MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011147	CCG	2	6	110752	110757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361304
2003	NC_011147	CAG	2	6	110772	110777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361304
2004	NC_011147	TTC	2	6	110862	110867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361304
2005	NC_011147	CG	3	6	110916	110921	0 %	0 %	50 %	50 %	197361304
2006	NC_011147	T	6	6	110993	110998	0 %	100 %	0 %	0 %	197361304
2007	NC_011147	GAC	2	6	111050	111055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361304
2008	NC_011147	CAG	2	6	111069	111074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361304
2009	NC_011147	GC	3	6	111167	111172	0 %	0 %	50 %	50 %	197361304
2010	NC_011147	TCT	2	6	111178	111183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361304
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2012	NC_011147	CGG	2	6	111242	111247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361304
2013	NC_011147	TTCGCG	2	12	111258	111269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361304
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2017	NC_011147	CGGCAG	2	12	111516	111527	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	197361304
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2122	NC_011147	GCC	2	6	117103	117108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361307
2123	NC_011147	TGGCG	2	10	117129	117138	0 %	20 %	60 %	20 %	197361307
2124	NC_011147	GAAA	2	8	117203	117210	75 %	0 %	25 %	0 %	197361307
2125	NC_011147	TG	3	6	117233	117238	0 %	50 %	50 %	0 %	197361307
2126	NC_011147	GCG	2	6	117294	117299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361307
2127	NC_011147	GCC	2	6	117340	117345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361307
2128	NC_011147	T	6	6	118459	118464	0 %	100 %	0 %	0 %	197361308
2129	NC_011147	ACAGA	2	10	118480	118489	60 %	0 %	20 %	20 %	197361308
2130	NC_011147	ATT	2	6	118504	118509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361308
2131	NC_011147	T	7	7	118524	118530	0 %	100 %	0 %	0 %	197361308
2132	NC_011147	ATT	2	6	118573	118578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361308
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2134	NC_011147	TTC	2	6	118630	118635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361308
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2136	NC_011147	ATA	2	6	118673	118678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361308
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2138	NC_011147	TCA	2	6	118749	118754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361308
2139	NC_011147	C	6	6	118760	118765	0 %	0 %	0 %	100 %	197361308
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2143	NC_011147	GGC	2	6	118880	118885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361309
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2149	NC_011147	GT	3	6	119197	119202	0 %	50 %	50 %	0 %	197361309
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2151	NC_011147	GAC	2	6	119260	119265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361309
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2154	NC_011147	TCT	2	6	119473	119478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361309
2155	NC_011147	CAGCG	2	10	119655	119664	20 %	0 %	40 %	40 %	197361310
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2157	NC_011147	GC	3	6	119782	119787	0 %	0 %	50 %	50 %	197361310
2158	NC_011147	GCCA	2	8	119789	119796	25 %	0 %	25 %	50 %	197361310
2159	NC_011147	GCG	2	6	119878	119883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361310
2160	NC_011147	CAG	2	6	119909	119914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361310
2161	NC_011147	CGA	2	6	119947	119952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361310
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2206	NC_011147	CAC	2	6	122046	122051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361311
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2227	NC_011147	TCG	2	6	122770	122775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361311
2228	NC_011147	GC	3	6	122800	122805	0 %	0 %	50 %	50 %	197361311
2229	NC_011147	CAATTG	2	12	122831	122842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197361311
2230	NC_011147	T	7	7	123285	123291	0 %	100 %	0 %	0 %	197361312
2231	NC_011147	ATCG	2	8	123292	123299	25 %	25 %	25 %	25 %	197361312
2232	NC_011147	AT	3	6	123318	123323	50 %	50 %	0 %	0 %	197361312
2233	NC_011147	TAA	3	9	123357	123365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361312
2234	NC_011147	TGTC	2	8	123378	123385	0 %	50 %	25 %	25 %	197361312
2235	NC_011147	AT	3	6	123395	123400	50 %	50 %	0 %	0 %	197361312
2236	NC_011147	CCG	2	6	123409	123414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361312
2237	NC_011147	TCA	2	6	123423	123428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361312
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2239	NC_011147	ATC	2	6	123595	123600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361312
2240	NC_011147	CTG	2	6	123649	123654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361312
2241	NC_011147	GTT	2	6	123660	123665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361312
2242	NC_011147	TAAT	2	8	123683	123690	50 %	50 %	0 %	0 %	197361312
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2244	NC_011147	TGCC	2	8	123729	123736	0 %	25 %	25 %	50 %	197361312
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2358	NC_011147	CGG	2	6	128850	128855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361317
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2486	NC_011147	CAG	2	6	136436	136441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361323
2487	NC_011147	ATA	2	6	136480	136485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361323
2488	NC_011147	A	6	6	136516	136521	100 %	0 %	0 %	0 %	197361323
2489	NC_011147	CGT	2	6	136552	136557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361323
2490	NC_011147	TTA	2	6	136606	136611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361323
2491	NC_011147	GAA	2	6	136617	136622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361323
2492	NC_011147	CGT	2	6	136626	136631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361323
2493	NC_011147	AAC	2	6	136738	136743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361323
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2495	NC_011147	TC	3	6	136755	136760	0 %	50 %	0 %	50 %	197361323
2496	NC_011147	GCTG	2	8	136894	136901	0 %	25 %	50 %	25 %	197361323
2497	NC_011147	ATGG	2	8	137018	137025	25 %	25 %	50 %	0 %	197361323
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2499	NC_011147	TGT	2	6	137386	137391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361324
2500	NC_011147	GTC	2	6	137406	137411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361324

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