MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_011147	TCG	2	6	3199776	3199781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56002	NC_011147	ACC	2	6	3199842	3199847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197364094
56003	NC_011147	A	6	6	3199857	3199862	100 %	0 %	0 %	0 %	197364094
56004	NC_011147	TCTT	2	8	3199881	3199888	0 %	75 %	0 %	25 %	197364094
56005	NC_011147	GGC	2	6	3199918	3199923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197364094
56006	NC_011147	CCTTC	2	10	3199941	3199950	0 %	40 %	0 %	60 %	197364094
56007	NC_011147	GCC	2	6	3199987	3199992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197364094
56008	NC_011147	CTG	2	6	3200021	3200026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56009	NC_011147	GCT	2	6	3200056	3200061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56010	NC_011147	ACC	2	6	3200132	3200137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197364094
56011	NC_011147	TCA	2	6	3200228	3200233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197364094
56012	NC_011147	ACC	2	6	3200243	3200248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197364094
56013	NC_011147	CTG	2	6	3200279	3200284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56014	NC_011147	GTC	2	6	3200285	3200290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56015	NC_011147	TGC	2	6	3200304	3200309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56016	NC_011147	TGG	2	6	3200319	3200324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197364094
56017	NC_011147	TCG	2	6	3200353	3200358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56018	NC_011147	GCCT	2	8	3200381	3200388	0 %	25 %	25 %	50 %	197364094
56019	NC_011147	GCG	2	6	3200397	3200402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197364094
56020	NC_011147	CTT	2	6	3200410	3200415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197364094
56021	NC_011147	GCC	2	6	3200429	3200434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197364094
56022	NC_011147	TACT	2	8	3200485	3200492	25 %	50 %	0 %	25 %	197364094
56023	NC_011147	GGC	2	6	3200563	3200568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197364094
56024	NC_011147	GCT	3	9	3200608	3200616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56025	NC_011147	GTG	2	6	3200621	3200626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197364094
56026	NC_011147	TG	3	6	3200634	3200639	0 %	50 %	50 %	0 %	197364094
56027	NC_011147	GCG	2	6	3200643	3200648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197364094
56028	NC_011147	TGC	2	6	3200673	3200678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364094
56029	NC_011147	GTA	2	6	3200732	3200737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197364094
56030	NC_011147	TAT	2	6	3200749	3200754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197364094
56031	NC_011147	TGTTC	2	10	3200803	3200812	0 %	60 %	20 %	20 %	197364094
56032	NC_011147	ACT	2	6	3201327	3201332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197364095
56033	NC_011147	TTAT	2	8	3201415	3201422	25 %	75 %	0 %	0 %	197364095
56034	NC_011147	GCT	2	6	3201444	3201449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364095
56035	NC_011147	GCC	2	6	3201454	3201459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197364095
56036	NC_011147	TGC	2	6	3201539	3201544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364095
56037	NC_011147	GCTG	2	8	3201593	3201600	0 %	25 %	50 %	25 %	197364095
56038	NC_011147	CT	3	6	3201628	3201633	0 %	50 %	0 %	50 %	197364095
56039	NC_011147	ATC	2	6	3201650	3201655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197364095
56040	NC_011147	ATT	2	6	3201696	3201701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197364095
56041	NC_011147	CTG	2	6	3201733	3201738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364095
56042	NC_011147	CCA	2	6	3201740	3201745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197364095
56043	NC_011147	CG	3	6	3201771	3201776	0 %	0 %	50 %	50 %	197364095
56044	NC_011147	TTG	2	6	3201805	3201810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197364095
56045	NC_011147	CTG	2	6	3201841	3201846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364095
56046	NC_011147	TGC	2	6	3201902	3201907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364095
56047	NC_011147	GTG	2	6	3201910	3201915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197364095
56048	NC_011147	T	6	6	3201922	3201927	0 %	100 %	0 %	0 %	197364095
56049	NC_011147	AAG	2	6	3201961	3201966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197364095
56050	NC_011147	CTG	2	6	3202039	3202044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364096
56051	NC_011147	ATG	2	6	3202060	3202065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197364096
56052	NC_011147	CG	3	6	3202108	3202113	0 %	0 %	50 %	50 %	197364096
56053	NC_011147	CAT	2	6	3202156	3202161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197364096
56054	NC_011147	CATT	2	8	3202176	3202183	25 %	50 %	0 %	25 %	197364096
56055	NC_011147	GCA	2	6	3202249	3202254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197364096
56056	NC_011147	GTC	2	6	3202291	3202296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364096
56057	NC_011147	CAG	2	6	3202300	3202305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197364096
56058	NC_011147	CAA	2	6	3202638	3202643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197364097
56059	NC_011147	GC	3	6	3202713	3202718	0 %	0 %	50 %	50 %	197364097
56060	NC_011147	AGA	2	6	3202749	3202754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197364097
56061	NC_011147	GCAAAA	2	12	3202786	3202797	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197364097
56062	NC_011147	A	7	7	3202857	3202863	100 %	0 %	0 %	0 %	197364097
56063	NC_011147	ACT	2	6	3202877	3202882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197364097
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56065	NC_011147	AGT	2	6	3203341	3203346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197364098
56066	NC_011147	GAA	2	6	3203354	3203359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197364098
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56068	NC_011147	CGG	2	6	3203527	3203532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197364098
56069	NC_011147	GGA	2	6	3203614	3203619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197364098
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56074	NC_011147	CTGG	2	8	3203721	3203728	0 %	25 %	50 %	25 %	197364099
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56085	NC_011147	CTG	2	6	3204304	3204309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364100
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56101	NC_011147	GCAAA	2	10	3205150	3205159	60 %	0 %	20 %	20 %	197364101
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56105	NC_011147	GAC	2	6	3205354	3205359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197364101
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56107	NC_011147	A	6	6	3205759	3205764	100 %	0 %	0 %	0 %	197364102
56108	NC_011147	GGC	2	6	3205778	3205783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197364102
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56233	NC_011147	CG	3	6	3211762	3211767	0 %	0 %	50 %	50 %	197364107
56234	NC_011147	GCA	2	6	3211791	3211796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197364107
56235	NC_011147	CAT	2	6	3211903	3211908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197364107
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56237	NC_011147	CGT	2	6	3211995	3212000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364107
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56243	NC_011147	GCT	2	6	3212200	3212205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197364107
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56255	NC_011147	CAG	2	6	3212764	3212769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197364108
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56259	NC_011147	TCT	2	6	3212985	3212990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197364108
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