MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011080	CGT	2	6	185001	185006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443781
3502	NC_011080	ATA	2	6	185015	185020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443781
3503	NC_011080	TTGG	2	8	185102	185109	0 %	50 %	50 %	0 %	194443781
3504	NC_011080	GTAA	2	8	185172	185179	50 %	25 %	25 %	0 %	194443781
3505	NC_011080	CTG	2	6	185185	185190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443781
3506	NC_011080	GCAT	2	8	185204	185211	25 %	25 %	25 %	25 %	194443781
3507	NC_011080	GCC	2	6	185273	185278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443781
3508	NC_011080	GCC	2	6	185293	185298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443781
3509	NC_011080	TCT	2	6	185333	185338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443781
3510	NC_011080	CGG	2	6	185440	185445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443781
3511	NC_011080	GCC	2	6	185454	185459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443781
3512	NC_011080	CGTTT	2	10	185488	185497	0 %	60 %	20 %	20 %	194443781
3513	NC_011080	T	6	6	185495	185500	0 %	100 %	0 %	0 %	194443781
3514	NC_011080	CCG	2	6	185508	185513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443781
3515	NC_011080	GGC	2	6	185527	185532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443781
3516	NC_011080	GGGGA	2	10	185540	185549	20 %	0 %	80 %	0 %	194443781
3517	NC_011080	ATG	2	6	185647	185652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445597
3518	NC_011080	CG	3	6	185669	185674	0 %	0 %	50 %	50 %	194445597
3519	NC_011080	GCG	3	9	185672	185680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445597
3520	NC_011080	CGA	2	6	185708	185713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3521	NC_011080	GCG	2	6	185817	185822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445597
3522	NC_011080	GGCG	2	8	185841	185848	0 %	0 %	75 %	25 %	194445597
3523	NC_011080	TC	3	6	185852	185857	0 %	50 %	0 %	50 %	194445597
3524	NC_011080	TGT	2	6	185861	185866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445597
3525	NC_011080	TGC	2	6	185876	185881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3526	NC_011080	TGC	3	9	185909	185917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3527	NC_011080	GTG	2	6	185918	185923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445597
3528	NC_011080	CTG	2	6	185938	185943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3529	NC_011080	CGC	2	6	185944	185949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445597
3530	NC_011080	CGA	2	6	185954	185959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3531	NC_011080	CTG	2	6	185960	185965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3532	NC_011080	ATT	2	6	185992	185997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445597
3533	NC_011080	CTG	2	6	186019	186024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3534	NC_011080	GCC	2	6	186113	186118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445597
3535	NC_011080	TGC	2	6	186149	186154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3536	NC_011080	CGC	2	6	186168	186173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445597
3537	NC_011080	TGG	2	6	186180	186185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445597
3538	NC_011080	TAT	2	6	186207	186212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445597
3539	NC_011080	TGC	2	6	186248	186253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3540	NC_011080	ATT	2	6	186301	186306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445597
3541	NC_011080	ACC	2	6	186349	186354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445597
3542	NC_011080	ATG	2	6	186355	186360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445597
3543	NC_011080	ATC	3	9	186364	186372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445597
3544	NC_011080	ATG	2	6	186373	186378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445597
3545	NC_011080	GTC	3	9	186379	186387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3546	NC_011080	TGG	2	6	186389	186394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445597
3547	NC_011080	TGA	2	6	186395	186400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445597
3548	NC_011080	TCG	2	6	186401	186406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3549	NC_011080	TGC	2	6	186420	186425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3550	NC_011080	AAC	2	6	186428	186433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445597
3551	NC_011080	GGT	2	6	186439	186444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445597
3552	NC_011080	CTG	2	6	186493	186498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3553	NC_011080	CGG	2	6	186523	186528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445597
3554	NC_011080	ACC	2	6	186587	186592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445597
3555	NC_011080	TGA	2	6	186615	186620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445597
3556	NC_011080	TGG	3	9	186654	186662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445597
3557	NC_011080	TTG	2	6	186663	186668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445597
3558	NC_011080	CGG	2	6	186675	186680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445597
3559	NC_011080	TGC	2	6	186716	186721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3560	NC_011080	GAGC	2	8	186750	186757	25 %	0 %	50 %	25 %	194445597
3561	NC_011080	CATC	2	8	186777	186784	25 %	25 %	0 %	50 %	194445597
3562	NC_011080	TGGC	2	8	186905	186912	0 %	25 %	50 %	25 %	194445597
3563	NC_011080	CGC	2	6	187138	187143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445597
3564	NC_011080	CA	3	6	187214	187219	50 %	0 %	0 %	50 %	194445597
3565	NC_011080	TCG	2	6	187638	187643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3566	NC_011080	AGA	2	6	187648	187653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445093
3567	NC_011080	TGC	2	6	187678	187683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3568	NC_011080	GCT	2	6	187738	187743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3569	NC_011080	GAA	3	9	187763	187771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445093
3570	NC_011080	TCC	2	6	187801	187806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445093
3571	NC_011080	GCT	2	6	187847	187852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3572	NC_011080	ACC	2	6	187868	187873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445093
3573	NC_011080	CTG	2	6	187907	187912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3574	NC_011080	ACA	2	6	187932	187937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445093
3575	NC_011080	TGAT	2	8	187947	187954	25 %	50 %	25 %	0 %	194445093
3576	NC_011080	TGC	2	6	187984	187989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3577	NC_011080	CTG	2	6	188009	188014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3578	NC_011080	ACG	2	6	188031	188036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3579	NC_011080	AGA	2	6	188038	188043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445093
3580	NC_011080	CCG	2	6	188120	188125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445093
3581	NC_011080	A	6	6	188133	188138	100 %	0 %	0 %	0 %	194445093
3582	NC_011080	TCACCG	2	12	188139	188150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194445093
3583	NC_011080	CGA	2	6	188179	188184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3584	NC_011080	TC	4	8	188185	188192	0 %	50 %	0 %	50 %	194445093
3585	NC_011080	A	6	6	188248	188253	100 %	0 %	0 %	0 %	194445093
3586	NC_011080	CAAA	2	8	188302	188309	75 %	0 %	0 %	25 %	194445093
3587	NC_011080	A	6	6	188324	188329	100 %	0 %	0 %	0 %	194445093
3588	NC_011080	GTG	2	6	188357	188362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445093
3589	NC_011080	TTC	2	6	188371	188376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445093
3590	NC_011080	GCG	3	9	188445	188453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445093
3591	NC_011080	GGC	2	6	188465	188470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445093
3592	NC_011080	TCT	2	6	188484	188489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445093
3593	NC_011080	GC	3	6	188511	188516	0 %	0 %	50 %	50 %	194445093
3594	NC_011080	CGA	2	6	188650	188655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3595	NC_011080	GTGC	2	8	188657	188664	0 %	25 %	50 %	25 %	194445093
3596	NC_011080	GGT	2	6	188666	188671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445093
3597	NC_011080	ACC	2	6	188702	188707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445093
3598	NC_011080	AGC	2	6	188774	188779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3599	NC_011080	TC	3	6	188787	188792	0 %	50 %	0 %	50 %	194445093
3600	NC_011080	GGTC	2	8	188806	188813	0 %	25 %	50 %	25 %	194445093
3601	NC_011080	GCG	2	6	188820	188825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445093
3602	NC_011080	TAC	2	6	188887	188892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445093
3603	NC_011080	CCG	2	6	188943	188948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445093
3604	NC_011080	CAC	2	6	189004	189009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445093
3605	NC_011080	CAC	2	6	189011	189016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445093
3606	NC_011080	TC	3	6	189051	189056	0 %	50 %	0 %	50 %	194445093
3607	NC_011080	TGC	3	9	189099	189107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
3608	NC_011080	CGG	2	6	189124	189129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445093
3609	NC_011080	CGG	2	6	189168	189173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445093
3610	NC_011080	CTGGT	2	10	189177	189186	0 %	40 %	40 %	20 %	194445093
3611	NC_011080	TGC	2	6	189193	189198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
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3614	NC_011080	TCT	2	6	189360	189365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445093
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3616	NC_011080	GAT	2	6	189529	189534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445093
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3618	NC_011080	TGGC	2	8	189593	189600	0 %	25 %	50 %	25 %	194445093
3619	NC_011080	GCT	2	6	189610	189615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445093
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3621	NC_011080	TG	3	6	189687	189692	0 %	50 %	50 %	0 %	194445093
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3983	NC_011080	TG	3	6	207883	207888	0 %	50 %	50 %	0 %	194446310
3984	NC_011080	GTG	2	6	207949	207954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446310
3985	NC_011080	TCG	3	9	208078	208086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
3986	NC_011080	TCA	2	6	208090	208095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446310
3987	NC_011080	TTG	2	6	208174	208179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446310
3988	NC_011080	CTG	2	6	208203	208208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
3989	NC_011080	TCT	2	6	208225	208230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446310
3990	NC_011080	TCG	2	6	208330	208335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
3991	NC_011080	GTG	2	6	208405	208410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446310
3992	NC_011080	GAC	2	6	208419	208424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446310
3993	NC_011080	GCC	2	6	208587	208592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446310
3994	NC_011080	GTC	2	6	208644	208649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
3995	NC_011080	GTT	2	6	208659	208664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446310
3996	NC_011080	CGTCA	2	10	208782	208791	20 %	20 %	20 %	40 %	194446310
3997	NC_011080	TGC	2	6	208802	208807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
3998	NC_011080	CGG	2	6	208850	208855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446310
3999	NC_011080	TCG	2	6	208922	208927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446310
4000	NC_011080	GCTG	2	8	208940	208947	0 %	25 %	50 %	25 %	194446310

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