MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_011149	GCC	2	6	134664	134669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248574
2503	NC_011149	TCG	2	6	134697	134702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248574
2504	NC_011149	GAT	2	6	134717	134722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248574
2505	NC_011149	CCA	2	6	134848	134853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248574
2506	NC_011149	CG	3	6	134854	134859	0 %	0 %	50 %	50 %	197248574
2507	NC_011149	TCA	2	6	134910	134915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248574
2508	NC_011149	CG	3	6	134948	134953	0 %	0 %	50 %	50 %	197248574
2509	NC_011149	TGC	2	6	134974	134979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248574
2510	NC_011149	TGG	2	6	134986	134991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248574
2511	NC_011149	AAT	2	6	135293	135298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248574
2512	NC_011149	ATG	2	6	135312	135317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248574
2513	NC_011149	CG	3	6	136262	136267	0 %	0 %	50 %	50 %	449785014
2514	NC_011149	CAG	2	6	136467	136472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449785014
2515	NC_011149	ATA	2	6	136511	136516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449785014
2516	NC_011149	A	6	6	136547	136552	100 %	0 %	0 %	0 %	449785014
2517	NC_011149	CGT	2	6	136583	136588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449785014
2518	NC_011149	TTA	2	6	136637	136642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449785014
2519	NC_011149	GAA	2	6	136648	136653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449785014
2520	NC_011149	CGT	2	6	136657	136662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449785014
2521	NC_011149	AAC	2	6	136769	136774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449785014
2522	NC_011149	GTT	2	6	136780	136785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449785014
2523	NC_011149	TC	3	6	136786	136791	0 %	50 %	0 %	50 %	449785014
2524	NC_011149	GCTG	2	8	136925	136932	0 %	25 %	50 %	25 %	449785014
2525	NC_011149	ATGG	2	8	137049	137056	25 %	25 %	50 %	0 %	449785014
2526	NC_011149	TTA	2	6	137062	137067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449785014
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2528	NC_011149	TGT	2	6	137417	137422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248826
2529	NC_011149	GTC	2	6	137437	137442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248826
2530	NC_011149	ATG	2	6	137510	137515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248826
2531	NC_011149	GATC	2	8	137535	137542	25 %	25 %	25 %	25 %	197248826
2532	NC_011149	GTG	2	6	137617	137622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248826
2533	NC_011149	ATTCC	2	10	137684	137693	20 %	40 %	0 %	40 %	197248826
2534	NC_011149	ATTG	2	8	137727	137734	25 %	50 %	25 %	0 %	197248826
2535	NC_011149	ATG	2	6	137738	137743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248826
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2538	NC_011149	CTGG	2	8	137847	137854	0 %	25 %	50 %	25 %	197248826
2539	NC_011149	GGT	2	6	137877	137882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248826
2540	NC_011149	A	7	7	137917	137923	100 %	0 %	0 %	0 %	197248826
2541	NC_011149	A	6	6	138027	138032	100 %	0 %	0 %	0 %	197248826
2542	NC_011149	GGT	2	6	138036	138041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248826
2543	NC_011149	CAT	2	6	138093	138098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248826
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2545	NC_011149	GAC	2	6	138259	138264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248826
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2548	NC_011149	GGT	2	6	138366	138371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248826
2549	NC_011149	GAT	2	6	138442	138447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248826
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2552	NC_011149	AG	3	6	138471	138476	50 %	0 %	50 %	0 %	197248826
2553	NC_011149	GC	3	6	138480	138485	0 %	0 %	50 %	50 %	197248826
2554	NC_011149	GAAAGC	2	12	138511	138522	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	197248826
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2557	NC_011149	CGG	2	6	138660	138665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248826
2558	NC_011149	GAAA	2	8	138723	138730	75 %	0 %	25 %	0 %	197248826
2559	NC_011149	TGG	2	6	138731	138736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248826
2560	NC_011149	GCA	2	6	138755	138760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248826
2561	NC_011149	CTGAAC	2	12	138820	138831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197248826
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2563	NC_011149	TCG	2	6	139034	139039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248826
2564	NC_011149	TGA	2	6	139132	139137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248826
2565	NC_011149	ATA	2	6	139219	139224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248052
2566	NC_011149	AGC	2	6	139321	139326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248052
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2573	NC_011149	GAC	2	6	139644	139649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248162
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2575	NC_011149	CAGG	2	8	139714	139721	25 %	0 %	50 %	25 %	197248162
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2579	NC_011149	TCG	2	6	140342	140347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247480
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2581	NC_011149	GAT	2	6	140404	140409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247480
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2583	NC_011149	GC	3	6	140468	140473	0 %	0 %	50 %	50 %	197247480
2584	NC_011149	CCGCA	2	10	140514	140523	20 %	0 %	20 %	60 %	197247480
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2587	NC_011149	GCT	2	6	140742	140747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247480
2588	NC_011149	TGA	2	6	140835	140840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247480
2589	NC_011149	TCG	2	6	140889	140894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247480
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2591	NC_011149	CATC	2	8	141638	141645	25 %	25 %	0 %	50 %	197249345
2592	NC_011149	CTG	2	6	141654	141659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249345
2593	NC_011149	CCTG	2	8	141668	141675	0 %	25 %	25 %	50 %	197249345
2594	NC_011149	ATT	2	6	141684	141689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249345
2595	NC_011149	GATG	2	8	141776	141783	25 %	25 %	50 %	0 %	197249345
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2597	NC_011149	CAA	2	6	141863	141868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249345
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2599	NC_011149	AC	3	6	141999	142004	50 %	0 %	0 %	50 %	197248687
2600	NC_011149	CGG	2	6	142083	142088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248687
2601	NC_011149	CGAT	2	8	142139	142146	25 %	25 %	25 %	25 %	197248687
2602	NC_011149	CAT	2	6	142200	142205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248687
2603	NC_011149	GCTG	2	8	142224	142231	0 %	25 %	50 %	25 %	197248687
2604	NC_011149	TCT	2	6	142294	142299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248687
2605	NC_011149	CG	3	6	142373	142378	0 %	0 %	50 %	50 %	197248687
2606	NC_011149	GCC	2	6	142387	142392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248687
2607	NC_011149	CGG	2	6	142406	142411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248687
2608	NC_011149	AGG	2	6	142412	142417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248687
2609	NC_011149	GAG	2	6	142450	142455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248687
2610	NC_011149	TTG	2	6	142484	142489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248687
2611	NC_011149	GCG	3	9	142543	142551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248687
2612	NC_011149	GGA	2	6	142629	142634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248687
2613	NC_011149	GCTC	2	8	142655	142662	0 %	25 %	25 %	50 %	197248687
2614	NC_011149	GGCG	2	8	142678	142685	0 %	0 %	75 %	25 %	197248687
2615	NC_011149	ATC	2	6	142693	142698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248687
2616	NC_011149	CGG	2	6	142769	142774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248687
2617	NC_011149	A	6	6	142801	142806	100 %	0 %	0 %	0 %	197248687
2618	NC_011149	AGTTC	2	10	142885	142894	20 %	40 %	20 %	20 %	197248687
2619	NC_011149	AG	3	6	142905	142910	50 %	0 %	50 %	0 %	197248687
2620	NC_011149	CAG	2	6	142925	142930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250573
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2622	NC_011149	CAT	2	6	143054	143059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250573
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2988	NC_011149	GGT	2	6	160471	160476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248857
2989	NC_011149	GGT	2	6	160532	160537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248857
2990	NC_011149	AAC	2	6	160688	160693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248857
2991	NC_011149	GCCA	2	8	160753	160760	25 %	0 %	25 %	50 %	197248857
2992	NC_011149	AAC	2	6	160799	160804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248857
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