MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011080	CGGCG	2	10	132329	132338	0 %	0 %	60 %	40 %	194443917
2502	NC_011080	TGCCGA	2	12	132421	132432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194443917
2503	NC_011080	GTGG	2	8	132455	132462	0 %	25 %	75 %	0 %	194443917
2504	NC_011080	CGC	2	6	132475	132480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443917
2505	NC_011080	GC	4	8	132718	132725	0 %	0 %	50 %	50 %	194443917
2506	NC_011080	CAG	2	6	132782	132787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443917
2507	NC_011080	CGTTT	2	10	132791	132800	0 %	60 %	20 %	20 %	194443917
2508	NC_011080	AAT	2	6	132828	132833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443917
2509	NC_011080	ATA	2	6	132887	132892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444403
2510	NC_011080	ACTG	2	8	132910	132917	25 %	25 %	25 %	25 %	194444403
2511	NC_011080	GCA	3	9	133023	133031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444403
2512	NC_011080	GCC	2	6	133096	133101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444403
2513	NC_011080	TCG	2	6	133184	133189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444403
2514	NC_011080	CAG	2	6	133219	133224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444403
2515	NC_011080	TGG	2	6	133260	133265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444403
2516	NC_011080	CAT	2	6	133317	133322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444403
2517	NC_011080	CGG	2	6	133388	133393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444403
2518	NC_011080	CCG	2	6	133523	133528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444403
2519	NC_011080	CA	4	8	133540	133547	50 %	0 %	0 %	50 %	194444403
2520	NC_011080	GCG	2	6	133565	133570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444403
2521	NC_011080	GC	3	6	133577	133582	0 %	0 %	50 %	50 %	194444403
2522	NC_011080	AAT	2	6	133637	133642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444403
2523	NC_011080	GCA	2	6	133662	133667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444403
2524	NC_011080	CTGG	2	8	133680	133687	0 %	25 %	50 %	25 %	194444403
2525	NC_011080	GCC	2	6	133717	133722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444403
2526	NC_011080	CCG	2	6	133811	133816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444403
2527	NC_011080	TGG	2	6	133830	133835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444403
2528	NC_011080	TTC	2	6	133940	133945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444403
2529	NC_011080	TTG	2	6	133963	133968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444052
2530	NC_011080	CGG	2	6	134012	134017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444052
2531	NC_011080	GGA	2	6	134058	134063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444052
2532	NC_011080	CGA	2	6	134066	134071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2533	NC_011080	GCG	2	6	134100	134105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444052
2534	NC_011080	ATG	2	6	134109	134114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444052
2535	NC_011080	ACG	2	6	134119	134124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2536	NC_011080	CGT	2	6	134192	134197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2537	NC_011080	GCCGTT	2	12	134241	134252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2538	NC_011080	CGC	2	6	134253	134258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444052
2539	NC_011080	CAC	2	6	134276	134281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444052
2540	NC_011080	TTC	2	6	134361	134366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444052
2541	NC_011080	TAA	2	6	134378	134383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444052
2542	NC_011080	T	6	6	134421	134426	0 %	100 %	0 %	0 %	194444052
2543	NC_011080	CGT	2	6	134447	134452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2544	NC_011080	GGT	2	6	134456	134461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444052
2545	NC_011080	TGT	2	6	134465	134470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444052
2546	NC_011080	CGG	2	6	134513	134518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444052
2547	NC_011080	TGG	2	6	134620	134625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444052
2548	NC_011080	TTG	2	6	134668	134673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444052
2549	NC_011080	CTGG	2	8	134709	134716	0 %	25 %	50 %	25 %	194444052
2550	NC_011080	GTG	2	6	134730	134735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444052
2551	NC_011080	GT	3	6	134746	134751	0 %	50 %	50 %	0 %	194444052
2552	NC_011080	ATG	2	6	134758	134763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444052
2553	NC_011080	CTT	2	6	134792	134797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444052
2554	NC_011080	CG	3	6	134854	134859	0 %	0 %	50 %	50 %	194444052
2555	NC_011080	GCC	2	6	134872	134877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444052
2556	NC_011080	TCG	2	6	134905	134910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2557	NC_011080	GAT	2	6	134925	134930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444052
2558	NC_011080	CCA	2	6	135056	135061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444052
2559	NC_011080	CG	3	6	135062	135067	0 %	0 %	50 %	50 %	194444052
2560	NC_011080	TCA	2	6	135118	135123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444052
2561	NC_011080	CG	3	6	135156	135161	0 %	0 %	50 %	50 %	194444052
2562	NC_011080	TGC	2	6	135182	135187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2563	NC_011080	TGG	2	6	135194	135199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444052
2564	NC_011080	AAT	2	6	135501	135506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444052
2565	NC_011080	ATG	2	6	135520	135525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444052
2566	NC_011080	CG	3	6	136470	136475	0 %	0 %	50 %	50 %	194444092
2567	NC_011080	CAG	2	6	136675	136680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444092
2568	NC_011080	ATA	2	6	136719	136724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444092
2569	NC_011080	A	6	6	136755	136760	100 %	0 %	0 %	0 %	194444092
2570	NC_011080	CGT	2	6	136791	136796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444092
2571	NC_011080	TTA	2	6	136845	136850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444092
2572	NC_011080	GAA	2	6	136856	136861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444092
2573	NC_011080	CGT	2	6	136865	136870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444092
2574	NC_011080	AAC	2	6	136977	136982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444092
2575	NC_011080	GTT	2	6	136988	136993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444092
2576	NC_011080	TC	3	6	136994	136999	0 %	50 %	0 %	50 %	194444092
2577	NC_011080	GCTG	2	8	137133	137140	0 %	25 %	50 %	25 %	194444092
2578	NC_011080	ATGG	2	8	137257	137264	25 %	25 %	50 %	0 %	194444092
2579	NC_011080	TTA	2	6	137270	137275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444092
2580	NC_011080	TGA	2	6	137589	137594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444736
2581	NC_011080	TGT	2	6	137625	137630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444736
2582	NC_011080	GTC	2	6	137645	137650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444736
2583	NC_011080	ATG	2	6	137718	137723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444736
2584	NC_011080	GATC	2	8	137743	137750	25 %	25 %	25 %	25 %	194444736
2585	NC_011080	GTG	2	6	137825	137830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2586	NC_011080	ATTCC	2	10	137892	137901	20 %	40 %	0 %	40 %	194444736
2587	NC_011080	ATTG	2	8	137935	137942	25 %	50 %	25 %	0 %	194444736
2588	NC_011080	ATG	2	6	137946	137951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444736
2589	NC_011080	TGG	2	6	137970	137975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2590	NC_011080	GGT	2	6	137989	137994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2591	NC_011080	CTGG	2	8	138055	138062	0 %	25 %	50 %	25 %	194444736
2592	NC_011080	GGT	2	6	138085	138090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2593	NC_011080	A	7	7	138125	138131	100 %	0 %	0 %	0 %	194444736
2594	NC_011080	A	6	6	138235	138240	100 %	0 %	0 %	0 %	194444736
2595	NC_011080	GGT	2	6	138244	138249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2596	NC_011080	CAT	2	6	138301	138306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444736
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2598	NC_011080	GAC	2	6	138467	138472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444736
2599	NC_011080	ACG	2	6	138476	138481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444736
2600	NC_011080	AAT	2	6	138482	138487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444736
2601	NC_011080	GGT	2	6	138574	138579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2602	NC_011080	TGG	2	6	138665	138670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
2603	NC_011080	CAG	2	6	138671	138676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444736
2604	NC_011080	GC	3	6	138688	138693	0 %	0 %	50 %	50 %	194444736
2605	NC_011080	ACA	2	6	138805	138810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444736
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2607	NC_011080	CGG	2	6	138868	138873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444736
2608	NC_011080	GAAA	2	8	138931	138938	75 %	0 %	25 %	0 %	194444736
2609	NC_011080	TGG	2	6	138939	138944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444736
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2611	NC_011080	TAA	2	6	139225	139230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444736
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2617	NC_011080	ATT	2	6	139678	139683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443650
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2621	NC_011080	AAAGC	2	10	140189	140198	60 %	0 %	20 %	20 %	194444269
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2744	NC_011080	GTG	2	6	146323	146328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443335
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2862	NC_011080	GGCG	2	8	151771	151778	0 %	0 %	75 %	25 %	194443313
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2984	NC_011080	GGCA	2	8	157767	157774	25 %	0 %	50 %	25 %	194444484
2985	NC_011080	GCG	2	6	157778	157783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444484
2986	NC_011080	CGGCG	2	10	157794	157803	0 %	0 %	60 %	40 %	194444484
2987	NC_011080	GTG	2	6	157852	157857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444484
2988	NC_011080	GCT	2	6	157965	157970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444484
2989	NC_011080	ACG	2	6	158021	158026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444484
2990	NC_011080	CCCG	2	8	158066	158073	0 %	0 %	25 %	75 %	194444484
2991	NC_011080	TGA	2	6	158078	158083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444484
2992	NC_011080	ATG	2	6	158134	158139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444484
2993	NC_011080	GAA	2	6	158173	158178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444484
2994	NC_011080	TCT	2	6	158197	158202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444484
2995	NC_011080	GCT	2	6	158205	158210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444484
2996	NC_011080	GC	4	8	158231	158238	0 %	0 %	50 %	50 %	194444484
2997	NC_011080	CGG	2	6	158258	158263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444484
2998	NC_011080	CG	3	6	158311	158316	0 %	0 %	50 %	50 %	194444484
2999	NC_011080	ACG	2	6	158372	158377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444484
3000	NC_011080	GTT	2	6	158392	158397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444484

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