MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011149	TAA	2	6	285687	285692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250206
5502	NC_011149	CAT	2	6	285770	285775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248168
5503	NC_011149	TAT	2	6	285801	285806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248168
5504	NC_011149	TTG	2	6	285888	285893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248168
5505	NC_011149	GCG	2	6	285922	285927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248168
5506	NC_011149	CT	3	6	285997	286002	0 %	50 %	0 %	50 %	197248168
5507	NC_011149	T	6	6	286068	286073	0 %	100 %	0 %	0 %	197248168
5508	NC_011149	GCTG	2	8	286088	286095	0 %	25 %	50 %	25 %	197248168
5509	NC_011149	TCA	2	6	286115	286120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248168
5510	NC_011149	ATA	2	6	286141	286146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248168
5511	NC_011149	CGC	2	6	286150	286155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248168
5512	NC_011149	AAG	2	6	286186	286191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248168
5513	NC_011149	CTGT	2	8	286256	286263	0 %	50 %	25 %	25 %	197248168
5514	NC_011149	T	6	6	286272	286277	0 %	100 %	0 %	0 %	197248168
5515	NC_011149	GGC	2	6	286278	286283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248168
5516	NC_011149	GCT	2	6	286331	286336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5517	NC_011149	GTAT	2	8	286447	286454	25 %	50 %	25 %	0 %	197248168
5518	NC_011149	TGA	3	9	286519	286527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248168
5519	NC_011149	CT	3	6	286540	286545	0 %	50 %	0 %	50 %	197248168
5520	NC_011149	CGG	2	6	286580	286585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248168
5521	NC_011149	CTG	2	6	286695	286700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5522	NC_011149	GCG	2	6	286813	286818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248168
5523	NC_011149	GGC	2	6	286871	286876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248168
5524	NC_011149	ATG	2	6	286944	286949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248168
5525	NC_011149	CGG	2	6	286999	287004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248168
5526	NC_011149	TGC	2	6	287008	287013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5527	NC_011149	GATT	2	8	287032	287039	25 %	50 %	25 %	0 %	197248168
5528	NC_011149	TGA	2	6	287141	287146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248168
5529	NC_011149	TGA	2	6	287201	287206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248168
5530	NC_011149	GATG	2	8	287255	287262	25 %	25 %	50 %	0 %	197248168
5531	NC_011149	CGC	2	6	287294	287299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248168
5532	NC_011149	TGG	2	6	287302	287307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248168
5533	NC_011149	GTG	3	9	287331	287339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248168
5534	NC_011149	A	6	6	287341	287346	100 %	0 %	0 %	0 %	197248168
5535	NC_011149	CTG	2	6	287361	287366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5536	NC_011149	GCT	2	6	287408	287413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5537	NC_011149	TGC	2	6	287581	287586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5538	NC_011149	GAT	2	6	287609	287614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248168
5539	NC_011149	CTG	2	6	287790	287795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248168
5540	NC_011149	TGCTC	2	10	287797	287806	0 %	40 %	20 %	40 %	197248168
5541	NC_011149	TCA	2	6	287982	287987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251017
5542	NC_011149	TCCCT	2	10	288144	288153	0 %	40 %	0 %	60 %	197251017
5543	NC_011149	T	6	6	288303	288308	0 %	100 %	0 %	0 %	197251017
5544	NC_011149	CT	3	6	288444	288449	0 %	50 %	0 %	50 %	197249380
5545	NC_011149	GCG	2	6	288475	288480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249380
5546	NC_011149	TCA	2	6	288563	288568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249380
5547	NC_011149	GC	3	6	288702	288707	0 %	0 %	50 %	50 %	197249380
5548	NC_011149	GCA	2	6	288758	288763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5549	NC_011149	CTG	2	6	288789	288794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5550	NC_011149	CCGG	2	8	288816	288823	0 %	0 %	50 %	50 %	197249380
5551	NC_011149	CTT	2	6	288867	288872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249380
5552	NC_011149	GA	3	6	288884	288889	50 %	0 %	50 %	0 %	197249380
5553	NC_011149	T	6	6	288980	288985	0 %	100 %	0 %	0 %	197249380
5554	NC_011149	GCA	2	6	289010	289015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5555	NC_011149	GCG	2	6	289035	289040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249380
5556	NC_011149	GCT	2	6	289079	289084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5557	NC_011149	ACG	2	6	289122	289127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5558	NC_011149	CT	3	6	289143	289148	0 %	50 %	0 %	50 %	197249380
5559	NC_011149	CGG	2	6	289173	289178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249380
5560	NC_011149	GCG	2	6	289179	289184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249380
5561	NC_011149	GCTG	2	8	289195	289202	0 %	25 %	50 %	25 %	197249380
5562	NC_011149	AGG	2	6	289255	289260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197249380
5563	NC_011149	TGGCGC	2	12	289261	289272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197249380
5564	NC_011149	CGA	2	6	289274	289279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5565	NC_011149	TGG	2	6	289338	289343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249380
5566	NC_011149	ACA	2	6	289361	289366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249380
5567	NC_011149	ACG	2	6	289371	289376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5568	NC_011149	CTGC	2	8	289410	289417	0 %	25 %	25 %	50 %	197249380
5569	NC_011149	GGC	2	6	289446	289451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249380
5570	NC_011149	GAA	2	6	289473	289478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249380
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5572	NC_011149	CGA	2	6	289584	289589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249380
5573	NC_011149	CGC	2	6	289597	289602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249380
5574	NC_011149	TGT	2	6	289603	289608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249380
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5577	NC_011149	AAG	2	6	289675	289680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249380
5578	NC_011149	ATG	2	6	289976	289981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248247
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5580	NC_011149	GCA	2	6	290074	290079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248965
5581	NC_011149	GCC	2	6	290122	290127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248965
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5583	NC_011149	ATG	2	6	290552	290557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249612
5584	NC_011149	TGA	2	6	290587	290592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249612
5585	NC_011149	ATC	2	6	290655	290660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249612
5586	NC_011149	GCGA	2	8	290729	290736	25 %	0 %	50 %	25 %	197249612
5587	NC_011149	GCG	2	6	290765	290770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249612
5588	NC_011149	TGG	2	6	290777	290782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249612
5589	NC_011149	CAG	2	6	290783	290788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249612
5590	NC_011149	GC	3	6	290802	290807	0 %	0 %	50 %	50 %	197249612
5591	NC_011149	CGA	2	6	290895	290900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249612
5592	NC_011149	AAT	2	6	290936	290941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249612
5593	NC_011149	CG	3	6	291037	291042	0 %	0 %	50 %	50 %	197251225
5594	NC_011149	GGT	2	6	291052	291057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251225
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5596	NC_011149	GCCA	2	8	291151	291158	25 %	0 %	25 %	50 %	197251225
5597	NC_011149	GAT	2	6	291172	291177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251225
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5599	NC_011149	CGC	2	6	291325	291330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251225
5600	NC_011149	TCT	2	6	291352	291357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251225
5601	NC_011149	TCG	2	6	291381	291386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251225
5602	NC_011149	TAA	2	6	291493	291498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250768
5603	NC_011149	GGC	2	6	291532	291537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250768
5604	NC_011149	GCA	2	6	291553	291558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250768
5605	NC_011149	GCG	2	6	291567	291572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250768
5606	NC_011149	TGC	2	6	291573	291578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250768
5607	NC_011149	TGA	2	6	291639	291644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250768
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5609	NC_011149	CGG	2	6	291711	291716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250768
5610	NC_011149	TAT	2	6	291755	291760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250768
5611	NC_011149	CG	3	6	291761	291766	0 %	0 %	50 %	50 %	197250768
5612	NC_011149	GTAT	3	12	291882	291893	25 %	50 %	25 %	0 %	197250768
5613	NC_011149	GCG	2	6	291905	291910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250768
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5616	NC_011149	CACT	2	8	292123	292130	25 %	25 %	0 %	50 %	197250768
5617	NC_011149	TCG	2	6	292297	292302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250542
5618	NC_011149	GTC	2	6	292392	292397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250542
5619	NC_011149	GC	4	8	292418	292425	0 %	0 %	50 %	50 %	197250542
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5989	NC_011149	ATG	2	6	321016	321021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248307
5990	NC_011149	A	6	6	321025	321030	100 %	0 %	0 %	0 %	197248307
5991	NC_011149	GCAA	2	8	321038	321045	50 %	0 %	25 %	25 %	197248307
5992	NC_011149	GAT	2	6	321054	321059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248307
5993	NC_011149	AATTA	2	10	321080	321089	60 %	40 %	0 %	0 %	197248307
5994	NC_011149	AAT	2	6	321710	321715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248240
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