	6	213113	213118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248848
4048	NC_011149	TGCC	2	8	213214	213221	0 %	25 %	25 %	50 %	197248848
4049	NC_011149	GTA	2	6	213248	213253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248848
4050	NC_011149	GGT	2	6	213293	213298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248848
4051	NC_011149	TGG	2	6	213463	213468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248848
4052	NC_011149	AGCGCC	2	12	213528	213539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197248848
4053	NC_011149	AGC	2	6	213540	213545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248848
4054	NC_011149	TTC	2	6	213555	213560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248848
4055	NC_011149	CG	3	6	213637	213642	0 %	0 %	50 %	50 %	197249470
4056	NC_011149	CAG	3	9	213667	213675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4057	NC_011149	CGA	2	6	213720	213725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4058	NC_011149	TGC	2	6	213792	213797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4059	NC_011149	ACG	2	6	213840	213845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4060	NC_011149	CG	3	6	213844	213849	0 %	0 %	50 %	50 %	197249470
4061	NC_011149	CAC	2	6	213850	213855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249470
4062	NC_011149	GTT	2	6	213883	213888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249470
4063	NC_011149	TGC	2	6	213918	213923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4064	NC_011149	CGAG	2	8	213927	213934	25 %	0 %	50 %	25 %	197249470
4065	NC_011149	ATA	2	6	213946	213951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249470
4066	NC_011149	CGC	2	6	214023	214028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249470
4067	NC_011149	CGC	2	6	214054	214059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249470
4068	NC_011149	GGCT	2	8	214070	214077	0 %	25 %	50 %	25 %	197249470
4069	NC_011149	GCC	2	6	214108	214113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249470
4070	NC_011149	CCG	2	6	214205	214210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249470
4071	NC_011149	TG	3	6	214223	214228	0 %	50 %	50 %	0 %	197249470
4072	NC_011149	GTG	2	6	214289	214294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249470
4073	NC_011149	TCG	3	9	214418	214426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4074	NC_011149	TCA	2	6	214430	214435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249470
4075	NC_011149	TTG	2	6	214514	214519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249470
4076	NC_011149	CTG	2	6	214543	214548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4077	NC_011149	TCT	2	6	214565	214570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249470
4078	NC_011149	TCG	2	6	214670	214675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4079	NC_011149	GTG	2	6	214745	214750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249470
4080	NC_011149	GAC	2	6	214759	214764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249470
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4082	NC_011149	CAG	2	6	214963	214968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4083	NC_011149	GTC	2	6	214984	214989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
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4085	NC_011149	CTT	2	6	215112	215117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249470
4086	NC_011149	TGC	2	6	215142	215147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4087	NC_011149	CGG	2	6	215190	215195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249470
4088	NC_011149	TCG	2	6	215262	215267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4089	NC_011149	GCTG	2	8	215280	215287	0 %	25 %	50 %	25 %	197249470
4090	NC_011149	CGG	2	6	215373	215378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249470
4091	NC_011149	TCG	2	6	215540	215545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4092	NC_011149	CCT	2	6	215613	215618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197249470
4093	NC_011149	CGG	2	6	215629	215634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249470
4094	NC_011149	CG	4	8	215643	215650	0 %	0 %	50 %	50 %	197249470
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4099	NC_011149	TATTGA	2	12	215898	215909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197249470
4100	NC_011149	CG	3	6	216024	216029	0 %	0 %	50 %	50 %	197249470
4101	NC_011149	TGC	2	6	216051	216056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249470
4102	NC_011149	AC	3	6	216067	216072	50 %	0 %	0 %	50 %	197249470
4103	NC_011149	AGCGC	2	10	216073	216082	20 %	0 %	40 %	40 %	197249470
4104	NC_011149	ATAA	2	8	216084	216091	75 %	25 %	0 %	0 %	197249470
4105	NC_011149	GTTT	2	8	216151	216158	0 %	75 %	25 %	0 %	197247820
4106	NC_011149	TGA	2	6	216188	216193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247820
4107	NC_011149	GGC	3	9	216216	216224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247820
4108	NC_011149	ATA	2	6	216315	216320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247820
4109	NC_011149	TTC	2	6	216331	216336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247820
4110	NC_011149	GT	3	6	216455	216460	0 %	50 %	50 %	0 %	197247820
4111	NC_011149	TGC	2	6	216479	216484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247820
4112	NC_011149	CCAG	2	8	216503	216510	25 %	0 %	25 %	50 %	197247820
4113	NC_011149	GCC	2	6	216540	216545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247820
4114	NC_011149	GTA	2	6	216560	216565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247820
4115	NC_011149	GCG	2	6	216596	216601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247820
4116	NC_011149	CGC	2	6	216623	216628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247820
4117	NC_011149	CAA	2	6	216793	216798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197247820
4118	NC_011149	GCGG	2	8	216950	216957	0 %	0 %	75 %	25 %	197248018
4119	NC_011149	CAT	2	6	217081	217086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248018
4120	NC_011149	GC	3	6	217136	217141	0 %	0 %	50 %	50 %	197248018
4121	NC_011149	CTG	2	6	217149	217154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248018
4122	NC_011149	AG	3	6	217230	217235	50 %	0 %	50 %	0 %	197248018
4123	NC_011149	GCG	2	6	217347	217352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248018
4124	NC_011149	AGTG	2	8	217382	217389	25 %	25 %	50 %	0 %	197248018
4125	NC_011149	GAT	2	6	217513	217518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248141
4126	NC_011149	GCG	2	6	217523	217528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248141
4127	NC_011149	GAA	2	6	217530	217535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248141
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4130	NC_011149	AAT	2	6	217671	217676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249142
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4133	NC_011149	A	7	7	217727	217733	100 %	0 %	0 %	0 %	197249142
4134	NC_011149	CAT	2	6	217742	217747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249142
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4137	NC_011149	CGGCG	2	10	217981	217990	0 %	0 %	60 %	40 %	197251223
4138	NC_011149	GTCGC	2	10	218000	218009	0 %	20 %	40 %	40 %	197251223
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4141	NC_011149	GC	3	6	218136	218141	0 %	0 %	50 %	50 %	197251223
4142	NC_011149	CAG	3	9	218165	218173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251223
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4150	NC_011149	ATT	2	6	218682	218687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248288
4151	NC_011149	GGCT	2	8	218743	218750	0 %	25 %	50 %	25 %	197248288
4152	NC_011149	ATC	2	6	218803	218808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248288
4153	NC_011149	TGA	2	6	218819	218824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248288
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4163	NC_011149	ATA	2	6	219244	219249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248288
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4243	NC_011149	GCA	3	9	223318	223326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249173
4244	NC_011149	ATG	2	6	223376	223381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249173
4245	NC_011149	ACG	2	6	223442	223447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249173
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4365	NC_011149	TGC	2	6	228922	228927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247716
4366	NC_011149	CCCG	2	8	229007	229014	0 %	0 %	25 %	75 %	197247716
4367	NC_011149	GCGAA	2	10	229045	229054	40 %	0 %	40 %	20 %	197247716
4368	NC_011149	CG	3	6	229132	229137	0 %	0 %	50 %	50 %	197247716
4369	NC_011149	GAA	2	6	229253	229258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247716
4370	NC_011149	GA	3	6	229332	229337	50 %	0 %	50 %	0 %	197250706
4371	NC_011149	TCT	3	9	229340	229348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250706
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4374	NC_011149	CGT	2	6	229481	229486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251303
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4471	NC_011149	AGCA	2	8	233298	233305	50 %	0 %	25 %	25 %	197250727
4472	NC_011149	TGT	2	6	233357	233362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250727
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4476	NC_011149	ACG	2	6	233500	233505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250727
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4479	NC_011149	ACT	2	6	233712	233717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250727
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4483	NC_011149	CAA	2	6	233960	233965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197250727
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4485	NC_011149	TCTT	2	8	233988	233995	0 %	75 %	0 %	25 %	197250727
4486	NC_011149	GCG	2	6	234048	234053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250727
4487	NC_011149	CGT	2	6	234071	234076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250727
4488	NC_011149	ACG	2	6	234108	234113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250727
4489	NC_011149	CGT	2	6	234163	234168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250727
4490	NC_011149	CTTT	2	8	234184	234191	0 %	75 %	0 %	25 %	197250727
4491	NC_011149	GGCG	2	8	234225	234232	0 %	0 %	75 %	25 %	197250727
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