MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 62106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011080	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
2	NC_011080	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
3	NC_011080	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
4	NC_011080	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
5	NC_011080	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
6	NC_011080	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
7	NC_011080	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
8	NC_011080	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
9	NC_011080	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
10	NC_011080	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446390
11	NC_011080	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
12	NC_011080	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
13	NC_011080	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
14	NC_011080	CTG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
15	NC_011080	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446390
16	NC_011080	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446390
17	NC_011080	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
18	NC_011080	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
19	NC_011080	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
20	NC_011080	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
21	NC_011080	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446390
22	NC_011080	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
23	NC_011080	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
24	NC_011080	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446390
25	NC_011080	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446390
26	NC_011080	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446390
27	NC_011080	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
28	NC_011080	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446390
29	NC_011080	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446390
30	NC_011080	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
31	NC_011080	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
32	NC_011080	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446390
33	NC_011080	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
34	NC_011080	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446390
35	NC_011080	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446390
36	NC_011080	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
37	NC_011080	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446390
38	NC_011080	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
39	NC_011080	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
40	NC_011080	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
41	NC_011080	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446390
42	NC_011080	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
43	NC_011080	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
44	NC_011080	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446390
45	NC_011080	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
46	NC_011080	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
47	NC_011080	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
48	NC_011080	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444692
49	NC_011080	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444692
50	NC_011080	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444692
51	NC_011080	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444692
52	NC_011080	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444692
53	NC_011080	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
54	NC_011080	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444692
55	NC_011080	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444692
56	NC_011080	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444692
57	NC_011080	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
58	NC_011080	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444692
59	NC_011080	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
60	NC_011080	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444692
61	NC_011080	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
62	NC_011080	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444103
63	NC_011080	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444103
64	NC_011080	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444103
65	NC_011080	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
66	NC_011080	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
67	NC_011080	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444103
68	NC_011080	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
69	NC_011080	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444103
70	NC_011080	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444103
71	NC_011080	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
72	NC_011080	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444103
73	NC_011080	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444103
74	NC_011080	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
75	NC_011080	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444103
76	NC_011080	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
77	NC_011080	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
78	NC_011080	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444103
79	NC_011080	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444103
80	NC_011080	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444103
81	NC_011080	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
82	NC_011080	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444103
83	NC_011080	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443561
84	NC_011080	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443561
85	NC_011080	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443561
86	NC_011080	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443561
87	NC_011080	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443561
88	NC_011080	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443561
89	NC_011080	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443561
90	NC_011080	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443561
91	NC_011080	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443561
92	NC_011080	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443561
93	NC_011080	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443561
94	NC_011080	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442782
95	NC_011080	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442782
96	NC_011080	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442782
97	NC_011080	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
98	NC_011080	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
99	NC_011080	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442782
100	NC_011080	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442782
101	NC_011080	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
102	NC_011080	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442782
103	NC_011080	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
104	NC_011080	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442782
105	NC_011080	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442782
106	NC_011080	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442782
107	NC_011080	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442782
108	NC_011080	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442782
109	NC_011080	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
110	NC_011080	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442782
111	NC_011080	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442295
112	NC_011080	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
113	NC_011080	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
114	NC_011080	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
115	NC_011080	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442295
116	NC_011080	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442295
117	NC_011080	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442295
118	NC_011080	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442295
119	NC_011080	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442295
120	NC_011080	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442295
121	NC_011080	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
122	NC_011080	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442295
123	NC_011080	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446748
124	NC_011080	ACC	2	6	8837	8842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446748
125	NC_011080	ATC	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446748
126	NC_011080	TGA	2	6	8914	8919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446748
127	NC_011080	GCT	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446748
128	NC_011080	GTC	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446748
129	NC_011080	CAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446224
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253	NC_011080	TTA	2	6	18031	18036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443256
254	NC_011080	TTG	2	6	18150	18155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443256
255	NC_011080	AGA	2	6	18184	18189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443256
256	NC_011080	CTG	2	6	18353	18358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443256
257	NC_011080	CGG	2	6	18427	18432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443256
258	NC_011080	CCG	2	6	18462	18467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443256
259	NC_011080	GTG	2	6	18503	18508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443256
260	NC_011080	GCT	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443256
261	NC_011080	CTG	2	6	18693	18698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443256
262	NC_011080	ACT	2	6	18701	18706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443256
263	NC_011080	GCT	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443256
264	NC_011080	TGA	2	6	18765	18770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443256
265	NC_011080	CTT	2	6	18778	18783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443256
266	NC_011080	CCA	2	6	18811	18816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443256
267	NC_011080	CTG	2	6	18875	18880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443256
268	NC_011080	CGC	2	6	18966	18971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443256
269	NC_011080	CTA	2	6	19002	19007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443256
270	NC_011080	CGC	2	6	19173	19178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443256
271	NC_011080	CGA	2	6	19381	19386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443256
272	NC_011080	GCG	2	6	19415	19420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443256
273	NC_011080	TTC	2	6	19471	19476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443256
274	NC_011080	TGA	2	6	19477	19482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443256
275	NC_011080	GAA	2	6	19706	19711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443256
276	NC_011080	GAA	2	6	19739	19744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443256
277	NC_011080	GAT	2	6	19763	19768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443256
278	NC_011080	CAG	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443256
279	NC_011080	TGG	2	6	19886	19891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443256
280	NC_011080	CGG	2	6	19927	19932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443256
281	NC_011080	TCA	2	6	20119	20124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445060
282	NC_011080	GCG	2	6	20206	20211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445060
283	NC_011080	AAC	2	6	20274	20279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445060
284	NC_011080	ATC	2	6	20280	20285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445060
285	NC_011080	TAA	2	6	20288	20293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445060
286	NC_011080	CTT	2	6	20307	20312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445060
287	NC_011080	CGC	2	6	20462	20467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445060
288	NC_011080	AAC	2	6	20473	20478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445060
289	NC_011080	CCG	2	6	20479	20484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445060
290	NC_011080	GAA	2	6	20741	20746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445060
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292	NC_011080	GCC	2	6	20820	20825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445060
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