MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011149	GC	3	6	161069	161074	0 %	0 %	50 %	50 %	197248857
3002	NC_011149	AAG	2	6	161127	161132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248857
3003	NC_011149	CCG	2	6	161196	161201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3004	NC_011149	GC	4	8	161206	161213	0 %	0 %	50 %	50 %	197248857
3005	NC_011149	TCA	2	6	161262	161267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248857
3006	NC_011149	TTG	2	6	161268	161273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248857
3007	NC_011149	AAG	2	6	161343	161348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248857
3008	NC_011149	ACT	2	6	161400	161405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248857
3009	NC_011149	CGG	2	6	161442	161447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248857
3010	NC_011149	CTAT	2	8	161472	161479	25 %	50 %	0 %	25 %	197248857
3011	NC_011149	CGT	2	6	161491	161496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248857
3012	NC_011149	GAT	2	6	161515	161520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248857
3013	NC_011149	A	6	6	161562	161567	100 %	0 %	0 %	0 %	197248857
3014	NC_011149	AG	3	6	161663	161668	50 %	0 %	50 %	0 %	197248857
3015	NC_011149	GCG	2	6	161756	161761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248857
3016	NC_011149	CTA	2	6	161772	161777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248857
3017	NC_011149	CGC	2	6	161833	161838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3018	NC_011149	GAA	2	6	161855	161860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248857
3019	NC_011149	CGG	2	6	161917	161922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248857
3020	NC_011149	CCG	2	6	161956	161961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3021	NC_011149	TTC	2	6	162010	162015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248857
3022	NC_011149	ATG	2	6	162080	162085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248857
3023	NC_011149	CTG	2	6	162197	162202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248857
3024	NC_011149	ATG	3	9	162207	162215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248857
3025	NC_011149	CTG	2	6	162260	162265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248857
3026	NC_011149	CCG	2	6	162341	162346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3027	NC_011149	GAG	2	6	162458	162463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248857
3028	NC_011149	AGA	2	6	162514	162519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248857
3029	NC_011149	GGT	2	6	162520	162525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248857
3030	NC_011149	ATG	2	6	162536	162541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248857
3031	NC_011149	TGC	2	6	162564	162569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248857
3032	NC_011149	GGC	2	6	162601	162606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248857
3033	NC_011149	CGC	2	6	162697	162702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3034	NC_011149	GCA	2	6	162826	162831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248857
3035	NC_011149	GCC	2	6	162854	162859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3036	NC_011149	GCC	2	6	162875	162880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3037	NC_011149	CCTTGC	2	12	162914	162925	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197248857
3038	NC_011149	A	6	6	163125	163130	100 %	0 %	0 %	0 %	197250671
3039	NC_011149	ACG	2	6	163165	163170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250671
3040	NC_011149	TTA	2	6	163177	163182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250671
3041	NC_011149	CGC	2	6	163190	163195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250671
3042	NC_011149	CGG	2	6	163229	163234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250671
3043	NC_011149	CGA	2	6	163247	163252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250671
3044	NC_011149	ATT	2	6	163319	163324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250671
3045	NC_011149	AAG	2	6	163411	163416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250671
3046	NC_011149	CCG	2	6	163467	163472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250671
3047	NC_011149	ATT	2	6	163485	163490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250671
3048	NC_011149	TTA	2	6	163548	163553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247778
3049	NC_011149	CGG	3	9	163595	163603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247778
3050	NC_011149	CGT	2	6	163604	163609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3051	NC_011149	GCC	2	6	163630	163635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247778
3052	NC_011149	CAG	2	6	163737	163742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3053	NC_011149	GCA	2	6	163873	163878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3054	NC_011149	TCT	2	6	163882	163887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247778
3055	NC_011149	CGA	2	6	163937	163942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3056	NC_011149	TCT	2	6	164137	164142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247778
3057	NC_011149	GTA	2	6	164172	164177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247778
3058	NC_011149	TCG	2	6	164300	164305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3059	NC_011149	CGA	2	6	164323	164328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3060	NC_011149	CATA	2	8	164372	164379	50 %	25 %	0 %	25 %	197247778
3061	NC_011149	GTC	2	6	164445	164450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3062	NC_011149	TAC	2	6	164540	164545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247778
3063	NC_011149	TAA	2	6	164639	164644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247928
3064	NC_011149	ATG	2	6	164651	164656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247928
3065	NC_011149	GCG	2	6	164716	164721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247928
3066	NC_011149	GGA	2	6	164769	164774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247928
3067	NC_011149	TTG	2	6	164791	164796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247928
3068	NC_011149	ACC	2	6	164803	164808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247928
3069	NC_011149	TGA	2	6	164877	164882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247928
3070	NC_011149	CGG	2	6	164951	164956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247928
3071	NC_011149	AACG	2	8	165055	165062	50 %	0 %	25 %	25 %	197247928
3072	NC_011149	CGC	2	6	165182	165187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247928
3073	NC_011149	TCA	2	6	165203	165208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247928
3074	NC_011149	TC	3	6	165336	165341	0 %	50 %	0 %	50 %	197247928
3075	NC_011149	CGC	2	6	165342	165347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247928
3076	NC_011149	GAG	2	6	165430	165435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247928
3077	NC_011149	CTGC	2	8	165439	165446	0 %	25 %	25 %	50 %	197247928
3078	NC_011149	TAT	2	6	165466	165471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247928
3079	NC_011149	CG	3	6	165478	165483	0 %	0 %	50 %	50 %	197247928
3080	NC_011149	TATT	2	8	165506	165513	25 %	75 %	0 %	0 %	197247928
3081	NC_011149	ATT	2	6	165515	165520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247928
3082	NC_011149	GTC	2	6	165582	165587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248595
3083	NC_011149	CGC	2	6	165602	165607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248595
3084	NC_011149	CGG	2	6	165629	165634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248595
3085	NC_011149	C	6	6	165698	165703	0 %	0 %	0 %	100 %	197248595
3086	NC_011149	GAC	2	6	165705	165710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248595
3087	NC_011149	ACG	2	6	165736	165741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248595
3088	NC_011149	GCA	2	6	165905	165910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3089	NC_011149	CGT	2	6	165917	165922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3090	NC_011149	GATCA	2	10	165984	165993	40 %	20 %	20 %	20 %	197247589
3091	NC_011149	TGT	2	6	166069	166074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247589
3092	NC_011149	GCC	2	6	166119	166124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247589
3093	NC_011149	GCT	2	6	166175	166180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3094	NC_011149	CTG	2	6	166227	166232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3095	NC_011149	GCT	2	6	166295	166300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3096	NC_011149	CAG	2	6	166317	166322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3097	NC_011149	A	6	6	166378	166383	100 %	0 %	0 %	0 %	197247589
3098	NC_011149	TCT	2	6	166466	166471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247589
3099	NC_011149	TTA	2	6	166602	166607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251746
3100	NC_011149	GC	3	6	166634	166639	0 %	0 %	50 %	50 %	197251746
3101	NC_011149	CG	3	6	166681	166686	0 %	0 %	50 %	50 %	197251746
3102	NC_011149	CAT	2	6	166690	166695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251746
3103	NC_011149	CGTCA	2	10	166730	166739	20 %	20 %	20 %	40 %	197251746
3104	NC_011149	ACC	2	6	166740	166745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251746
3105	NC_011149	CAG	2	6	166784	166789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251746
3106	NC_011149	CTG	2	6	166847	166852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251746
3107	NC_011149	TTC	2	6	166889	166894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251746
3108	NC_011149	A	6	6	166903	166908	100 %	0 %	0 %	0 %	197251746
3109	NC_011149	CGG	2	6	166926	166931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251746
3110	NC_011149	CGG	2	6	166945	166950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251746
3111	NC_011149	GGGC	2	8	166990	166997	0 %	0 %	75 %	25 %	197251746
3112	NC_011149	GC	3	6	167018	167023	0 %	0 %	50 %	50 %	197251746
3113	NC_011149	ATA	2	6	167025	167030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251746
3114	NC_011149	CCG	2	6	167100	167105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251746
3115	NC_011149	GAA	2	6	167363	167368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250913
3116	NC_011149	CTG	2	6	167571	167576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250913
3117	NC_011149	GAA	2	6	167597	167602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250913
3118	NC_011149	A	6	6	167685	167690	100 %	0 %	0 %	0 %	197250913
3119	NC_011149	TCG	2	6	167775	167780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250913
3120	NC_011149	ACG	2	6	167912	167917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250913
3121	NC_011149	CGG	2	6	167952	167957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3122	NC_011149	GGC	2	6	167990	167995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3123	NC_011149	GGC	2	6	168011	168016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
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3145	NC_011149	AGA	2	6	169026	169031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250502
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3158	NC_011149	TGA	2	6	169531	169536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250502
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3230	NC_011149	GC	3	6	173947	173952	0 %	0 %	50 %	50 %	197248970
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3234	NC_011149	ATT	2	6	174031	174036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248970
3235	NC_011149	GGC	2	6	174177	174182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249747
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3237	NC_011149	TGG	2	6	174370	174375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249747
3238	NC_011149	CG	3	6	174415	174420	0 %	0 %	50 %	50 %	197249747
3239	NC_011149	TCG	2	6	174423	174428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249747
3240	NC_011149	AGT	2	6	174457	174462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249747
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3242	NC_011149	TGA	2	6	174693	174698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249747
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3482	NC_011149	CGT	2	6	186520	186525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248333
3483	NC_011149	ATA	2	6	186534	186539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248333
3484	NC_011149	TTGG	2	8	186621	186628	0 %	50 %	50 %	0 %	197248333
3485	NC_011149	GTAA	2	8	186691	186698	50 %	25 %	25 %	0 %	197248333
3486	NC_011149	CTG	2	6	186704	186709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248333
3487	NC_011149	GCAT	2	8	186723	186730	25 %	25 %	25 %	25 %	197248333
3488	NC_011149	GCC	2	6	186792	186797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248333
3489	NC_011149	GCC	2	6	186812	186817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248333
3490	NC_011149	TCT	2	6	186852	186857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248333
3491	NC_011149	CGG	2	6	186959	186964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248333
3492	NC_011149	GCC	2	6	186973	186978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248333
3493	NC_011149	CGTTT	2	10	187007	187016	0 %	60 %	20 %	20 %	197248333
3494	NC_011149	T	6	6	187014	187019	0 %	100 %	0 %	0 %	197248333
3495	NC_011149	CCG	2	6	187027	187032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248333
3496	NC_011149	GGC	2	6	187046	187051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248333
3497	NC_011149	GGGGA	2	10	187059	187068	20 %	0 %	80 %	0 %	197248333
3498	NC_011149	ATG	2	6	187166	187171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
3499	NC_011149	CG	3	6	187188	187193	0 %	0 %	50 %	50 %	197249020
3500	NC_011149	GCG	3	9	187191	187199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020

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