MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011149	TGC	2	6	322480	322485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513447904
6002	NC_011149	GTA	2	6	322545	322550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513447904
6003	NC_011149	GAA	2	6	322580	322585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513447904
6004	NC_011149	ATT	2	6	323484	323489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250194
6005	NC_011149	A	6	6	323502	323507	100 %	0 %	0 %	0 %	197250194
6006	NC_011149	GGT	2	6	323508	323513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250194
6007	NC_011149	A	7	7	323532	323538	100 %	0 %	0 %	0 %	197250194
6008	NC_011149	ATG	2	6	323563	323568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250194
6009	NC_011149	GCT	2	6	323569	323574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250194
6010	NC_011149	GTT	2	6	323576	323581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250194
6011	NC_011149	G	9	9	323765	323773	0 %	0 %	100 %	0 %	289472798
6012	NC_011149	GGCA	2	8	323881	323888	25 %	0 %	50 %	25 %	289472798
6013	NC_011149	GA	3	6	323901	323906	50 %	0 %	50 %	0 %	289472798
6014	NC_011149	TAC	2	6	323943	323948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289472798
6015	NC_011149	AATT	2	8	324110	324117	50 %	50 %	0 %	0 %	197248201
6016	NC_011149	GCC	2	6	324171	324176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248201
6017	NC_011149	GCA	2	6	324179	324184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248201
6018	NC_011149	AGA	2	6	324323	324328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449785017
6019	NC_011149	GCC	2	6	324359	324364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449785017
6020	NC_011149	CAG	2	6	324387	324392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449785017
6021	NC_011149	TAT	2	6	324404	324409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449785017
6022	NC_011149	TGG	2	6	324416	324421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449785017
6023	NC_011149	ACC	2	6	324473	324478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449785017
6024	NC_011149	CAA	2	6	324629	324634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449785017
6025	NC_011149	ACCCC	2	10	324649	324658	20 %	0 %	0 %	80 %	449785017
6026	NC_011149	C	7	7	324722	324728	0 %	0 %	0 %	100 %	449785017
6027	NC_011149	GTG	2	6	324766	324771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449785017
6028	NC_011149	ATT	2	6	324786	324791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449785017
6029	NC_011149	GGT	2	6	324801	324806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449785017
6030	NC_011149	AAC	2	6	324873	324878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248731
6031	NC_011149	ACA	2	6	325003	325008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248731
6032	NC_011149	GTCA	2	8	325127	325134	25 %	25 %	25 %	25 %	197248731
6033	NC_011149	AGC	2	6	325183	325188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248731
6034	NC_011149	AAT	2	6	325253	325258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248731
6035	NC_011149	GCAACT	2	12	325261	325272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197248731
6036	NC_011149	GAT	2	6	325334	325339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248731
6037	NC_011149	TGA	2	6	325356	325361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248731
6038	NC_011149	GCGTG	2	10	325460	325469	0 %	20 %	60 %	20 %	197248731
6039	NC_011149	GGCA	2	8	325518	325525	25 %	0 %	50 %	25 %	197248731
6040	NC_011149	GTC	2	6	325566	325571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248731
6041	NC_011149	ACA	2	6	325650	325655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248731
6042	NC_011149	CGCA	2	8	325706	325713	25 %	0 %	25 %	50 %	197248731
6043	NC_011149	ACA	2	6	325752	325757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248731
6044	NC_011149	AGT	2	6	325808	325813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248731
6045	NC_011149	CGG	2	6	326023	326028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248731
6046	NC_011149	G	6	6	326071	326076	0 %	0 %	100 %	0 %	197248731
6047	NC_011149	TC	3	6	326078	326083	0 %	50 %	0 %	50 %	197248731
6048	NC_011149	AC	4	8	326118	326125	50 %	0 %	0 %	50 %	197248731
6049	NC_011149	CCT	2	6	326160	326165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197248731
6050	NC_011149	T	7	7	326209	326215	0 %	100 %	0 %	0 %	197248731
6051	NC_011149	TAC	2	6	326335	326340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248731
6052	NC_011149	AGTC	2	8	326351	326358	25 %	25 %	25 %	25 %	197248731
6053	NC_011149	ATG	2	6	326427	326432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248731
6054	NC_011149	GC	3	6	326520	326525	0 %	0 %	50 %	50 %	197248731
6055	NC_011149	AAT	2	6	326585	326590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248731
6056	NC_011149	GGT	2	6	326627	326632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248731
6057	NC_011149	CAA	2	6	326639	326644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248731
6058	NC_011149	TCAG	2	8	326667	326674	25 %	25 %	25 %	25 %	197248731
6059	NC_011149	GGT	3	9	326723	326731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248731
6060	NC_011149	GGT	2	6	326780	326785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248731
6061	NC_011149	CCA	2	6	326848	326853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248731
6062	NC_011149	GGC	2	6	326933	326938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248731
6063	NC_011149	CA	3	6	327052	327057	50 %	0 %	0 %	50 %	197248731
6064	NC_011149	GTG	2	6	327071	327076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248731
6065	NC_011149	GGT	2	6	327091	327096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248731
6066	NC_011149	TGA	2	6	327135	327140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248731
6067	NC_011149	TGC	2	6	327211	327216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248731
6068	NC_011149	TGG	2	6	327219	327224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248731
6069	NC_011149	CGC	2	6	327481	327486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247822
6070	NC_011149	ACTT	2	8	327518	327525	25 %	50 %	0 %	25 %	197247822
6071	NC_011149	GATGG	2	10	327545	327554	20 %	20 %	60 %	0 %	197247822
6072	NC_011149	TGC	2	6	327648	327653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247822
6073	NC_011149	AGG	2	6	327852	327857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247822
6074	NC_011149	TGGC	2	8	328375	328382	0 %	25 %	50 %	25 %	197248294
6075	NC_011149	CTGG	2	8	328388	328395	0 %	25 %	50 %	25 %	197248294
6076	NC_011149	CTG	2	6	328406	328411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248294
6077	NC_011149	GGC	2	6	328477	328482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248294
6078	NC_011149	TGC	2	6	328514	328519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248294
6079	NC_011149	TCTT	2	8	328544	328551	0 %	75 %	0 %	25 %	197248294
6080	NC_011149	ATG	2	6	328613	328618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248294
6081	NC_011149	TGA	2	6	328650	328655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248294
6082	NC_011149	TGC	2	6	328661	328666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248294
6083	NC_011149	TTG	2	6	328703	328708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248294
6084	NC_011149	CGCACA	2	12	328718	328729	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	197248294
6085	NC_011149	TTC	2	6	328793	328798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248294
6086	NC_011149	GCTG	2	8	329003	329010	0 %	25 %	50 %	25 %	197248294
6087	NC_011149	CGT	2	6	329014	329019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248294
6088	NC_011149	CAC	2	6	329031	329036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248294
6089	NC_011149	GCT	2	6	329052	329057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248294
6090	NC_011149	CTGA	2	8	329087	329094	25 %	25 %	25 %	25 %	197248294
6091	NC_011149	TAT	2	6	329663	329668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250853
6092	NC_011149	ATG	2	6	329911	329916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251913
6093	NC_011149	AAT	2	6	329926	329931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251913
6094	NC_011149	GAT	2	6	329949	329954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251913
6095	NC_011149	TTA	2	6	329957	329962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251913
6096	NC_011149	CTG	2	6	330020	330025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251913
6097	NC_011149	GCC	2	6	330041	330046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251913
6098	NC_011149	TTACT	2	10	330065	330074	20 %	60 %	0 %	20 %	197251913
6099	NC_011149	ACTG	2	8	330099	330106	25 %	25 %	25 %	25 %	197251913
6100	NC_011149	AGCT	2	8	330273	330280	25 %	25 %	25 %	25 %	197251913
6101	NC_011149	T	7	7	330324	330330	0 %	100 %	0 %	0 %	197251913
6102	NC_011149	TGA	2	6	330348	330353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251913
6103	NC_011149	AT	3	6	330444	330449	50 %	50 %	0 %	0 %	197251913
6104	NC_011149	ATT	2	6	330496	330501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251913
6105	NC_011149	AAT	2	6	330601	330606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251913
6106	NC_011149	GGCTT	2	10	330663	330672	0 %	40 %	40 %	20 %	197251913
6107	NC_011149	CCA	2	6	330674	330679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251913
6108	NC_011149	A	6	6	330687	330692	100 %	0 %	0 %	0 %	197251913
6109	NC_011149	TAT	2	6	330769	330774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251913
6110	NC_011149	AAT	2	6	330820	330825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251913
6111	NC_011149	ATG	2	6	330848	330853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251913
6112	NC_011149	TCC	2	6	331144	331149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197249672
6113	NC_011149	CT	3	6	331444	331449	0 %	50 %	0 %	50 %	197248128
6114	NC_011149	CCAA	2	8	331562	331569	50 %	0 %	0 %	50 %	197248128
6115	NC_011149	AACAT	2	10	331581	331590	60 %	20 %	0 %	20 %	197248128
6116	NC_011149	TTG	2	6	331701	331706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248128
6117	NC_011149	AAAG	2	8	331822	331829	75 %	0 %	25 %	0 %	197248128
6118	NC_011149	ACACC	2	10	331875	331884	40 %	0 %	0 %	60 %	197248128
6119	NC_011149	CAATC	2	10	332083	332092	40 %	20 %	0 %	40 %	197248128
6120	NC_011149	A	6	6	332134	332139	100 %	0 %	0 %	0 %	197248128
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6122	NC_011149	AACT	2	8	332221	332228	50 %	25 %	0 %	25 %	197248128
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6486	NC_011149	AACC	2	8	357892	357899	50 %	0 %	0 %	50 %	197251752
6487	NC_011149	CTG	3	9	357953	357961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251752
6488	NC_011149	GCG	2	6	358018	358023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251752
6489	NC_011149	GCT	2	6	358074	358079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251752
6490	NC_011149	ATGG	2	8	358082	358089	25 %	25 %	50 %	0 %	197251752
6491	NC_011149	GCA	2	6	358105	358110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251752
6492	NC_011149	A	6	6	358129	358134	100 %	0 %	0 %	0 %	197251752
6493	NC_011149	GAC	2	6	358178	358183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251752
6494	NC_011149	CGGG	2	8	358225	358232	0 %	0 %	75 %	25 %	197251752
6495	NC_011149	ATCC	2	8	358262	358269	25 %	25 %	0 %	50 %	197251752
6496	NC_011149	TA	3	6	358289	358294	50 %	50 %	0 %	0 %	197251752
6497	NC_011149	TGG	2	6	358345	358350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251752
6498	NC_011149	A	6	6	358358	358363	100 %	0 %	0 %	0 %	197251752
6499	NC_011149	GTC	2	6	358439	358444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251752
6500	NC_011149	CAT	2	6	358464	358469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251752

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