MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011134	ATG	2	6	188020	188025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
3002	NC_011134	GA	3	6	188063	188068	50 %	0 %	50 %	0 %	195977321
3003	NC_011134	ACA	2	6	188083	188088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977321
3004	NC_011134	CCA	2	6	188107	188112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977321
3005	NC_011134	AGC	2	6	188202	188207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977321
3006	NC_011134	AGG	2	6	188269	188274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977321
3007	NC_011134	ATT	2	6	188281	188286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977321
3008	NC_011134	TGC	2	6	188356	188361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977321
3009	NC_011134	TTC	2	6	188365	188370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977321
3010	NC_011134	AGGT	2	8	188533	188540	25 %	25 %	50 %	0 %	195977321
3011	NC_011134	AGGATC	2	12	188572	188583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195977321
3012	NC_011134	T	6	6	188746	188751	0 %	100 %	0 %	0 %	195977321
3013	NC_011134	GAG	2	6	188790	188795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977321
3014	NC_011134	GAT	2	6	188859	188864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
3015	NC_011134	AGG	2	6	188891	188896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977321
3016	NC_011134	GAT	2	6	188952	188957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
3017	NC_011134	GCT	2	6	188975	188980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977321
3018	NC_011134	ACA	2	6	189033	189038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977321
3019	NC_011134	TTTGA	2	10	189057	189066	20 %	60 %	20 %	0 %	195977321
3020	NC_011134	CAA	2	6	189088	189093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977321
3021	NC_011134	GAT	2	6	189147	189152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
3022	NC_011134	ATT	2	6	189156	189161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977321
3023	NC_011134	TCAT	2	8	189295	189302	25 %	50 %	0 %	25 %	195977321
3024	NC_011134	ATT	2	6	189308	189313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977321
3025	NC_011134	GAA	2	6	189587	189592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977322
3026	NC_011134	GAA	2	6	189596	189601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977322
3027	NC_011134	TGG	2	6	189632	189637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977322
3028	NC_011134	GTG	2	6	189672	189677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977322
3029	NC_011134	TGT	2	6	189682	189687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977322
3030	NC_011134	A	6	6	189722	189727	100 %	0 %	0 %	0 %	195977322
3031	NC_011134	GCA	2	6	189893	189898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977322
3032	NC_011134	CAA	2	6	189907	189912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977322
3033	NC_011134	TTG	2	6	189936	189941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977322
3034	NC_011134	TAT	2	6	189994	189999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977322
3035	NC_011134	CTG	2	6	190047	190052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977322
3036	NC_011134	TGAC	2	8	190137	190144	25 %	25 %	25 %	25 %	195977322
3037	NC_011134	AGG	2	6	190189	190194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977322
3038	NC_011134	TGT	2	6	190267	190272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977322
3039	NC_011134	TGA	2	6	190414	190419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977322
3040	NC_011134	CATT	2	8	190473	190480	25 %	50 %	0 %	25 %	195977322
3041	NC_011134	TGG	2	6	190489	190494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977322
3042	NC_011134	CAGGAT	2	12	190511	190522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195977322
3043	NC_011134	GAC	2	6	190553	190558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977322
3044	NC_011134	CTT	2	6	190561	190566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977322
3045	NC_011134	GCTT	2	8	190736	190743	0 %	50 %	25 %	25 %	195977323
3046	NC_011134	GTTT	2	8	190760	190767	0 %	75 %	25 %	0 %	195977323
3047	NC_011134	AGG	2	6	190806	190811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977323
3048	NC_011134	CTG	2	6	190812	190817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977323
3049	NC_011134	TGCT	2	8	190853	190860	0 %	50 %	25 %	25 %	195977323
3050	NC_011134	A	6	6	191159	191164	100 %	0 %	0 %	0 %	195977324
3051	NC_011134	AGC	2	6	191170	191175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3052	NC_011134	ATG	2	6	191247	191252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977324
3053	NC_011134	AAGGA	2	10	191376	191385	60 %	0 %	40 %	0 %	195977324
3054	NC_011134	AG	3	6	191414	191419	50 %	0 %	50 %	0 %	195977324
3055	NC_011134	GA	3	6	191538	191543	50 %	0 %	50 %	0 %	195977324
3056	NC_011134	TCAG	2	8	191563	191570	25 %	25 %	25 %	25 %	195977324
3057	NC_011134	CTT	2	6	191573	191578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977324
3058	NC_011134	TGG	2	6	191611	191616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977324
3059	NC_011134	GCA	2	6	191620	191625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3060	NC_011134	TTGGC	2	10	191631	191640	0 %	40 %	40 %	20 %	195977324
3061	NC_011134	TCG	2	6	191710	191715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3062	NC_011134	GCT	2	6	191731	191736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3063	NC_011134	ATT	2	6	191765	191770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977324
3064	NC_011134	TGA	2	6	191823	191828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977324
3065	NC_011134	GAG	2	6	192020	192025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977324
3066	NC_011134	TCG	3	9	192049	192057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3067	NC_011134	CAG	2	6	192078	192083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3068	NC_011134	TTA	2	6	192168	192173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977324
3069	NC_011134	AGC	2	6	192228	192233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
3070	NC_011134	TTA	2	6	192249	192254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977324
3071	NC_011134	GAC	2	6	192296	192301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
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3073	NC_011134	AACT	2	8	192377	192384	50 %	25 %	0 %	25 %	195977325
3074	NC_011134	CTT	2	6	192411	192416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977325
3075	NC_011134	CTG	2	6	192421	192426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
3076	NC_011134	TGGAT	2	10	192449	192458	20 %	40 %	40 %	0 %	195977325
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3079	NC_011134	CTTG	2	8	192654	192661	0 %	50 %	25 %	25 %	195977325
3080	NC_011134	T	6	6	192778	192783	0 %	100 %	0 %	0 %	195977325
3081	NC_011134	GCC	2	6	192831	192836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977325
3082	NC_011134	ATG	2	6	192988	192993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977325
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3085	NC_011134	ATT	2	6	193126	193131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977325
3086	NC_011134	GCT	2	6	193213	193218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
3087	NC_011134	TGT	2	6	193232	193237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977325
3088	NC_011134	TGC	2	6	193257	193262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
3089	NC_011134	TCA	2	6	193267	193272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977325
3090	NC_011134	TCA	2	6	193276	193281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977325
3091	NC_011134	CAA	2	6	193448	193453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977325
3092	NC_011134	CAG	3	9	193477	193485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977325
3093	NC_011134	ATT	2	6	193618	193623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977325
3094	NC_011134	TAT	2	6	193644	193649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977325
3095	NC_011134	CTG	3	9	193652	193660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
3096	NC_011134	TGC	2	6	193707	193712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
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3099	NC_011134	TTG	2	6	193919	193924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977325
3100	NC_011134	ATCA	2	8	193972	193979	50 %	25 %	0 %	25 %	195977325
3101	NC_011134	GCCA	2	8	194017	194024	25 %	0 %	25 %	50 %	195977325
3102	NC_011134	T	7	7	194305	194311	0 %	100 %	0 %	0 %	195977326
3103	NC_011134	GATC	2	8	194355	194362	25 %	25 %	25 %	25 %	195977326
3104	NC_011134	AGC	2	6	194378	194383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977326
3105	NC_011134	GCT	2	6	194400	194405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977326
3106	NC_011134	ACA	2	6	194612	194617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977327
3107	NC_011134	AAG	2	6	194625	194630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977327
3108	NC_011134	A	6	6	194696	194701	100 %	0 %	0 %	0 %	195977327
3109	NC_011134	GAA	2	6	194729	194734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977327
3110	NC_011134	AGA	2	6	194770	194775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977327
3111	NC_011134	CCT	2	6	194815	194820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977327
3112	NC_011134	AACC	2	8	194831	194838	50 %	0 %	0 %	50 %	195977327
3113	NC_011134	GAT	2	6	195089	195094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977327
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3115	NC_011134	ATT	3	9	195171	195179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977327
3116	NC_011134	GA	3	6	195222	195227	50 %	0 %	50 %	0 %	195977327
3117	NC_011134	TAC	2	6	195228	195233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977327
3118	NC_011134	AAG	2	6	195234	195239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977327
3119	NC_011134	A	6	6	195395	195400	100 %	0 %	0 %	0 %	195977327
3120	NC_011134	CAAG	2	8	195475	195482	50 %	0 %	25 %	25 %	195977327
3121	NC_011134	TGGC	2	8	195487	195494	0 %	25 %	50 %	25 %	195977327
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3488	NC_011134	A	6	6	220039	220044	100 %	0 %	0 %	0 %	195977347
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