MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011081	A	7	7	1909	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	194447211
2	NC_011081	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	194447275
3	NC_011081	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	194447275
4	NC_011081	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	194447275
5	NC_011081	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	194447261
6	NC_011081	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	194447261
7	NC_011081	T	6	6	5673	5678	0 %	100 %	0 %	0 %	194447261
8	NC_011081	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
9	NC_011081	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
10	NC_011081	T	6	6	6265	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
11	NC_011081	T	6	6	6305	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	194447192
12	NC_011081	A	6	6	8505	8510	100 %	0 %	0 %	0 %	194447260
13	NC_011081	A	7	7	8958	8964	100 %	0 %	0 %	0 %	194447260
14	NC_011081	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	194447260
15	NC_011081	A	6	6	10467	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	194447200
16	NC_011081	A	6	6	10673	10678	100 %	0 %	0 %	0 %	194447264
17	NC_011081	T	6	6	12012	12017	0 %	100 %	0 %	0 %	194447223
18	NC_011081	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	194447262
19	NC_011081	T	6	6	14900	14905	0 %	100 %	0 %	0 %	194447298
20	NC_011081	T	8	8	14945	14952	0 %	100 %	0 %	0 %	194447298
21	NC_011081	A	6	6	15985	15990	100 %	0 %	0 %	0 %	194447206
22	NC_011081	T	6	6	16004	16009	0 %	100 %	0 %	0 %	194447206
23	NC_011081	G	6	6	16155	16160	0 %	0 %	100 %	0 %	194447206
24	NC_011081	G	6	6	16660	16665	0 %	0 %	100 %	0 %	194447254
25	NC_011081	A	8	8	19194	19201	100 %	0 %	0 %	0 %	194447181
26	NC_011081	A	6	6	21137	21142	100 %	0 %	0 %	0 %	194447224
27	NC_011081	T	6	6	22132	22137	0 %	100 %	0 %	0 %	194447243
28	NC_011081	A	6	6	22263	22268	100 %	0 %	0 %	0 %	194447204
29	NC_011081	A	6	6	23050	23055	100 %	0 %	0 %	0 %	194447245
30	NC_011081	G	6	6	23395	23400	0 %	0 %	100 %	0 %	194447245
31	NC_011081	A	6	6	24066	24071	100 %	0 %	0 %	0 %	194447177
32	NC_011081	T	6	6	26521	26526	0 %	100 %	0 %	0 %	194447256
33	NC_011081	A	7	7	26587	26593	100 %	0 %	0 %	0 %	194447256
34	NC_011081	A	6	6	28736	28741	100 %	0 %	0 %	0 %	194447180
35	NC_011081	T	6	6	31823	31828	0 %	100 %	0 %	0 %	194447290
36	NC_011081	T	6	6	34672	34677	0 %	100 %	0 %	0 %	194447231
37	NC_011081	A	7	7	35081	35087	100 %	0 %	0 %	0 %	194447203
38	NC_011081	A	6	6	36651	36656	100 %	0 %	0 %	0 %	194447282
39	NC_011081	T	7	7	37059	37065	0 %	100 %	0 %	0 %	194447240
40	NC_011081	T	6	6	38793	38798	0 %	100 %	0 %	0 %	194447202
41	NC_011081	A	6	6	39137	39142	100 %	0 %	0 %	0 %	194447197
42	NC_011081	A	7	7	40088	40094	100 %	0 %	0 %	0 %	194447209
43	NC_011081	A	7	7	40311	40317	100 %	0 %	0 %	0 %	194447209
44	NC_011081	A	6	6	40414	40419	100 %	0 %	0 %	0 %	194447209
45	NC_011081	A	8	8	42082	42089	100 %	0 %	0 %	0 %	194447209
46	NC_011081	T	7	7	42152	42158	0 %	100 %	0 %	0 %	194447258
47	NC_011081	T	6	6	43119	43124	0 %	100 %	0 %	0 %	194447258
48	NC_011081	C	6	6	43663	43668	0 %	0 %	0 %	100 %	194447258
49	NC_011081	T	6	6	43763	43768	0 %	100 %	0 %	0 %	194447258
50	NC_011081	T	6	6	44980	44985	0 %	100 %	0 %	0 %	194447208
51	NC_011081	T	6	6	48274	48279	0 %	100 %	0 %	0 %	194447212
52	NC_011081	T	6	6	49386	49391	0 %	100 %	0 %	0 %	194447288
53	NC_011081	A	7	7	49540	49546	100 %	0 %	0 %	0 %	194447288
54	NC_011081	T	6	6	49624	49629	0 %	100 %	0 %	0 %	194447288
55	NC_011081	A	6	6	50076	50081	100 %	0 %	0 %	0 %	194447277
56	NC_011081	T	6	6	51007	51012	0 %	100 %	0 %	0 %	194447277
57	NC_011081	T	6	6	52511	52516	0 %	100 %	0 %	0 %	194447228
58	NC_011081	T	6	6	52558	52563	0 %	100 %	0 %	0 %	194447228
59	NC_011081	T	6	6	54305	54310	0 %	100 %	0 %	0 %	194447267
60	NC_011081	T	6	6	57519	57524	0 %	100 %	0 %	0 %	194447222
61	NC_011081	T	6	6	57566	57571	0 %	100 %	0 %	0 %	194447222
62	NC_011081	T	6	6	58060	58065	0 %	100 %	0 %	0 %	194447222
63	NC_011081	C	6	6	58657	58662	0 %	0 %	0 %	100 %	194447186
64	NC_011081	T	6	6	58675	58680	0 %	100 %	0 %	0 %	194447186
65	NC_011081	T	7	7	59698	59704	0 %	100 %	0 %	0 %	194447271
66	NC_011081	T	6	6	59823	59828	0 %	100 %	0 %	0 %	194447271
67	NC_011081	T	6	6	59884	59889	0 %	100 %	0 %	0 %	194447271
68	NC_011081	T	7	7	63341	63347	0 %	100 %	0 %	0 %	194447246
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74	NC_011081	T	6	6	66103	66108	0 %	100 %	0 %	0 %	194447299
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84	NC_011081	T	6	6	73167	73172	0 %	100 %	0 %	0 %	194447234
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86	NC_011081	T	6	6	73789	73794	0 %	100 %	0 %	0 %	194447234
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91	NC_011081	A	6	6	77346	77351	100 %	0 %	0 %	0 %	194447294
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93	NC_011081	T	7	7	77763	77769	0 %	100 %	0 %	0 %	194447269
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99	NC_011081	T	6	6	84609	84614	0 %	100 %	0 %	0 %	194447207
100	NC_011081	T	6	6	84714	84719	0 %	100 %	0 %	0 %	194447207
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102	NC_011081	T	8	8	86230	86237	0 %	100 %	0 %	0 %	194447233
103	NC_011081	A	6	6	87052	87057	100 %	0 %	0 %	0 %	194447241
104	NC_011081	A	6	6	87656	87661	100 %	0 %	0 %	0 %	194447218
105	NC_011081	A	6	6	88073	88078	100 %	0 %	0 %	0 %	194447300
106	NC_011081	T	6	6	88295	88300	0 %	100 %	0 %	0 %	194447300
107	NC_011081	A	6	6	89379	89384	100 %	0 %	0 %	0 %	194447239
108	NC_011081	T	6	6	90393	90398	0 %	100 %	0 %	0 %	194447216
109	NC_011081	A	6	6	90579	90584	100 %	0 %	0 %	0 %	194447216

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.