MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 89417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011083	AGC	2	6	25311	25316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448112
502	NC_011083	CAT	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448112
503	NC_011083	GCT	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448112
504	NC_011083	GA	3	6	25523	25528	50 %	0 %	50 %	0 %	194448112
505	NC_011083	TGT	2	6	25721	25726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447857
506	NC_011083	TAC	2	6	25743	25748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447857
507	NC_011083	CGGTA	2	10	25761	25770	20 %	20 %	40 %	20 %	194447857
508	NC_011083	CGC	2	6	25794	25799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447857
509	NC_011083	CTGTT	2	10	25800	25809	0 %	60 %	20 %	20 %	194447857
510	NC_011083	TGG	2	6	25880	25885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447857
511	NC_011083	AGA	2	6	25896	25901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447857
512	NC_011083	CCAG	2	8	25937	25944	25 %	0 %	25 %	50 %	194447857
513	NC_011083	GCG	2	6	25948	25953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447857
514	NC_011083	CGA	2	6	26024	26029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447857
515	NC_011083	A	8	8	26315	26322	100 %	0 %	0 %	0 %	448967568
516	NC_011083	ATT	2	6	26341	26346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
517	NC_011083	CTG	2	6	26351	26356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967568
518	NC_011083	CGG	2	6	26358	26363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967568
519	NC_011083	CCT	2	6	26445	26450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448967568
520	NC_011083	ATT	2	6	26456	26461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
521	NC_011083	TTC	2	6	26464	26469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967568
522	NC_011083	T	7	7	26481	26487	0 %	100 %	0 %	0 %	448967568
523	NC_011083	CGC	2	6	26544	26549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967568
524	NC_011083	CT	3	6	26550	26555	0 %	50 %	0 %	50 %	448967568
525	NC_011083	A	6	6	26570	26575	100 %	0 %	0 %	0 %	448967568
526	NC_011083	AT	3	6	26580	26585	50 %	50 %	0 %	0 %	448967568
527	NC_011083	TAT	2	6	26590	26595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
528	NC_011083	ACCG	2	8	26614	26621	25 %	0 %	25 %	50 %	448967568
529	NC_011083	TATTT	2	10	26634	26643	20 %	80 %	0 %	0 %	448967568
530	NC_011083	AAAT	2	8	26674	26681	75 %	25 %	0 %	0 %	448967568
531	NC_011083	TAC	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967568
532	NC_011083	A	6	6	26867	26872	100 %	0 %	0 %	0 %	448967568
533	NC_011083	CCG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967568
534	NC_011083	ACG	2	6	26966	26971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967568
535	NC_011083	ATG	2	6	26995	27000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967568
536	NC_011083	TCTG	2	8	27131	27138	0 %	50 %	25 %	25 %	194449449
537	NC_011083	GGC	2	6	27188	27193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
538	NC_011083	GAC	2	6	27269	27274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
539	NC_011083	GC	3	6	27283	27288	0 %	0 %	50 %	50 %	194449449
540	NC_011083	GCCT	2	8	27312	27319	0 %	25 %	25 %	50 %	194449449
541	NC_011083	TTG	2	6	27369	27374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449449
542	NC_011083	GGC	3	9	27380	27388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
543	NC_011083	GCC	2	6	27423	27428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449449
544	NC_011083	GCA	2	6	27449	27454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
545	NC_011083	GGC	2	6	27479	27484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
546	NC_011083	GGC	2	6	27597	27602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
547	NC_011083	ACT	2	6	27670	27675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449449
548	NC_011083	GCG	2	6	27694	27699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
549	NC_011083	AGCGAC	2	12	27708	27719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
550	NC_011083	GCA	2	6	27722	27727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
551	NC_011083	ATT	2	6	27806	27811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449449
552	NC_011083	CCTT	2	8	27818	27825	0 %	50 %	0 %	50 %	194449449
553	NC_011083	GAC	2	6	27849	27854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
554	NC_011083	CAT	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449449
555	NC_011083	GCC	2	6	27968	27973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449449
556	NC_011083	CCG	2	6	28006	28011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449449
557	NC_011083	GCG	2	6	28015	28020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
558	NC_011083	CCG	2	6	28081	28086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449449
559	NC_011083	GGC	2	6	28108	28113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
560	NC_011083	GCG	2	6	28122	28127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
561	NC_011083	TAG	2	6	28151	28156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449449
562	NC_011083	TCAG	2	8	28177	28184	25 %	25 %	25 %	25 %	194449449
563	NC_011083	GCG	2	6	28273	28278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
564	NC_011083	ATA	2	6	28342	28347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449449
565	NC_011083	GAT	2	6	28461	28466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449449
566	NC_011083	ATT	2	6	28543	28548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449449
567	NC_011083	TAT	2	6	28557	28562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449449
568	NC_011083	AGG	2	6	28566	28571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449449
569	NC_011083	ATCA	2	8	28590	28597	50 %	25 %	0 %	25 %	194449449
570	NC_011083	TTA	2	6	28624	28629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449449
571	NC_011083	TGA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449449
572	NC_011083	TTG	2	6	28674	28679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449449
573	NC_011083	ACA	2	6	28729	28734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449449
574	NC_011083	GAT	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449449
575	NC_011083	CTG	2	6	28917	28922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449449
576	NC_011083	ACA	2	6	28942	28947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449449
577	NC_011083	GCG	2	6	28984	28989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
578	NC_011083	CAG	2	6	29064	29069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
579	NC_011083	GCG	2	6	29086	29091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
580	NC_011083	TGG	2	6	29095	29100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449449
581	NC_011083	AGCC	2	8	29124	29131	25 %	0 %	25 %	50 %	194449449
582	NC_011083	CG	3	6	29213	29218	0 %	0 %	50 %	50 %	194449449
583	NC_011083	GGT	2	6	29228	29233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449449
584	NC_011083	CGA	2	6	29242	29247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
585	NC_011083	TGA	2	6	29291	29296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449449
586	NC_011083	TGA	2	6	29306	29311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449449
587	NC_011083	CCGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	25 %	50 %	194449449
588	NC_011083	GC	3	6	29341	29346	0 %	0 %	50 %	50 %	194449449
589	NC_011083	GC	3	6	29377	29382	0 %	0 %	50 %	50 %	194449449
590	NC_011083	ACGGTG	2	12	29433	29444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194449449
591	NC_011083	TTG	2	6	29467	29472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449449
592	NC_011083	GCGTC	2	10	29557	29566	0 %	20 %	40 %	40 %	194449449
593	NC_011083	ATC	2	6	29569	29574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449449
594	NC_011083	TC	3	6	29573	29578	0 %	50 %	0 %	50 %	194449449
595	NC_011083	TCC	2	6	29580	29585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194449449
596	NC_011083	ACA	2	6	29603	29608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449449
597	NC_011083	CTG	2	6	29649	29654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448823
598	NC_011083	GT	3	6	29691	29696	0 %	50 %	50 %	0 %	194448823
599	NC_011083	ATTA	2	8	29724	29731	50 %	50 %	0 %	0 %	194448823
600	NC_011083	A	6	6	29791	29796	100 %	0 %	0 %	0 %	194448823
601	NC_011083	GT	3	6	29820	29825	0 %	50 %	50 %	0 %	194448823
602	NC_011083	CGGCG	2	10	29831	29840	0 %	0 %	60 %	40 %	194448823
603	NC_011083	TTC	2	6	29960	29965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448823
604	NC_011083	GGCG	2	8	29966	29973	0 %	0 %	75 %	25 %	194448823
605	NC_011083	ATG	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448823
606	NC_011083	TCG	2	6	30091	30096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448823
607	NC_011083	CCG	2	6	30145	30150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448823
608	NC_011083	A	6	6	30318	30323	100 %	0 %	0 %	0 %	194448823
609	NC_011083	ATG	2	6	30484	30489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448823
610	NC_011083	CG	3	6	30528	30533	0 %	0 %	50 %	50 %	194448823
611	NC_011083	ACA	2	6	30564	30569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448823
612	NC_011083	GAC	2	6	30702	30707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450483
613	NC_011083	AAC	2	6	30830	30835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450483
614	NC_011083	ATG	2	6	31012	31017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450483
615	NC_011083	AAT	2	6	31038	31043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450483
616	NC_011083	GGT	2	6	31052	31057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450483
617	NC_011083	CGG	2	6	31144	31149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450483
618	NC_011083	ATGA	2	8	31171	31178	50 %	25 %	25 %	0 %	194450483
619	NC_011083	TGC	2	6	31225	31230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449817
620	NC_011083	GGC	2	6	31232	31237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449817
621	NC_011083	CT	3	6	31305	31310	0 %	50 %	0 %	50 %	194449817
622	NC_011083	GCA	2	6	31423	31428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449817
623	NC_011083	GCG	2	6	31435	31440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449817
624	NC_011083	GCG	2	6	31461	31466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449817
625	NC_011083	GGC	2	6	31650	31655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449817
626	NC_011083	AT	3	6	31732	31737	50 %	50 %	0 %	0 %	448967569
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628	NC_011083	GTG	2	6	31774	31779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967569
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