MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011149	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	197248853
1002	NC_011149	GT	3	6	52916	52921	0 %	50 %	50 %	0 %	197248853
1003	NC_011149	GAA	2	6	52986	52991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248853
1004	NC_011149	GGT	3	9	53012	53020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248853
1005	NC_011149	GCG	2	6	53119	53124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248853
1006	NC_011149	TGTGC	2	10	53132	53141	0 %	40 %	40 %	20 %	197248853
1007	NC_011149	CGC	2	6	53154	53159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248853
1008	NC_011149	CTG	2	6	53196	53201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248853
1009	NC_011149	GAT	2	6	53238	53243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248853
1010	NC_011149	TTA	2	6	53280	53285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248853
1011	NC_011149	GGC	2	6	53343	53348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248853
1012	NC_011149	AGT	2	6	53358	53363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248853
1013	NC_011149	GGA	2	6	53387	53392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248853
1014	NC_011149	CTG	2	6	53415	53420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248853
1015	NC_011149	CGA	2	6	53459	53464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248853
1016	NC_011149	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	197248853
1017	NC_011149	CAA	2	6	53625	53630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248853
1018	NC_011149	CTG	2	6	53643	53648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248853
1019	NC_011149	AGC	2	6	53713	53718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248853
1020	NC_011149	TGA	2	6	53732	53737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248853
1021	NC_011149	T	6	6	53781	53786	0 %	100 %	0 %	0 %	197248853
1022	NC_011149	TGA	2	6	53850	53855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1023	NC_011149	GCG	2	6	53904	53909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248475
1024	NC_011149	GAT	3	9	53951	53959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1025	NC_011149	CAT	2	6	53968	53973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248475
1026	NC_011149	A	6	6	53984	53989	100 %	0 %	0 %	0 %	197248475
1027	NC_011149	A	7	7	53993	53999	100 %	0 %	0 %	0 %	197248475
1028	NC_011149	ATG	2	6	54012	54017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1029	NC_011149	GCA	2	6	54036	54041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1030	NC_011149	CAT	2	6	54343	54348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248475
1031	NC_011149	CG	3	6	54350	54355	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
1032	NC_011149	GCGGAA	2	12	54437	54448	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	197248475
1033	NC_011149	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	197248475
1034	NC_011149	ACC	2	6	54572	54577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248475
1035	NC_011149	CTG	2	6	54758	54763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1036	NC_011149	CTG	2	6	55007	55012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1037	NC_011149	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
1038	NC_011149	A	6	6	55041	55046	100 %	0 %	0 %	0 %	197248475
1039	NC_011149	GCA	2	6	55048	55053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1040	NC_011149	CG	3	6	55097	55102	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
1041	NC_011149	AAG	2	6	55131	55136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248475
1042	NC_011149	GCT	2	6	55303	55308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1043	NC_011149	GGC	2	6	55327	55332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248475
1044	NC_011149	GTG	2	6	55378	55383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248475
1045	NC_011149	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	197248475
1046	NC_011149	CCA	2	6	55473	55478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248475
1047	NC_011149	TGC	2	6	55519	55524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1048	NC_011149	TCC	2	6	55571	55576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197248475
1049	NC_011149	TGA	2	6	55578	55583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1050	NC_011149	CGC	2	6	55692	55697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248475
1051	NC_011149	TGA	2	6	55704	55709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1052	NC_011149	TGC	2	6	55798	55803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1053	NC_011149	TCG	2	6	55813	55818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1054	NC_011149	CG	3	6	55831	55836	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
1055	NC_011149	CTG	2	6	55841	55846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1056	NC_011149	TGG	2	6	55899	55904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248475
1057	NC_011149	GCA	2	6	55942	55947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1058	NC_011149	GGT	2	6	55987	55992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248475
1059	NC_011149	CAT	2	6	56044	56049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248475
1060	NC_011149	CG	3	6	56086	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	197248475
1061	NC_011149	TGA	2	6	56170	56175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1062	NC_011149	ACG	2	6	56232	56237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1063	NC_011149	GTT	2	6	56239	56244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248475
1064	NC_011149	GAA	2	6	56261	56266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248475
1065	NC_011149	CAA	2	6	56314	56319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248475
1066	NC_011149	AAG	2	6	56411	56416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248475
1067	NC_011149	G	6	6	56485	56490	0 %	0 %	100 %	0 %	197248475
1068	NC_011149	TGA	3	9	56494	56502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1069	NC_011149	GCT	2	6	56577	56582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248475
1070	NC_011149	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	197248475
1071	NC_011149	AAC	2	6	56667	56672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248475
1072	NC_011149	TGA	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248475
1073	NC_011149	GTA	2	6	56731	56736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247967
1074	NC_011149	GCA	2	6	56759	56764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247967
1075	NC_011149	TCC	2	6	56774	56779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197247967
1076	NC_011149	GCG	2	6	56876	56881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247967
1077	NC_011149	TGA	2	6	56939	56944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247967
1078	NC_011149	ATC	2	6	56995	57000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247967
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1080	NC_011149	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	197247967
1081	NC_011149	TGT	2	6	57045	57050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247967
1082	NC_011149	CGGCG	2	10	57123	57132	0 %	0 %	60 %	40 %	197247967
1083	NC_011149	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	197249530
1084	NC_011149	GTG	2	6	57253	57258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249530
1085	NC_011149	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	197249034
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1088	NC_011149	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	197249034
1089	NC_011149	AGC	3	9	57486	57494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249034
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1091	NC_011149	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	197249034
1092	NC_011149	CGC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249034
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1094	NC_011149	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	197249034
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1096	NC_011149	GC	3	6	57881	57886	0 %	0 %	50 %	50 %	197251022
1097	NC_011149	GC	4	8	58111	58118	0 %	0 %	50 %	50 %	197251022
1098	NC_011149	G	6	6	58207	58212	0 %	0 %	100 %	0 %	197251022
1099	NC_011149	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	197251022
1100	NC_011149	TCG	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251022
1101	NC_011149	ACT	2	6	58390	58395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251022
1102	NC_011149	GTG	2	6	58438	58443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251022
1103	NC_011149	TGG	2	6	58445	58450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251022
1104	NC_011149	TCTAAC	2	12	58468	58479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251022
1105	NC_011149	GAA	2	6	58508	58513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197251022
1106	NC_011149	CGA	2	6	58527	58532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251022
1107	NC_011149	GCG	2	6	58534	58539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251022
1108	NC_011149	AGG	2	6	58547	58552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197251022
1109	NC_011149	GCC	2	6	58567	58572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251022
1110	NC_011149	GGC	3	9	58648	58656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251022
1111	NC_011149	GAA	2	6	58681	58686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197251022
1112	NC_011149	T	6	6	58909	58914	0 %	100 %	0 %	0 %	197250613
1113	NC_011149	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	197250613
1114	NC_011149	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	197247355
1115	NC_011149	GAA	2	6	59195	59200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247355
1116	NC_011149	CAG	2	6	59242	59247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247355
1117	NC_011149	A	6	6	59279	59284	100 %	0 %	0 %	0 %	197247355
1118	NC_011149	CACGAA	2	12	59347	59358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	197247355
1119	NC_011149	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	197247355
1120	NC_011149	G	6	6	59505	59510	0 %	0 %	100 %	0 %	197247355
1121	NC_011149	GCG	2	6	59697	59702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247355
1122	NC_011149	TGC	2	6	59705	59710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247355
1123	NC_011149	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	197247355
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1125	NC_011149	TAT	2	6	59848	59853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247355
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1499	NC_011149	GTC	2	6	77736	77741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250511
1500	NC_011149	CG	3	6	77763	77768	0 %	0 %	50 %	50 %	197250511

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