MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011147	CCA	2	6	329912	329917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361488
6002	NC_011147	CG	3	6	329935	329940	0 %	0 %	50 %	50 %	197361488
6003	NC_011147	TGC	2	6	330054	330059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361488
6004	NC_011147	GCC	2	6	330061	330066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361488
6005	NC_011147	CGC	2	6	330078	330083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361488
6006	NC_011147	TCA	2	6	330084	330089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361488
6007	NC_011147	GCG	2	6	330103	330108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361488
6008	NC_011147	CGG	2	6	330175	330180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361489
6009	NC_011147	GAC	2	6	330239	330244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6010	NC_011147	GGT	2	6	330349	330354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361489
6011	NC_011147	GATGC	2	10	330356	330365	20 %	20 %	40 %	20 %	197361489
6012	NC_011147	GGT	2	6	330383	330388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361489
6013	NC_011147	TGCGT	2	10	330460	330469	0 %	40 %	40 %	20 %	197361489
6014	NC_011147	TCG	2	6	330561	330566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6015	NC_011147	CTG	2	6	330593	330598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6016	NC_011147	GGC	2	6	330695	330700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361489
6017	NC_011147	GCG	2	6	330777	330782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361489
6018	NC_011147	CTG	2	6	330794	330799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6019	NC_011147	GTG	2	6	330800	330805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361489
6020	NC_011147	GCT	2	6	330841	330846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6021	NC_011147	GAC	2	6	330883	330888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6022	NC_011147	GGC	2	6	330932	330937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361489
6023	NC_011147	ATCG	2	8	330977	330984	25 %	25 %	25 %	25 %	197361489
6024	NC_011147	CGG	2	6	330985	330990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361489
6025	NC_011147	TGG	2	6	330996	331001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361489
6026	NC_011147	GGCG	2	8	331126	331133	0 %	0 %	75 %	25 %	197361489
6027	NC_011147	TGA	2	6	331164	331169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361489
6028	NC_011147	GC	3	6	331206	331211	0 %	0 %	50 %	50 %	197361489
6029	NC_011147	CTG	2	6	331223	331228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6030	NC_011147	GGC	2	6	331298	331303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361489
6031	NC_011147	TTG	2	6	331389	331394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361489
6032	NC_011147	GCT	2	6	331462	331467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361489
6033	NC_011147	GCC	2	6	332158	332163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361490
6034	NC_011147	GCC	2	6	332337	332342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361490
6035	NC_011147	AAT	2	6	332365	332370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361490
6036	NC_011147	TG	3	6	332447	332452	0 %	50 %	50 %	0 %	197361490
6037	NC_011147	GC	4	8	332502	332509	0 %	0 %	50 %	50 %	197361490
6038	NC_011147	TGC	2	6	332547	332552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361490
6039	NC_011147	GAAT	2	8	332562	332569	50 %	25 %	25 %	0 %	197361490
6040	NC_011147	ATT	2	6	332582	332587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361490
6041	NC_011147	TGC	2	6	332595	332600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361490
6042	NC_011147	GCT	2	6	332617	332622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361490
6043	NC_011147	T	6	6	332629	332634	0 %	100 %	0 %	0 %	197361490
6044	NC_011147	CGT	2	6	332642	332647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361490
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6047	NC_011147	TTC	2	6	332771	332776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361491
6048	NC_011147	GCG	2	6	332778	332783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361491
6049	NC_011147	TGA	2	6	332818	332823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361491
6050	NC_011147	AGG	2	6	332840	332845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361491
6051	NC_011147	CTC	2	6	332866	332871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361491
6052	NC_011147	CCG	2	6	332880	332885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361491
6053	NC_011147	GCTTCC	2	12	332909	332920	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197361491
6054	NC_011147	CTTTT	2	10	332923	332932	0 %	80 %	0 %	20 %	197361491
6055	NC_011147	CCA	2	6	332946	332951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361491
6056	NC_011147	CATAAG	2	12	332982	332993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197361491
6057	NC_011147	CG	3	6	333005	333010	0 %	0 %	50 %	50 %	197361491
6058	NC_011147	GCT	2	6	333063	333068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361491
6059	NC_011147	GGC	2	6	333154	333159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361491
6060	NC_011147	CAT	2	6	333211	333216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361491
6061	NC_011147	AGCG	2	8	333228	333235	25 %	0 %	50 %	25 %	197361491
6062	NC_011147	CCG	2	6	333236	333241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361491
6063	NC_011147	CGGT	2	8	333266	333273	0 %	25 %	50 %	25 %	197361491
6064	NC_011147	CAT	2	6	333307	333312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361491
6065	NC_011147	CGC	2	6	333376	333381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361491
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6070	NC_011147	AGC	2	6	333566	333571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361491
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6072	NC_011147	TAT	2	6	333585	333590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361491
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6121	NC_011147	CGC	2	6	335992	335997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361493
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6240	NC_011147	TGA	2	6	342321	342326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361496
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6484	NC_011147	GC	3	6	356548	356553	0 %	0 %	50 %	50 %	197361506
6485	NC_011147	GCGG	3	12	356582	356593	0 %	0 %	75 %	25 %	197361506
6486	NC_011147	CTG	2	6	356604	356609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361506
6487	NC_011147	TATG	2	8	356615	356622	25 %	50 %	25 %	0 %	197361506
6488	NC_011147	GTG	2	6	356658	356663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361506
6489	NC_011147	TGGC	2	8	356673	356680	0 %	25 %	50 %	25 %	197361506
6490	NC_011147	CGC	3	9	356723	356731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361506
6491	NC_011147	TTA	2	6	356733	356738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361506
6492	NC_011147	TGG	3	9	356761	356769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361506
6493	NC_011147	CTGG	2	8	356822	356829	0 %	25 %	50 %	25 %	197361506
6494	NC_011147	TGCTG	2	10	356869	356878	0 %	40 %	40 %	20 %	197361506
6495	NC_011147	CG	3	6	356898	356903	0 %	0 %	50 %	50 %	197361506
6496	NC_011147	CGC	2	6	356935	356940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361506
6497	NC_011147	GCG	2	6	357007	357012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361506
6498	NC_011147	GC	4	8	357020	357027	0 %	0 %	50 %	50 %	197361506
6499	NC_011147	GGC	2	6	357143	357148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361506
6500	NC_011147	GCT	2	6	357179	357184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361506

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