MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011134	GGC	2	6	220646	220651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195977347
3502	NC_011134	TGCC	2	8	220655	220662	0 %	25 %	25 %	50 %	195977347
3503	NC_011134	AGCA	2	8	220670	220677	50 %	0 %	25 %	25 %	195977347
3504	NC_011134	TTG	2	6	220725	220730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977347
3505	NC_011134	CAA	2	6	220735	220740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977347
3506	NC_011134	ATT	2	6	220883	220888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977347
3507	NC_011134	ATC	2	6	220892	220897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977347
3508	NC_011134	GAC	2	6	221024	221029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977347
3509	NC_011134	GA	3	6	221059	221064	50 %	0 %	50 %	0 %	195977347
3510	NC_011134	GCC	2	6	221163	221168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977348
3511	NC_011134	CCA	2	6	221194	221199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977348
3512	NC_011134	TCG	2	6	221227	221232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977348
3513	NC_011134	ATTCA	2	10	221244	221253	40 %	40 %	0 %	20 %	195977348
3514	NC_011134	TCG	2	6	221254	221259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977348
3515	NC_011134	GAG	2	6	221283	221288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977348
3516	NC_011134	GTC	2	6	221295	221300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977348
3517	NC_011134	CCAAG	2	10	221366	221375	40 %	0 %	20 %	40 %	195977348
3518	NC_011134	TGA	2	6	221402	221407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977348
3519	NC_011134	TCC	2	6	221470	221475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977348
3520	NC_011134	TTG	2	6	221488	221493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977348
3521	NC_011134	AGC	2	6	221569	221574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977348
3522	NC_011134	CA	3	6	221594	221599	50 %	0 %	0 %	50 %	195977348
3523	NC_011134	TGA	2	6	221617	221622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977348
3524	NC_011134	GAG	2	6	221634	221639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977348
3525	NC_011134	TTG	2	6	221707	221712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977348
3526	NC_011134	ATT	2	6	221751	221756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977348
3527	NC_011134	TTG	2	6	221766	221771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977348
3528	NC_011134	ATG	2	6	221902	221907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977348
3529	NC_011134	GAC	2	6	221973	221978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977348
3530	NC_011134	AGC	2	6	222225	222230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3531	NC_011134	TGC	2	6	222269	222274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3532	NC_011134	AGC	2	6	222341	222346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3533	NC_011134	TCA	2	6	222360	222365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977349
3534	NC_011134	GTGC	2	8	222376	222383	0 %	25 %	50 %	25 %	195977349
3535	NC_011134	GTG	2	6	222409	222414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977349
3536	NC_011134	AGC	2	6	222422	222427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3537	NC_011134	ATG	2	6	222448	222453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977349
3538	NC_011134	AGA	2	6	222456	222461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977349
3539	NC_011134	TATCA	2	10	222550	222559	40 %	40 %	0 %	20 %	195977349
3540	NC_011134	GCA	2	6	222634	222639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3541	NC_011134	GGT	2	6	222645	222650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977349
3542	NC_011134	TAC	2	6	222787	222792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977349
3543	NC_011134	CTG	2	6	222847	222852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3544	NC_011134	TGA	2	6	222861	222866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977349
3545	NC_011134	GCA	2	6	222936	222941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3546	NC_011134	TTGA	2	8	223018	223025	25 %	50 %	25 %	0 %	195977349
3547	NC_011134	GCA	2	6	223061	223066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3548	NC_011134	CA	3	6	223187	223192	50 %	0 %	0 %	50 %	195977349
3549	NC_011134	GT	3	6	223218	223223	0 %	50 %	50 %	0 %	195977349
3550	NC_011134	ATG	2	6	223358	223363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977349
3551	NC_011134	CAG	3	9	223460	223468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977349
3552	NC_011134	CAGT	2	8	223483	223490	25 %	25 %	25 %	25 %	195977349
3553	NC_011134	GGT	2	6	223527	223532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977349
3554	NC_011134	GAAG	2	8	223533	223540	50 %	0 %	50 %	0 %	195977349
3555	NC_011134	CAC	2	6	223561	223566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977349
3556	NC_011134	AAT	2	6	223754	223759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977350
3557	NC_011134	ATT	2	6	223777	223782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977350
3558	NC_011134	GGCT	2	8	223896	223903	0 %	25 %	50 %	25 %	195977350
3559	NC_011134	AGA	2	6	223928	223933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977350
3560	NC_011134	AGC	2	6	223952	223957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977350
3561	NC_011134	TTG	2	6	223987	223992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977350
3562	NC_011134	ATTGGT	2	12	223995	224006	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	195977350
3563	NC_011134	TCA	2	6	224121	224126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977350
3564	NC_011134	ACA	3	9	224199	224207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977350
3565	NC_011134	AAG	2	6	224263	224268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977350
3566	NC_011134	CAA	2	6	224273	224278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977350
3567	NC_011134	TGT	2	6	224354	224359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977350
3568	NC_011134	TGG	2	6	224372	224377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977350
3569	NC_011134	GCA	2	6	224418	224423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977350
3570	NC_011134	TCA	2	6	224481	224486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977350
3571	NC_011134	CAT	2	6	224584	224589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977350
3572	NC_011134	TGG	2	6	224607	224612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977350
3573	NC_011134	AGC	2	6	224614	224619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977350
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3579	NC_011134	TGG	2	6	224885	224890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977350
3580	NC_011134	CTT	2	6	224954	224959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977350
3581	NC_011134	CTT	2	6	225051	225056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977350
3582	NC_011134	AGC	2	6	225083	225088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977350
3583	NC_011134	ACGC	2	8	225094	225101	25 %	0 %	25 %	50 %	195977350
3584	NC_011134	TCA	2	6	225744	225749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977351
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3586	NC_011134	TTG	2	6	225814	225819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977351
3587	NC_011134	ACGTC	2	10	225867	225876	20 %	20 %	20 %	40 %	195977351
3588	NC_011134	GGT	2	6	225902	225907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977351
3589	NC_011134	AAT	2	6	225939	225944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977351
3590	NC_011134	GA	3	6	226023	226028	50 %	0 %	50 %	0 %	195977351
3591	NC_011134	A	6	6	226095	226100	100 %	0 %	0 %	0 %	195977351
3592	NC_011134	ATT	2	6	226110	226115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977351
3593	NC_011134	ACA	2	6	226365	226370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977351
3594	NC_011134	TTG	2	6	226411	226416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977351
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3596	NC_011134	ACA	2	6	226458	226463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977351
3597	NC_011134	GGT	2	6	226473	226478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977351
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3599	NC_011134	CAA	2	6	226678	226683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977352
3600	NC_011134	TCT	2	6	226794	226799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977352
3601	NC_011134	CTG	2	6	226807	226812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977352
3602	NC_011134	CTC	2	6	226818	226823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977352
3603	NC_011134	TGA	2	6	226836	226841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977352
3604	NC_011134	TGA	2	6	226848	226853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977352
3605	NC_011134	GCA	2	6	226868	226873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977352
3606	NC_011134	GCT	2	6	226986	226991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977352
3607	NC_011134	T	6	6	227050	227055	0 %	100 %	0 %	0 %	195977352
3608	NC_011134	TAC	2	6	227176	227181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977352
3609	NC_011134	GGA	2	6	227211	227216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977352
3610	NC_011134	AGCT	2	8	227234	227241	25 %	25 %	25 %	25 %	195977352
3611	NC_011134	TTA	2	6	227276	227281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977352
3612	NC_011134	GCCTA	2	10	227312	227321	20 %	20 %	20 %	40 %	195977352
3613	NC_011134	AG	3	6	227340	227345	50 %	0 %	50 %	0 %	195977352
3614	NC_011134	ATG	3	9	227626	227634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977352
3615	NC_011134	A	7	7	227668	227674	100 %	0 %	0 %	0 %	195977352
3616	NC_011134	GTC	2	6	227720	227725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977352
3617	NC_011134	TTG	2	6	227752	227757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977352
3618	NC_011134	GAG	2	6	227773	227778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977352
3619	NC_011134	CAC	2	6	227820	227825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977352
3620	NC_011134	TGT	2	6	227859	227864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977352
3621	NC_011134	TGA	2	6	227883	227888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977352
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3866	NC_011134	TGA	2	6	241523	241528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
3867	NC_011134	TTG	2	6	241543	241548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977367
3868	NC_011134	TGG	2	6	241609	241614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977367
3869	NC_011134	TGA	2	6	241634	241639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
3870	NC_011134	TGA	2	6	241661	241666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
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3874	NC_011134	CTG	2	6	241940	241945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977367
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3879	NC_011134	GTTT	2	8	242279	242286	0 %	75 %	25 %	0 %	195977367
3880	NC_011134	TGG	2	6	242313	242318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977367
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3899	NC_011134	TGT	2	6	242915	242920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977368
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3902	NC_011134	AGCTG	2	10	242990	242999	20 %	20 %	40 %	20 %	195977368
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3987	NC_011134	TTG	2	6	249093	249098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977373
3988	NC_011134	GTCT	2	8	249121	249128	0 %	50 %	25 %	25 %	195977373
3989	NC_011134	CA	3	6	249155	249160	50 %	0 %	0 %	50 %	195977373
3990	NC_011134	TGGT	2	8	249216	249223	0 %	50 %	50 %	0 %	195977373
3991	NC_011134	CA	3	6	249265	249270	50 %	0 %	0 %	50 %	195977373
3992	NC_011134	ATG	2	6	249282	249287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977373
3993	NC_011134	CTT	2	6	249379	249384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977373
3994	NC_011134	GCTCA	2	10	249396	249405	20 %	20 %	20 %	40 %	195977373
3995	NC_011134	T	6	6	249461	249466	0 %	100 %	0 %	0 %	195977373
3996	NC_011134	CTG	2	6	249494	249499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977373
3997	NC_011134	A	7	7	249521	249527	100 %	0 %	0 %	0 %	195977373
3998	NC_011134	ATA	2	6	249558	249563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977373
3999	NC_011134	TCA	2	6	250454	250459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977374
4000	NC_011134	GTCA	2	8	250597	250604	25 %	25 %	25 %	25 %	195977374

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