MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011149	CTC	2	6	77776	77781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197250511
1502	NC_011149	GCC	2	6	77825	77830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250511
1503	NC_011149	CGA	2	6	77854	77859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1504	NC_011149	TGA	2	6	77862	77867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250511
1505	NC_011149	CCT	2	6	77895	77900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197250511
1506	NC_011149	ACC	2	6	77981	77986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250511
1507	NC_011149	TCGG	2	8	77996	78003	0 %	25 %	50 %	25 %	197250511
1508	NC_011149	CGCA	2	8	78023	78030	25 %	0 %	25 %	50 %	197250511
1509	NC_011149	CGA	2	6	78103	78108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1510	NC_011149	CCG	2	6	78130	78135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250511
1511	NC_011149	TC	3	6	78196	78201	0 %	50 %	0 %	50 %	197250511
1512	NC_011149	GGCG	2	8	78373	78380	0 %	0 %	75 %	25 %	197250511
1513	NC_011149	GCG	2	6	78455	78460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1514	NC_011149	GCGAA	2	10	78510	78519	40 %	0 %	40 %	20 %	197250511
1515	NC_011149	CCGT	2	8	78521	78528	0 %	25 %	25 %	50 %	197250511
1516	NC_011149	CGG	3	9	78553	78561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1517	NC_011149	ACT	2	6	78594	78599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250511
1518	NC_011149	CAT	2	6	78646	78651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250511
1519	NC_011149	CGG	2	6	78784	78789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1520	NC_011149	GC	5	10	78809	78818	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
1521	NC_011149	CG	3	6	78869	78874	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
1522	NC_011149	TGG	2	6	78993	78998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250511
1523	NC_011149	CTT	2	6	79005	79010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250511
1524	NC_011149	CGG	2	6	79077	79082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1525	NC_011149	TGC	2	6	79107	79112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1526	NC_011149	TGA	2	6	79126	79131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250511
1527	NC_011149	GTGGAC	2	12	79142	79153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197250511
1528	NC_011149	GGC	2	6	79184	79189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1529	NC_011149	GGCG	2	8	79210	79217	0 %	0 %	75 %	25 %	197250511
1530	NC_011149	CAG	2	6	79289	79294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1531	NC_011149	TGA	2	6	79332	79337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250511
1532	NC_011149	GCG	2	6	79394	79399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1533	NC_011149	GGC	2	6	79450	79455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1534	NC_011149	GC	3	6	79454	79459	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
1535	NC_011149	TAC	2	6	79517	79522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250511
1536	NC_011149	GTG	2	6	79535	79540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250511
1537	NC_011149	CCA	2	6	79668	79673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250511
1538	NC_011149	GAA	2	6	79675	79680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250511
1539	NC_011149	GCT	2	6	79693	79698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1540	NC_011149	GTG	2	6	79727	79732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250511
1541	NC_011149	CGC	2	6	79738	79743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250511
1542	NC_011149	GCT	2	6	79747	79752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1543	NC_011149	CCAC	2	8	79776	79783	25 %	0 %	0 %	75 %	197250511
1544	NC_011149	GTC	2	6	79848	79853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1545	NC_011149	ATC	2	6	79895	79900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250511
1546	NC_011149	ACC	2	6	79904	79909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250511
1547	NC_011149	GCC	2	6	79914	79919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250511
1548	NC_011149	CGC	2	6	79946	79951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250511
1549	NC_011149	GC	3	6	79953	79958	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511
1550	NC_011149	CGG	2	6	79993	79998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250511
1551	NC_011149	ACG	2	6	80006	80011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1552	NC_011149	CGTC	2	8	80855	80862	0 %	25 %	25 %	50 %	197248515
1553	NC_011149	CGGT	2	8	80877	80884	0 %	25 %	50 %	25 %	197248515
1554	NC_011149	TTC	2	6	80886	80891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248515
1555	NC_011149	GTA	2	6	81005	81010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248515
1556	NC_011149	CG	3	6	81011	81016	0 %	0 %	50 %	50 %	197248515
1557	NC_011149	CAG	2	6	81030	81035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248515
1558	NC_011149	TTGCC	2	10	81036	81045	0 %	40 %	20 %	40 %	197248515
1559	NC_011149	GGC	2	6	81078	81083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248515
1560	NC_011149	CT	3	6	81091	81096	0 %	50 %	0 %	50 %	197248515
1561	NC_011149	CGTCC	2	10	81146	81155	0 %	20 %	20 %	60 %	197248515
1562	NC_011149	CAC	2	6	81156	81161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248515
1563	NC_011149	GGTATC	2	12	81213	81224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197248515
1564	NC_011149	GCCT	2	8	81264	81271	0 %	25 %	25 %	50 %	197248515
1565	NC_011149	CAC	2	6	81390	81395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248515
1566	NC_011149	TCT	2	6	81599	81604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251288
1567	NC_011149	CGC	2	6	81636	81641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251288
1568	NC_011149	CTT	2	6	81660	81665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251288
1569	NC_011149	CG	3	6	81685	81690	0 %	0 %	50 %	50 %	197251288
1570	NC_011149	GTT	2	6	81738	81743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197251288
1571	NC_011149	CG	4	8	81753	81760	0 %	0 %	50 %	50 %	197251288
1572	NC_011149	CTT	2	6	81816	81821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251288
1573	NC_011149	GCA	2	6	81873	81878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251288
1574	NC_011149	CGC	3	9	81897	81905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251288
1575	NC_011149	CCG	2	6	81975	81980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251288
1576	NC_011149	CCG	2	6	81998	82003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251288
1577	NC_011149	GCC	2	6	82075	82080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251288
1578	NC_011149	CAGC	2	8	82133	82140	25 %	0 %	25 %	50 %	197251288
1579	NC_011149	CGC	2	6	82158	82163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251288
1580	NC_011149	GGTC	2	8	82262	82269	0 %	25 %	50 %	25 %	197251288
1581	NC_011149	ACTC	2	8	82314	82321	25 %	25 %	0 %	50 %	197251288
1582	NC_011149	T	8	8	82387	82394	0 %	100 %	0 %	0 %	197247510
1583	NC_011149	ATT	2	6	82396	82401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247510
1584	NC_011149	TCA	2	6	82549	82554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247510
1585	NC_011149	ACCA	2	8	82572	82579	50 %	0 %	0 %	50 %	197247510
1586	NC_011149	ATA	2	6	82612	82617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247510
1587	NC_011149	CGC	2	6	82649	82654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247510
1588	NC_011149	CATCCT	2	12	82697	82708	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	197247510
1589	NC_011149	CGG	2	6	82841	82846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247510
1590	NC_011149	TCG	2	6	82864	82869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1591	NC_011149	AAT	2	6	82944	82949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247510
1592	NC_011149	CAG	2	6	82983	82988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1593	NC_011149	TGC	2	6	83068	83073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1594	NC_011149	GCG	2	6	83086	83091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247510
1595	NC_011149	ATC	3	9	83113	83121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247510
1596	NC_011149	TGC	2	6	83207	83212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1597	NC_011149	GCG	2	6	83233	83238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247510
1598	NC_011149	TCA	2	6	83287	83292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247510
1599	NC_011149	AGT	2	6	83318	83323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247510
1600	NC_011149	ACC	2	6	83356	83361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247510
1601	NC_011149	GGT	2	6	83376	83381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247510
1602	NC_011149	CCG	2	6	83402	83407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247510
1603	NC_011149	GTG	2	6	83443	83448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197247510
1604	NC_011149	CGT	2	6	83486	83491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1605	NC_011149	GCT	2	6	83501	83506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1606	NC_011149	CAGA	2	8	83514	83521	50 %	0 %	25 %	25 %	197247510
1607	NC_011149	CAG	2	6	83592	83597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1608	NC_011149	TTC	2	6	83631	83636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247510
1609	NC_011149	A	6	6	83768	83773	100 %	0 %	0 %	0 %	197247510
1610	NC_011149	GTC	2	6	83886	83891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247510
1611	NC_011149	GGC	2	6	84071	84076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250411
1612	NC_011149	GTT	2	6	84122	84127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250411
1613	NC_011149	ATG	2	6	84141	84146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250411
1614	NC_011149	TCAGC	2	10	84265	84274	20 %	20 %	20 %	40 %	197250411
1615	NC_011149	GC	3	6	84278	84283	0 %	0 %	50 %	50 %	197250411
1616	NC_011149	GT	4	8	84300	84307	0 %	50 %	50 %	0 %	197250411
1617	NC_011149	GCCA	2	8	84309	84316	25 %	0 %	25 %	50 %	197250411
1618	NC_011149	CGA	2	6	84334	84339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250411
1619	NC_011149	GATG	2	8	84364	84371	25 %	25 %	50 %	0 %	197250411
1620	NC_011149	GGCCA	2	10	84413	84422	20 %	0 %	40 %	40 %	197250411
1621	NC_011149	GTA	2	6	84512	84517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250411
1622	NC_011149	CGC	2	6	84553	84558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250411
1623	NC_011149	AGT	2	6	84565	84570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250411
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1997	NC_011149	CGA	2	6	105271	105276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248833
1998	NC_011149	GTT	2	6	105282	105287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248833
1999	NC_011149	ATC	2	6	105304	105309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248833
2000	NC_011149	TTGTT	2	10	105391	105400	0 %	80 %	20 %	0 %	197248833

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