MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 89417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011083	ACG	2	6	181448	181453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3502	NC_011083	AGA	2	6	181455	181460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450891
3503	NC_011083	CCG	2	6	181537	181542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450891
3504	NC_011083	A	6	6	181550	181555	100 %	0 %	0 %	0 %	194450891
3505	NC_011083	TCACCG	2	12	181556	181567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194450891
3506	NC_011083	CGA	2	6	181596	181601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3507	NC_011083	TC	4	8	181602	181609	0 %	50 %	0 %	50 %	194450891
3508	NC_011083	CAAA	2	8	181719	181726	75 %	0 %	0 %	25 %	194450891
3509	NC_011083	A	6	6	181741	181746	100 %	0 %	0 %	0 %	194450891
3510	NC_011083	GTG	2	6	181774	181779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450891
3511	NC_011083	TTC	2	6	181788	181793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450891
3512	NC_011083	GCG	3	9	181862	181870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3513	NC_011083	GGC	2	6	181882	181887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3514	NC_011083	TCT	2	6	181901	181906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450891
3515	NC_011083	GC	3	6	181928	181933	0 %	0 %	50 %	50 %	194450891
3516	NC_011083	CGA	2	6	182067	182072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3517	NC_011083	GTGC	2	8	182074	182081	0 %	25 %	50 %	25 %	194450891
3518	NC_011083	GGT	2	6	182083	182088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450891
3519	NC_011083	ACC	2	6	182119	182124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450891
3520	NC_011083	AGC	2	6	182191	182196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3521	NC_011083	GGTC	2	8	182223	182230	0 %	25 %	50 %	25 %	194450891
3522	NC_011083	TCCG	2	8	182252	182259	0 %	25 %	25 %	50 %	194450891
3523	NC_011083	CCG	2	6	182360	182365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450891
3524	NC_011083	CAC	2	6	182421	182426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450891
3525	NC_011083	CAC	2	6	182428	182433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450891
3526	NC_011083	TGC	3	9	182516	182524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3527	NC_011083	CGG	2	6	182541	182546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3528	NC_011083	CGG	2	6	182585	182590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3529	NC_011083	TCTGG	2	10	182593	182602	0 %	40 %	40 %	20 %	194450891
3530	NC_011083	GCC	2	6	182611	182616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450891
3531	NC_011083	CTG	2	6	182743	182748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3532	NC_011083	GAA	2	6	182757	182762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450891
3533	NC_011083	TCT	2	6	182777	182782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450891
3534	NC_011083	CTG	2	6	182935	182940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3535	NC_011083	GAT	2	6	182946	182951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450891
3536	NC_011083	CGT	2	6	182971	182976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3537	NC_011083	TGGC	2	8	183010	183017	0 %	25 %	50 %	25 %	194450891
3538	NC_011083	CTG	2	6	183028	183033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3539	NC_011083	CGG	2	6	183059	183064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3540	NC_011083	TG	3	6	183104	183109	0 %	50 %	50 %	0 %	194450891
3541	NC_011083	GAC	2	6	183124	183129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3542	NC_011083	CTG	2	6	183136	183141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3543	NC_011083	CGA	2	6	183165	183170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3544	NC_011083	CG	3	6	183211	183216	0 %	0 %	50 %	50 %	194450891
3545	NC_011083	GCT	2	6	183225	183230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3546	NC_011083	GCC	2	6	183273	183278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450891
3547	NC_011083	CGC	2	6	183291	183296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450891
3548	NC_011083	GAA	2	6	183307	183312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450891
3549	NC_011083	CTA	2	6	183315	183320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450891
3550	NC_011083	GGT	2	6	183411	183416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450891
3551	NC_011083	GGC	2	6	183489	183494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3552	NC_011083	CGG	2	6	183566	183571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450891
3553	NC_011083	CT	3	6	183604	183609	0 %	50 %	0 %	50 %	194450891
3554	NC_011083	GAA	2	6	183696	183701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451349
3555	NC_011083	TAA	2	6	183705	183710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451349
3556	NC_011083	T	7	7	183744	183750	0 %	100 %	0 %	0 %	194451349
3557	NC_011083	CTT	2	6	183827	183832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451349
3558	NC_011083	GGC	2	6	183986	183991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451349
3559	NC_011083	TCA	2	6	184014	184019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451349
3560	NC_011083	AAG	2	6	184022	184027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451349
3561	NC_011083	GTG	2	6	184076	184081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451349
3562	NC_011083	CCG	2	6	184099	184104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451349
3563	NC_011083	GTT	2	6	184111	184116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451349
3564	NC_011083	TTG	2	6	184130	184135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451349
3565	NC_011083	TCA	2	6	184158	184163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451349
3566	NC_011083	CTT	2	6	184204	184209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451349
3567	NC_011083	AGT	2	6	184275	184280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451349
3568	NC_011083	TCT	2	6	184293	184298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451349
3569	NC_011083	AT	3	6	184407	184412	50 %	50 %	0 %	0 %	194451349
3570	NC_011083	TAA	2	6	184474	184479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451349
3571	NC_011083	CAA	2	6	184514	184519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451349
3572	NC_011083	TTG	2	6	184547	184552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451349
3573	NC_011083	CCG	2	6	184585	184590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451349
3574	NC_011083	TAA	2	6	184618	184623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451349
3575	NC_011083	TAT	2	6	184739	184744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451851
3576	NC_011083	TAT	2	6	184752	184757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451851
3577	NC_011083	TAA	2	6	184758	184763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451851
3578	NC_011083	GAA	2	6	184784	184789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451851
3579	NC_011083	AT	3	6	184825	184830	50 %	50 %	0 %	0 %	194451851
3580	NC_011083	GAA	2	6	184850	184855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451851
3581	NC_011083	GCG	2	6	184882	184887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451851
3582	NC_011083	TAA	2	6	184926	184931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451851
3583	NC_011083	ATC	2	6	184974	184979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451851
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3585	NC_011083	CGC	2	6	185125	185130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451851
3586	NC_011083	GC	3	6	185203	185208	0 %	0 %	50 %	50 %	194451851
3587	NC_011083	TCG	2	6	185271	185276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451851
3588	NC_011083	T	7	7	185341	185347	0 %	100 %	0 %	0 %	194451851
3589	NC_011083	ATG	2	6	185352	185357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451851
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3591	NC_011083	CGT	2	6	185377	185382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451851
3592	NC_011083	A	6	6	185387	185392	100 %	0 %	0 %	0 %	194451851
3593	NC_011083	CTG	2	6	185432	185437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451851
3594	NC_011083	ACA	2	6	185440	185445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451851
3595	NC_011083	GCG	2	6	185457	185462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451851
3596	NC_011083	GGAG	2	8	185527	185534	25 %	0 %	75 %	0 %	194451851
3597	NC_011083	CAG	2	6	185564	185569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451851
3598	NC_011083	TGCG	2	8	185621	185628	0 %	25 %	50 %	25 %	194451851
3599	NC_011083	AGC	3	9	185640	185648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451851
3600	NC_011083	CTGG	2	8	185649	185656	0 %	25 %	50 %	25 %	194451851
3601	NC_011083	CAA	2	6	185704	185709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451851
3602	NC_011083	A	6	6	185720	185725	100 %	0 %	0 %	0 %	194451851
3603	NC_011083	CAT	2	6	185768	185773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451851
3604	NC_011083	CGC	2	6	185775	185780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451851
3605	NC_011083	ATA	2	6	185790	185795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451851
3606	NC_011083	GCG	2	6	185876	185881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447673
3607	NC_011083	GAT	2	6	185917	185922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447673
3608	NC_011083	GC	4	8	185955	185962	0 %	0 %	50 %	50 %	194447673
3609	NC_011083	CAG	2	6	186086	186091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447673
3610	NC_011083	TTCT	2	8	186099	186106	0 %	75 %	0 %	25 %	194447673
3611	NC_011083	TGG	2	6	186110	186115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447673
3612	NC_011083	CAT	2	6	186176	186181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448896
3613	NC_011083	GCG	2	6	186282	186287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448896
3614	NC_011083	GGT	2	6	186298	186303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448896
3615	NC_011083	ATCGC	2	10	186305	186314	20 %	20 %	20 %	40 %	194448896
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3617	NC_011083	ATCC	2	8	186382	186389	25 %	25 %	0 %	50 %	194448896
3618	NC_011083	CTG	2	6	186445	186450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448896
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3620	NC_011083	TGG	2	6	186548	186553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448896
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3622	NC_011083	CTG	2	6	186583	186588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448896
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3742	NC_011083	GCCCA	2	10	194011	194020	20 %	0 %	20 %	60 %	194451683
3743	NC_011083	CCA	3	9	194018	194026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451683
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3987	NC_011083	GAC	2	6	206685	206690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450545
3988	NC_011083	GCC	2	6	206853	206858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450545
3989	NC_011083	CAG	2	6	206889	206894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450545
3990	NC_011083	GTC	2	6	206910	206915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
3991	NC_011083	GTT	2	6	206925	206930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450545
3992	NC_011083	GTCC	2	8	206968	206975	0 %	25 %	25 %	50 %	194450545
3993	NC_011083	CGTCA	2	10	207048	207057	20 %	20 %	20 %	40 %	194450545
3994	NC_011083	TGC	2	6	207068	207073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
3995	NC_011083	CGG	2	6	207116	207121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450545
3996	NC_011083	TCG	2	6	207188	207193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
3997	NC_011083	GCTG	2	8	207206	207213	0 %	25 %	50 %	25 %	194450545
3998	NC_011083	CGG	2	6	207299	207304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450545
3999	NC_011083	TCG	2	6	207466	207471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
4000	NC_011083	CCT	2	6	207539	207544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450545

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