MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 1861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011092	GTG	2	6	34492	34497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733856
502	NC_011092	GGT	2	6	34617	34622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733856
503	NC_011092	TCG	2	6	34679	34684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733856
504	NC_011092	GT	3	6	34728	34733	0 %	50 %	50 %	0 %	194733856
505	NC_011092	GCA	3	9	34799	34807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733856
506	NC_011092	GCG	2	6	34834	34839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
507	NC_011092	GCG	2	6	34859	34864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
508	NC_011092	GGT	2	6	34884	34889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733856
509	NC_011092	GAT	2	6	34890	34895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733856
510	NC_011092	CAA	2	6	34953	34958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733856
511	NC_011092	TCG	2	6	35062	35067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733856
512	NC_011092	AGCGC	2	10	35111	35120	20 %	0 %	40 %	40 %	194733856
513	NC_011092	TTC	2	6	35122	35127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733856
514	NC_011092	GTA	2	6	35151	35156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733856
515	NC_011092	CGT	2	6	35171	35176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733856
516	NC_011092	TGA	2	6	35207	35212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733856
517	NC_011092	CGG	2	6	35228	35233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
518	NC_011092	GC	4	8	35241	35248	0 %	0 %	50 %	50 %	194733856
519	NC_011092	GCA	2	6	35267	35272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733856
520	NC_011092	GGC	2	6	35298	35303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
521	NC_011092	GCG	2	6	35339	35344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
522	NC_011092	GCG	2	6	35349	35354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
523	NC_011092	GGC	2	6	35436	35441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
524	NC_011092	GGC	2	6	35472	35477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
525	NC_011092	TCAA	2	8	35506	35513	50 %	25 %	0 %	25 %	194733856
526	NC_011092	CTG	3	9	35577	35585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733856
527	NC_011092	GAT	2	6	35619	35624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733856
528	NC_011092	GAT	2	6	35640	35645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733856
529	NC_011092	CGT	2	6	35701	35706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733856
530	NC_011092	CAG	2	6	35729	35734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733856
531	NC_011092	GCCA	2	8	35896	35903	25 %	0 %	25 %	50 %	194733856
532	NC_011092	GC	3	6	36028	36033	0 %	0 %	50 %	50 %	194733856
533	NC_011092	GCC	2	6	36068	36073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733856
534	NC_011092	CCG	2	6	36219	36224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733856
535	NC_011092	CCA	2	6	36284	36289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733856
536	NC_011092	CAG	2	6	36474	36479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733856
537	NC_011092	GCG	2	6	36510	36515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733856
538	NC_011092	CCA	2	6	36580	36585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733888
539	NC_011092	T	6	6	36589	36594	0 %	100 %	0 %	0 %	194733888
540	NC_011092	TTTC	2	8	36650	36657	0 %	75 %	0 %	25 %	194733888
541	NC_011092	GCT	2	6	36676	36681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733888
542	NC_011092	GC	3	6	36723	36728	0 %	0 %	50 %	50 %	194733888
543	NC_011092	CTT	2	6	36805	36810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733888
544	NC_011092	GCG	2	6	36857	36862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733888
545	NC_011092	TCA	2	6	36867	36872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733888
546	NC_011092	CAC	3	9	36902	36910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733888
547	NC_011092	CAG	2	6	36935	36940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733888
548	NC_011092	GCT	2	6	37043	37048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733888
549	NC_011092	TCAA	2	8	37138	37145	50 %	25 %	0 %	25 %	194733888
550	NC_011092	ACG	2	6	37265	37270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733867
551	NC_011092	GCT	2	6	37272	37277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733867
552	NC_011092	GGA	2	6	37299	37304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733867
553	NC_011092	GGC	2	6	37406	37411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733867
554	NC_011092	ATC	2	6	37469	37474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733804
555	NC_011092	GC	3	6	37622	37627	0 %	0 %	50 %	50 %	194733804
556	NC_011092	TGC	2	6	37694	37699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733804
557	NC_011092	GC	3	6	37733	37738	0 %	0 %	50 %	50 %	194733804
558	NC_011092	CGC	2	6	37773	37778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733804
559	NC_011092	CCA	2	6	37804	37809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733804
560	NC_011092	GCT	2	6	37827	37832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733804
561	NC_011092	ATA	2	6	37974	37979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733797
562	NC_011092	GGCCT	2	10	37989	37998	0 %	20 %	40 %	40 %	194733797
563	NC_011092	TGG	2	6	38033	38038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733797
564	NC_011092	GTT	2	6	38118	38123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733797
565	NC_011092	GAGCA	2	10	38178	38187	40 %	0 %	40 %	20 %	194733797
566	NC_011092	GC	3	6	38189	38194	0 %	0 %	50 %	50 %	194733797
567	NC_011092	GGCG	2	8	38202	38209	0 %	0 %	75 %	25 %	194733797
568	NC_011092	TGA	2	6	38222	38227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733797
569	NC_011092	CTT	2	6	38244	38249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733797
570	NC_011092	GTT	2	6	38253	38258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733797
571	NC_011092	ACG	2	6	38298	38303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733797
572	NC_011092	GGA	2	6	38304	38309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733797
573	NC_011092	GA	3	6	38308	38313	50 %	0 %	50 %	0 %	194733797
574	NC_011092	CAGC	2	8	38519	38526	25 %	0 %	25 %	50 %	194733797
575	NC_011092	ATG	2	6	38587	38592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733797
576	NC_011092	GTA	2	6	38698	38703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733885
577	NC_011092	GGA	2	6	38748	38753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733885
578	NC_011092	GAC	2	6	38791	38796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733885
579	NC_011092	GC	3	6	38833	38838	0 %	0 %	50 %	50 %	194733885
580	NC_011092	CGG	2	6	38842	38847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733885
581	NC_011092	GGC	2	6	38929	38934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733885
582	NC_011092	CGC	2	6	38955	38960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733885
583	NC_011092	TCG	2	6	38996	39001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733885
584	NC_011092	ATC	2	6	39005	39010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733885
585	NC_011092	GAT	2	6	39025	39030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733885
586	NC_011092	GCC	2	6	39043	39048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733885
587	NC_011092	TGC	2	6	39092	39097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733885
588	NC_011092	AGC	2	6	39152	39157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733885
589	NC_011092	GAC	2	6	39280	39285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733885
590	NC_011092	GGC	2	6	39336	39341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733885
591	NC_011092	GCG	2	6	39414	39419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733885
592	NC_011092	AGG	2	6	39430	39435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733885
593	NC_011092	CGC	2	6	39438	39443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733885
594	NC_011092	CGG	2	6	39485	39490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733885
595	NC_011092	GC	3	6	39538	39543	0 %	0 %	50 %	50 %	194733885
596	NC_011092	TTACCT	2	12	39683	39694	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194733885
597	NC_011092	GCC	2	6	39797	39802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733885
598	NC_011092	TGA	2	6	39849	39854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733885
599	NC_011092	ACG	2	6	39862	39867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733885
600	NC_011092	GC	3	6	39868	39873	0 %	0 %	50 %	50 %	194733885
601	NC_011092	TCA	2	6	39887	39892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733885
602	NC_011092	GCTG	2	8	40023	40030	0 %	25 %	50 %	25 %	194733823
603	NC_011092	GTC	2	6	40064	40069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733823
604	NC_011092	CCGC	2	8	40115	40122	0 %	0 %	25 %	75 %	194733823
605	NC_011092	CAT	2	6	40142	40147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733823
606	NC_011092	GCA	2	6	40197	40202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733823
607	NC_011092	GCAG	2	8	40214	40221	25 %	0 %	50 %	25 %	194733823
608	NC_011092	GTC	2	6	40239	40244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733823
609	NC_011092	GGC	2	6	40245	40250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733823
610	NC_011092	GC	3	6	40267	40272	0 %	0 %	50 %	50 %	194733823
611	NC_011092	CGG	2	6	40346	40351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733823
612	NC_011092	TCG	3	9	40384	40392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733823
613	NC_011092	CTGG	2	8	40407	40414	0 %	25 %	50 %	25 %	194733823
614	NC_011092	GGC	2	6	40555	40560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733823
615	NC_011092	GCC	2	6	40580	40585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733823
616	NC_011092	CG	3	6	40664	40669	0 %	0 %	50 %	50 %	194733823
617	NC_011092	CCG	2	6	40670	40675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733823
618	NC_011092	GCC	2	6	40690	40695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733823
619	NC_011092	CGG	2	6	40703	40708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733823
620	NC_011092	GC	3	6	40740	40745	0 %	0 %	50 %	50 %	194733806
621	NC_011092	AGC	2	6	40746	40751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733806
622	NC_011092	GAAC	2	8	40765	40772	50 %	0 %	25 %	25 %	194733806
623	NC_011092	AGCGCG	2	12	40782	40793	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194733806
624	NC_011092	AAGG	2	8	40814	40821	50 %	0 %	50 %	0 %	194733806
625	NC_011092	CGG	2	6	40825	40830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733806
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627	NC_011092	GGCAGG	2	12	40867	40878	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	194733806
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