MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011149	GC	3	6	259408	259413	0 %	0 %	50 %	50 %	197248248
5002	NC_011149	ACG	2	6	259542	259547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248248
5003	NC_011149	CTT	2	6	259555	259560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248248
5004	NC_011149	TCG	2	6	259575	259580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248248
5005	NC_011149	AG	3	6	259661	259666	50 %	0 %	50 %	0 %	197248248
5006	NC_011149	TTC	2	6	259677	259682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248248
5007	NC_011149	GTGA	2	8	259691	259698	25 %	25 %	50 %	0 %	197248248
5008	NC_011149	T	6	6	259714	259719	0 %	100 %	0 %	0 %	197248248
5009	NC_011149	GC	3	6	259732	259737	0 %	0 %	50 %	50 %	197248248
5010	NC_011149	CGGCG	2	10	259810	259819	0 %	0 %	60 %	40 %	197248248
5011	NC_011149	CTG	2	6	259850	259855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248248
5012	NC_011149	AC	3	6	259883	259888	50 %	0 %	0 %	50 %	197248735
5013	NC_011149	GTT	2	6	259926	259931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248735
5014	NC_011149	GCA	2	6	259944	259949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5015	NC_011149	ATT	2	6	259951	259956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248735
5016	NC_011149	GC	3	6	259961	259966	0 %	0 %	50 %	50 %	197248735
5017	NC_011149	TCT	2	6	259994	259999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248735
5018	NC_011149	CAG	2	6	260077	260082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5019	NC_011149	ATGA	2	8	260111	260118	50 %	25 %	25 %	0 %	197248735
5020	NC_011149	TGGG	2	8	260132	260139	0 %	25 %	75 %	0 %	197248735
5021	NC_011149	GCG	2	6	260202	260207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248735
5022	NC_011149	CCG	2	6	260268	260273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248735
5023	NC_011149	CGG	2	6	260391	260396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248735
5024	NC_011149	CCG	2	6	260441	260446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248735
5025	NC_011149	CG	3	6	260445	260450	0 %	0 %	50 %	50 %	197248735
5026	NC_011149	TGC	2	6	260492	260497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5027	NC_011149	GCGT	2	8	260506	260513	0 %	25 %	50 %	25 %	197248735
5028	NC_011149	TCA	2	6	260591	260596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248735
5029	NC_011149	GCA	2	6	260610	260615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5030	NC_011149	ACGC	2	8	260641	260648	25 %	0 %	25 %	50 %	197248735
5031	NC_011149	TGAC	2	8	260877	260884	25 %	25 %	25 %	25 %	197248735
5032	NC_011149	CAG	2	6	260887	260892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5033	NC_011149	CCAG	2	8	260904	260911	25 %	0 %	25 %	50 %	197248735
5034	NC_011149	GC	3	6	260973	260978	0 %	0 %	50 %	50 %	197248735
5035	NC_011149	CGC	3	9	260994	261002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248735
5036	NC_011149	GCG	2	6	261029	261034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248735
5037	NC_011149	TCT	2	6	261104	261109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248735
5038	NC_011149	GT	3	6	261146	261151	0 %	50 %	50 %	0 %	197248735
5039	NC_011149	CGA	2	6	261195	261200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5040	NC_011149	GCA	2	6	261252	261257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5041	NC_011149	GC	3	6	261307	261312	0 %	0 %	50 %	50 %	197248735
5042	NC_011149	GGC	2	6	261345	261350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248735
5043	NC_011149	CGT	2	6	261373	261378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5044	NC_011149	CAT	2	6	261412	261417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248735
5045	NC_011149	GTC	2	6	261463	261468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5046	NC_011149	GCAG	2	8	261533	261540	25 %	0 %	50 %	25 %	197248735
5047	NC_011149	AGC	2	6	261569	261574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
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5049	NC_011149	TCA	2	6	261621	261626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248735
5050	NC_011149	CGC	2	6	261651	261656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248735
5051	NC_011149	CAG	2	6	261697	261702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5052	NC_011149	ACC	2	6	261722	261727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248735
5053	NC_011149	CG	3	6	261781	261786	0 %	0 %	50 %	50 %	197248735
5054	NC_011149	CCA	2	6	261813	261818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248735
5055	NC_011149	CGAG	2	8	261825	261832	25 %	0 %	50 %	25 %	197248735
5056	NC_011149	GCC	2	6	261886	261891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248735
5057	NC_011149	GCT	2	6	261895	261900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5058	NC_011149	TGG	2	6	261944	261949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248735
5059	NC_011149	GGC	2	6	261973	261978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248735
5060	NC_011149	CAG	2	6	262057	262062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5061	NC_011149	CAGA	2	8	262098	262105	50 %	0 %	25 %	25 %	197248735
5062	NC_011149	CAG	2	6	262111	262116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5063	NC_011149	CGTA	2	8	262129	262136	25 %	25 %	25 %	25 %	197248735
5064	NC_011149	AAAGT	2	10	262167	262176	60 %	20 %	20 %	0 %	197248735
5065	NC_011149	CAG	2	6	262177	262182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248735
5066	NC_011149	CGC	2	6	262266	262271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248735
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5068	NC_011149	TTCGG	2	10	262363	262372	0 %	40 %	40 %	20 %	197248735
5069	NC_011149	CCAG	2	8	262419	262426	25 %	0 %	25 %	50 %	197248735
5070	NC_011149	GC	3	6	262475	262480	0 %	0 %	50 %	50 %	197248735
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5080	NC_011149	CCTTCG	2	12	263111	263122	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197249306
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5086	NC_011149	GTT	2	6	263433	263438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249306
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5089	NC_011149	GC	3	6	264140	264145	0 %	0 %	50 %	50 %	197249787
5090	NC_011149	CAT	2	6	264159	264164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249787
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5092	NC_011149	AAGCG	2	10	264270	264279	40 %	0 %	40 %	20 %	197249787
5093	NC_011149	GCT	2	6	264289	264294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249787
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5096	NC_011149	AAGA	2	8	264433	264440	75 %	0 %	25 %	0 %	197249787
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5101	NC_011149	A	6	6	265095	265100	100 %	0 %	0 %	0 %	197250881
5102	NC_011149	CTGA	2	8	265104	265111	25 %	25 %	25 %	25 %	197250881
5103	NC_011149	GCG	2	6	265170	265175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250881
5104	NC_011149	A	6	6	265176	265181	100 %	0 %	0 %	0 %	197250881
5105	NC_011149	GCT	2	6	265194	265199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250881
5106	NC_011149	GACT	2	8	265262	265269	25 %	25 %	25 %	25 %	197250881
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5110	NC_011149	GC	3	6	265473	265478	0 %	0 %	50 %	50 %	197250881
5111	NC_011149	GCAA	2	8	265548	265555	50 %	0 %	25 %	25 %	197250881
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5114	NC_011149	GAA	2	6	265685	265690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250881
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5117	NC_011149	GCA	2	6	265842	265847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250881
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5120	NC_011149	TGGTG	2	10	266174	266183	0 %	40 %	60 %	0 %	197251322
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5122	NC_011149	CGCC	2	8	266324	266331	0 %	0 %	25 %	75 %	197251322
5123	NC_011149	CTG	2	6	266394	266399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251322
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5126	NC_011149	TTC	2	6	266445	266450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251322
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5245	NC_011149	CGT	2	6	272746	272751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249707
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5247	NC_011149	CTA	2	6	272809	272814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249707
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5361	NC_011149	GC	3	6	278947	278952	0 %	0 %	50 %	50 %	197249555
5362	NC_011149	GTG	2	6	279035	279040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249555
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5364	NC_011149	GGC	2	6	279112	279117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249555
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5483	NC_011149	GCC	2	6	284714	284719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250206
5484	NC_011149	ATC	2	6	284817	284822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250206
5485	NC_011149	GGC	2	6	284826	284831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250206
5486	NC_011149	GCG	3	9	284839	284847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250206
5487	NC_011149	CTA	2	6	284882	284887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250206
5488	NC_011149	GTGCCG	2	12	284913	284924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197250206
5489	NC_011149	GGC	2	6	284970	284975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250206
5490	NC_011149	ATT	2	6	285121	285126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250206
5491	NC_011149	GTC	2	6	285138	285143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250206
5492	NC_011149	GAT	2	6	285144	285149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250206
5493	NC_011149	CG	3	6	285218	285223	0 %	0 %	50 %	50 %	197250206
5494	NC_011149	GCCGG	2	10	285228	285237	0 %	0 %	60 %	40 %	197250206
5495	NC_011149	CGAC	2	8	285286	285293	25 %	0 %	25 %	50 %	197250206
5496	NC_011149	GCC	2	6	285483	285488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250206
5497	NC_011149	ACC	2	6	285510	285515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250206
5498	NC_011149	CCTG	2	8	285522	285529	0 %	25 %	25 %	50 %	197250206
5499	NC_011149	AGC	3	9	285531	285539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250206
5500	NC_011149	GCCT	2	8	285629	285636	0 %	25 %	25 %	50 %	197250206

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