MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 89417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011083	TTA	2	6	130686	130691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447976
2502	NC_011083	TGA	2	6	131005	131010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448104
2503	NC_011083	TGT	2	6	131041	131046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448104
2504	NC_011083	GTC	2	6	131061	131066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448104
2505	NC_011083	ATG	2	6	131134	131139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448104
2506	NC_011083	GATC	2	8	131159	131166	25 %	25 %	25 %	25 %	194448104
2507	NC_011083	GTG	2	6	131241	131246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2508	NC_011083	ATTCC	2	10	131308	131317	20 %	40 %	0 %	40 %	194448104
2509	NC_011083	ATTG	2	8	131351	131358	25 %	50 %	25 %	0 %	194448104
2510	NC_011083	ATG	2	6	131362	131367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448104
2511	NC_011083	TGG	2	6	131386	131391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2512	NC_011083	GGT	2	6	131405	131410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2513	NC_011083	CTGG	2	8	131471	131478	0 %	25 %	50 %	25 %	194448104
2514	NC_011083	GGT	2	6	131501	131506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2515	NC_011083	A	7	7	131541	131547	100 %	0 %	0 %	0 %	194448104
2516	NC_011083	A	6	6	131651	131656	100 %	0 %	0 %	0 %	194448104
2517	NC_011083	GGT	2	6	131660	131665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2518	NC_011083	CAT	2	6	131717	131722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448104
2519	NC_011083	GGT	2	6	131741	131746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2520	NC_011083	GAC	2	6	131883	131888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448104
2521	NC_011083	ACG	2	6	131892	131897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448104
2522	NC_011083	AAT	2	6	131898	131903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448104
2523	NC_011083	GGT	2	6	131990	131995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2524	NC_011083	GAT	2	6	132066	132071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448104
2525	NC_011083	TGG	2	6	132081	132086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2526	NC_011083	CAG	2	6	132087	132092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448104
2527	NC_011083	AG	3	6	132095	132100	50 %	0 %	50 %	0 %	194448104
2528	NC_011083	GC	3	6	132104	132109	0 %	0 %	50 %	50 %	194448104
2529	NC_011083	GAAAGC	2	12	132135	132146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194448104
2530	NC_011083	ACA	2	6	132221	132226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448104
2531	NC_011083	GCC	2	6	132237	132242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448104
2532	NC_011083	CGG	2	6	132284	132289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448104
2533	NC_011083	GAAA	2	8	132347	132354	75 %	0 %	25 %	0 %	194448104
2534	NC_011083	TGG	2	6	132355	132360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448104
2535	NC_011083	AAC	2	6	132453	132458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448104
2536	NC_011083	TAA	2	6	132641	132646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448104
2537	NC_011083	TCG	2	6	132658	132663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448104
2538	NC_011083	TGA	2	6	132756	132761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448104
2539	NC_011083	ATA	2	6	132843	132848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451253
2540	NC_011083	TGC	2	6	132969	132974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451253
2541	NC_011083	ACGG	2	8	133047	133054	25 %	0 %	50 %	25 %	194451253
2542	NC_011083	ATT	2	6	133094	133099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451253
2543	NC_011083	TTG	2	6	133191	133196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451253
2544	NC_011083	CGT	2	6	133213	133218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451253
2545	NC_011083	CG	3	6	133227	133232	0 %	0 %	50 %	50 %	194451253
2546	NC_011083	GAC	2	6	133268	133273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449113
2547	NC_011083	GCGT	2	8	133276	133283	0 %	25 %	50 %	25 %	194449113
2548	NC_011083	CAGG	2	8	133338	133345	25 %	0 %	50 %	25 %	194449113
2549	NC_011083	AAAGC	2	10	133605	133614	60 %	0 %	20 %	20 %	194448255
2550	NC_011083	CTG	2	6	133815	133820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448255
2551	NC_011083	CCG	2	6	133917	133922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448255
2552	NC_011083	TCG	2	6	133966	133971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448255
2553	NC_011083	CG	3	6	133980	133985	0 %	0 %	50 %	50 %	194448255
2554	NC_011083	GAT	2	6	134028	134033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448255
2555	NC_011083	CGG	2	6	134068	134073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448255
2556	NC_011083	GC	3	6	134092	134097	0 %	0 %	50 %	50 %	194448255
2557	NC_011083	CCGCA	2	10	134138	134147	20 %	0 %	20 %	60 %	194448255
2558	NC_011083	GCC	2	6	134205	134210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448255
2559	NC_011083	GTT	2	6	134216	134221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448255
2560	NC_011083	GCG	2	6	134309	134314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448255
2561	NC_011083	GCT	2	6	134366	134371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448255
2562	NC_011083	TGA	2	6	134459	134464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448255
2563	NC_011083	TCG	2	6	134513	134518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448255
2564	NC_011083	G	6	6	135153	135158	0 %	0 %	100 %	0 %	194450621
2565	NC_011083	CATC	2	8	135262	135269	25 %	25 %	0 %	50 %	194450621
2566	NC_011083	CTG	2	6	135278	135283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450621
2567	NC_011083	CCTG	2	8	135292	135299	0 %	25 %	25 %	50 %	194450621
2568	NC_011083	ATT	2	6	135308	135313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450621
2569	NC_011083	GATG	2	8	135400	135407	25 %	25 %	50 %	0 %	194450621
2570	NC_011083	AAG	2	6	135462	135467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450621
2571	NC_011083	CAA	2	6	135487	135492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450621
2572	NC_011083	GAT	2	6	135605	135610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449989
2573	NC_011083	AC	3	6	135623	135628	50 %	0 %	0 %	50 %	194449989
2574	NC_011083	CGG	2	6	135707	135712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449989
2575	NC_011083	CGAT	2	8	135763	135770	25 %	25 %	25 %	25 %	194449989
2576	NC_011083	CAT	2	6	135824	135829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449989
2577	NC_011083	GCTG	2	8	135848	135855	0 %	25 %	50 %	25 %	194449989
2578	NC_011083	TCT	2	6	135918	135923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449989
2579	NC_011083	CG	3	6	135997	136002	0 %	0 %	50 %	50 %	194449989
2580	NC_011083	GCC	2	6	136011	136016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449989
2581	NC_011083	CGG	2	6	136030	136035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449989
2582	NC_011083	GAG	2	6	136074	136079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449989
2583	NC_011083	TTG	2	6	136108	136113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449989
2584	NC_011083	GCG	3	9	136167	136175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449989
2585	NC_011083	GGA	2	6	136253	136258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449989
2586	NC_011083	GCTC	2	8	136279	136286	0 %	25 %	25 %	50 %	194449989
2587	NC_011083	GGCG	2	8	136302	136309	0 %	0 %	75 %	25 %	194449989
2588	NC_011083	ATC	2	6	136317	136322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449989
2589	NC_011083	CGG	2	6	136393	136398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449989
2590	NC_011083	A	6	6	136425	136430	100 %	0 %	0 %	0 %	194449989
2591	NC_011083	AGTTC	2	10	136509	136518	20 %	40 %	20 %	20 %	194449989
2592	NC_011083	AG	3	6	136529	136534	50 %	0 %	50 %	0 %	194449989
2593	NC_011083	CAG	2	6	136549	136554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448775
2594	NC_011083	TGCCT	2	10	136609	136618	0 %	40 %	20 %	40 %	194448775
2595	NC_011083	CAT	2	6	136678	136683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448775
2596	NC_011083	CGG	2	6	136689	136694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448775
2597	NC_011083	GGT	2	6	136699	136704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448775
2598	NC_011083	ACG	2	6	136706	136711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448775
2599	NC_011083	GAA	2	6	136802	136807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448775
2600	NC_011083	GCA	2	6	136864	136869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448775
2601	NC_011083	AGC	2	6	136930	136935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450364
2602	NC_011083	GAA	2	6	136964	136969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450364
2603	NC_011083	TCA	2	6	136980	136985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450364
2604	NC_011083	T	7	7	137031	137037	0 %	100 %	0 %	0 %	194450364
2605	NC_011083	CG	3	6	137045	137050	0 %	0 %	50 %	50 %	194450364
2606	NC_011083	ACCG	2	8	137147	137154	25 %	0 %	25 %	50 %	194450364
2607	NC_011083	AAG	2	6	137211	137216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450364
2608	NC_011083	CGG	2	6	137227	137232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450364
2609	NC_011083	TTTA	2	8	137330	137337	25 %	75 %	0 %	0 %	194450364
2610	NC_011083	GC	3	6	137342	137347	0 %	0 %	50 %	50 %	194450364
2611	NC_011083	A	6	6	137378	137383	100 %	0 %	0 %	0 %	194450364
2612	NC_011083	GAA	2	6	137411	137416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450364
2613	NC_011083	CGC	2	6	137420	137425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450364
2614	NC_011083	TAC	2	6	137426	137431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450364
2615	NC_011083	GCGA	2	8	137538	137545	25 %	0 %	50 %	25 %	194450364
2616	NC_011083	TCC	2	6	137588	137593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450364
2617	NC_011083	TGA	2	6	137632	137637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450364
2618	NC_011083	AAC	2	6	137669	137674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450364
2619	NC_011083	TGGCGA	2	12	137742	137753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194450364
2620	NC_011083	CAA	2	6	137773	137778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450364
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2622	NC_011083	TGA	2	6	137865	137870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450364
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2747	NC_011083	GGC	2	6	143007	143012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448105
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2762	NC_011083	CG	3	6	143797	143802	0 %	0 %	50 %	50 %	194448105
2763	NC_011083	TGC	2	6	143821	143826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448105
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2985	NC_011083	CTAT	2	8	155096	155103	25 %	50 %	0 %	25 %	194450713
2986	NC_011083	CGT	2	6	155115	155120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450713
2987	NC_011083	GAT	2	6	155139	155144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450713
2988	NC_011083	A	6	6	155186	155191	100 %	0 %	0 %	0 %	194450713
2989	NC_011083	AG	3	6	155287	155292	50 %	0 %	50 %	0 %	194450713
2990	NC_011083	GCG	2	6	155380	155385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450713
2991	NC_011083	CGC	2	6	155457	155462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450713
2992	NC_011083	GAA	2	6	155479	155484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194450713
2993	NC_011083	CGG	2	6	155541	155546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450713
2994	NC_011083	CCG	2	6	155580	155585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450713
2995	NC_011083	TTC	2	6	155634	155639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450713
2996	NC_011083	ATG	2	6	155704	155709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450713
2997	NC_011083	CTG	2	6	155821	155826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450713
2998	NC_011083	ATG	3	9	155831	155839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450713
2999	NC_011083	CTG	2	6	155884	155889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450713
3000	NC_011083	CCG	2	6	155965	155970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450713

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