MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011149	GGAA	2	8	234806	234813	50 %	0 %	50 %	0 %	197248095
4502	NC_011149	CGG	2	6	234962	234967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248095
4503	NC_011149	GC	3	6	234977	234982	0 %	0 %	50 %	50 %	197248095
4504	NC_011149	CTG	3	9	235020	235028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248095
4505	NC_011149	CAG	2	6	235098	235103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248095
4506	NC_011149	GGT	2	6	235115	235120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248095
4507	NC_011149	TGC	2	6	235126	235131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248095
4508	NC_011149	GGC	2	6	235145	235150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248095
4509	NC_011149	ATT	2	6	235162	235167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248095
4510	NC_011149	CGG	2	6	235181	235186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248095
4511	NC_011149	CGG	2	6	235279	235284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248095
4512	NC_011149	CGC	2	6	235337	235342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248555
4513	NC_011149	TTA	2	6	235346	235351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248555
4514	NC_011149	CGC	2	6	235368	235373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248555
4515	NC_011149	CCG	2	6	235417	235422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248555
4516	NC_011149	GCT	3	9	235453	235461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248555
4517	NC_011149	TGGCG	2	10	235483	235492	0 %	20 %	60 %	20 %	197248555
4518	NC_011149	CCG	2	6	235526	235531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248555
4519	NC_011149	TGAT	2	8	235545	235552	25 %	50 %	25 %	0 %	197248555
4520	NC_011149	CTG	2	6	235583	235588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248555
4521	NC_011149	CGT	2	6	235602	235607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248555
4522	NC_011149	TGGTC	2	10	235611	235620	0 %	40 %	40 %	20 %	197248555
4523	NC_011149	GCCA	2	8	235799	235806	25 %	0 %	25 %	50 %	197248555
4524	NC_011149	CCG	2	6	235822	235827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248555
4525	NC_011149	G	6	6	235829	235834	0 %	0 %	100 %	0 %	197248555
4526	NC_011149	TGA	2	6	235845	235850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248555
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4528	NC_011149	CGG	2	6	235971	235976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248555
4529	NC_011149	AAG	2	6	236004	236009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248555
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4531	NC_011149	CCG	2	6	236121	236126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248555
4532	NC_011149	GGC	2	6	236227	236232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247572
4533	NC_011149	GCC	2	6	236291	236296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247572
4534	NC_011149	TGTT	2	8	236321	236328	0 %	75 %	25 %	0 %	197247572
4535	NC_011149	GCC	2	6	236329	236334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247572
4536	NC_011149	GCTG	2	8	236336	236343	0 %	25 %	50 %	25 %	197247572
4537	NC_011149	CAT	2	6	236415	236420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247572
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4540	NC_011149	GCT	2	6	236469	236474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
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4542	NC_011149	GC	3	6	236612	236617	0 %	0 %	50 %	50 %	197247572
4543	NC_011149	CA	3	6	236622	236627	50 %	0 %	0 %	50 %	197247572
4544	NC_011149	GCC	2	6	236632	236637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247572
4545	NC_011149	GC	3	6	236660	236665	0 %	0 %	50 %	50 %	197247572
4546	NC_011149	GGCGT	2	10	236674	236683	0 %	20 %	60 %	20 %	197247572
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4553	NC_011149	GCT	2	6	237060	237065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
4554	NC_011149	CTG	2	6	237091	237096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
4555	NC_011149	GC	3	6	237097	237102	0 %	0 %	50 %	50 %	197247572
4556	NC_011149	ATGG	2	8	237177	237184	25 %	25 %	50 %	0 %	197247572
4557	NC_011149	GC	3	6	237218	237223	0 %	0 %	50 %	50 %	197247572
4558	NC_011149	GCT	2	6	237225	237230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
4559	NC_011149	GCT	2	6	237237	237242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
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4561	NC_011149	GGC	2	6	237294	237299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247572
4562	NC_011149	TTGCCG	2	12	237323	237334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
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4565	NC_011149	GCT	2	6	237417	237422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247572
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4587	NC_011149	GC	3	6	238214	238219	0 %	0 %	50 %	50 %	197247572
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4592	NC_011149	T	6	6	238932	238937	0 %	100 %	0 %	0 %	197250708
4593	NC_011149	A	6	6	238945	238950	100 %	0 %	0 %	0 %	197250708
4594	NC_011149	TATT	2	8	238951	238958	25 %	75 %	0 %	0 %	197250708
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4597	NC_011149	A	6	6	238984	238989	100 %	0 %	0 %	0 %	197250708
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4601	NC_011149	CGA	2	6	239338	239343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248071
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4604	NC_011149	CGG	3	9	239533	239541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248071
4605	NC_011149	ACC	2	6	239574	239579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248071
4606	NC_011149	GCG	3	9	239642	239650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248071
4607	NC_011149	CCA	2	6	239697	239702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248071
4608	NC_011149	CAG	2	6	239722	239727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248071
4609	NC_011149	A	6	6	239856	239861	100 %	0 %	0 %	0 %	197247605
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4613	NC_011149	ATC	2	6	240034	240039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247605
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4617	NC_011149	ATA	2	6	240115	240120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247605
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4622	NC_011149	GGTG	2	8	240443	240450	0 %	25 %	75 %	0 %	197247605
4623	NC_011149	GC	3	6	240473	240478	0 %	0 %	50 %	50 %	197247605
4624	NC_011149	GGCG	2	8	240580	240587	0 %	0 %	75 %	25 %	197247605
4625	NC_011149	GGC	2	6	240666	240671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247605
4626	NC_011149	TTA	2	6	240676	240681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247605
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4629	NC_011149	GC	3	6	240741	240746	0 %	0 %	50 %	50 %	197247605
4630	NC_011149	GCGG	2	8	240775	240782	0 %	0 %	75 %	25 %	197247605
4631	NC_011149	GAA	2	6	240870	240875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197247605
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4643	NC_011149	TCA	2	6	241757	241762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247605
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4647	NC_011149	GCT	2	6	241904	241909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247605
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4741	NC_011149	CGA	2	6	246417	246422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250049
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4987	NC_011149	TGA	2	6	258703	258708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251680
4988	NC_011149	TTA	2	6	258727	258732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251680
4989	NC_011149	CTT	2	6	258766	258771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251680
4990	NC_011149	T	6	6	258770	258775	0 %	100 %	0 %	0 %	197251680
4991	NC_011149	TCA	2	6	258813	258818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251680
4992	NC_011149	GTTG	2	8	258908	258915	0 %	50 %	50 %	0 %	197251680
4993	NC_011149	AAT	2	6	259050	259055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248248
4994	NC_011149	T	6	6	259094	259099	0 %	100 %	0 %	0 %	197248248
4995	NC_011149	CCG	2	6	259171	259176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248248
4996	NC_011149	CTT	2	6	259264	259269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248248
4997	NC_011149	CG	3	6	259299	259304	0 %	0 %	50 %	50 %	197248248
4998	NC_011149	ATG	2	6	259326	259331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248248
4999	NC_011149	CGC	2	6	259360	259365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248248
5000	NC_011149	CGC	2	6	259375	259380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248248

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