MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011080	ATC	2	6	105312	105317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444526
2002	NC_011080	TTGTT	2	10	105399	105408	0 %	80 %	20 %	0 %	194444526
2003	NC_011080	TCT	2	6	105463	105468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
2004	NC_011080	CGT	2	6	105532	105537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2005	NC_011080	GCT	2	6	105544	105549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2006	NC_011080	CCTG	2	8	105552	105559	0 %	25 %	25 %	50 %	194444526
2007	NC_011080	ACG	2	6	105612	105617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2008	NC_011080	ATT	2	6	105620	105625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444526
2009	NC_011080	GAC	2	6	105626	105631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2010	NC_011080	G	6	6	105655	105660	0 %	0 %	100 %	0 %	194444526
2011	NC_011080	AGC	2	6	105699	105704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2012	NC_011080	TTC	2	6	105714	105719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
2013	NC_011080	GTT	2	6	105897	105902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445274
2014	NC_011080	AGC	2	6	105954	105959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2015	NC_011080	AGT	2	6	106017	106022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2016	NC_011080	AAT	2	6	106113	106118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445274
2017	NC_011080	AT	3	6	106139	106144	50 %	50 %	0 %	0 %	194445274
2018	NC_011080	GCT	4	12	106207	106218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2019	NC_011080	GTC	2	6	106327	106332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2020	NC_011080	TGT	2	6	106347	106352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445274
2021	NC_011080	TAG	2	6	106379	106384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2022	NC_011080	CGG	2	6	106416	106421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445274
2023	NC_011080	CAT	3	9	106422	106430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445274
2024	NC_011080	GCA	2	6	106530	106535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2025	NC_011080	AAG	2	6	106536	106541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445274
2026	NC_011080	GCTTC	2	10	106779	106788	0 %	40 %	20 %	40 %	194445274
2027	NC_011080	GTA	2	6	106939	106944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2028	NC_011080	GCT	2	6	106975	106980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2029	NC_011080	TGCGT	2	10	107066	107075	0 %	40 %	40 %	20 %	194445274
2030	NC_011080	TACT	2	8	107096	107103	25 %	50 %	0 %	25 %	194445274
2031	NC_011080	TGC	2	6	107186	107191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2032	NC_011080	GAT	2	6	107229	107234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2033	NC_011080	GCCT	2	8	107287	107294	0 %	25 %	25 %	50 %	194445274
2034	NC_011080	ATA	2	6	107324	107329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445274
2035	NC_011080	CGG	2	6	107336	107341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445274
2036	NC_011080	TGG	2	6	107361	107366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445274
2037	NC_011080	TTC	2	6	107557	107562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445274
2038	NC_011080	CAC	2	6	107587	107592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445274
2039	NC_011080	AGG	2	6	107619	107624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445274
2040	NC_011080	GCT	2	6	107667	107672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2041	NC_011080	CCA	2	6	107706	107711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445274
2042	NC_011080	ATC	2	6	107794	107799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445274
2043	NC_011080	TGA	2	6	107864	107869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2044	NC_011080	GGC	2	6	107892	107897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445274
2045	NC_011080	TGA	2	6	108074	108079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2046	NC_011080	TGG	2	6	108102	108107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445274
2047	NC_011080	AGA	2	6	108110	108115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445274
2048	NC_011080	T	6	6	108127	108132	0 %	100 %	0 %	0 %	194445274
2049	NC_011080	TATT	2	8	108142	108149	25 %	75 %	0 %	0 %	194444461
2050	NC_011080	CAT	2	6	108154	108159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444461
2051	NC_011080	TGA	2	6	108429	108434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442223
2052	NC_011080	GCG	2	6	108438	108443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442223
2053	NC_011080	CTG	2	6	108467	108472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442223
2054	NC_011080	T	6	6	108548	108553	0 %	100 %	0 %	0 %	194442223
2055	NC_011080	CCA	2	6	108555	108560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442223
2056	NC_011080	CAGT	2	8	108628	108635	25 %	25 %	25 %	25 %	194442223
2057	NC_011080	TGATC	2	10	108766	108775	20 %	40 %	20 %	20 %	194442223
2058	NC_011080	GGC	2	6	108802	108807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442223
2059	NC_011080	CT	3	6	108820	108825	0 %	50 %	0 %	50 %	194442223
2060	NC_011080	ATG	2	6	108908	108913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442223
2061	NC_011080	GCG	2	6	108918	108923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442223
2062	NC_011080	GGC	2	6	108932	108937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442223
2063	NC_011080	ATC	2	6	108942	108947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442223
2064	NC_011080	CGG	3	9	108955	108963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442223
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2068	NC_011080	TGA	2	6	109068	109073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442223
2069	NC_011080	CAT	2	6	109079	109084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442223
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2071	NC_011080	ATG	2	6	109121	109126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442223
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2080	NC_011080	CG	3	6	109659	109664	0 %	0 %	50 %	50 %	194443178
2081	NC_011080	CGC	2	6	109749	109754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443178
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2090	NC_011080	CTG	2	6	110040	110045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2091	NC_011080	TCG	3	9	110071	110079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2092	NC_011080	GC	3	6	110098	110103	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2093	NC_011080	CG	3	6	110155	110160	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2094	NC_011080	ATCA	2	8	110163	110170	50 %	25 %	0 %	25 %	194446131
2095	NC_011080	TGC	2	6	110252	110257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
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2100	NC_011080	ACG	2	6	110410	110415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
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2102	NC_011080	TGC	3	9	110477	110485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
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2111	NC_011080	T	6	6	111029	111034	0 %	100 %	0 %	0 %	194446131
2112	NC_011080	GAC	2	6	111086	111091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2113	NC_011080	CAG	2	6	111105	111110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2114	NC_011080	GC	3	6	111203	111208	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2115	NC_011080	TCT	2	6	111214	111219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446131
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2120	NC_011080	CCA	2	6	111420	111425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446131
2121	NC_011080	CG	3	6	111505	111510	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2122	NC_011080	CGGCAG	2	12	111552	111563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194446131
2123	NC_011080	TCA	2	6	111670	111675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446131
2124	NC_011080	GGC	2	6	111678	111683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446131
2125	NC_011080	TCG	2	6	111691	111696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2126	NC_011080	TCG	2	6	111769	111774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2127	NC_011080	CAG	2	6	111795	111800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
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2129	NC_011080	TGGCG	2	10	111927	111936	0 %	20 %	60 %	20 %	194446131
2130	NC_011080	CAG	3	9	111939	111947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
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2132	NC_011080	GAT	2	6	112022	112027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446131
2133	NC_011080	TCG	2	6	112033	112038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2134	NC_011080	ACC	2	6	112039	112044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446131
2135	NC_011080	GCT	2	6	112082	112087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
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2138	NC_011080	CGT	2	6	112151	112156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2139	NC_011080	GCA	2	6	112214	112219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2140	NC_011080	GAT	2	6	112257	112262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446131
2141	NC_011080	CCG	2	6	112274	112279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446131
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2145	NC_011080	CG	3	6	112358	112363	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2146	NC_011080	CGA	2	6	112372	112377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2147	NC_011080	CAT	2	6	112382	112387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446131
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2149	NC_011080	AGCGC	2	10	112487	112496	20 %	0 %	40 %	40 %	194446131
2150	NC_011080	TCGA	2	8	112509	112516	25 %	25 %	25 %	25 %	194446131
2151	NC_011080	TCT	2	6	112645	112650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446131
2152	NC_011080	GC	3	6	112740	112745	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2153	NC_011080	CATC	2	8	112796	112803	25 %	25 %	0 %	50 %	194446131
2154	NC_011080	CAA	2	6	112805	112810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446131
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2158	NC_011080	GCG	2	6	113161	113166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
2159	NC_011080	CTG	2	6	113168	113173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446652
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2162	NC_011080	GCG	2	6	113296	113301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2165	NC_011080	GCG	2	6	113470	113475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2182	NC_011080	TCG	2	6	114328	114333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446652
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2186	NC_011080	GCA	2	6	114700	114705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446652
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2221	NC_011080	ATTTT	2	10	116716	116725	20 %	80 %	0 %	0 %	194444922
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2223	NC_011080	T	6	6	116878	116883	0 %	100 %	0 %	0 %	194444922
2224	NC_011080	ACAGA	2	10	116899	116908	60 %	0 %	20 %	20 %	194444922
2225	NC_011080	ATT	2	6	116923	116928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444922
2226	NC_011080	T	7	7	116943	116949	0 %	100 %	0 %	0 %	194444922
2227	NC_011080	A	6	6	116970	116975	100 %	0 %	0 %	0 %	194444922
2228	NC_011080	GGA	2	6	118800	118805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443651
2229	NC_011080	CAA	2	6	118847	118852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443651
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2231	NC_011080	GGAA	2	8	118881	118888	50 %	0 %	50 %	0 %	194443651
2232	NC_011080	ATT	2	6	118915	118920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443651
2233	NC_011080	AT	3	6	118968	118973	50 %	50 %	0 %	0 %	194443651
2234	NC_011080	TCA	2	6	118986	118991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443651
2235	NC_011080	TGC	2	6	119086	119091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967492
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2237	NC_011080	GGC	2	6	119117	119122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967492
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2239	NC_011080	CTT	2	6	119144	119149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967492
2240	NC_011080	GCG	2	6	119239	119244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967492
2241	NC_011080	CAA	2	6	119270	119275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448967492
2242	NC_011080	GTGG	2	8	119367	119374	0 %	25 %	75 %	0 %	448967492
2243	NC_011080	GT	3	6	119434	119439	0 %	50 %	50 %	0 %	448967492
2244	NC_011080	GCC	2	6	119445	119450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967492
2245	NC_011080	GAC	2	6	119497	119502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967492
2246	NC_011080	ACC	3	9	119545	119553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448967492
2247	NC_011080	CGC	2	6	119609	119614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967492
2248	NC_011080	TCT	2	6	119710	119715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967492
2249	NC_011080	CAGCG	2	10	119892	119901	20 %	0 %	40 %	40 %	194446528
2250	NC_011080	ATCA	2	8	119933	119940	50 %	25 %	0 %	25 %	194446528
2251	NC_011080	GC	3	6	120019	120024	0 %	0 %	50 %	50 %	194446528
2252	NC_011080	GCCA	2	8	120026	120033	25 %	0 %	25 %	50 %	194446528
2253	NC_011080	GCG	2	6	120115	120120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446528
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2255	NC_011080	CGA	2	6	120184	120189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2256	NC_011080	GCCGG	2	10	120192	120201	0 %	0 %	60 %	40 %	194446528
2257	NC_011080	GCC	2	6	120239	120244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
2258	NC_011080	GGAC	2	8	120293	120300	25 %	0 %	50 %	25 %	194446528
2259	NC_011080	AC	3	6	120299	120304	50 %	0 %	0 %	50 %	194446528
2260	NC_011080	CGAGC	2	10	120317	120326	20 %	0 %	40 %	40 %	194446528
2261	NC_011080	TCC	2	6	120363	120368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446528
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2264	NC_011080	TGC	2	6	120468	120473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2265	NC_011080	GTA	2	6	120531	120536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446528
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2268	NC_011080	GGCG	2	8	120638	120645	0 %	0 %	75 %	25 %	194446528
2269	NC_011080	GCT	2	6	120656	120661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446528
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2272	NC_011080	ATTTG	2	10	120760	120769	20 %	60 %	20 %	0 %	194446528
2273	NC_011080	GTCA	2	8	120788	120795	25 %	25 %	25 %	25 %	194446528
2274	NC_011080	GAC	2	6	120923	120928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2275	NC_011080	TGC	2	6	120933	120938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2276	NC_011080	CG	3	6	120948	120953	0 %	0 %	50 %	50 %	194446528
2277	NC_011080	GCC	2	6	120974	120979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
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2279	NC_011080	GCG	2	6	121035	121040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446528
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2282	NC_011080	GCTG	2	8	121315	121322	0 %	25 %	50 %	25 %	194446528
2283	NC_011080	TGT	2	6	121438	121443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445733
2284	NC_011080	CTG	2	6	121461	121466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445733
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2322	NC_011080	CAATTG	2	12	123068	123079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194445733
2323	NC_011080	T	7	7	123522	123528	0 %	100 %	0 %	0 %	194445205
2324	NC_011080	ATCG	2	8	123529	123536	25 %	25 %	25 %	25 %	194445205
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2326	NC_011080	TAA	3	9	123594	123602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445205
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2328	NC_011080	AT	3	6	123632	123637	50 %	50 %	0 %	0 %	194445205
2329	NC_011080	CCG	2	6	123646	123651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445205
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2332	NC_011080	ATC	2	6	123832	123837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445205
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2336	NC_011080	CCG	2	6	123940	123945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445205
2337	NC_011080	TGCC	2	8	123966	123973	0 %	25 %	25 %	50 %	194445205
2338	NC_011080	CAG	2	6	124072	124077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445205
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2342	NC_011080	CGCTGG	2	12	124470	124481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194444593
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2346	NC_011080	TAT	2	6	124576	124581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444593
2347	NC_011080	CTGG	2	8	124612	124619	0 %	25 %	50 %	25 %	194444593
2348	NC_011080	GCT	2	6	124675	124680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444593
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2351	NC_011080	GCC	2	6	124840	124845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444593
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2353	NC_011080	GCT	3	9	124924	124932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444593
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2356	NC_011080	GGC	2	6	124974	124979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444593
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2358	NC_011080	TA	3	6	125118	125123	50 %	50 %	0 %	0 %	194444593
2359	NC_011080	TAG	2	6	125248	125253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444261
2360	NC_011080	TTGCC	2	10	125264	125273	0 %	40 %	20 %	40 %	194444261
2361	NC_011080	CGTC	2	8	125282	125289	0 %	25 %	25 %	50 %	194444261
2362	NC_011080	CGA	3	9	125292	125300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444261
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2486	NC_011080	TGG	2	6	131575	131580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443917
2487	NC_011080	CTTCCG	2	12	131689	131700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194443917
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2489	NC_011080	CCG	3	9	131779	131787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443917
2490	NC_011080	CG	3	6	131786	131791	0 %	0 %	50 %	50 %	194443917
2491	NC_011080	GC	3	6	131907	131912	0 %	0 %	50 %	50 %	194443917
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2498	NC_011080	CGC	2	6	132241	132246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443917
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