MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011147	AACC	2	8	244766	244773	50 %	0 %	0 %	50 %	197361412
4502	NC_011147	CTTC	2	8	244804	244811	0 %	50 %	0 %	50 %	197361412
4503	NC_011147	GCC	2	6	244976	244981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361413
4504	NC_011147	GAC	2	6	244999	245004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361413
4505	NC_011147	CAT	2	6	245011	245016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361413
4506	NC_011147	ATA	2	6	245078	245083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361413
4507	NC_011147	AAT	2	6	245146	245151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361413
4508	NC_011147	CGC	2	6	245154	245159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361413
4509	NC_011147	TGGC	2	8	245299	245306	0 %	25 %	50 %	25 %	197361413
4510	NC_011147	CAG	2	6	245311	245316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361413
4511	NC_011147	CGA	2	6	245343	245348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361413
4512	NC_011147	CGC	2	6	245415	245420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361413
4513	NC_011147	ACG	2	6	245432	245437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361413
4514	NC_011147	GTT	2	6	245610	245615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361414
4515	NC_011147	GCG	2	6	245618	245623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361414
4516	NC_011147	ATA	2	6	245627	245632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361414
4517	NC_011147	CCG	2	6	245828	245833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361414
4518	NC_011147	GGT	2	6	245836	245841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361414
4519	NC_011147	GAA	2	6	245901	245906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361414
4520	NC_011147	GCG	2	6	245948	245953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361414
4521	NC_011147	CTGC	2	8	245976	245983	0 %	25 %	25 %	50 %	197361414
4522	NC_011147	CCAC	2	8	246060	246067	25 %	0 %	0 %	75 %	197361414
4523	NC_011147	CCG	2	6	246119	246124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361414
4524	NC_011147	CGA	2	6	246132	246137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361414
4525	NC_011147	ATTC	2	8	246172	246179	25 %	50 %	0 %	25 %	197361414
4526	NC_011147	T	6	6	246204	246209	0 %	100 %	0 %	0 %	197361414
4527	NC_011147	CGGG	2	8	246216	246223	0 %	0 %	75 %	25 %	197361414
4528	NC_011147	GCT	2	6	246235	246240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361414
4529	NC_011147	CGG	2	6	246261	246266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361414
4530	NC_011147	AAGC	2	8	246270	246277	50 %	0 %	25 %	25 %	197361414
4531	NC_011147	GA	3	6	246291	246296	50 %	0 %	50 %	0 %	197361414
4532	NC_011147	CG	3	6	246306	246311	0 %	0 %	50 %	50 %	197361414
4533	NC_011147	AGC	2	6	246341	246346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361414
4534	NC_011147	CGC	2	6	246428	246433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361415
4535	NC_011147	ACC	2	6	246498	246503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361415
4536	NC_011147	TAA	2	6	246616	246621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361415
4537	NC_011147	CGC	2	6	246628	246633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361415
4538	NC_011147	CGG	2	6	246688	246693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361415
4539	NC_011147	ATC	2	6	246704	246709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361415
4540	NC_011147	CCGG	2	8	246720	246727	0 %	0 %	50 %	50 %	197361415
4541	NC_011147	CGT	2	6	246775	246780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361415
4542	NC_011147	GAC	2	6	246800	246805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361415
4543	NC_011147	TGA	2	6	246856	246861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361415
4544	NC_011147	GCC	2	6	246906	246911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361415
4545	NC_011147	GCC	2	6	246983	246988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361415
4546	NC_011147	GCA	2	6	247024	247029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361415
4547	NC_011147	CTT	3	9	247036	247044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361415
4548	NC_011147	ATG	2	6	247056	247061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361415
4549	NC_011147	ATCG	2	8	247162	247169	25 %	25 %	25 %	25 %	197361416
4550	NC_011147	TCG	2	6	247195	247200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361416
4551	NC_011147	GCA	2	6	247300	247305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361416
4552	NC_011147	A	6	6	247305	247310	100 %	0 %	0 %	0 %	197361416
4553	NC_011147	GCC	2	6	247413	247418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361416
4554	NC_011147	GGA	2	6	247438	247443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361416
4555	NC_011147	GCCT	2	8	247493	247500	0 %	25 %	25 %	50 %	197361416
4556	NC_011147	CCG	2	6	247520	247525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361416
4557	NC_011147	GGC	2	6	247543	247548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361416
4558	NC_011147	AGCC	2	8	247595	247602	25 %	0 %	25 %	50 %	197361416
4559	NC_011147	TG	3	6	247619	247624	0 %	50 %	50 %	0 %	197361416
4560	NC_011147	GAA	2	6	247652	247657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361416
4561	NC_011147	CGC	2	6	247673	247678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361416
4562	NC_011147	TGG	2	6	247805	247810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361416
4563	NC_011147	GAA	2	6	247846	247851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361416
4564	NC_011147	TAT	2	6	247859	247864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361416
4565	NC_011147	GAT	2	6	247958	247963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361416
4566	NC_011147	AGC	2	6	248022	248027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361416
4567	NC_011147	CCA	2	6	248056	248061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361416
4568	NC_011147	TGG	2	6	248085	248090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361416
4569	NC_011147	T	6	6	248150	248155	0 %	100 %	0 %	0 %	197361416
4570	NC_011147	TAAA	2	8	248178	248185	75 %	25 %	0 %	0 %	197361416
4571	NC_011147	GCC	2	6	248283	248288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361416
4572	NC_011147	TTA	2	6	248384	248389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361416
4573	NC_011147	TGG	2	6	248439	248444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361416
4574	NC_011147	GTC	2	6	248528	248533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361416
4575	NC_011147	CGG	2	6	248553	248558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361416
4576	NC_011147	ATT	2	6	248577	248582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361416
4577	NC_011147	TGAC	2	8	248619	248626	25 %	25 %	25 %	25 %	197361416
4578	NC_011147	A	7	7	248807	248813	100 %	0 %	0 %	0 %	197361417
4579	NC_011147	CGG	2	6	248877	248882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361417
4580	NC_011147	CAG	2	6	248912	248917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4581	NC_011147	GGT	2	6	248959	248964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361417
4582	NC_011147	CAC	2	6	248986	248991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361417
4583	NC_011147	CGC	2	6	249000	249005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361417
4584	NC_011147	CAG	2	6	249023	249028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4585	NC_011147	GCG	2	6	249096	249101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361417
4586	NC_011147	CGG	2	6	249106	249111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361417
4587	NC_011147	CGG	2	6	249115	249120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361417
4588	NC_011147	CAA	2	6	249122	249127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361417
4589	NC_011147	ATT	2	6	249158	249163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361417
4590	NC_011147	CGC	2	6	249166	249171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361417
4591	NC_011147	CGT	2	6	249181	249186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4592	NC_011147	CAA	2	6	249190	249195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361417
4593	NC_011147	AGT	2	6	249262	249267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361417
4594	NC_011147	GAA	2	6	249316	249321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361417
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4597	NC_011147	CGG	2	6	249580	249585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361417
4598	NC_011147	TGG	2	6	249645	249650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361417
4599	NC_011147	CAG	2	6	249838	249843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4600	NC_011147	GCG	2	6	249848	249853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361417
4601	NC_011147	GC	3	6	249856	249861	0 %	0 %	50 %	50 %	197361417
4602	NC_011147	GCA	2	6	249885	249890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4603	NC_011147	CTG	2	6	249905	249910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4604	NC_011147	GCA	2	6	249946	249951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4605	NC_011147	AGC	2	6	249953	249958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4606	NC_011147	AGC	2	6	250046	250051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4607	NC_011147	CGC	2	6	250069	250074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361417
4608	NC_011147	A	6	6	250088	250093	100 %	0 %	0 %	0 %	197361417
4609	NC_011147	CAG	2	6	250118	250123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361417
4610	NC_011147	GTG	2	6	250197	250202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361417
4611	NC_011147	TATT	2	8	250210	250217	25 %	75 %	0 %	0 %	197361417
4612	NC_011147	TGGC	3	12	250385	250396	0 %	25 %	50 %	25 %	197361418
4613	NC_011147	GC	3	6	250429	250434	0 %	0 %	50 %	50 %	197361418
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4617	NC_011147	CGA	2	6	250572	250577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361418
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4619	NC_011147	GAT	2	6	250722	250727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361418
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4621	NC_011147	GAA	2	6	250810	250815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361418
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4987	NC_011147	CGT	2	6	270310	270315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361434
4988	NC_011147	GGC	2	6	270392	270397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361434
4989	NC_011147	CTC	2	6	270493	270498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361434
4990	NC_011147	CAA	2	6	270517	270522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361434
4991	NC_011147	CTG	2	6	270537	270542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361434
4992	NC_011147	TGA	2	6	270549	270554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361434
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