MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011149	ACG	2	6	187226	187231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3502	NC_011149	GCT	2	6	187330	187335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3503	NC_011149	GCG	2	6	187336	187341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
3504	NC_011149	GGCG	2	8	187360	187367	0 %	0 %	75 %	25 %	197249020
3505	NC_011149	TC	3	6	187371	187376	0 %	50 %	0 %	50 %	197249020
3506	NC_011149	TGT	2	6	187380	187385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249020
3507	NC_011149	TGC	2	6	187395	187400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3508	NC_011149	TGC	3	9	187428	187436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3509	NC_011149	GTG	2	6	187437	187442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
3510	NC_011149	CTG	2	6	187457	187462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3511	NC_011149	CGC	2	6	187463	187468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
3512	NC_011149	CGA	2	6	187473	187478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3513	NC_011149	CTG	2	6	187479	187484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3514	NC_011149	ATT	2	6	187511	187516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249020
3515	NC_011149	CTG	2	6	187538	187543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3516	NC_011149	GCC	2	6	187632	187637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
3517	NC_011149	TGC	2	6	187668	187673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3518	NC_011149	CGC	2	6	187687	187692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
3519	NC_011149	TGG	2	6	187699	187704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
3520	NC_011149	TAT	2	6	187726	187731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249020
3521	NC_011149	TGC	2	6	187767	187772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3522	NC_011149	ATT	2	6	187820	187825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249020
3523	NC_011149	ACC	2	6	187868	187873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249020
3524	NC_011149	ATG	2	6	187874	187879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
3525	NC_011149	ATC	3	9	187883	187891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249020
3526	NC_011149	ATG	2	6	187892	187897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
3527	NC_011149	GTC	3	9	187898	187906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3528	NC_011149	TGG	2	6	187908	187913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
3529	NC_011149	TGA	2	6	187914	187919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
3530	NC_011149	TCG	2	6	187920	187925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3531	NC_011149	TGC	2	6	187939	187944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3532	NC_011149	AAC	2	6	187947	187952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249020
3533	NC_011149	GGT	2	6	187958	187963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
3534	NC_011149	CTG	2	6	188012	188017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3535	NC_011149	CGG	2	6	188042	188047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
3536	NC_011149	ACC	2	6	188106	188111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249020
3537	NC_011149	TGG	2	6	188173	188178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
3538	NC_011149	GTC	2	6	188181	188186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
3539	NC_011149	CGG	2	6	188191	188196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
3540	NC_011149	GAGC	2	8	188266	188273	25 %	0 %	50 %	25 %	197249020
3541	NC_011149	CATC	2	8	188293	188300	25 %	25 %	0 %	50 %	197249020
3542	NC_011149	TGGC	2	8	188421	188428	0 %	25 %	50 %	25 %	197249020
3543	NC_011149	CG	3	6	188470	188475	0 %	0 %	50 %	50 %	197249020
3544	NC_011149	GCC	2	6	188655	188660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
3545	NC_011149	CA	3	6	188730	188735	50 %	0 %	0 %	50 %	197249020
3546	NC_011149	TCG	2	6	189154	189159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3547	NC_011149	AGA	2	6	189164	189169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
3548	NC_011149	TGC	2	6	189194	189199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3549	NC_011149	GCT	2	6	189254	189259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3550	NC_011149	GAA	3	9	189279	189287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
3551	NC_011149	TCC	2	6	189317	189322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197249635
3552	NC_011149	GCT	2	6	189363	189368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3553	NC_011149	ACC	2	6	189384	189389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
3554	NC_011149	CTG	2	6	189423	189428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3555	NC_011149	ACA	2	6	189448	189453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249635
3556	NC_011149	CTG	2	6	189525	189530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3557	NC_011149	ACG	2	6	189547	189552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3558	NC_011149	AGA	2	6	189554	189559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
3559	NC_011149	CCG	2	6	189636	189641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
3560	NC_011149	A	6	6	189649	189654	100 %	0 %	0 %	0 %	197249635
3561	NC_011149	TCACCG	2	12	189655	189666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	197249635
3562	NC_011149	CGA	2	6	189695	189700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3563	NC_011149	A	6	6	189840	189845	100 %	0 %	0 %	0 %	197249635
3564	NC_011149	GTG	2	6	189873	189878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
3565	NC_011149	TTC	2	6	189887	189892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249635
3566	NC_011149	GCG	3	9	189961	189969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3567	NC_011149	TCT	2	6	190000	190005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249635
3568	NC_011149	GC	3	6	190027	190032	0 %	0 %	50 %	50 %	197249635
3569	NC_011149	TGAT	2	8	190075	190082	25 %	50 %	25 %	0 %	197249635
3570	NC_011149	GTGC	2	8	190173	190180	0 %	25 %	50 %	25 %	197249635
3571	NC_011149	GGT	2	6	190182	190187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
3572	NC_011149	ACC	2	6	190218	190223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
3573	NC_011149	AGC	2	6	190290	190295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3574	NC_011149	GGTC	2	8	190322	190329	0 %	25 %	50 %	25 %	197249635
3575	NC_011149	GCG	2	6	190336	190341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3576	NC_011149	TCCG	2	8	190351	190358	0 %	25 %	25 %	50 %	197249635
3577	NC_011149	TAC	2	6	190403	190408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249635
3578	NC_011149	CCG	2	6	190459	190464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
3579	NC_011149	CAC	2	6	190520	190525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
3580	NC_011149	CAC	2	6	190527	190532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
3581	NC_011149	TGC	3	9	190615	190623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3582	NC_011149	CGG	2	6	190640	190645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3583	NC_011149	CGG	2	6	190684	190689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3584	NC_011149	TGG	2	6	190699	190704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
3585	NC_011149	GCC	2	6	190710	190715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
3586	NC_011149	CTG	2	6	190842	190847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3587	NC_011149	GAA	2	6	190856	190861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
3588	NC_011149	TCT	2	6	190876	190881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249635
3589	NC_011149	CTG	2	6	191034	191039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3590	NC_011149	GAT	2	6	191045	191050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249635
3591	NC_011149	CGT	2	6	191070	191075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3592	NC_011149	CGT	2	6	191085	191090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3593	NC_011149	TGGC	2	8	191109	191116	0 %	25 %	50 %	25 %	197249635
3594	NC_011149	GCT	2	6	191126	191131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3595	NC_011149	GAC	2	6	191223	191228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
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3597	NC_011149	CGA	2	6	191264	191269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3598	NC_011149	CG	3	6	191310	191315	0 %	0 %	50 %	50 %	197249635
3599	NC_011149	GCT	2	6	191324	191329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
3600	NC_011149	GCC	2	6	191372	191377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
3601	NC_011149	GAA	2	6	191406	191411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
3602	NC_011149	TAC	2	6	191415	191420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249635
3603	NC_011149	GCG	2	6	191437	191442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3604	NC_011149	CG	3	6	191441	191446	0 %	0 %	50 %	50 %	197249635
3605	NC_011149	GTT	2	6	191461	191466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249635
3606	NC_011149	GGT	2	6	191510	191515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
3607	NC_011149	CTCTAC	2	12	191516	191527	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	197249635
3608	NC_011149	GGC	2	6	191588	191593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3609	NC_011149	GGC	2	6	191597	191602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3610	NC_011149	CGG	2	6	191665	191670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
3611	NC_011149	TACC	2	8	191675	191682	25 %	25 %	0 %	50 %	197249635
3612	NC_011149	CT	3	6	191703	191708	0 %	50 %	0 %	50 %	197249635
3613	NC_011149	GAA	2	6	191795	191800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250230
3614	NC_011149	TAA	2	6	191804	191809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250230
3615	NC_011149	T	7	7	191843	191849	0 %	100 %	0 %	0 %	197250230
3616	NC_011149	GAC	2	6	191905	191910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250230
3617	NC_011149	CTT	2	6	191926	191931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250230
3618	NC_011149	GGC	2	6	192085	192090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250230
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3986	NC_011149	CCA	2	6	210518	210523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251379
3987	NC_011149	TTG	2	6	210544	210549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197251379
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3990	NC_011149	A	7	7	210714	210720	100 %	0 %	0 %	0 %	197251732
3991	NC_011149	CGG	2	6	210728	210733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251732
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3998	NC_011149	CT	3	6	211092	211097	0 %	50 %	0 %	50 %	197251732
3999	NC_011149	CGC	2	6	211110	211115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251732
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