MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011147	ATG	2	6	137479	137484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361324
2502	NC_011147	GATC	2	8	137504	137511	25 %	25 %	25 %	25 %	197361324
2503	NC_011147	GTG	2	6	137586	137591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2504	NC_011147	TGG	2	6	137593	137598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2505	NC_011147	ATTCC	2	10	137653	137662	20 %	40 %	0 %	40 %	197361324
2506	NC_011147	ATTG	2	8	137696	137703	25 %	50 %	25 %	0 %	197361324
2507	NC_011147	ATG	2	6	137707	137712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361324
2508	NC_011147	TGG	2	6	137731	137736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2509	NC_011147	GGT	2	6	137750	137755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2510	NC_011147	CTGG	2	8	137816	137823	0 %	25 %	50 %	25 %	197361324
2511	NC_011147	GGT	2	6	137846	137851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2512	NC_011147	A	7	7	137886	137892	100 %	0 %	0 %	0 %	197361324
2513	NC_011147	A	6	6	137996	138001	100 %	0 %	0 %	0 %	197361324
2514	NC_011147	GGT	2	6	138005	138010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2515	NC_011147	CAT	2	6	138062	138067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361324
2516	NC_011147	GGT	2	6	138086	138091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2517	NC_011147	GAC	2	6	138228	138233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361324
2518	NC_011147	ACG	2	6	138237	138242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361324
2519	NC_011147	AAT	2	6	138243	138248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361324
2520	NC_011147	GGT	2	6	138335	138340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2521	NC_011147	GAT	2	6	138411	138416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361324
2522	NC_011147	TGG	2	6	138426	138431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2523	NC_011147	CAG	2	6	138432	138437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361324
2524	NC_011147	GC	3	6	138449	138454	0 %	0 %	50 %	50 %	197361324
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2529	NC_011147	GAAA	2	8	138692	138699	75 %	0 %	25 %	0 %	197361324
2530	NC_011147	TGG	2	6	138700	138705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361324
2531	NC_011147	CTGAAC	2	12	138789	138800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197361324
2532	NC_011147	TAA	2	6	138986	138991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361324
2533	NC_011147	TCG	2	6	139003	139008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361324
2534	NC_011147	TGA	2	6	139101	139106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361324
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2536	NC_011147	TGC	2	6	139314	139319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361325
2537	NC_011147	ACGG	2	8	139392	139399	25 %	0 %	50 %	25 %	197361325
2538	NC_011147	ATT	2	6	139439	139444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361325
2539	NC_011147	TTG	2	6	139536	139541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361325
2540	NC_011147	CGT	2	6	139558	139563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361325
2541	NC_011147	CG	3	6	139572	139577	0 %	0 %	50 %	50 %	197361325
2542	NC_011147	GCTGA	2	10	139593	139602	20 %	20 %	40 %	20 %	197361325
2543	NC_011147	AAAGC	2	10	139950	139959	60 %	0 %	20 %	20 %	197361326
2544	NC_011147	GCT	2	6	140159	140164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361326
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2546	NC_011147	TCG	2	6	140311	140316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361326
2547	NC_011147	CG	3	6	140325	140330	0 %	0 %	50 %	50 %	197361326
2548	NC_011147	GAT	2	6	140373	140378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361326
2549	NC_011147	CGG	2	6	140413	140418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361326
2550	NC_011147	GC	3	6	140437	140442	0 %	0 %	50 %	50 %	197361326
2551	NC_011147	CCGCA	2	10	140483	140492	20 %	0 %	20 %	60 %	197361326
2552	NC_011147	GCC	2	6	140550	140555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361326
2553	NC_011147	GTT	2	6	140561	140566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361326
2554	NC_011147	GCG	2	6	140654	140659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361326
2555	NC_011147	GCT	2	6	140711	140716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361326
2556	NC_011147	TGA	2	6	140804	140809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361326
2557	NC_011147	TCG	2	6	140858	140863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361326
2558	NC_011147	G	6	6	141498	141503	0 %	0 %	100 %	0 %	197361327
2559	NC_011147	CATC	2	8	141607	141614	25 %	25 %	0 %	50 %	197361327
2560	NC_011147	CTG	2	6	141623	141628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361327
2561	NC_011147	CCTG	2	8	141637	141644	0 %	25 %	25 %	50 %	197361327
2562	NC_011147	ATT	2	6	141653	141658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361327
2563	NC_011147	GATG	2	8	141745	141752	25 %	25 %	50 %	0 %	197361327
2564	NC_011147	AAG	2	6	141807	141812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361327
2565	NC_011147	CAA	2	6	141832	141837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361327
2566	NC_011147	GAT	2	6	141950	141955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361328
2567	NC_011147	AC	3	6	141968	141973	50 %	0 %	0 %	50 %	197361328
2568	NC_011147	CGG	2	6	142052	142057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361328
2569	NC_011147	CGAT	2	8	142108	142115	25 %	25 %	25 %	25 %	197361328
2570	NC_011147	CAT	2	6	142169	142174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361328
2571	NC_011147	GCTG	2	8	142193	142200	0 %	25 %	50 %	25 %	197361328
2572	NC_011147	TCT	2	6	142263	142268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361328
2573	NC_011147	CG	3	6	142342	142347	0 %	0 %	50 %	50 %	197361328
2574	NC_011147	GCC	2	6	142356	142361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361328
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2581	NC_011147	GCTC	2	8	142624	142631	0 %	25 %	25 %	50 %	197361328
2582	NC_011147	GGCG	2	8	142647	142654	0 %	0 %	75 %	25 %	197361328
2583	NC_011147	ATC	2	6	142662	142667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361328
2584	NC_011147	CGG	2	6	142738	142743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361328
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2586	NC_011147	AGTTC	2	10	142854	142863	20 %	40 %	20 %	20 %	197361328
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2588	NC_011147	CAG	2	6	142894	142899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361329
2589	NC_011147	TGCCT	2	10	142954	142963	0 %	40 %	20 %	40 %	197361329
2590	NC_011147	CAT	2	6	143023	143028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361329
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2592	NC_011147	GGT	2	6	143044	143049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361329
2593	NC_011147	ACG	2	6	143051	143056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361329
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2595	NC_011147	GCA	2	6	143209	143214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361329
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2599	NC_011147	T	7	7	143376	143382	0 %	100 %	0 %	0 %	197361330
2600	NC_011147	CG	3	6	143390	143395	0 %	0 %	50 %	50 %	197361330
2601	NC_011147	ACCG	2	8	143492	143499	25 %	0 %	25 %	50 %	197361330
2602	NC_011147	AAG	2	6	143556	143561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361330
2603	NC_011147	CGG	2	6	143572	143577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361330
2604	NC_011147	TTTA	2	8	143675	143682	25 %	75 %	0 %	0 %	197361330
2605	NC_011147	GC	3	6	143687	143692	0 %	0 %	50 %	50 %	197361330
2606	NC_011147	A	6	6	143723	143728	100 %	0 %	0 %	0 %	197361330
2607	NC_011147	CATT	2	8	143743	143750	25 %	50 %	0 %	25 %	197361330
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2609	NC_011147	TAC	2	6	143771	143776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361330
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2612	NC_011147	TGA	2	6	143977	143982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361330
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2614	NC_011147	TGGCGA	2	12	144087	144098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197361330
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2617	NC_011147	TGA	2	6	144210	144215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361330
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2620	NC_011147	TACT	2	8	144403	144410	25 %	50 %	0 %	25 %	197361330
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2622	NC_011147	AG	3	6	144499	144504	50 %	0 %	50 %	0 %	197361330
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2744	NC_011147	GTTTG	2	10	149510	149519	0 %	60 %	40 %	0 %	197361334
2745	NC_011147	GCG	2	6	149532	149537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361334
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2752	NC_011147	CAG	2	6	149807	149812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361334
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2987	NC_011147	A	6	6	161531	161536	100 %	0 %	0 %	0 %	197361344
2988	NC_011147	AG	3	6	161632	161637	50 %	0 %	50 %	0 %	197361344
2989	NC_011147	GCG	2	6	161725	161730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361344
2990	NC_011147	CTA	2	6	161741	161746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361344
2991	NC_011147	CGC	2	6	161802	161807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361344
2992	NC_011147	GAA	2	6	161824	161829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361344
2993	NC_011147	GGT	2	6	161887	161892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361344
2994	NC_011147	CCG	2	6	161925	161930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361344
2995	NC_011147	TTC	2	6	161979	161984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361344
2996	NC_011147	ATG	2	6	162049	162054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361344
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2999	NC_011147	CTG	2	6	162229	162234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361344
3000	NC_011147	CCG	2	6	162310	162315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361344

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