MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 89417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011083	GAG	2	6	156082	156087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194450713
3002	NC_011083	AGA	2	6	156138	156143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450713
3003	NC_011083	GGT	2	6	156144	156149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450713
3004	NC_011083	ATG	2	6	156160	156165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450713
3005	NC_011083	TGC	2	6	156188	156193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450713
3006	NC_011083	GGC	2	6	156225	156230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450713
3007	NC_011083	CGC	2	6	156321	156326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450713
3008	NC_011083	GCA	2	6	156450	156455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450713
3009	NC_011083	GCC	2	6	156478	156483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450713
3010	NC_011083	GCC	2	6	156499	156504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450713
3011	NC_011083	CCTTGC	2	12	156538	156549	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194450713
3012	NC_011083	A	6	6	156749	156754	100 %	0 %	0 %	0 %	194448034
3013	NC_011083	ACG	2	6	156789	156794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448034
3014	NC_011083	TTA	2	6	156801	156806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448034
3015	NC_011083	CGC	2	6	156814	156819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448034
3016	NC_011083	CGG	2	6	156853	156858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448034
3017	NC_011083	AAG	2	6	157035	157040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448034
3018	NC_011083	CCG	2	6	157091	157096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448034
3019	NC_011083	ATT	2	6	157109	157114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448034
3020	NC_011083	GTC	2	6	157481	157486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448599
3021	NC_011083	CGC	2	6	157501	157506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448599
3022	NC_011083	CGG	2	6	157528	157533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448599
3023	NC_011083	C	6	6	157597	157602	0 %	0 %	0 %	100 %	194448599
3024	NC_011083	GAC	2	6	157604	157609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448599
3025	NC_011083	ACG	2	6	157635	157640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448599
3026	NC_011083	GCA	2	6	157804	157809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448049
3027	NC_011083	CGT	2	6	157816	157821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448049
3028	NC_011083	GATCA	2	10	157883	157892	40 %	20 %	20 %	20 %	194448049
3029	NC_011083	TGT	2	6	157968	157973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448049
3030	NC_011083	GCC	2	6	158018	158023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448049
3031	NC_011083	GCT	2	6	158074	158079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448049
3032	NC_011083	CCG	2	6	158113	158118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448049
3033	NC_011083	CTG	2	6	158126	158131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448049
3034	NC_011083	GCT	2	6	158194	158199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448049
3035	NC_011083	CAG	2	6	158216	158221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448049
3036	NC_011083	A	6	6	158277	158282	100 %	0 %	0 %	0 %	194448049
3037	NC_011083	TCT	2	6	158365	158370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448049
3038	NC_011083	TTA	2	6	158501	158506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449907
3039	NC_011083	GC	3	6	158533	158538	0 %	0 %	50 %	50 %	194449907
3040	NC_011083	CG	3	6	158580	158585	0 %	0 %	50 %	50 %	194449907
3041	NC_011083	CAT	2	6	158589	158594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449907
3042	NC_011083	CGTCA	2	10	158629	158638	20 %	20 %	20 %	40 %	194449907
3043	NC_011083	ACC	2	6	158639	158644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449907
3044	NC_011083	CAG	2	6	158683	158688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449907
3045	NC_011083	CTG	2	6	158722	158727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449907
3046	NC_011083	CTG	2	6	158746	158751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449907
3047	NC_011083	TTC	2	6	158788	158793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449907
3048	NC_011083	A	6	6	158802	158807	100 %	0 %	0 %	0 %	194449907
3049	NC_011083	CGG	2	6	158844	158849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449907
3050	NC_011083	GGGC	2	8	158889	158896	0 %	0 %	75 %	25 %	194449907
3051	NC_011083	GC	3	6	158917	158922	0 %	0 %	50 %	50 %	194449907
3052	NC_011083	ATA	2	6	158924	158929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449907
3053	NC_011083	CCG	2	6	158999	159004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449907
3054	NC_011083	GAA	2	6	159262	159267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450562
3055	NC_011083	CTG	2	6	159470	159475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450562
3056	NC_011083	GAA	2	6	159496	159501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450562
3057	NC_011083	A	6	6	159584	159589	100 %	0 %	0 %	0 %	194450562
3058	NC_011083	TCG	2	6	159674	159679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450562
3059	NC_011083	ACG	2	6	159811	159816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450562
3060	NC_011083	CGG	2	6	159851	159856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450562
3061	NC_011083	GGC	2	6	159910	159915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450562
3062	NC_011083	GGC	3	9	159949	159957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450562
3063	NC_011083	GGC	2	6	159976	159981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450562
3064	NC_011083	AG	3	6	159999	160004	50 %	0 %	50 %	0 %	194450562
3065	NC_011083	CGG	2	6	160005	160010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450562
3066	NC_011083	AGA	2	6	160020	160025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450562
3067	NC_011083	CGG	2	6	160089	160094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450562
3068	NC_011083	CG	3	6	160108	160113	0 %	0 %	50 %	50 %	194450562
3069	NC_011083	CAC	2	6	160242	160247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450562
3070	NC_011083	ATCCC	2	10	160329	160338	20 %	20 %	0 %	60 %	194450042
3071	NC_011083	TGA	2	6	160410	160415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450042
3072	NC_011083	GCCAGC	2	12	160454	160465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194450042
3073	NC_011083	GCA	2	6	160497	160502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450042
3074	NC_011083	T	6	6	160574	160579	0 %	100 %	0 %	0 %	194450042
3075	NC_011083	GAA	2	6	160686	160691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450042
3076	NC_011083	AGA	2	6	160787	160792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450042
3077	NC_011083	CGCTGC	2	12	160793	160804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194450042
3078	NC_011083	AAT	2	6	160909	160914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450042
3079	NC_011083	AGA	2	6	160925	160930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450042
3080	NC_011083	GGC	2	6	160960	160965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450042
3081	NC_011083	GCA	2	6	160986	160991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450042
3082	NC_011083	GGC	2	6	161008	161013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450042
3083	NC_011083	AAT	2	6	161023	161028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450042
3084	NC_011083	AGCGC	2	10	161037	161046	20 %	0 %	40 %	40 %	194450042
3085	NC_011083	AGC	2	6	161103	161108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450042
3086	NC_011083	ATC	2	6	161144	161149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450042
3087	NC_011083	GCG	2	6	161160	161165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450042
3088	NC_011083	ATGA	2	8	161314	161321	50 %	25 %	25 %	0 %	194450042
3089	NC_011083	TGA	2	6	161333	161338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450042
3090	NC_011083	CTT	2	6	161358	161363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450042
3091	NC_011083	GCG	2	6	161372	161377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450042
3092	NC_011083	TGA	2	6	161430	161435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450042
3093	NC_011083	TGCC	2	8	161759	161766	0 %	25 %	25 %	50 %	194451855
3094	NC_011083	GC	3	6	161776	161781	0 %	0 %	50 %	50 %	194451855
3095	NC_011083	CAC	2	6	161804	161809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451855
3096	NC_011083	CTA	2	6	161866	161871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451855
3097	NC_011083	ATC	2	6	161892	161897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451855
3098	NC_011083	TGC	2	6	161916	161921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451855
3099	NC_011083	TGG	2	6	161941	161946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451855
3100	NC_011083	GCC	2	6	161988	161993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451855
3101	NC_011083	ATG	3	9	162039	162047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451855
3102	NC_011083	GC	4	8	162067	162074	0 %	0 %	50 %	50 %	194451855
3103	NC_011083	GGAT	2	8	162105	162112	25 %	25 %	50 %	0 %	194451855
3104	NC_011083	GC	3	6	162199	162204	0 %	0 %	50 %	50 %	194451855
3105	NC_011083	CAA	2	6	162350	162355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451855
3106	NC_011083	GAC	2	6	162362	162367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451855
3107	NC_011083	CTT	2	6	162376	162381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451855
3108	NC_011083	CGCC	2	8	162418	162425	0 %	0 %	25 %	75 %	194451855
3109	NC_011083	GAA	2	6	162547	162552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451855
3110	NC_011083	GAT	2	6	162718	162723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451855
3111	NC_011083	CA	3	6	162747	162752	50 %	0 %	0 %	50 %	194451855
3112	NC_011083	ACC	2	6	162816	162821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451855
3113	NC_011083	TGA	2	6	162864	162869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451855
3114	NC_011083	TGAGC	2	10	162886	162895	20 %	20 %	40 %	20 %	194451855
3115	NC_011083	TGT	2	6	162951	162956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448638
3116	NC_011083	GGCG	2	8	163022	163029	0 %	0 %	75 %	25 %	194448638
3117	NC_011083	ATG	2	6	163032	163037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448638
3118	NC_011083	TGA	2	6	163075	163080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448638
3119	NC_011083	TGA	2	6	163117	163122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448638
3120	NC_011083	CGCAT	2	10	163148	163157	20 %	20 %	20 %	40 %	194448638
3121	NC_011083	CCA	2	6	163167	163172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448638
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3126	NC_011083	GC	3	6	163620	163625	0 %	0 %	50 %	50 %	194447977
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3142	NC_011083	TGG	2	6	164645	164650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447333
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3243	NC_011083	CCG	2	6	169821	169826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449960
3244	NC_011083	CGC	2	6	169872	169877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449960
3245	NC_011083	GCT	2	6	169923	169928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449960
3246	NC_011083	TGC	2	6	169934	169939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449960
3247	NC_011083	CCAA	2	8	170536	170543	50 %	0 %	0 %	50 %	194450870
3248	NC_011083	AGC	3	9	170562	170570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450870
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3250	NC_011083	CGAAG	2	10	170689	170698	40 %	0 %	40 %	20 %	194450870
3251	NC_011083	TTG	2	6	170702	170707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450870
3252	NC_011083	TCG	2	6	170710	170715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450870
3253	NC_011083	GCG	2	6	170721	170726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450870
3254	NC_011083	AGC	2	6	170741	170746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450870
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3262	NC_011083	CGT	2	6	171236	171241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450870
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3275	NC_011083	GGC	2	6	171839	171844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451280
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3349	NC_011083	GCG	3	9	174997	175005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447496
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3351	NC_011083	CTG	2	6	175034	175039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447496
3352	NC_011083	ACG	2	6	175082	175087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447496
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3354	NC_011083	CG	3	6	175225	175230	0 %	0 %	50 %	50 %	194447496
3355	NC_011083	GCT	2	6	175243	175248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447496
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3357	NC_011083	TGC	2	6	175271	175276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447496
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3359	NC_011083	TGA	2	6	175376	175381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447496
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3482	NC_011083	GAGC	2	8	180167	180174	25 %	0 %	50 %	25 %	194449777
3483	NC_011083	CATC	2	8	180194	180201	25 %	25 %	0 %	50 %	194449777
3484	NC_011083	TGGC	2	8	180322	180329	0 %	25 %	50 %	25 %	194449777
3485	NC_011083	CG	3	6	180371	180376	0 %	0 %	50 %	50 %	194449777
3486	NC_011083	GCC	2	6	180556	180561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449777
3487	NC_011083	CA	3	6	180631	180636	50 %	0 %	0 %	50 %	194449777
3488	NC_011083	TCG	2	6	181055	181060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3489	NC_011083	AGA	2	6	181065	181070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450891
3490	NC_011083	TGC	2	6	181095	181100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3491	NC_011083	GCT	2	6	181155	181160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3492	NC_011083	GAA	3	9	181180	181188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450891
3493	NC_011083	TCC	2	6	181218	181223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450891
3494	NC_011083	GCT	2	6	181264	181269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3495	NC_011083	ACC	2	6	181285	181290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450891
3496	NC_011083	CTG	2	6	181324	181329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3497	NC_011083	ACA	2	6	181349	181354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450891
3498	NC_011083	TGAT	2	8	181364	181371	25 %	50 %	25 %	0 %	194450891
3499	NC_011083	TGC	2	6	181401	181406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891
3500	NC_011083	CTG	2	6	181426	181431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450891

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