MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 89417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011083	CGA	2	6	78134	78139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1502	NC_011083	CATCCT	2	12	78152	78163	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194450926
1503	NC_011083	CGG	2	6	78296	78301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450926
1504	NC_011083	TCG	2	6	78319	78324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1505	NC_011083	AAT	2	6	78399	78404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450926
1506	NC_011083	AGG	2	6	78431	78436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194450926
1507	NC_011083	CAG	2	6	78438	78443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1508	NC_011083	TGC	2	6	78523	78528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1509	NC_011083	GCG	2	6	78541	78546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450926
1510	NC_011083	ATC	3	9	78568	78576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450926
1511	NC_011083	AGC	2	6	78649	78654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1512	NC_011083	TGC	2	6	78662	78667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1513	NC_011083	CGG	2	6	78668	78673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450926
1514	NC_011083	GCG	2	6	78688	78693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450926
1515	NC_011083	TCA	2	6	78742	78747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450926
1516	NC_011083	AGT	2	6	78773	78778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450926
1517	NC_011083	ACC	2	6	78811	78816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450926
1518	NC_011083	GGT	2	6	78831	78836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450926
1519	NC_011083	CCG	2	6	78857	78862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450926
1520	NC_011083	CGT	2	6	78941	78946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1521	NC_011083	GCT	2	6	78956	78961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1522	NC_011083	CAGA	2	8	78969	78976	50 %	0 %	25 %	25 %	194450926
1523	NC_011083	CAG	2	6	79047	79052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1524	NC_011083	TTC	2	6	79086	79091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450926
1525	NC_011083	A	6	6	79223	79228	100 %	0 %	0 %	0 %	194450926
1526	NC_011083	GTC	2	6	79341	79346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450926
1527	NC_011083	GGC	2	6	79526	79531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450506
1528	NC_011083	GTT	2	6	79577	79582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450506
1529	NC_011083	ATG	2	6	79596	79601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450506
1530	NC_011083	TTCAG	2	10	79719	79728	20 %	40 %	20 %	20 %	194450506
1531	NC_011083	GT	4	8	79755	79762	0 %	50 %	50 %	0 %	194450506
1532	NC_011083	GCCA	2	8	79764	79771	25 %	0 %	25 %	50 %	194450506
1533	NC_011083	CGA	2	6	79789	79794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450506
1534	NC_011083	GATG	2	8	79819	79826	25 %	25 %	50 %	0 %	194450506
1535	NC_011083	TG	3	6	79830	79835	0 %	50 %	50 %	0 %	194450506
1536	NC_011083	GGCCA	2	10	79868	79877	20 %	0 %	40 %	40 %	194450506
1537	NC_011083	GTA	2	6	79967	79972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450506
1538	NC_011083	CGC	2	6	80008	80013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450506
1539	NC_011083	AGT	2	6	80020	80025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450506
1540	NC_011083	CAT	2	6	80027	80032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450506
1541	NC_011083	GCA	2	6	80050	80055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450506
1542	NC_011083	GCC	2	6	80118	80123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450506
1543	NC_011083	GTC	2	6	80133	80138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450506
1544	NC_011083	CGG	2	6	80161	80166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450506
1545	NC_011083	CTC	2	6	80267	80272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450506
1546	NC_011083	TCA	2	6	80340	80345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450506
1547	NC_011083	CGG	2	6	80355	80360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450506
1548	NC_011083	GCG	2	6	80474	80479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450506
1549	NC_011083	A	6	6	80608	80613	100 %	0 %	0 %	0 %	194450506
1550	NC_011083	TCA	2	6	80662	80667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450506
1551	NC_011083	T	6	6	80682	80687	0 %	100 %	0 %	0 %	194450506
1552	NC_011083	ACC	2	6	80834	80839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450855
1553	NC_011083	GGT	2	6	80884	80889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450855
1554	NC_011083	CAG	2	6	81026	81031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450855
1555	NC_011083	CGA	2	6	81187	81192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450855
1556	NC_011083	CTT	2	6	81214	81219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450855
1557	NC_011083	CCGA	2	8	81245	81252	25 %	0 %	25 %	50 %	194450855
1558	NC_011083	CGT	2	6	81277	81282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450855
1559	NC_011083	CAG	2	6	81297	81302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450855
1560	NC_011083	TTG	2	6	81333	81338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450855
1561	NC_011083	CAA	2	6	81364	81369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450855
1562	NC_011083	TC	3	6	81408	81413	0 %	50 %	0 %	50 %	194450855
1563	NC_011083	CCT	2	6	81642	81647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450855
1564	NC_011083	ACA	2	6	81658	81663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450855
1565	NC_011083	GC	3	6	81673	81678	0 %	0 %	50 %	50 %	194450855
1566	NC_011083	TCCA	2	8	81693	81700	25 %	25 %	0 %	50 %	194450855
1567	NC_011083	CGG	2	6	81703	81708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450855
1568	NC_011083	CCG	2	6	81735	81740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450855
1569	NC_011083	TCC	2	6	81744	81749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450855
1570	NC_011083	CAG	2	6	81755	81760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450855
1571	NC_011083	TAA	2	6	81986	81991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451766
1572	NC_011083	GAA	2	6	82017	82022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451766
1573	NC_011083	TCC	2	6	82032	82037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194451766
1574	NC_011083	ACCC	2	8	82067	82074	25 %	0 %	0 %	75 %	194451766
1575	NC_011083	CAG	2	6	82080	82085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451766
1576	NC_011083	GAT	2	6	82095	82100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451766
1577	NC_011083	GGC	2	6	82138	82143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451766
1578	NC_011083	GAA	2	6	82236	82241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451766
1579	NC_011083	TGG	2	6	82250	82255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451766
1580	NC_011083	GGC	2	6	82272	82277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451766
1581	NC_011083	GC	4	8	82294	82301	0 %	0 %	50 %	50 %	194451766
1582	NC_011083	CAG	3	9	82353	82361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451766
1583	NC_011083	TGC	2	6	82367	82372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451766
1584	NC_011083	GTACG	2	10	82439	82448	20 %	20 %	40 %	20 %	194451766
1585	NC_011083	CAC	2	6	82501	82506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451766
1586	NC_011083	GCC	2	6	82539	82544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451766
1587	NC_011083	AGT	2	6	82616	82621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451766
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1589	NC_011083	CAG	2	6	82756	82761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451766
1590	NC_011083	ATG	3	9	82765	82773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451766
1591	NC_011083	CCA	2	6	82877	82882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451766
1592	NC_011083	CGA	2	6	82895	82900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451766
1593	NC_011083	AAC	2	6	82909	82914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451766
1594	NC_011083	CGA	2	6	82934	82939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451766
1595	NC_011083	CATC	2	8	82970	82977	25 %	25 %	0 %	50 %	194451766
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1597	NC_011083	CGG	2	6	83112	83117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451766
1598	NC_011083	TAG	3	9	83128	83136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451766
1599	NC_011083	CAGAA	2	10	83152	83161	60 %	0 %	20 %	20 %	194451766
1600	NC_011083	AGG	2	6	83177	83182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194451766
1601	NC_011083	CAT	2	6	83187	83192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451766
1602	NC_011083	CCAG	2	8	83264	83271	25 %	0 %	25 %	50 %	194451766
1603	NC_011083	TAA	2	6	83351	83356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451766
1604	NC_011083	ATT	2	6	83410	83415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451766
1605	NC_011083	A	8	8	83424	83431	100 %	0 %	0 %	0 %	194451766
1606	NC_011083	T	6	6	83451	83456	0 %	100 %	0 %	0 %	194451766
1607	NC_011083	T	6	6	83637	83642	0 %	100 %	0 %	0 %	194447638
1608	NC_011083	ATT	2	6	83649	83654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447638
1609	NC_011083	TTTA	2	8	83679	83686	25 %	75 %	0 %	0 %	194447638
1610	NC_011083	ATTG	2	8	83690	83697	25 %	50 %	25 %	0 %	194447638
1611	NC_011083	T	6	6	83705	83710	0 %	100 %	0 %	0 %	194447638
1612	NC_011083	T	6	6	83714	83719	0 %	100 %	0 %	0 %	194447638
1613	NC_011083	TTG	2	6	83739	83744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448402
1614	NC_011083	TTTC	2	8	83784	83791	0 %	75 %	0 %	25 %	194448402
1615	NC_011083	TG	3	6	83837	83842	0 %	50 %	50 %	0 %	194448402
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1621	NC_011083	CT	3	6	84180	84185	0 %	50 %	0 %	50 %	194448940
1622	NC_011083	TGA	2	6	84194	84199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448940
1623	NC_011083	AC	3	6	84245	84250	50 %	0 %	0 %	50 %	194448940
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1625	NC_011083	TTC	2	6	84314	84319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448940
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1996	NC_011083	CTGC	2	8	105219	105226	0 %	25 %	25 %	50 %	194448284
1997	NC_011083	ACA	2	6	105291	105296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448284
1998	NC_011083	ACC	2	6	105314	105319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448284
1999	NC_011083	CCAG	2	8	105348	105355	25 %	0 %	25 %	50 %	194448284
2000	NC_011083	GCG	2	6	105363	105368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448284

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