MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 89417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011083	TCTAAC	2	12	53928	53939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449983
1002	NC_011083	GAA	2	6	53968	53973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449983
1003	NC_011083	CGA	2	6	53987	53992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449983
1004	NC_011083	GCG	2	6	53994	53999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449983
1005	NC_011083	AGG	2	6	54007	54012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449983
1006	NC_011083	GCC	2	6	54027	54032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449983
1007	NC_011083	CTG	2	6	54046	54051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449983
1008	NC_011083	GGC	3	9	54108	54116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449983
1009	NC_011083	GAA	2	6	54141	54146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449983
1010	NC_011083	AAAAT	2	10	54409	54418	80 %	20 %	0 %	0 %	194451956
1011	NC_011083	TGGA	2	8	54451	54458	25 %	25 %	50 %	0 %	194451956
1012	NC_011083	CAA	2	6	54461	54466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451956
1013	NC_011083	CCTG	2	8	54487	54494	0 %	25 %	25 %	50 %	194451956
1014	NC_011083	CT	3	6	54561	54566	0 %	50 %	0 %	50 %	194451956
1015	NC_011083	GAA	2	6	54655	54660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451956
1016	NC_011083	CAG	2	6	54702	54707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451956
1017	NC_011083	A	6	6	54739	54744	100 %	0 %	0 %	0 %	194451956
1018	NC_011083	CACGAA	2	12	54807	54818	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	194451956
1019	NC_011083	GATT	2	8	54849	54856	25 %	50 %	25 %	0 %	194451956
1020	NC_011083	G	6	6	54965	54970	0 %	0 %	100 %	0 %	194451956
1021	NC_011083	GCG	2	6	55157	55162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451956
1022	NC_011083	TGC	2	6	55165	55170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451956
1023	NC_011083	GGAAA	2	10	55196	55205	60 %	0 %	40 %	0 %	194451956
1024	NC_011083	GATC	2	8	55218	55225	25 %	25 %	25 %	25 %	194451956
1025	NC_011083	TAT	2	6	55308	55313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451956
1026	NC_011083	CGC	2	6	55346	55351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451956
1027	NC_011083	ATT	2	6	55639	55644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451485
1028	NC_011083	TGA	2	6	55665	55670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451485
1029	NC_011083	CGCTG	2	10	55686	55695	0 %	20 %	40 %	40 %	194451485
1030	NC_011083	C	6	6	55700	55705	0 %	0 %	0 %	100 %	194451485
1031	NC_011083	TAA	2	6	55721	55726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451485
1032	NC_011083	A	6	6	55754	55759	100 %	0 %	0 %	0 %	194451485
1033	NC_011083	CGC	2	6	55829	55834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451485
1034	NC_011083	TGC	2	6	55835	55840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451485
1035	NC_011083	TGA	2	6	55958	55963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451485
1036	NC_011083	TG	3	6	56180	56185	0 %	50 %	50 %	0 %	194451485
1037	NC_011083	CTGC	2	8	56236	56243	0 %	25 %	25 %	50 %	194451485
1038	NC_011083	GTA	2	6	56297	56302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451485
1039	NC_011083	CTGG	2	8	56343	56350	0 %	25 %	50 %	25 %	194451485
1040	NC_011083	CCG	2	6	56414	56419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451485
1041	NC_011083	GGT	2	6	56427	56432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451485
1042	NC_011083	TGGCGC	2	12	56474	56485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194451485
1043	NC_011083	GTGG	2	8	56508	56515	0 %	25 %	75 %	0 %	194451485
1044	NC_011083	TC	3	6	56584	56589	0 %	50 %	0 %	50 %	194448313
1045	NC_011083	CTG	2	6	56678	56683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448313
1046	NC_011083	CTG	2	6	56706	56711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448313
1047	NC_011083	CTGC	2	8	56718	56725	0 %	25 %	25 %	50 %	194448313
1048	NC_011083	TCA	2	6	56765	56770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448313
1049	NC_011083	TGC	2	6	56906	56911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448313
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1051	NC_011083	AAT	2	6	57007	57012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448313
1052	NC_011083	AATC	2	8	57051	57058	50 %	25 %	0 %	25 %	194448313
1053	NC_011083	A	6	6	57074	57079	100 %	0 %	0 %	0 %	194448313
1054	NC_011083	CTT	2	6	57121	57126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448313
1055	NC_011083	CGA	2	6	57153	57158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448313
1056	NC_011083	CCA	2	6	57189	57194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448313
1057	NC_011083	TTC	2	6	57254	57259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448113
1058	NC_011083	ATT	2	6	57302	57307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448113
1059	NC_011083	CGA	2	6	57313	57318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448113
1060	NC_011083	ACCA	2	8	57354	57361	50 %	0 %	0 %	50 %	194448113
1061	NC_011083	GTT	2	6	57383	57388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448113
1062	NC_011083	GTGG	2	8	57389	57396	0 %	25 %	75 %	0 %	194448113
1063	NC_011083	AAT	2	6	57464	57469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448113
1064	NC_011083	CAA	2	6	57565	57570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448113
1065	NC_011083	CATT	2	8	57579	57586	25 %	50 %	0 %	25 %	194448113
1066	NC_011083	CAA	2	6	57613	57618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448113
1067	NC_011083	ATA	2	6	57665	57670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448113
1068	NC_011083	GGT	3	9	57694	57702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448113
1069	NC_011083	TGG	2	6	57738	57743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448113
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1071	NC_011083	CAGCGC	2	12	57764	57775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194448113
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1074	NC_011083	TGC	2	6	57837	57842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448113
1075	NC_011083	GC	3	6	57846	57851	0 %	0 %	50 %	50 %	194448113
1076	NC_011083	TTG	2	6	57912	57917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448113
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1078	NC_011083	AAT	2	6	57953	57958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448113
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1080	NC_011083	T	7	7	58020	58026	0 %	100 %	0 %	0 %	194448113
1081	NC_011083	GCG	2	6	58027	58032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448113
1082	NC_011083	A	8	8	58039	58046	100 %	0 %	0 %	0 %	194448113
1083	NC_011083	TGG	2	6	58065	58070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448113
1084	NC_011083	GCG	2	6	58118	58123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448113
1085	NC_011083	ACA	2	6	58195	58200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448113
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1087	NC_011083	GCG	2	6	58277	58282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448113
1088	NC_011083	ACA	2	6	58291	58296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448113
1089	NC_011083	CAG	3	9	58301	58309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448113
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1091	NC_011083	CGC	2	6	58510	58515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448113
1092	NC_011083	AT	3	6	58521	58526	50 %	50 %	0 %	0 %	194448113
1093	NC_011083	TCAA	2	8	58620	58627	50 %	25 %	0 %	25 %	194448113
1094	NC_011083	TGG	2	6	58786	58791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448113
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1098	NC_011083	CCG	2	6	59169	59174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448149
1099	NC_011083	CAG	2	6	59215	59220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448149
1100	NC_011083	GCC	2	6	59240	59245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448149
1101	NC_011083	ACC	2	6	59264	59269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448149
1102	NC_011083	CAG	3	9	59272	59280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448149
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1104	NC_011083	CCA	2	6	59400	59405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448149
1105	NC_011083	CGC	2	6	59406	59411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448149
1106	NC_011083	CAG	2	6	59446	59451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448149
1107	NC_011083	CGGCG	2	10	59452	59461	0 %	0 %	60 %	40 %	194448149
1108	NC_011083	GCA	3	9	59466	59474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448149
1109	NC_011083	CCA	2	6	59478	59483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448149
1110	NC_011083	GTA	2	6	59484	59489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448149
1111	NC_011083	T	6	6	59511	59516	0 %	100 %	0 %	0 %	194448149
1112	NC_011083	CTCCGT	2	12	59560	59571	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194448149
1113	NC_011083	GC	4	8	59577	59584	0 %	0 %	50 %	50 %	194448149
1114	NC_011083	CGG	2	6	59590	59595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448149
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1120	NC_011083	TCAGCG	2	12	59766	59777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194448149
1121	NC_011083	GCC	2	6	59810	59815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448149
1122	NC_011083	AGC	2	6	59822	59827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448149
1123	NC_011083	CAG	2	6	59845	59850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448149
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1125	NC_011083	GCG	2	6	59895	59900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448149
1126	NC_011083	CAGCGC	2	12	60001	60012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194448149
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1128	NC_011083	CGT	2	6	60084	60089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448149
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1244	NC_011083	AG	3	6	65265	65270	50 %	0 %	50 %	0 %	194449626
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1248	NC_011083	CG	3	6	65344	65349	0 %	0 %	50 %	50 %	194449626
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1250	NC_011083	GGC	3	9	65406	65414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449626
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