MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011080	CGG	2	6	209033	209038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446310
4002	NC_011080	TCG	2	6	209200	209205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
4003	NC_011080	CCT	2	6	209273	209278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446310
4004	NC_011080	CGG	2	6	209289	209294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446310
4005	NC_011080	GTT	2	6	209310	209315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446310
4006	NC_011080	GCTG	2	8	209372	209379	0 %	25 %	50 %	25 %	194446310
4007	NC_011080	CGT	2	6	209514	209519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
4008	NC_011080	CG	3	6	209539	209544	0 %	0 %	50 %	50 %	194446310
4009	NC_011080	TATTGA	2	12	209558	209569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194446310
4010	NC_011080	CG	3	6	209684	209689	0 %	0 %	50 %	50 %	194446310
4011	NC_011080	TGC	2	6	209711	209716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
4012	NC_011080	AC	3	6	209727	209732	50 %	0 %	0 %	50 %	194446310
4013	NC_011080	AGCGC	2	10	209733	209742	20 %	0 %	40 %	40 %	194446310
4014	NC_011080	ATAA	2	8	209744	209751	75 %	25 %	0 %	0 %	194446310
4015	NC_011080	GTTT	2	8	209811	209818	0 %	75 %	25 %	0 %	194442367
4016	NC_011080	TGA	2	6	209848	209853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442367
4017	NC_011080	GGC	3	9	209876	209884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442367
4018	NC_011080	ATA	2	6	209975	209980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442367
4019	NC_011080	TTC	2	6	209991	209996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442367
4020	NC_011080	ATCG	2	8	210031	210038	25 %	25 %	25 %	25 %	194442367
4021	NC_011080	GT	3	6	210115	210120	0 %	50 %	50 %	0 %	194442367
4022	NC_011080	TGC	2	6	210139	210144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442367
4023	NC_011080	CCAG	2	8	210163	210170	25 %	0 %	25 %	50 %	194442367
4024	NC_011080	GCC	2	6	210200	210205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442367
4025	NC_011080	GTA	2	6	210220	210225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442367
4026	NC_011080	GCG	2	6	210256	210261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442367
4027	NC_011080	CAA	2	6	210453	210458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442367
4028	NC_011080	GCGG	2	8	210610	210617	0 %	0 %	75 %	25 %	194444005
4029	NC_011080	CTG	2	6	210648	210653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444005
4030	NC_011080	CAT	2	6	210747	210752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444005
4031	NC_011080	GC	3	6	210802	210807	0 %	0 %	50 %	50 %	194444005
4032	NC_011080	CTG	2	6	210815	210820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444005
4033	NC_011080	AG	3	6	210896	210901	50 %	0 %	50 %	0 %	194444005
4034	NC_011080	TTC	2	6	210907	210912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444005
4035	NC_011080	GCG	2	6	211013	211018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444005
4036	NC_011080	GGC	2	6	211033	211038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444005
4037	NC_011080	AGTG	2	8	211048	211055	25 %	25 %	50 %	0 %	194444005
4038	NC_011080	GCT	2	6	211319	211324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444659
4039	NC_011080	AAT	2	6	211337	211342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444659
4040	NC_011080	T	7	7	211348	211354	0 %	100 %	0 %	0 %	194444659
4041	NC_011080	A	6	6	211359	211364	100 %	0 %	0 %	0 %	194444659
4042	NC_011080	GT	3	6	211379	211384	0 %	50 %	50 %	0 %	194444659
4043	NC_011080	A	7	7	211393	211399	100 %	0 %	0 %	0 %	194444659
4044	NC_011080	AAG	2	6	211507	211512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443994
4045	NC_011080	ATG	2	6	211582	211587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443994
4046	NC_011080	TG	3	6	211586	211591	0 %	50 %	50 %	0 %	194443994
4047	NC_011080	CGGCG	2	10	211647	211656	0 %	0 %	60 %	40 %	194443994
4048	NC_011080	TGA	2	6	211676	211681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443994
4049	NC_011080	GGA	2	6	211734	211739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443994
4050	NC_011080	GC	3	6	211802	211807	0 %	0 %	50 %	50 %	194443994
4051	NC_011080	CAG	3	9	211831	211839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443994
4052	NC_011080	TGC	2	6	211859	211864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443994
4053	NC_011080	AT	3	6	211942	211947	50 %	50 %	0 %	0 %	194443969
4054	NC_011080	GTT	2	6	211958	211963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443969
4055	NC_011080	ACG	2	6	212027	212032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443969
4056	NC_011080	GCC	2	6	212039	212044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443969
4057	NC_011080	ATT	2	6	212130	212135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443969
4058	NC_011080	TGG	2	6	212325	212330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443969
4059	NC_011080	ATT	2	6	212348	212353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443969
4060	NC_011080	GGCT	2	8	212409	212416	0 %	25 %	50 %	25 %	194443969
4061	NC_011080	ATC	2	6	212469	212474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443969
4062	NC_011080	TGA	2	6	212485	212490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443969
4063	NC_011080	CCA	2	6	212517	212522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443969
4064	NC_011080	TTCGG	2	10	212527	212536	0 %	40 %	40 %	20 %	194443969
4065	NC_011080	GGA	2	6	212602	212607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443969
4066	NC_011080	CG	3	6	212621	212626	0 %	0 %	50 %	50 %	194443969
4067	NC_011080	GC	4	8	212636	212643	0 %	0 %	50 %	50 %	194443969
4068	NC_011080	GGT	2	6	212644	212649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443969
4069	NC_011080	TAT	2	6	212734	212739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443969
4070	NC_011080	T	6	6	212854	212859	0 %	100 %	0 %	0 %	194443969
4071	NC_011080	CGC	2	6	212879	212884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443969
4072	NC_011080	TA	3	6	212892	212897	50 %	50 %	0 %	0 %	194443969
4073	NC_011080	ATA	2	6	212910	212915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443969
4074	NC_011080	CA	3	6	212950	212955	50 %	0 %	0 %	50 %	194443969
4075	NC_011080	TCTT	2	8	212977	212984	0 %	75 %	0 %	25 %	194443969
4076	NC_011080	GGC	2	6	212993	212998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443969
4077	NC_011080	AGC	2	6	213019	213024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443969
4078	NC_011080	CAC	2	6	213052	213057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443969
4079	NC_011080	TGC	2	6	213093	213098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443969
4080	NC_011080	CTT	2	6	213271	213276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443433
4081	NC_011080	GCC	2	6	213336	213341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443433
4082	NC_011080	GAT	2	6	213356	213361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443433
4083	NC_011080	CTTGC	2	10	213536	213545	0 %	40 %	20 %	40 %	194443433
4084	NC_011080	GGC	2	6	213711	213716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442904
4085	NC_011080	CAG	2	6	213756	213761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4086	NC_011080	GTC	2	6	213786	213791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4087	NC_011080	TTCA	2	8	213807	213814	25 %	50 %	0 %	25 %	194442904
4088	NC_011080	GGCAAT	2	12	213825	213836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194442904
4089	NC_011080	GCGAT	2	10	213877	213886	20 %	20 %	40 %	20 %	194442904
4090	NC_011080	TCA	2	6	213887	213892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442904
4091	NC_011080	GCT	2	6	213920	213925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4092	NC_011080	TGAGC	2	10	213948	213957	20 %	20 %	40 %	20 %	194442904
4093	NC_011080	AAT	2	6	213978	213983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442904
4094	NC_011080	CGA	2	6	213992	213997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4095	NC_011080	CCA	2	6	214022	214027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442904
4096	NC_011080	CGC	2	6	214124	214129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442904
4097	NC_011080	AG	3	6	214167	214172	50 %	0 %	50 %	0 %	194442904
4098	NC_011080	ACGT	2	8	214186	214193	25 %	25 %	25 %	25 %	194442904
4099	NC_011080	CAC	2	6	214359	214364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442904
4100	NC_011080	CGT	2	6	214406	214411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4101	NC_011080	TGG	2	6	214424	214429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442904
4102	NC_011080	GAC	2	6	214463	214468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4103	NC_011080	GCA	2	6	214481	214486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442904
4104	NC_011080	CAA	2	6	214511	214516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442904
4105	NC_011080	TTC	2	6	214652	214657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442278
4106	NC_011080	CTG	2	6	214694	214699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442278
4107	NC_011080	CGG	2	6	214702	214707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442278
4108	NC_011080	GCC	2	6	214760	214765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442278
4109	NC_011080	GCCGAT	2	12	214823	214834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194442278
4110	NC_011080	GCAC	2	8	214882	214889	25 %	0 %	25 %	50 %	194442278
4111	NC_011080	CCAGCA	2	12	214891	214902	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194442278
4112	NC_011080	CAG	2	6	214940	214945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442278
4113	NC_011080	CGC	2	6	214960	214965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442278
4114	NC_011080	GCC	2	6	214982	214987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442278
4115	NC_011080	CCAG	2	8	215071	215078	25 %	0 %	25 %	50 %	194442278
4116	NC_011080	GCC	2	6	215081	215086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442278
4117	NC_011080	CGCA	2	8	215111	215118	25 %	0 %	25 %	50 %	194442278
4118	NC_011080	AGC	2	6	215184	215189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442278
4119	NC_011080	GC	3	6	215200	215205	0 %	0 %	50 %	50 %	194442278
4120	NC_011080	GCACG	2	10	215212	215221	20 %	0 %	40 %	40 %	194442278
4121	NC_011080	TCG	2	6	215322	215327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442278
4122	NC_011080	T	6	6	215378	215383	0 %	100 %	0 %	0 %	194442278
4123	NC_011080	CTTG	2	8	215386	215393	0 %	50 %	25 %	25 %	194442278
4124	NC_011080	GCA	2	6	215401	215406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442278
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4126	NC_011080	GCA	2	6	215568	215573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446701
4127	NC_011080	AGATC	2	10	215617	215626	40 %	20 %	20 %	20 %	194446701
4128	NC_011080	CGGT	2	8	215697	215704	0 %	25 %	50 %	25 %	194446701
4129	NC_011080	TTC	2	6	215822	215827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446701
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4136	NC_011080	TCG	2	6	216092	216097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967495
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4230	NC_011080	CGGGG	2	10	220591	220600	0 %	0 %	80 %	20 %	194442804
4231	NC_011080	CGT	2	6	220673	220678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4232	NC_011080	GGC	2	6	220681	220686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442804
4233	NC_011080	TGAA	2	8	220719	220726	50 %	25 %	25 %	0 %	194442804
4234	NC_011080	GC	4	8	220756	220763	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4235	NC_011080	GTG	2	6	220796	220801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442804
4236	NC_011080	CGA	2	6	221019	221024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4237	NC_011080	GC	3	6	221038	221043	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4238	NC_011080	TGA	2	6	221092	221097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442804
4239	NC_011080	CTG	2	6	221123	221128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4240	NC_011080	GCT	3	9	221146	221154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4241	NC_011080	CCCGCC	2	12	221282	221293	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	194442804
4242	NC_011080	GTC	2	6	221363	221368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4243	NC_011080	CG	3	6	221401	221406	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4244	NC_011080	TCAG	2	8	221439	221446	25 %	25 %	25 %	25 %	194442804
4245	NC_011080	GC	3	6	221461	221466	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4246	NC_011080	GC	3	6	221470	221475	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4247	NC_011080	GAC	2	6	221478	221483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4248	NC_011080	CTG	2	6	221507	221512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4249	NC_011080	GCGG	2	8	221530	221537	0 %	0 %	75 %	25 %	194442804
4250	NC_011080	CTGG	2	8	221632	221639	0 %	25 %	50 %	25 %	194442804
4251	NC_011080	GCC	2	6	221644	221649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442804
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4253	NC_011080	TAT	2	6	221679	221684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442804
4254	NC_011080	GC	3	6	221694	221699	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4255	NC_011080	GC	3	6	221718	221723	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4256	NC_011080	GGC	2	6	221737	221742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442804
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4269	NC_011080	CGC	2	6	222105	222110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442804
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4273	NC_011080	CGTCTG	2	12	222404	222415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442804
4274	NC_011080	GCG	2	6	222422	222427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442804
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4281	NC_011080	CG	3	6	222798	222803	0 %	0 %	50 %	50 %	194442804
4282	NC_011080	GAA	2	6	222919	222924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442804
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4352	NC_011080	TTA	2	6	225733	225738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446710
4353	NC_011080	CCTT	2	8	225741	225748	0 %	50 %	0 %	50 %	194446710
4354	NC_011080	CGA	2	6	225808	225813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446710
4355	NC_011080	TGC	2	6	225828	225833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446710
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4357	NC_011080	TCA	2	6	225873	225878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446710
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4359	NC_011080	GTA	2	6	225944	225949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967496
4360	NC_011080	TGTC	2	8	225969	225976	0 %	50 %	25 %	25 %	448967496
4361	NC_011080	GGC	2	6	225985	225990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967496
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4365	NC_011080	A	6	6	226119	226124	100 %	0 %	0 %	0 %	448967496
4366	NC_011080	GGT	2	6	226141	226146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967496
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4486	NC_011080	GCG	3	9	231258	231266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444741
4487	NC_011080	CTG	2	6	231270	231275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444741
4488	NC_011080	ATT	2	6	231276	231281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444741
4489	NC_011080	GCC	2	6	231288	231293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444741
4490	NC_011080	GCG	2	6	231298	231303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444741
4491	NC_011080	TGC	2	6	231361	231366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444741
4492	NC_011080	ATG	2	6	231369	231374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444741
4493	NC_011080	GCG	2	6	231385	231390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444741
4494	NC_011080	CGC	2	6	231510	231515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444741
4495	NC_011080	GCG	2	6	231538	231543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444741
4496	NC_011080	CG	5	10	231548	231557	0 %	0 %	50 %	50 %	194444741
4497	NC_011080	GCT	2	6	231590	231595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444741
4498	NC_011080	GGC	2	6	231602	231607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444741
4499	NC_011080	CGA	2	6	231625	231630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444741
4500	NC_011080	CGG	2	6	231799	231804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444741

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