MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011080	GCA	2	6	158457	158462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444484
3002	NC_011080	CAG	2	6	158482	158487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444484
3003	NC_011080	A	6	6	158516	158521	100 %	0 %	0 %	0 %	194444484
3004	NC_011080	GGC	2	6	158556	158561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444484
3005	NC_011080	AAGC	2	8	158602	158609	50 %	0 %	25 %	25 %	194444484
3006	NC_011080	GAT	2	6	158716	158721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442525
3007	NC_011080	CAAA	2	8	158722	158729	75 %	0 %	0 %	25 %	194442525
3008	NC_011080	AC	3	6	158770	158775	50 %	0 %	0 %	50 %	194442525
3009	NC_011080	A	6	6	158780	158785	100 %	0 %	0 %	0 %	194442525
3010	NC_011080	TCG	2	6	158833	158838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442525
3011	NC_011080	ATG	2	6	158925	158930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442525
3012	NC_011080	TGC	2	6	158959	158964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442525
3013	NC_011080	ATGG	2	8	159026	159033	25 %	25 %	50 %	0 %	194442525
3014	NC_011080	CTG	2	6	159056	159061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442525
3015	NC_011080	TGA	2	6	159076	159081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442525
3016	NC_011080	A	6	6	159095	159100	100 %	0 %	0 %	0 %	194442525
3017	NC_011080	CGAT	2	8	159210	159217	25 %	25 %	25 %	25 %	194442525
3018	NC_011080	CAG	2	6	159220	159225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442525
3019	NC_011080	GGC	2	6	159341	159346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442525
3020	NC_011080	GTT	2	6	159365	159370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442525
3021	NC_011080	TTCG	2	8	159419	159426	0 %	50 %	25 %	25 %	194442525
3022	NC_011080	TG	3	6	159462	159467	0 %	50 %	50 %	0 %	194442525
3023	NC_011080	ATT	2	6	159476	159481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442525
3024	NC_011080	GAC	2	6	159581	159586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442525
3025	NC_011080	TTA	2	6	159972	159977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513538106
3026	NC_011080	CGC	2	6	160019	160024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513538106
3027	NC_011080	GAC	2	6	160046	160051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513538106
3028	NC_011080	CGT	2	6	160110	160115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513538106
3029	NC_011080	CTTT	2	8	160173	160180	0 %	75 %	0 %	25 %	513538106
3030	NC_011080	CAT	2	6	160236	160241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513538106
3031	NC_011080	AGG	2	6	160279	160284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513538106
3032	NC_011080	CGC	2	6	160288	160293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513538106
3033	NC_011080	CGC	2	6	160305	160310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513538106
3034	NC_011080	TAT	2	6	160467	160472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443083
3035	NC_011080	ATT	2	6	160482	160487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443083
3036	NC_011080	CGT	2	6	160525	160530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443083
3037	NC_011080	TTA	2	6	160550	160555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443083
3038	NC_011080	AG	3	6	160650	160655	50 %	0 %	50 %	0 %	194443083
3039	NC_011080	GGT	2	6	160677	160682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443083
3040	NC_011080	GGT	2	6	160738	160743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443083
3041	NC_011080	AAC	2	6	160894	160899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443083
3042	NC_011080	GCCA	2	8	160959	160966	25 %	0 %	25 %	50 %	194443083
3043	NC_011080	AAC	2	6	161005	161010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443083
3044	NC_011080	ACA	2	6	161036	161041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443083
3045	NC_011080	TGG	2	6	161090	161095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443083
3046	NC_011080	CGC	2	6	161132	161137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3047	NC_011080	ATT	2	6	161140	161145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443083
3048	NC_011080	CCGGC	2	10	161147	161156	0 %	0 %	40 %	60 %	194443083
3049	NC_011080	A	6	6	161179	161184	100 %	0 %	0 %	0 %	194443083
3050	NC_011080	AGA	2	6	161223	161228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443083
3051	NC_011080	TGA	2	6	161265	161270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443083
3052	NC_011080	GC	3	6	161275	161280	0 %	0 %	50 %	50 %	194443083
3053	NC_011080	AAG	2	6	161333	161338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443083
3054	NC_011080	CCG	2	6	161402	161407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3055	NC_011080	GC	4	8	161412	161419	0 %	0 %	50 %	50 %	194443083
3056	NC_011080	TCA	2	6	161468	161473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443083
3057	NC_011080	TTG	2	6	161474	161479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443083
3058	NC_011080	AAG	2	6	161549	161554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443083
3059	NC_011080	ACT	2	6	161606	161611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443083
3060	NC_011080	CGG	2	6	161648	161653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443083
3061	NC_011080	TCTA	2	8	161677	161684	25 %	50 %	0 %	25 %	194443083
3062	NC_011080	CGT	2	6	161697	161702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443083
3063	NC_011080	GAT	2	6	161721	161726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443083
3064	NC_011080	A	6	6	161768	161773	100 %	0 %	0 %	0 %	194443083
3065	NC_011080	AG	3	6	161869	161874	50 %	0 %	50 %	0 %	194443083
3066	NC_011080	GCG	2	6	161962	161967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443083
3067	NC_011080	CGC	2	6	162039	162044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3068	NC_011080	GAA	2	6	162061	162066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443083
3069	NC_011080	CGG	2	6	162123	162128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443083
3070	NC_011080	CCG	2	6	162162	162167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3071	NC_011080	TTC	2	6	162216	162221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443083
3072	NC_011080	ATG	2	6	162286	162291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443083
3073	NC_011080	CTG	2	6	162403	162408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443083
3074	NC_011080	ATG	3	9	162413	162421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443083
3075	NC_011080	CGT	2	6	162436	162441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443083
3076	NC_011080	CTG	2	6	162466	162471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443083
3077	NC_011080	CCG	2	6	162547	162552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3078	NC_011080	GAG	2	6	162664	162669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443083
3079	NC_011080	AGA	2	6	162720	162725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443083
3080	NC_011080	GGT	2	6	162726	162731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443083
3081	NC_011080	ATG	2	6	162742	162747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443083
3082	NC_011080	TGC	2	6	162770	162775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443083
3083	NC_011080	GGC	2	6	162807	162812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443083
3084	NC_011080	CGC	2	6	162903	162908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3085	NC_011080	GCA	2	6	163032	163037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443083
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3087	NC_011080	GCC	2	6	163081	163086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443083
3088	NC_011080	CCTTGC	2	12	163120	163131	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194443083
3089	NC_011080	A	6	6	163330	163335	100 %	0 %	0 %	0 %	194445128
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3091	NC_011080	TTA	2	6	163382	163387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445128
3092	NC_011080	CGC	2	6	163395	163400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445128
3093	NC_011080	CGG	2	6	163434	163439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445128
3094	NC_011080	CGA	2	6	163452	163457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445128
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3096	NC_011080	AAG	2	6	163616	163621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445128
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3098	NC_011080	ATT	2	6	163690	163695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445128
3099	NC_011080	TTA	2	6	163753	163758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444623
3100	NC_011080	GCCG	2	8	163798	163805	0 %	0 %	50 %	50 %	194444623
3101	NC_011080	CGT	2	6	163809	163814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444623
3102	NC_011080	GCC	2	6	163835	163840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444623
3103	NC_011080	GTC	2	6	164062	164067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444422
3104	NC_011080	CGC	2	6	164082	164087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444422
3105	NC_011080	CGG	2	6	164109	164114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444422
3106	NC_011080	C	6	6	164178	164183	0 %	0 %	0 %	100 %	194444422
3107	NC_011080	GAC	2	6	164185	164190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444422
3108	NC_011080	ACG	2	6	164216	164221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444422
3109	NC_011080	GCA	2	6	164385	164390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3110	NC_011080	CGT	2	6	164397	164402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3111	NC_011080	GATCA	2	10	164464	164473	40 %	20 %	20 %	20 %	194443863
3112	NC_011080	TGT	2	6	164549	164554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443863
3113	NC_011080	GCC	2	6	164599	164604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443863
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3117	NC_011080	GCT	2	6	164775	164780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3118	NC_011080	CAG	2	6	164797	164802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3119	NC_011080	A	6	6	164858	164863	100 %	0 %	0 %	0 %	194443863
3120	NC_011080	TCT	2	6	164946	164951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443863
3121	NC_011080	TTA	2	6	165082	165087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443064
3122	NC_011080	GC	3	6	165114	165119	0 %	0 %	50 %	50 %	194443064
3123	NC_011080	CG	3	6	165161	165166	0 %	0 %	50 %	50 %	194443064
3124	NC_011080	CAT	2	6	165170	165175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443064
3125	NC_011080	CGTCA	2	10	165210	165219	20 %	20 %	20 %	40 %	194443064
3126	NC_011080	ACC	2	6	165220	165225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443064
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3128	NC_011080	CTG	2	6	165327	165332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443064
3129	NC_011080	TTC	2	6	165369	165374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443064
3130	NC_011080	A	6	6	165383	165388	100 %	0 %	0 %	0 %	194443064
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3134	NC_011080	ATA	2	6	165505	165510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443064
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3142	NC_011080	GGC	2	6	166470	166475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
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3150	NC_011080	CCGC	2	8	166744	166751	0 %	0 %	25 %	75 %	194443094
3151	NC_011080	GGC	2	6	166761	166766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
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3154	NC_011080	CCA	3	9	166961	166969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444325
3155	NC_011080	TGA	2	6	166991	166996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444325
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3166	NC_011080	AGA	2	6	167506	167511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444325
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3229	NC_011080	GTTG	2	8	171151	171158	0 %	50 %	50 %	0 %	194443693
3230	NC_011080	TGG	2	6	171226	171231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443693
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3232	NC_011080	C	6	6	171249	171254	0 %	0 %	0 %	100 %	194443693
3233	NC_011080	ATT	2	6	171284	171289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443693
3234	NC_011080	T	7	7	171320	171326	0 %	100 %	0 %	0 %	194443693
3235	NC_011080	TCG	2	6	171368	171373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443693
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3237	NC_011080	CAG	2	6	171525	171530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443693
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3239	NC_011080	GCTA	2	8	171558	171565	25 %	25 %	25 %	25 %	194443693
3240	NC_011080	TCG	2	6	171675	171680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443693
3241	NC_011080	ATGAC	2	10	171690	171699	40 %	20 %	20 %	20 %	194443693
3242	NC_011080	ATC	2	6	171768	171773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445301
3243	NC_011080	TGG	2	6	171846	171851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445301
3244	NC_011080	GCT	2	6	171883	171888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445301
3245	NC_011080	TGG	2	6	171906	171911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445301
3246	NC_011080	GCC	2	6	172051	172056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445301
3247	NC_011080	GTT	2	6	172099	172104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445301
3248	NC_011080	TGG	2	6	172179	172184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445301
3249	NC_011080	CTGG	2	8	172213	172220	0 %	25 %	50 %	25 %	194445301
3250	NC_011080	CGC	2	6	172233	172238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445301
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3252	NC_011080	CTGGA	2	10	172280	172289	20 %	20 %	40 %	20 %	194445301
3253	NC_011080	GGCG	2	8	172303	172310	0 %	0 %	75 %	25 %	194445301
3254	NC_011080	GCG	2	6	172466	172471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445301
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3257	NC_011080	ATT	2	6	172511	172516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445301
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3259	NC_011080	TGG	2	6	172850	172855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444745
3260	NC_011080	CG	3	6	172895	172900	0 %	0 %	50 %	50 %	194444745
3261	NC_011080	TCG	2	6	172903	172908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444745
3262	NC_011080	AGT	2	6	172937	172942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444745
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3264	NC_011080	TGA	2	6	173173	173178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444745
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3269	NC_011080	AGT	2	6	173516	173521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444745
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3271	NC_011080	GTT	2	6	173558	173563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444745
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3274	NC_011080	T	7	7	173683	173689	0 %	100 %	0 %	0 %	194446380
3275	NC_011080	CAG	2	6	173711	173716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446380
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3279	NC_011080	ATC	2	6	173948	173953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446380
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3350	NC_011080	GC	3	6	178113	178118	0 %	0 %	50 %	50 %	194442514
3351	NC_011080	GGC	2	6	178159	178164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442514
3352	NC_011080	CAT	2	6	178290	178295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442514
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3355	NC_011080	A	6	6	178315	178320	100 %	0 %	0 %	0 %	194442514
3356	NC_011080	GGC	2	6	178333	178338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442514
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3362	NC_011080	CG	3	6	178471	178476	0 %	0 %	50 %	50 %	194442514
3363	NC_011080	GTC	2	6	178487	178492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442514
3364	NC_011080	CT	3	6	178543	178548	0 %	50 %	0 %	50 %	194442514
3365	NC_011080	AAAC	2	8	178684	178691	75 %	0 %	0 %	25 %	194442514
3366	NC_011080	CGGCGA	2	12	178707	178718	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194442514
3367	NC_011080	GATG	2	8	178719	178726	25 %	25 %	50 %	0 %	194442514
3368	NC_011080	GCTG	2	8	178876	178883	0 %	25 %	50 %	25 %	194442514
3369	NC_011080	CTG	2	6	178924	178929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442514
3370	NC_011080	TGA	2	6	178961	178966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442514
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3372	NC_011080	CTT	2	6	179031	179036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442514
3373	NC_011080	CCG	2	6	179054	179059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442514
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3377	NC_011080	A	6	6	179143	179148	100 %	0 %	0 %	0 %	194442514
3378	NC_011080	GAA	2	6	179250	179255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442514
3379	NC_011080	GCGT	2	8	179270	179277	0 %	25 %	50 %	25 %	194442514
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3381	NC_011080	GC	3	6	179468	179473	0 %	0 %	50 %	50 %	194442514
3382	NC_011080	AGCAA	2	10	179483	179492	60 %	0 %	20 %	20 %	194442514
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3384	NC_011080	CGTG	2	8	179517	179524	0 %	25 %	50 %	25 %	194442514
3385	NC_011080	GAA	2	6	179541	179546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442514
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3389	NC_011080	TAC	2	6	179686	179691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442514
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3394	NC_011080	CTA	2	6	179814	179819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442514
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3400	NC_011080	TAC	3	9	180079	180087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442514
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3484	NC_011080	ATG	2	6	184301	184306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443599
3485	NC_011080	GCA	2	6	184343	184348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443599
3486	NC_011080	TGTC	2	8	184386	184393	0 %	50 %	25 %	25 %	194443599
3487	NC_011080	AT	3	6	184499	184504	50 %	50 %	0 %	0 %	194444072
3488	NC_011080	ACA	2	6	184518	184523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444072
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3490	NC_011080	GCG	2	6	184597	184602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444072
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3492	NC_011080	CAG	2	6	184656	184661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444072
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