MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011147	TCC	2	6	56783	56788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361257
1002	NC_011147	GCG	2	6	56885	56890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361257
1003	NC_011147	TGA	2	6	56948	56953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361257
1004	NC_011147	ATT	2	6	57004	57009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361257
1005	NC_011147	GGC	2	6	57010	57015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361257
1006	NC_011147	GC	3	6	57014	57019	0 %	0 %	50 %	50 %	197361257
1007	NC_011147	TGC	2	6	57135	57140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361257
1008	NC_011147	TTCAC	2	10	57387	57396	20 %	40 %	0 %	40 %	197361258
1009	NC_011147	GAT	2	6	57407	57412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361258
1010	NC_011147	CGG	2	6	57420	57425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361258
1011	NC_011147	AGCC	2	8	57447	57454	25 %	0 %	25 %	50 %	197361258
1012	NC_011147	AGC	3	9	57495	57503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361258
1013	NC_011147	AAG	2	6	57516	57521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361258
1014	NC_011147	AAAG	2	8	57526	57533	75 %	0 %	25 %	0 %	197361258
1015	NC_011147	CGC	2	6	57553	57558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361258
1016	NC_011147	GGC	2	6	57613	57618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361258
1017	NC_011147	ATGG	2	8	57659	57666	25 %	25 %	50 %	0 %	197361258
1018	NC_011147	TTG	2	6	57863	57868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361259
1019	NC_011147	GC	3	6	57890	57895	0 %	0 %	50 %	50 %	197361259
1020	NC_011147	TCT	2	6	58010	58015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361259
1021	NC_011147	GC	4	8	58120	58127	0 %	0 %	50 %	50 %	197361259
1022	NC_011147	GAA	2	6	58141	58146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361259
1023	NC_011147	G	6	6	58216	58221	0 %	0 %	100 %	0 %	197361259
1024	NC_011147	TGG	2	6	58229	58234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361259
1025	NC_011147	TGAT	2	8	58331	58338	25 %	50 %	25 %	0 %	197361259
1026	NC_011147	TCG	2	6	58364	58369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361259
1027	NC_011147	ACT	2	6	58399	58404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361259
1028	NC_011147	GTG	2	6	58447	58452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361259
1029	NC_011147	TGG	2	6	58454	58459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361259
1030	NC_011147	TCTAAC	2	12	58477	58488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361259
1031	NC_011147	GAA	2	6	58517	58522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361259
1032	NC_011147	CGA	2	6	58536	58541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361259
1033	NC_011147	GCG	2	6	58543	58548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361259
1034	NC_011147	AGG	2	6	58556	58561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361259
1035	NC_011147	CGC	2	6	58575	58580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361259
1036	NC_011147	GGC	3	9	58657	58665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361259
1037	NC_011147	GAA	2	6	58690	58695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361259
1038	NC_011147	AAAAT	2	10	58958	58967	80 %	20 %	0 %	0 %	197361260
1039	NC_011147	TGGA	2	8	59000	59007	25 %	25 %	50 %	0 %	197361260
1040	NC_011147	CAA	2	6	59010	59015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361260
1041	NC_011147	CCTG	2	8	59036	59043	0 %	25 %	25 %	50 %	197361260
1042	NC_011147	GAA	2	6	59204	59209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361260
1043	NC_011147	CAG	2	6	59251	59256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361260
1044	NC_011147	A	6	6	59288	59293	100 %	0 %	0 %	0 %	197361260
1045	NC_011147	CACGAA	2	12	59356	59367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	197361260
1046	NC_011147	GATT	2	8	59398	59405	25 %	50 %	25 %	0 %	197361260
1047	NC_011147	GCG	2	6	59706	59711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361260
1048	NC_011147	TGC	2	6	59714	59719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361260
1049	NC_011147	GGAAA	2	10	59745	59754	60 %	0 %	40 %	0 %	197361260
1050	NC_011147	GATC	2	8	59767	59774	25 %	25 %	25 %	25 %	197361260
1051	NC_011147	TAT	2	6	59857	59862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361260
1052	NC_011147	CGC	2	6	59895	59900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361260
1053	NC_011147	ATT	2	6	60188	60193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361261
1054	NC_011147	TGA	2	6	60214	60219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361261
1055	NC_011147	CGCTG	2	10	60235	60244	0 %	20 %	40 %	40 %	197361261
1056	NC_011147	C	6	6	60249	60254	0 %	0 %	0 %	100 %	197361261
1057	NC_011147	TAA	2	6	60270	60275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361261
1058	NC_011147	A	6	6	60303	60308	100 %	0 %	0 %	0 %	197361261
1059	NC_011147	GCT	2	6	60382	60387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361261
1060	NC_011147	TGA	2	6	60507	60512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361261
1061	NC_011147	GCC	3	9	60689	60697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361261
1062	NC_011147	TG	3	6	60729	60734	0 %	50 %	50 %	0 %	197361261
1063	NC_011147	GTA	2	6	60846	60851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361261
1064	NC_011147	CTGG	2	8	60892	60899	0 %	25 %	50 %	25 %	197361261
1065	NC_011147	ACG	2	6	60971	60976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361261
1066	NC_011147	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	197361261
1067	NC_011147	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	197361262
1068	NC_011147	CTG	2	6	61221	61226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361262
1069	NC_011147	CTG	2	6	61249	61254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361262
1070	NC_011147	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	197361262
1071	NC_011147	TCA	2	6	61308	61313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361262
1072	NC_011147	TGC	2	6	61449	61454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361262
1073	NC_011147	CGG	2	6	61537	61542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361262
1074	NC_011147	AAT	2	6	61550	61555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361262
1075	NC_011147	A	6	6	61617	61622	100 %	0 %	0 %	0 %	197361262
1076	NC_011147	CTT	2	6	61664	61669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361262
1077	NC_011147	CGA	2	6	61696	61701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361262
1078	NC_011147	CCA	2	6	61732	61737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361262
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1080	NC_011147	ATT	2	6	61845	61850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361263
1081	NC_011147	CGA	2	6	61856	61861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1082	NC_011147	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	197361263
1083	NC_011147	GTT	2	6	61926	61931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361263
1084	NC_011147	GTGG	2	8	61932	61939	0 %	25 %	75 %	0 %	197361263
1085	NC_011147	AAT	2	6	62007	62012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361263
1086	NC_011147	CAA	2	6	62108	62113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361263
1087	NC_011147	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	197361263
1088	NC_011147	CAA	2	6	62156	62161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361263
1089	NC_011147	ATA	2	6	62208	62213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361263
1090	NC_011147	GGT	3	9	62237	62245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361263
1091	NC_011147	TGG	2	6	62281	62286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361263
1092	NC_011147	CTG	3	9	62295	62303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1093	NC_011147	CAGCGC	2	12	62307	62318	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197361263
1094	NC_011147	CAG	2	6	62340	62345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1095	NC_011147	TGG	2	6	62354	62359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361263
1096	NC_011147	TGC	2	6	62380	62385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1097	NC_011147	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	197361263
1098	NC_011147	TTG	2	6	62455	62460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361263
1099	NC_011147	TAA	2	6	62468	62473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361263
1100	NC_011147	AAT	2	6	62496	62501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361263
1101	NC_011147	T	6	6	62556	62561	0 %	100 %	0 %	0 %	197361263
1102	NC_011147	T	7	7	62563	62569	0 %	100 %	0 %	0 %	197361263
1103	NC_011147	GCG	2	6	62570	62575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361263
1104	NC_011147	AAG	2	6	62584	62589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361263
1105	NC_011147	TGG	2	6	62608	62613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361263
1106	NC_011147	GCG	2	6	62661	62666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361263
1107	NC_011147	ACA	2	6	62738	62743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361263
1108	NC_011147	GCT	2	6	62771	62776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1109	NC_011147	GCG	2	6	62820	62825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361263
1110	NC_011147	ACA	2	6	62834	62839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361263
1111	NC_011147	CAG	3	9	62844	62852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1112	NC_011147	CGT	2	6	63041	63046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361263
1113	NC_011147	CGC	2	6	63053	63058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361263
1114	NC_011147	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	197361263
1115	NC_011147	GAT	2	6	63327	63332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361263
1116	NC_011147	CGG	2	6	63580	63585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361264
1117	NC_011147	CAG	2	6	63635	63640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361264
1118	NC_011147	GCC	2	6	63687	63692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361264
1119	NC_011147	CAG	2	6	63758	63763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361264
1120	NC_011147	GCC	2	6	63783	63788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361264
1121	NC_011147	ACC	2	6	63807	63812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361264
1122	NC_011147	CAG	3	9	63815	63823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361264
1123	NC_011147	CCA	2	6	63859	63864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361264
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1125	NC_011147	CGC	2	6	63949	63954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361264
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