MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 9694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011083	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	194450909
2	NC_011083	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	194450909
3	NC_011083	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	194451411
4	NC_011083	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	194450589
5	NC_011083	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	194450589
6	NC_011083	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	194450589
7	NC_011083	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	194450589
8	NC_011083	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	194450589
9	NC_011083	TGAG	2	8	6623	6630	25 %	25 %	50 %	0 %	194447372
10	NC_011083	GCCA	2	8	6663	6670	25 %	0 %	25 %	50 %	194447372
11	NC_011083	TGAA	2	8	7289	7296	50 %	25 %	25 %	0 %	194447372
12	NC_011083	GCGT	2	8	8155	8162	0 %	25 %	50 %	25 %	194447995
13	NC_011083	AAGA	2	8	8237	8244	75 %	0 %	25 %	0 %	194447995
14	NC_011083	TCCG	2	8	9278	9285	0 %	25 %	25 %	50 %	194448501
15	NC_011083	GAAC	2	8	9717	9724	50 %	0 %	25 %	25 %	194449286
16	NC_011083	CAGG	2	8	10121	10128	25 %	0 %	50 %	25 %	194447756
17	NC_011083	TTGA	2	8	10976	10983	25 %	50 %	25 %	0 %	194447911
18	NC_011083	TGGC	2	8	11003	11010	0 %	25 %	50 %	25 %	194447911
19	NC_011083	TCGT	2	8	11123	11130	0 %	50 %	25 %	25 %	194447911
20	NC_011083	ATTT	2	8	11369	11376	25 %	75 %	0 %	0 %	194451127
21	NC_011083	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	194451127
22	NC_011083	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	194451865
23	NC_011083	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	194451865
24	NC_011083	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	194451865
25	NC_011083	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	194451865
26	NC_011083	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	194451865
27	NC_011083	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	194451865
28	NC_011083	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	194451551
29	NC_011083	TCAG	2	8	15244	15251	25 %	25 %	25 %	25 %	194449168
30	NC_011083	TTTG	2	8	15534	15541	0 %	75 %	25 %	0 %	194449168
31	NC_011083	CGAA	2	8	15749	15756	50 %	0 %	25 %	25 %	194449168
32	NC_011083	ATTG	2	8	15761	15768	25 %	50 %	25 %	0 %	194449168
33	NC_011083	ATTA	2	8	16429	16436	50 %	50 %	0 %	0 %	194447356
34	NC_011083	ATAA	2	8	16521	16528	75 %	25 %	0 %	0 %	194448797
35	NC_011083	AATA	2	8	17997	18004	75 %	25 %	0 %	0 %	194450498
36	NC_011083	GGGC	2	8	18583	18590	0 %	0 %	75 %	25 %	194450498
37	NC_011083	CGTG	2	8	19283	19290	0 %	25 %	50 %	25 %	194450498
38	NC_011083	TCCA	2	8	20068	20075	25 %	25 %	0 %	50 %	194449860
39	NC_011083	CCAA	2	8	21284	21291	50 %	0 %	0 %	50 %	194449860
40	NC_011083	GACG	2	8	21630	21637	25 %	0 %	50 %	25 %	194449860
41	NC_011083	TGGC	2	8	22283	22290	0 %	25 %	50 %	25 %	194449860
42	NC_011083	TGGC	2	8	22389	22396	0 %	25 %	50 %	25 %	194449860
43	NC_011083	CGCC	2	8	22655	22662	0 %	0 %	25 %	75 %	194449860
44	NC_011083	CTGG	2	8	23001	23008	0 %	25 %	50 %	25 %	194449860
45	NC_011083	TTTA	2	8	23499	23506	25 %	75 %	0 %	0 %	194450804
46	NC_011083	TCTG	2	8	23956	23963	0 %	50 %	25 %	25 %	194450804
47	NC_011083	TGCA	2	8	24749	24756	25 %	25 %	25 %	25 %	194448112
48	NC_011083	GCTG	2	8	24936	24943	0 %	25 %	50 %	25 %	194448112
49	NC_011083	CCAG	2	8	25937	25944	25 %	0 %	25 %	50 %	194447857
50	NC_011083	ACCG	2	8	26614	26621	25 %	0 %	25 %	50 %	448967568
51	NC_011083	AAAT	2	8	26674	26681	75 %	25 %	0 %	0 %	448967568
52	NC_011083	TCTG	2	8	27131	27138	0 %	50 %	25 %	25 %	194449449
53	NC_011083	GCCT	2	8	27312	27319	0 %	25 %	25 %	50 %	194449449
54	NC_011083	CCTT	2	8	27818	27825	0 %	50 %	0 %	50 %	194449449
55	NC_011083	TCAG	2	8	28177	28184	25 %	25 %	25 %	25 %	194449449
56	NC_011083	ATCA	2	8	28590	28597	50 %	25 %	0 %	25 %	194449449
57	NC_011083	AGCC	2	8	29124	29131	25 %	0 %	25 %	50 %	194449449
58	NC_011083	CCGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	25 %	50 %	194449449
59	NC_011083	ATTA	2	8	29724	29731	50 %	50 %	0 %	0 %	194448823
60	NC_011083	GGCG	2	8	29966	29973	0 %	0 %	75 %	25 %	194448823
61	NC_011083	ATGA	2	8	31171	31178	50 %	25 %	25 %	0 %	194450483
62	NC_011083	TGCT	2	8	31741	31748	0 %	50 %	25 %	25 %	448967569
63	NC_011083	TATC	2	8	31797	31804	25 %	50 %	0 %	25 %	448967569
64	NC_011083	GTAA	2	8	31834	31841	50 %	25 %	25 %	0 %	448967569
65	NC_011083	TTCG	2	8	32096	32103	0 %	50 %	25 %	25 %	448967569
66	NC_011083	GTCA	2	8	32606	32613	25 %	25 %	25 %	25 %	194448411
67	NC_011083	CCTG	2	8	33900	33907	0 %	25 %	25 %	50 %	194449400
68	NC_011083	TAAA	2	8	34160	34167	75 %	25 %	0 %	0 %	194449400
69	NC_011083	CTTA	2	8	36145	36152	25 %	50 %	0 %	25 %	194449885
70	NC_011083	AATC	2	8	36551	36558	50 %	25 %	0 %	25 %	194449885
71	NC_011083	TAGA	2	8	36690	36697	50 %	25 %	25 %	0 %	194449885
72	NC_011083	TAAA	2	8	36872	36879	75 %	25 %	0 %	0 %	194449885
73	NC_011083	GGCT	2	8	37371	37378	0 %	25 %	50 %	25 %	194451527
74	NC_011083	AAGA	2	8	37534	37541	75 %	0 %	25 %	0 %	194451527
75	NC_011083	CCGA	2	8	38149	38156	25 %	0 %	25 %	50 %	194451527
76	NC_011083	ACCG	2	8	38524	38531	25 %	0 %	25 %	50 %	194451770
77	NC_011083	TGAT	2	8	38808	38815	25 %	50 %	25 %	0 %	194451770
78	NC_011083	TGGT	2	8	38853	38860	0 %	50 %	50 %	0 %	194451770
79	NC_011083	AATG	2	8	39331	39338	50 %	25 %	25 %	0 %	194451770
80	NC_011083	CCTG	2	8	39910	39917	0 %	25 %	25 %	50 %	194451119
81	NC_011083	TGCC	2	8	40496	40503	0 %	25 %	25 %	50 %	194451119
82	NC_011083	GACG	2	8	40533	40540	25 %	0 %	50 %	25 %	194451119
83	NC_011083	ATTA	2	8	40840	40847	50 %	50 %	0 %	0 %	194451119
84	NC_011083	AATC	2	8	40936	40943	50 %	25 %	0 %	25 %	194451119
85	NC_011083	GAAA	2	8	42363	42370	75 %	0 %	25 %	0 %	194449159
86	NC_011083	TCGC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	25 %	50 %	194449159
87	NC_011083	GCTG	2	8	42569	42576	0 %	25 %	50 %	25 %	194449159
88	NC_011083	CACG	2	8	43267	43274	25 %	0 %	25 %	50 %	194448540
89	NC_011083	CAGC	2	8	43294	43301	25 %	0 %	25 %	50 %	194448540
90	NC_011083	CTGC	2	8	43431	43438	0 %	25 %	25 %	50 %	194448540
91	NC_011083	CATG	2	8	43999	44006	25 %	25 %	25 %	25 %	194451435
92	NC_011083	AAGT	2	8	44793	44800	50 %	25 %	25 %	0 %	194451435
93	NC_011083	CCAG	2	8	44851	44858	25 %	0 %	25 %	50 %	194451435
94	NC_011083	TTGA	2	8	45632	45639	25 %	50 %	25 %	0 %	194451435
95	NC_011083	GAAA	2	8	45967	45974	75 %	0 %	25 %	0 %	194448790
96	NC_011083	GCCA	2	8	46308	46315	25 %	0 %	25 %	50 %	194448790
97	NC_011083	TAAA	2	8	46701	46708	75 %	25 %	0 %	0 %	194448790
98	NC_011083	CATA	2	8	48346	48353	50 %	25 %	0 %	25 %	194448015
99	NC_011083	TCAG	2	8	48357	48364	25 %	25 %	25 %	25 %	194448015
100	NC_011083	GCCC	2	8	48529	48536	0 %	0 %	25 %	75 %	194448015
101	NC_011083	TGGC	2	8	49071	49078	0 %	25 %	50 %	25 %	194448015
102	NC_011083	AGCC	2	8	52898	52905	25 %	0 %	25 %	50 %	194450579
103	NC_011083	AAAG	2	8	52977	52984	75 %	0 %	25 %	0 %	194450579
104	NC_011083	ATGG	2	8	53110	53117	25 %	25 %	50 %	0 %	194450579
105	NC_011083	TGAT	2	8	53782	53789	25 %	50 %	25 %	0 %	194449983
106	NC_011083	TGGA	2	8	54451	54458	25 %	25 %	50 %	0 %	194451956
107	NC_011083	CCTG	2	8	54487	54494	0 %	25 %	25 %	50 %	194451956
108	NC_011083	GATT	2	8	54849	54856	25 %	50 %	25 %	0 %	194451956
109	NC_011083	GATC	2	8	55218	55225	25 %	25 %	25 %	25 %	194451956
110	NC_011083	CTGC	2	8	56236	56243	0 %	25 %	25 %	50 %	194451485
111	NC_011083	CTGG	2	8	56343	56350	0 %	25 %	50 %	25 %	194451485
112	NC_011083	GTGG	2	8	56508	56515	0 %	25 %	75 %	0 %	194451485
113	NC_011083	CTGC	2	8	56718	56725	0 %	25 %	25 %	50 %	194448313
114	NC_011083	AATC	2	8	57051	57058	50 %	25 %	0 %	25 %	194448313
115	NC_011083	ACCA	2	8	57354	57361	50 %	0 %	0 %	50 %	194448113
116	NC_011083	GTGG	2	8	57389	57396	0 %	25 %	75 %	0 %	194448113
117	NC_011083	CATT	2	8	57579	57586	25 %	50 %	0 %	25 %	194448113
118	NC_011083	TCAA	2	8	58620	58627	50 %	25 %	0 %	25 %	194448113
119	NC_011083	GCCA	2	8	60206	60213	25 %	0 %	25 %	50 %	194448149
120	NC_011083	GCTG	2	8	60594	60601	0 %	25 %	50 %	25 %	194450841
121	NC_011083	CCAG	2	8	61626	61633	25 %	0 %	25 %	50 %	194450841
122	NC_011083	TTCA	2	8	62342	62349	25 %	50 %	0 %	25 %	194447598
123	NC_011083	GAAG	2	8	63094	63101	50 %	0 %	50 %	0 %	194447501
124	NC_011083	CAGA	2	8	63267	63274	50 %	0 %	25 %	25 %	194447501
125	NC_011083	TTTC	2	8	63540	63547	0 %	75 %	0 %	25 %	194447501
126	NC_011083	AGTC	2	8	63699	63706	25 %	25 %	25 %	25 %	194447501
127	NC_011083	TAAT	2	8	63741	63748	50 %	50 %	0 %	0 %	194447501
128	NC_011083	ATTT	2	8	64127	64134	25 %	75 %	0 %	0 %	194448979
129	NC_011083	GTCG	2	8	64159	64166	0 %	25 %	50 %	25 %	194448979
130	NC_011083	GCAG	2	8	64444	64451	25 %	0 %	50 %	25 %	194448979
131	NC_011083	AGCA	2	8	64599	64606	50 %	0 %	25 %	25 %	194448979
132	NC_011083	ACCG	2	8	64670	64677	25 %	0 %	25 %	50 %	194448979
133	NC_011083	GATC	2	8	64816	64823	25 %	25 %	25 %	25 %	194448979
134	NC_011083	GGCA	2	8	65190	65197	25 %	0 %	50 %	25 %	194449626
135	NC_011083	TCCA	2	8	65232	65239	25 %	25 %	0 %	50 %	194449626
136	NC_011083	GAAG	2	8	66068	66075	50 %	0 %	50 %	0 %	194449708
137	NC_011083	AAGG	2	8	66325	66332	50 %	0 %	50 %	0 %	194449708
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139	NC_011083	CAAT	2	8	67368	67375	50 %	25 %	0 %	25 %	194449842
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