MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011147	CGC	3	9	81878	81886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361279
1502	NC_011147	GCC	2	6	81958	81963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361279
1503	NC_011147	CCG	2	6	81979	81984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361279
1504	NC_011147	GCC	2	6	82056	82061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361279
1505	NC_011147	CAGC	2	8	82114	82121	25 %	0 %	25 %	50 %	197361279
1506	NC_011147	CCG	3	9	82138	82146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361279
1507	NC_011147	GTC	2	6	82173	82178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361279
1508	NC_011147	GGTC	2	8	82243	82250	0 %	25 %	50 %	25 %	197361279
1509	NC_011147	T	8	8	82368	82375	0 %	100 %	0 %	0 %	197361280
1510	NC_011147	ATT	2	6	82377	82382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361280
1511	NC_011147	GGTC	2	8	82405	82412	0 %	25 %	50 %	25 %	197361280
1512	NC_011147	TCA	2	6	82530	82535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361280
1513	NC_011147	ACCA	2	8	82553	82560	50 %	0 %	0 %	50 %	197361280
1514	NC_011147	ATA	2	6	82593	82598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361280
1515	NC_011147	CGC	2	6	82630	82635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361280
1516	NC_011147	CATCCT	2	12	82678	82689	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	197361280
1517	NC_011147	CGG	2	6	82822	82827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361280
1518	NC_011147	TCG	2	6	82845	82850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1519	NC_011147	CGT	2	6	82899	82904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1520	NC_011147	AAT	2	6	82925	82930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361280
1521	NC_011147	CAG	2	6	82964	82969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1522	NC_011147	TGC	2	6	83049	83054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1523	NC_011147	GCG	2	6	83067	83072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361280
1524	NC_011147	ATC	3	9	83094	83102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361280
1525	NC_011147	CGG	2	6	83194	83199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361280
1526	NC_011147	TCA	2	6	83268	83273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361280
1527	NC_011147	AGT	2	6	83299	83304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361280
1528	NC_011147	TAA	2	6	83332	83337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361280
1529	NC_011147	GGT	2	6	83357	83362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361280
1530	NC_011147	CCG	2	6	83383	83388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361280
1531	NC_011147	GCT	2	6	83482	83487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1532	NC_011147	CAGA	2	8	83495	83502	50 %	0 %	25 %	25 %	197361280
1533	NC_011147	CAG	2	6	83573	83578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1534	NC_011147	TTC	2	6	83612	83617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361280
1535	NC_011147	GTC	2	6	83867	83872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361280
1536	NC_011147	GGC	2	6	84052	84057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361281
1537	NC_011147	GTT	2	6	84103	84108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361281
1538	NC_011147	ATG	2	6	84122	84127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361281
1539	NC_011147	TCAGC	2	10	84246	84255	20 %	20 %	20 %	40 %	197361281
1540	NC_011147	GC	3	6	84259	84264	0 %	0 %	50 %	50 %	197361281
1541	NC_011147	GT	4	8	84281	84288	0 %	50 %	50 %	0 %	197361281
1542	NC_011147	GCCA	2	8	84290	84297	25 %	0 %	25 %	50 %	197361281
1543	NC_011147	CGA	2	6	84315	84320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361281
1544	NC_011147	GATG	2	8	84345	84352	25 %	25 %	50 %	0 %	197361281
1545	NC_011147	GGCCA	2	10	84394	84403	20 %	0 %	40 %	40 %	197361281
1546	NC_011147	GTA	2	6	84493	84498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361281
1547	NC_011147	CGC	2	6	84534	84539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361281
1548	NC_011147	AGT	2	6	84546	84551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361281
1549	NC_011147	CAT	2	6	84553	84558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361281
1550	NC_011147	GCA	2	6	84576	84581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361281
1551	NC_011147	GTC	2	6	84659	84664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361281
1552	NC_011147	CGG	2	6	84687	84692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361281
1553	NC_011147	TCA	2	6	84866	84871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361281
1554	NC_011147	CGG	2	6	84881	84886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361281
1555	NC_011147	GGT	2	6	84925	84930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361281
1556	NC_011147	GCG	2	6	85000	85005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361281
1557	NC_011147	A	6	6	85134	85139	100 %	0 %	0 %	0 %	197361281
1558	NC_011147	ACC	2	6	85360	85365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361282
1559	NC_011147	GGT	2	6	85410	85415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361282
1560	NC_011147	CAG	2	6	85552	85557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361282
1561	NC_011147	CGA	2	6	85713	85718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361282
1562	NC_011147	CTT	2	6	85740	85745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361282
1563	NC_011147	CCGA	2	8	85771	85778	25 %	0 %	25 %	50 %	197361282
1564	NC_011147	TCA	2	6	85805	85810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361282
1565	NC_011147	CAG	2	6	85823	85828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361282
1566	NC_011147	TTG	2	6	85859	85864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361282
1567	NC_011147	TC	3	6	85934	85939	0 %	50 %	0 %	50 %	197361282
1568	NC_011147	ACA	2	6	86184	86189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361282
1569	NC_011147	GC	3	6	86199	86204	0 %	0 %	50 %	50 %	197361282
1570	NC_011147	TCCA	2	8	86219	86226	25 %	25 %	0 %	50 %	197361282
1571	NC_011147	CGG	2	6	86229	86234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361282
1572	NC_011147	CCG	2	6	86261	86266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361282
1573	NC_011147	TTC	2	6	86269	86274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361282
1574	NC_011147	CAG	2	6	86281	86286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361282
1575	NC_011147	TAA	2	6	86512	86517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361283
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1578	NC_011147	ACCC	2	8	86593	86600	25 %	0 %	0 %	75 %	197361283
1579	NC_011147	CAG	2	6	86606	86611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361283
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1582	NC_011147	GAA	2	6	86762	86767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361283
1583	NC_011147	TGG	2	6	86776	86781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361283
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1585	NC_011147	GC	4	8	86820	86827	0 %	0 %	50 %	50 %	197361283
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1588	NC_011147	GTACG	2	10	86965	86974	20 %	20 %	40 %	20 %	197361283
1589	NC_011147	CAC	2	6	87027	87032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361283
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1593	NC_011147	CAG	2	6	87282	87287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361283
1594	NC_011147	ATG	3	9	87291	87299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361283
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1598	NC_011147	CGA	2	6	87460	87465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361283
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1604	NC_011147	AGG	2	6	87703	87708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361283
1605	NC_011147	CAT	2	6	87713	87718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361283
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1609	NC_011147	A	8	8	87950	87957	100 %	0 %	0 %	0 %	197361283
1610	NC_011147	T	6	6	87977	87982	0 %	100 %	0 %	0 %	197361283
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1614	NC_011147	CAG	2	6	88634	88639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361284
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1616	NC_011147	CT	3	6	88715	88720	0 %	50 %	0 %	50 %	197361284
1617	NC_011147	TGA	2	6	88729	88734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361284
1618	NC_011147	AC	3	6	88780	88785	50 %	0 %	0 %	50 %	197361284
1619	NC_011147	GCC	2	6	88799	88804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361284
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1623	NC_011147	TGG	2	6	88884	88889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361284
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1625	NC_011147	CGG	2	6	89010	89015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361284
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1987	NC_011147	ATCA	2	8	110127	110134	50 %	25 %	0 %	25 %	197361304
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1994	NC_011147	ACG	2	6	110374	110379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361304
1995	NC_011147	CAG	2	6	110394	110399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361304
1996	NC_011147	TGC	3	9	110441	110449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361304
1997	NC_011147	TAA	2	6	110507	110512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361304
1998	NC_011147	CGC	2	6	110636	110641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361304
1999	NC_011147	CGA	2	6	110660	110665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361304
2000	NC_011147	GTC	3	9	110703	110711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361304

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