MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_011149	GCT	2	6	105536	105541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248833
2004	NC_011149	CCTG	2	8	105544	105551	0 %	25 %	25 %	50 %	197248833
2005	NC_011149	ACG	2	6	105604	105609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248833
2006	NC_011149	ATT	2	6	105612	105617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248833
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2013	NC_011149	AGT	2	6	106009	106014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250730
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2122	NC_011149	CG	3	6	111496	111501	0 %	0 %	50 %	50 %	197248148
2123	NC_011149	CGGCAG	2	12	111543	111554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	197248148
2124	NC_011149	TCA	2	6	111661	111666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248148
2125	NC_011149	GGC	2	6	111669	111674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248148
2126	NC_011149	CGT	2	6	111680	111685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248148
2127	NC_011149	TCG	2	6	111760	111765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248148
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2130	NC_011149	TGGCG	2	10	111918	111927	0 %	20 %	60 %	20 %	197248148
2131	NC_011149	CAG	3	9	111930	111938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248148
2132	NC_011149	AT	3	6	111976	111981	50 %	50 %	0 %	0 %	197248148
2133	NC_011149	GAT	2	6	112013	112018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248148
2134	NC_011149	TCG	2	6	112024	112029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248148
2135	NC_011149	ACC	2	6	112030	112035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248148
2136	NC_011149	GCT	2	6	112073	112078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248148
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2138	NC_011149	GTT	2	6	112115	112120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248148
2139	NC_011149	CGT	2	6	112142	112147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248148
2140	NC_011149	GCA	2	6	112205	112210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248148
2141	NC_011149	GAT	2	6	112248	112253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248148
2142	NC_011149	CCG	2	6	112265	112270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248148
2143	NC_011149	ATA	2	6	112277	112282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248148
2144	NC_011149	ATC	2	6	112297	112302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248148
2145	NC_011149	CAG	2	6	112341	112346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248148
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2147	NC_011149	CAT	2	6	112373	112378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248148
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2149	NC_011149	AGCGC	2	10	112478	112487	20 %	0 %	40 %	40 %	197248148
2150	NC_011149	TCGA	2	8	112500	112507	25 %	25 %	25 %	25 %	197248148
2151	NC_011149	TCT	2	6	112636	112641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248148
2152	NC_011149	GC	3	6	112731	112736	0 %	0 %	50 %	50 %	197248148
2153	NC_011149	CATC	2	8	112787	112794	25 %	25 %	0 %	50 %	197248148
2154	NC_011149	CAA	2	6	112796	112801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248148
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2173	NC_011149	A	6	6	118579	118584	100 %	0 %	0 %	0 %	197250479
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2201	NC_011149	CAG	2	6	119937	119942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251437
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2206	NC_011149	AC	3	6	120090	120095	50 %	0 %	0 %	50 %	197251437
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2210	NC_011149	AGT	3	9	120321	120329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251437
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2212	NC_011149	GGCG	2	8	120429	120436	0 %	0 %	75 %	25 %	197251437
2213	NC_011149	GCT	2	6	120447	120452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251437
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2217	NC_011149	GTCA	2	8	120579	120586	25 %	25 %	25 %	25 %	197251437
2218	NC_011149	GAC	2	6	120714	120719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251437
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2223	NC_011149	AGT	2	6	120853	120858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251437
2224	NC_011149	ACC	2	6	120922	120927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251437
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2226	NC_011149	TGT	2	6	121229	121234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248443
2227	NC_011149	CTG	2	6	121252	121257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248443
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2229	NC_011149	GGC	2	6	121345	121350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2230	NC_011149	CGG	2	6	121380	121385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2231	NC_011149	GCG	2	6	121394	121399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2232	NC_011149	CGA	2	6	121425	121430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248443
2233	NC_011149	GCA	2	6	121456	121461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248443
2234	NC_011149	GCC	2	6	121495	121500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248443
2235	NC_011149	GC	5	10	121556	121565	0 %	0 %	50 %	50 %	197248443
2236	NC_011149	GCG	2	6	121669	121674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2237	NC_011149	CAC	2	6	121693	121698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248443
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2239	NC_011149	CTGG	2	8	121762	121769	0 %	25 %	50 %	25 %	197248443
2240	NC_011149	TGC	2	6	121796	121801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248443
2241	NC_011149	CAC	2	6	121900	121905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248443
2242	NC_011149	GC	3	6	122022	122027	0 %	0 %	50 %	50 %	197248443
2243	NC_011149	CGC	2	6	122061	122066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248443
2244	NC_011149	CGG	2	6	122139	122144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2245	NC_011149	TCA	2	6	122201	122206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248443
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2258	NC_011149	GAT	2	6	122715	122720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248443
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2262	NC_011149	TCG	2	6	122798	122803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248443
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2264	NC_011149	CAATTG	2	12	122859	122870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197248443
2265	NC_011149	T	7	7	123313	123319	0 %	100 %	0 %	0 %	197247811
2266	NC_011149	ATCG	2	8	123320	123327	25 %	25 %	25 %	25 %	197247811
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2270	NC_011149	AT	3	6	123423	123428	50 %	50 %	0 %	0 %	197247811
2271	NC_011149	CCG	2	6	123437	123442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247811
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2278	NC_011149	CCG	2	6	123731	123736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247811
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2333	NC_011149	GCGTCA	2	12	126461	126472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197248623
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2345	NC_011149	GCCA	2	8	126922	126929	25 %	0 %	25 %	50 %	197248623
2346	NC_011149	GCA	2	6	127007	127012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248623
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2359	NC_011149	GTAA	2	8	127519	127526	50 %	25 %	25 %	0 %	197250327
2360	NC_011149	CGG	2	6	127546	127551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250327
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2363	NC_011149	GGT	2	6	127595	127600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250327
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2483	NC_011149	CGT	2	6	133984	133989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248574
2484	NC_011149	GCCGTT	2	12	134033	134044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248574
2485	NC_011149	CGC	2	6	134045	134050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248574
2486	NC_011149	CAC	2	6	134068	134073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248574
2487	NC_011149	TTC	2	6	134153	134158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248574
2488	NC_011149	TAA	2	6	134170	134175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248574
2489	NC_011149	T	6	6	134213	134218	0 %	100 %	0 %	0 %	197248574
2490	NC_011149	CGT	2	6	134239	134244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248574
2491	NC_011149	GGT	2	6	134248	134253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248574
2492	NC_011149	TGT	2	6	134257	134262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248574
2493	NC_011149	CGG	2	6	134305	134310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248574
2494	NC_011149	TGG	2	6	134412	134417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248574
2495	NC_011149	TTG	2	6	134460	134465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248574
2496	NC_011149	CTGG	2	8	134501	134508	0 %	25 %	50 %	25 %	197248574
2497	NC_011149	GTG	2	6	134522	134527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248574
2498	NC_011149	GT	3	6	134538	134543	0 %	50 %	50 %	0 %	197248574
2499	NC_011149	ATG	2	6	134550	134555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248574
2500	NC_011149	CTT	2	6	134584	134589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248574

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